MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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22119	NC_015850	TCT	2	6	1201572	1201577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781933
22120	NC_015850	GCT	2	6	1201648	1201653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781933
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22234	NC_015850	CCG	2	6	1209137	1209142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781942
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22236	NC_015850	CTG	2	6	1209184	1209189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781942
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22347	NC_015850	GGA	2	6	1216211	1216216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781948
22348	NC_015850	GGT	2	6	1216301	1216306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781948
22349	NC_015850	ATC	2	6	1216365	1216370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781948
22350	NC_015850	TGC	2	6	1216958	1216963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781949
22351	NC_015850	GCC	2	6	1217042	1217047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781949
22352	NC_015850	TTC	2	6	1218093	1218098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781950
22353	NC_015850	AATC	2	8	1218149	1218156	50 %	25 %	0 %	25 %	340781950
22354	NC_015850	AAC	2	6	1218606	1218611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781951
22355	NC_015850	CCT	2	6	1218652	1218657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781951
22356	NC_015850	GAC	2	6	1218788	1218793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781951
22357	NC_015850	GCG	2	6	1218800	1218805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781951
22358	NC_015850	CCT	2	6	1218832	1218837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781951
22359	NC_015850	CAGGG	2	10	1218846	1218855	20 %	0 %	60 %	20 %	340781951
22360	NC_015850	TCT	2	6	1218961	1218966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781951
22361	NC_015850	CCG	2	6	1219115	1219120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781951
22362	NC_015850	CTG	2	6	1219124	1219129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781951
22363	NC_015850	CG	3	6	1219353	1219358	0 %	0 %	50 %	50 %	340781951
22364	NC_015850	CGTCA	2	10	1219519	1219528	20 %	20 %	20 %	40 %	340781952
22365	NC_015850	GGT	2	6	1219545	1219550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781952
22366	NC_015850	CGT	2	6	1219679	1219684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781952
22367	NC_015850	T	6	6	1219759	1219764	0 %	100 %	0 %	0 %	340781952
22368	NC_015850	TCC	2	6	1219795	1219800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781952
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22371	NC_015850	GAT	2	6	1219931	1219936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781952
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22373	NC_015850	ACC	2	6	1219971	1219976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781952
22374	NC_015850	TGT	2	6	1220023	1220028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781952
22375	NC_015850	TCA	2	6	1220069	1220074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781952
22376	NC_015850	CG	3	6	1220092	1220097	0 %	0 %	50 %	50 %	340781952
22377	NC_015850	CAC	2	6	1220117	1220122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781952
22378	NC_015850	TCCA	2	8	1220155	1220162	25 %	25 %	0 %	50 %	340781952
22379	NC_015850	CAG	2	6	1220495	1220500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781953
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22382	NC_015850	ATG	2	6	1220717	1220722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781953
22383	NC_015850	GACC	2	8	1220827	1220834	25 %	0 %	25 %	50 %	340781953
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22452	NC_015850	ACC	2	6	1224695	1224700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781956
22453	NC_015850	C	6	6	1224699	1224704	0 %	0 %	0 %	100 %	340781956
22454	NC_015850	GCA	2	6	1224903	1224908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781956
22455	NC_015850	CCGT	2	8	1224915	1224922	0 %	25 %	25 %	50 %	340781956
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22457	NC_015850	AGGGA	2	10	1225026	1225035	40 %	0 %	60 %	0 %	340781956
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22459	NC_015850	CG	3	6	1225224	1225229	0 %	0 %	50 %	50 %	340781956
22460	NC_015850	CTC	3	9	1225262	1225270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781956
22461	NC_015850	ACC	2	6	1225311	1225316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781956
22462	NC_015850	CGC	2	6	1225653	1225658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781957
22463	NC_015850	CCG	2	6	1225778	1225783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781957
22464	NC_015850	CGG	2	6	1226030	1226035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781957
22465	NC_015850	CCG	3	9	1226060	1226068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781957
22466	NC_015850	CG	3	6	1226067	1226072	0 %	0 %	50 %	50 %	340781957
22467	NC_015850	GGC	2	6	1226077	1226082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781957
22468	NC_015850	TGG	2	6	1226092	1226097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781957
22469	NC_015850	GTT	2	6	1226103	1226108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781957
22470	NC_015850	ACC	2	6	1226127	1226132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781957
22471	NC_015850	CAG	2	6	1226556	1226561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781958
22472	NC_015850	A	6	6	1226624	1226629	100 %	0 %	0 %	0 %	340781958
22473	NC_015850	CGGCT	2	10	1226655	1226664	0 %	20 %	40 %	40 %	340781958
22474	NC_015850	TCC	2	6	1226704	1226709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781958
22475	NC_015850	AGA	2	6	1226749	1226754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781958
22476	NC_015850	TTGC	2	8	1226755	1226762	0 %	50 %	25 %	25 %	340781958
22477	NC_015850	CGT	2	6	1226804	1226809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781958
22478	NC_015850	GAG	2	6	1226843	1226848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781958
22479	NC_015850	TTC	2	6	1226880	1226885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781958
22480	NC_015850	AAG	2	6	1226931	1226936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781958
22481	NC_015850	CTT	2	6	1227042	1227047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781958
22482	NC_015850	CAC	2	6	1227134	1227139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781958
22483	NC_015850	T	7	7	1227204	1227210	0 %	100 %	0 %	0 %	340781958
22484	NC_015850	ATG	2	6	1227233	1227238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781958
22485	NC_015850	GACACT	2	12	1227351	1227362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340781958
22486	NC_015850	CAT	2	6	1227618	1227623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781958
22487	NC_015850	CTG	2	6	1227801	1227806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781958
22488	NC_015850	CGT	2	6	1227819	1227824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781958
22489	NC_015850	TGA	2	6	1227848	1227853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781958
22490	NC_015850	TCA	2	6	1227902	1227907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781958
22491	NC_015850	CTG	2	6	1227990	1227995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781958
22492	NC_015850	CTT	2	6	1228047	1228052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781958
22493	NC_015850	TATC	2	8	1228115	1228122	25 %	50 %	0 %	25 %	340781958
22494	NC_015850	AGGA	2	8	1228123	1228130	50 %	0 %	50 %	0 %	340781958
22495	NC_015850	CTG	2	6	1228149	1228154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781958
22496	NC_015850	ACG	2	6	1228246	1228251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781958
22497	NC_015850	AC	3	6	1228334	1228339	50 %	0 %	0 %	50 %	340781958
22498	NC_015850	TGC	2	6	1228446	1228451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781958
22499	NC_015850	TCG	2	6	1228516	1228521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781958
22500	NC_015850	GCA	2	6	1228568	1228573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781958

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