MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_015850	CG	3	6	1260589	1260594	0 %	0 %	50 %	50 %	340781990
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23004	NC_015850	GCC	2	6	1260647	1260652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781990
23005	NC_015850	CCA	2	6	1260655	1260660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781990
23006	NC_015850	CGA	2	6	1260670	1260675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781990
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23008	NC_015850	TGA	2	6	1260804	1260809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781990
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23010	NC_015850	GCG	2	6	1261030	1261035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781991
23011	NC_015850	TTGA	2	8	1261044	1261051	25 %	50 %	25 %	0 %	340781991
23012	NC_015850	GC	4	8	1261125	1261132	0 %	0 %	50 %	50 %	340781991
23013	NC_015850	TTG	2	6	1261303	1261308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781992
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23017	NC_015850	TCG	2	6	1261594	1261599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781992
23018	NC_015850	GCCC	2	8	1261649	1261656	0 %	0 %	25 %	75 %	340781992
23019	NC_015850	GC	3	6	1261674	1261679	0 %	0 %	50 %	50 %	340781992
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23100	NC_015850	GGA	2	6	1265411	1265416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781993
23101	NC_015850	GCA	2	6	1265454	1265459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781993
23102	NC_015850	GAT	2	6	1265491	1265496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781993
23103	NC_015850	GCGG	2	8	1265550	1265557	0 %	0 %	75 %	25 %	340781993
23104	NC_015850	G	6	6	1265639	1265644	0 %	0 %	100 %	0 %	340781994
23105	NC_015850	ACA	2	6	1265706	1265711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781994
23106	NC_015850	CGC	2	6	1265820	1265825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781994
23107	NC_015850	TAC	2	6	1265829	1265834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781994
23108	NC_015850	CAG	2	6	1265853	1265858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781994
23109	NC_015850	CAC	2	6	1266018	1266023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781994
23110	NC_015850	TGC	2	6	1266206	1266211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781994
23111	NC_015850	ACG	2	6	1266220	1266225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781994
23112	NC_015850	GCG	2	6	1266252	1266257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781994
23113	NC_015850	GC	3	6	1266295	1266300	0 %	0 %	50 %	50 %	340781994
23114	NC_015850	CGTC	2	8	1266485	1266492	0 %	25 %	25 %	50 %	340781994
23115	NC_015850	CGG	2	6	1266500	1266505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781994
23116	NC_015850	CCTTG	2	10	1266536	1266545	0 %	40 %	20 %	40 %	340781994
23117	NC_015850	GTTCTT	2	12	1266555	1266566	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340781994
23118	NC_015850	CTTGAG	2	12	1266711	1266722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340781994
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23225	NC_015850	CATC	2	8	1274110	1274117	25 %	25 %	0 %	50 %	340782002
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23228	NC_015850	TCCA	2	8	1274487	1274494	25 %	25 %	0 %	50 %	340782003
23229	NC_015850	ACA	2	6	1274497	1274502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782003
23230	NC_015850	AC	3	6	1275076	1275081	50 %	0 %	0 %	50 %	340782004
23231	NC_015850	AC	3	6	1275091	1275096	50 %	0 %	0 %	50 %	340782004
23232	NC_015850	GAA	2	6	1275108	1275113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782004
23233	NC_015850	CTG	2	6	1275121	1275126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782004
23234	NC_015850	CAA	2	6	1275276	1275281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782004
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23332	NC_015850	GCCC	2	8	1281696	1281703	0 %	0 %	25 %	75 %	340782014
23333	NC_015850	AGGT	2	8	1281805	1281812	25 %	25 %	50 %	0 %	340782014
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23341	NC_015850	GGC	2	6	1282294	1282299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782014
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23346	NC_015850	TG	3	6	1282694	1282699	0 %	50 %	50 %	0 %	340782015
23347	NC_015850	TAA	2	6	1282718	1282723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782015
23348	NC_015850	ACC	2	6	1283018	1283023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782016
23349	NC_015850	TCT	2	6	1283062	1283067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782016
23350	NC_015850	CG	3	6	1283152	1283157	0 %	0 %	50 %	50 %	340782016
23351	NC_015850	CCT	2	6	1283239	1283244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782016
23352	NC_015850	CGGGG	2	10	1283346	1283355	0 %	0 %	80 %	20 %	340782016
23353	NC_015850	ACGCTC	2	12	1283360	1283371	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782016
23354	NC_015850	TCA	2	6	1283443	1283448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782016
23355	NC_015850	T	6	6	1283457	1283462	0 %	100 %	0 %	0 %	340782016
23356	NC_015850	CCT	3	9	1283503	1283511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782016
23357	NC_015850	TGG	2	6	1283569	1283574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782016
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23359	NC_015850	TCT	2	6	1283638	1283643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782016
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23361	NC_015850	CTT	2	6	1283756	1283761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782016
23362	NC_015850	CGT	2	6	1283765	1283770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782016
23363	NC_015850	CTC	2	6	1283879	1283884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782016
23364	NC_015850	GCC	2	6	1283904	1283909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782016
23365	NC_015850	TCG	2	6	1283955	1283960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782016
23366	NC_015850	ATT	2	6	1283987	1283992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340782016
23367	NC_015850	CAT	2	6	1283999	1284004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782016
23368	NC_015850	GGCAT	2	10	1284012	1284021	20 %	20 %	40 %	20 %	340782016
23369	NC_015850	CGG	2	6	1284163	1284168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782017
23370	NC_015850	ATGG	2	8	1284290	1284297	25 %	25 %	50 %	0 %	340782017
23371	NC_015850	CAA	2	6	1284323	1284328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782017
23372	NC_015850	TCG	2	6	1284365	1284370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782017
23373	NC_015850	TGG	2	6	1284506	1284511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782017
23374	NC_015850	TGC	2	6	1284522	1284527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782017
23375	NC_015850	CCA	2	6	1284615	1284620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782017
23376	NC_015850	GCG	2	6	1284624	1284629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782017
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23379	NC_015850	CG	3	6	1284736	1284741	0 %	0 %	50 %	50 %	340782017
23380	NC_015850	TCA	2	6	1284744	1284749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782017
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23382	NC_015850	CGT	2	6	1284851	1284856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782017
23383	NC_015850	CCA	2	6	1284880	1284885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782017
23384	NC_015850	CTG	2	6	1284975	1284980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782017
23385	NC_015850	ATC	2	6	1284999	1285004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782017
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23387	NC_015850	GCTG	2	8	1285053	1285060	0 %	25 %	50 %	25 %	340782017
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23398	NC_015850	GA	3	6	1286147	1286152	50 %	0 %	50 %	0 %	340782019
23399	NC_015850	CGATAC	2	12	1286231	1286242	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340782019
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23461	NC_015850	CCAC	2	8	1290436	1290443	25 %	0 %	0 %	75 %	340782021
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