MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_015850	CTG	2	6	1324379	1324384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782049
24003	NC_015850	GCG	2	6	1324385	1324390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782049
24004	NC_015850	GCA	2	6	1324391	1324396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782049
24005	NC_015850	TCG	2	6	1324428	1324433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782049
24006	NC_015850	AAG	2	6	1324485	1324490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782049
24007	NC_015850	TCT	2	6	1324504	1324509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782049
24008	NC_015850	GCG	2	6	1324530	1324535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782049
24009	NC_015850	GAG	2	6	1324568	1324573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782049
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24011	NC_015850	GCT	2	6	1324699	1324704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782049
24012	NC_015850	CG	3	6	1324747	1324752	0 %	0 %	50 %	50 %	340782049
24013	NC_015850	CG	3	6	1324780	1324785	0 %	0 %	50 %	50 %	340782049
24014	NC_015850	GGC	2	6	1324801	1324806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782049
24015	NC_015850	GCC	2	6	1324875	1324880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782049
24016	NC_015850	CATCGT	2	12	1324924	1324935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340782049
24017	NC_015850	GCC	2	6	1324936	1324941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782049
24018	NC_015850	GAG	2	6	1324958	1324963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782049
24019	NC_015850	CTG	2	6	1325021	1325026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782050
24020	NC_015850	CCG	2	6	1325051	1325056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782050
24021	NC_015850	CAT	2	6	1325061	1325066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782050
24022	NC_015850	GTC	2	6	1325077	1325082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782050
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24027	NC_015850	GCT	2	6	1325247	1325252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782050
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24031	NC_015850	CTG	2	6	1325446	1325451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782050
24032	NC_015850	GCC	2	6	1325544	1325549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782051
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24034	NC_015850	CGT	2	6	1325579	1325584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782051
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24048	NC_015850	TCGAGG	2	12	1326360	1326371	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340782052
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24053	NC_015850	CGA	2	6	1326480	1326485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782052
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24057	NC_015850	CCGC	2	8	1326727	1326734	0 %	0 %	25 %	75 %	340782052
24058	NC_015850	GC	3	6	1326733	1326738	0 %	0 %	50 %	50 %	340782052
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24089	NC_015850	GC	4	8	1328191	1328198	0 %	0 %	50 %	50 %	340782053
24090	NC_015850	CTGG	2	8	1328336	1328343	0 %	25 %	50 %	25 %	340782053
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24099	NC_015850	CGG	2	6	1328675	1328680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782053
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24103	NC_015850	GAT	2	6	1328920	1328925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782054
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24108	NC_015850	CA	3	6	1330165	1330170	50 %	0 %	0 %	50 %	340782055
24109	NC_015850	TGA	2	6	1330178	1330183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782055
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24111	NC_015850	GTA	2	6	1330216	1330221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782055
24112	NC_015850	CGG	2	6	1330257	1330262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782055
24113	NC_015850	TCA	2	6	1330275	1330280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782055
24114	NC_015850	GGC	2	6	1330285	1330290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782055
24115	NC_015850	GCA	2	6	1330377	1330382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782055
24116	NC_015850	GAT	2	6	1330399	1330404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782055
24117	NC_015850	CCCAG	2	10	1330425	1330434	20 %	0 %	20 %	60 %	340782055
24118	NC_015850	CGA	2	6	1330449	1330454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782055
24119	NC_015850	GCCA	2	8	1330460	1330467	25 %	0 %	25 %	50 %	340782055
24120	NC_015850	ACC	2	6	1330493	1330498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782055
24121	NC_015850	ATG	2	6	1330523	1330528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782055
24122	NC_015850	GGCC	2	8	1330557	1330564	0 %	0 %	50 %	50 %	340782055
24123	NC_015850	GTA	2	6	1330726	1330731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782055
24124	NC_015850	GGGTCA	2	12	1330746	1330757	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340782055
24125	NC_015850	TCG	2	6	1330784	1330789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782055
24126	NC_015850	CCA	2	6	1330791	1330796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782055
24127	NC_015850	CCG	2	6	1330812	1330817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782055
24128	NC_015850	GAT	2	6	1330819	1330824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782055
24129	NC_015850	TCG	2	6	1330832	1330837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782055
24130	NC_015850	GAA	2	6	1331071	1331076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782055
24131	NC_015850	CGC	2	6	1331090	1331095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782055
24132	NC_015850	TGC	2	6	1331135	1331140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782055
24133	NC_015850	G	6	6	1331154	1331159	0 %	0 %	100 %	0 %	340782055
24134	NC_015850	GCC	2	6	1331170	1331175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782055
24135	NC_015850	GTAACG	2	12	1331212	1331223	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340782055
24136	NC_015850	GCA	2	6	1331234	1331239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782055
24137	NC_015850	GTC	2	6	1331252	1331257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782055
24138	NC_015850	CTG	2	6	1331307	1331312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782055
24139	NC_015850	TCC	2	6	1331354	1331359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782055
24140	NC_015850	AAG	2	6	1331372	1331377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782055
24141	NC_015850	TGA	2	6	1331570	1331575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782056
24142	NC_015850	TGA	3	9	1331579	1331587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782056
24143	NC_015850	AGC	2	6	1331590	1331595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782056
24144	NC_015850	TGG	2	6	1331609	1331614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782056
24145	NC_015850	GAT	2	6	1331631	1331636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782056
24146	NC_015850	CAG	2	6	1331673	1331678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782056
24147	NC_015850	ACC	2	6	1331682	1331687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782056
24148	NC_015850	GAT	2	6	1331700	1331705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782056
24149	NC_015850	ACCA	2	8	1331706	1331713	50 %	0 %	0 %	50 %	340782056
24150	NC_015850	CAG	2	6	1331787	1331792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782056
24151	NC_015850	ACG	2	6	1331939	1331944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782057
24152	NC_015850	GCG	2	6	1332065	1332070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782057
24153	NC_015850	TGAT	2	8	1332089	1332096	25 %	50 %	25 %	0 %	340782057
24154	NC_015850	GCC	2	6	1332121	1332126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782057
24155	NC_015850	GC	3	6	1332134	1332139	0 %	0 %	50 %	50 %	340782057
24156	NC_015850	CGA	2	6	1332159	1332164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782057
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24159	NC_015850	CTG	2	6	1332477	1332482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782058
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24165	NC_015850	GGT	2	6	1332768	1332773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782058
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24191	NC_015850	TGG	2	6	1333975	1333980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782058
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24200	NC_015850	CTACC	2	10	1334457	1334466	20 %	20 %	0 %	60 %	340782059
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24202	NC_015850	CTGG	2	8	1334534	1334541	0 %	25 %	50 %	25 %	340782059
24203	NC_015850	GACC	2	8	1334561	1334568	25 %	0 %	25 %	50 %	340782059
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24214	NC_015850	TGA	2	6	1335158	1335163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782060
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24217	NC_015850	GTCG	2	8	1335284	1335291	0 %	25 %	50 %	25 %	340782060
24218	NC_015850	GA	3	6	1335310	1335315	50 %	0 %	50 %	0 %	340782060
24219	NC_015850	CGG	2	6	1335350	1335355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782060
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24221	NC_015850	ATG	2	6	1335400	1335405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782060
24222	NC_015850	TTC	2	6	1335414	1335419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782060
24223	NC_015850	GGC	2	6	1335435	1335440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782060
24224	NC_015850	TCG	2	6	1335448	1335453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782060
24225	NC_015850	GT	3	6	1335502	1335507	0 %	50 %	50 %	0 %	340782060
24226	NC_015850	GAT	2	6	1335624	1335629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782060
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24228	NC_015850	CACC	2	8	1335746	1335753	25 %	0 %	0 %	75 %	340782060
24229	NC_015850	TCG	2	6	1335781	1335786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782060
24230	NC_015850	AAT	2	6	1335851	1335856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782060
24231	NC_015850	GTG	2	6	1335919	1335924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782060
24232	NC_015850	ATGACG	2	12	1335931	1335942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340782060
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24242	NC_015850	TCC	2	6	1336290	1336295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782061
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24334	NC_015850	GGAGCT	2	12	1341499	1341510	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340782064
24335	NC_015850	TCA	2	6	1341588	1341593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782064
24336	NC_015850	TGCGTC	2	12	1341640	1341651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782064
24337	NC_015850	TCG	2	6	1341725	1341730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782064
24338	NC_015850	GC	3	6	1341791	1341796	0 %	0 %	50 %	50 %	340782064
24339	NC_015850	GCAGC	2	10	1341818	1341827	20 %	0 %	40 %	40 %	340782064
24340	NC_015850	CAGC	2	8	1342035	1342042	25 %	0 %	25 %	50 %	340782064
24341	NC_015850	GTGG	2	8	1342046	1342053	0 %	25 %	75 %	0 %	340782064
24342	NC_015850	TGG	2	6	1342121	1342126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782064
24343	NC_015850	CGG	2	6	1342154	1342159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782064
24344	NC_015850	GCATCG	2	12	1342230	1342241	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782064
24345	NC_015850	ACG	2	6	1342253	1342258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782064
24346	NC_015850	CCA	2	6	1342292	1342297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782064
24347	NC_015850	GGT	2	6	1342336	1342341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782064
24348	NC_015850	CGGG	2	8	1342365	1342372	0 %	0 %	75 %	25 %	340782064
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24350	NC_015850	ACT	2	6	1342513	1342518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782064
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24352	NC_015850	CGGCT	2	10	1342584	1342593	0 %	20 %	40 %	40 %	340782064
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24357	NC_015850	G	6	6	1342903	1342908	0 %	0 %	100 %	0 %	340782064
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24453	NC_015850	GCA	2	6	1347747	1347752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782066
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24462	NC_015850	GAC	2	6	1348254	1348259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782067
24463	NC_015850	GCG	2	6	1348262	1348267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782067
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