MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_015850	TCC	2	6	1350286	1350291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782069
24503	NC_015850	TCG	2	6	1350293	1350298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782069
24504	NC_015850	GCA	2	6	1350328	1350333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782069
24505	NC_015850	ATCG	2	8	1350404	1350411	25 %	25 %	25 %	25 %	340782069
24506	NC_015850	TCC	2	6	1350451	1350456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782069
24507	NC_015850	CGC	2	6	1350479	1350484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782069
24508	NC_015850	GGC	2	6	1350492	1350497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782069
24509	NC_015850	CGG	2	6	1350533	1350538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782069
24510	NC_015850	CGATAG	2	12	1350574	1350585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340782069
24511	NC_015850	GCG	2	6	1350639	1350644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782069
24512	NC_015850	GAA	2	6	1350867	1350872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782069
24513	NC_015850	CGG	2	6	1350895	1350900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782069
24514	NC_015850	GCC	2	6	1350960	1350965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782069
24515	NC_015850	CCG	2	6	1351012	1351017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782069
24516	NC_015850	CGG	2	6	1351130	1351135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782069
24517	NC_015850	CCT	2	6	1351160	1351165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782069
24518	NC_015850	GCC	2	6	1351219	1351224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782069
24519	NC_015850	GGCGCG	2	12	1351236	1351247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782069
24520	NC_015850	CAT	2	6	1351248	1351253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782069
24521	NC_015850	CCG	2	6	1351305	1351310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782070
24522	NC_015850	CCG	2	6	1351367	1351372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782070
24523	NC_015850	TCG	2	6	1351409	1351414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782070
24524	NC_015850	CAC	2	6	1351460	1351465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782070
24525	NC_015850	TGA	2	6	1351497	1351502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782070
24526	NC_015850	TGC	2	6	1351638	1351643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782070
24527	NC_015850	GAG	2	6	1351692	1351697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782071
24528	NC_015850	CCGGTA	2	12	1351721	1351732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782071
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24531	NC_015850	GCC	2	6	1351933	1351938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782071
24532	NC_015850	GC	3	6	1351978	1351983	0 %	0 %	50 %	50 %	340782071
24533	NC_015850	TGC	2	6	1352053	1352058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782071
24534	NC_015850	CCG	2	6	1352093	1352098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782071
24535	NC_015850	GAT	2	6	1352148	1352153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782071
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24543	NC_015850	GC	3	6	1352602	1352607	0 %	0 %	50 %	50 %	340782071
24544	NC_015850	GCCCG	2	10	1352633	1352642	0 %	0 %	40 %	60 %	340782071
24545	NC_015850	GTA	2	6	1352652	1352657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782071
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24550	NC_015850	TGC	2	6	1352902	1352907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782071
24551	NC_015850	TCC	2	6	1352935	1352940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782071
24552	NC_015850	GAC	2	6	1353171	1353176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782071
24553	NC_015850	GTG	3	9	1353337	1353345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782072
24554	NC_015850	CA	3	6	1353434	1353439	50 %	0 %	0 %	50 %	340782072
24555	NC_015850	CCG	2	6	1353500	1353505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782072
24556	NC_015850	TCG	2	6	1353514	1353519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782072
24557	NC_015850	CGA	2	6	1353530	1353535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782072
24558	NC_015850	TGC	2	6	1353581	1353586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782072
24559	NC_015850	GC	3	6	1353708	1353713	0 %	0 %	50 %	50 %	340782072
24560	NC_015850	GGC	2	6	1353737	1353742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782072
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24565	NC_015850	CGC	2	6	1354034	1354039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782072
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24570	NC_015850	CGT	2	6	1354175	1354180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782072
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24576	NC_015850	ATG	2	6	1354417	1354422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782072
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24585	NC_015850	TCCATG	2	12	1354741	1354752	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340782072
24586	NC_015850	GAT	2	6	1354791	1354796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782072
24587	NC_015850	GCA	2	6	1354817	1354822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782072
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24597	NC_015850	AATG	2	8	1355192	1355199	50 %	25 %	25 %	0 %	340782072
24598	NC_015850	GGCA	2	8	1355234	1355241	25 %	0 %	50 %	25 %	340782072
24599	NC_015850	CAG	2	6	1355244	1355249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782072
24600	NC_015850	AGGT	2	8	1355272	1355279	25 %	25 %	50 %	0 %	340782072
24601	NC_015850	CTG	2	6	1355283	1355288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782072
24602	NC_015850	TCC	2	6	1355314	1355319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782072
24603	NC_015850	GCG	2	6	1355425	1355430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782072
24604	NC_015850	CG	3	6	1355457	1355462	0 %	0 %	50 %	50 %	340782072
24605	NC_015850	CGT	2	6	1355477	1355482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782072
24606	NC_015850	CAGG	2	8	1355499	1355506	25 %	0 %	50 %	25 %	340782072
24607	NC_015850	CGC	2	6	1355529	1355534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782072
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24609	NC_015850	A	6	6	1355680	1355685	100 %	0 %	0 %	0 %	340782072
24610	NC_015850	CGG	2	6	1355834	1355839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782073
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24612	NC_015850	CAG	2	6	1355889	1355894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782073
24613	NC_015850	GCCCGC	2	12	1355941	1355952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782073
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24615	NC_015850	CCCG	2	8	1355974	1355981	0 %	0 %	25 %	75 %	340782073
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24843	NC_015850	CCCG	2	8	1366195	1366202	0 %	0 %	25 %	75 %	340782082
24844	NC_015850	CAG	2	6	1366243	1366248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782082
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