MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_015850	TCTGC	2	10	1165331	1165340	0 %	40 %	20 %	40 %	340781903
21502	NC_015850	TGGCAC	2	12	1165347	1165358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21503	NC_015850	TGAT	2	8	1165396	1165403	25 %	50 %	25 %	0 %	340781903
21504	NC_015850	TGCCT	2	10	1165413	1165422	0 %	40 %	20 %	40 %	340781903
21505	NC_015850	TCA	2	6	1165451	1165456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781903
21506	NC_015850	TTG	2	6	1165606	1165611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781903
21507	NC_015850	CCA	2	6	1165670	1165675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781903
21508	NC_015850	CGC	2	6	1165721	1165726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781903
21509	NC_015850	CG	3	6	1165859	1165864	0 %	0 %	50 %	50 %	340781903
21510	NC_015850	CAT	2	6	1165877	1165882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781903
21511	NC_015850	GCA	2	6	1165981	1165986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21512	NC_015850	TCA	2	6	1166053	1166058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781903
21513	NC_015850	GTG	2	6	1166074	1166079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781903
21514	NC_015850	CTCC	2	8	1166100	1166107	0 %	25 %	0 %	75 %	340781903
21515	NC_015850	C	6	6	1166203	1166208	0 %	0 %	0 %	100 %	340781903
21516	NC_015850	GA	3	6	1166366	1166371	50 %	0 %	50 %	0 %	340781903
21517	NC_015850	CCA	2	6	1166384	1166389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781903
21518	NC_015850	CTG	2	6	1166420	1166425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21519	NC_015850	GGTT	2	8	1166492	1166499	0 %	50 %	50 %	0 %	340781903
21520	NC_015850	TCG	2	6	1166500	1166505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21521	NC_015850	GCC	2	6	1166522	1166527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781903
21522	NC_015850	TCG	2	6	1166557	1166562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21523	NC_015850	TCGG	2	8	1166614	1166621	0 %	25 %	50 %	25 %	340781903
21524	NC_015850	TTC	2	6	1166739	1166744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781903
21525	NC_015850	TCG	2	6	1166881	1166886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21526	NC_015850	GCG	2	6	1166905	1166910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781903
21527	NC_015850	GCTTGC	2	12	1166948	1166959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21528	NC_015850	CGA	2	6	1167104	1167109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21529	NC_015850	GCC	2	6	1167156	1167161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781903
21530	NC_015850	CGA	2	6	1167174	1167179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21531	NC_015850	ATG	2	6	1167187	1167192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781903
21532	NC_015850	GC	3	6	1167208	1167213	0 %	0 %	50 %	50 %	340781903
21533	NC_015850	TTC	2	6	1167306	1167311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781903
21534	NC_015850	CAG	2	6	1167363	1167368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21535	NC_015850	CCA	2	6	1167563	1167568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781903
21536	NC_015850	GGCGC	2	10	1167645	1167654	0 %	0 %	60 %	40 %	340781903
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21539	NC_015850	AAAAG	2	10	1167888	1167897	80 %	0 %	20 %	0 %	340781903
21540	NC_015850	GTT	2	6	1167900	1167905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781903
21541	NC_015850	CTG	2	6	1167918	1167923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21542	NC_015850	TGA	2	6	1167989	1167994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781903
21543	NC_015850	TGG	2	6	1168003	1168008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781903
21544	NC_015850	CCTG	2	8	1168045	1168052	0 %	25 %	25 %	50 %	340781903
21545	NC_015850	CTG	2	6	1168059	1168064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21546	NC_015850	TGG	2	6	1168226	1168231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781903
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21548	NC_015850	CTG	2	6	1168251	1168256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781903
21549	NC_015850	TTC	2	6	1168329	1168334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781903
21550	NC_015850	TTGTCG	2	12	1168450	1168461	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340781903
21551	NC_015850	GAT	2	6	1168470	1168475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781903
21552	NC_015850	GC	3	6	1168681	1168686	0 %	0 %	50 %	50 %	340781903
21553	NC_015850	CCG	2	6	1168687	1168692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781903
21554	NC_015850	TGA	2	6	1168829	1168834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781903
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21556	NC_015850	CTT	2	6	1168866	1168871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781903
21557	NC_015850	TCT	2	6	1168928	1168933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781903
21558	NC_015850	CGC	2	6	1169023	1169028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781904
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21560	NC_015850	TCC	2	6	1169120	1169125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781904
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21566	NC_015850	GCG	2	6	1169806	1169811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781905
21567	NC_015850	CTG	2	6	1169825	1169830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781905
21568	NC_015850	GTCG	2	8	1169863	1169870	0 %	25 %	50 %	25 %	340781905
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21570	NC_015850	AGT	2	6	1170090	1170095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781906
21571	NC_015850	TGGT	2	8	1170103	1170110	0 %	50 %	50 %	0 %	340781906
21572	NC_015850	GTTG	2	8	1170170	1170177	0 %	50 %	50 %	0 %	340781906
21573	NC_015850	CTT	2	6	1170223	1170228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781906
21574	NC_015850	TGGG	2	8	1170253	1170260	0 %	25 %	75 %	0 %	340781906
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21584	NC_015850	GACG	2	8	1171027	1171034	25 %	0 %	50 %	25 %	340781907
21585	NC_015850	GCG	2	6	1171055	1171060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781907
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21588	NC_015850	CGT	2	6	1171219	1171224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781907
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21599	NC_015850	AGG	2	6	1172020	1172025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781908
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21601	NC_015850	TGG	2	6	1172058	1172063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781908
21602	NC_015850	CAG	2	6	1172067	1172072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781908
21603	NC_015850	CGC	2	6	1172089	1172094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781908
21604	NC_015850	C	6	6	1172094	1172099	0 %	0 %	0 %	100 %	340781908
21605	NC_015850	GCG	2	6	1172235	1172240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781908
21606	NC_015850	GGC	2	6	1172266	1172271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781908
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