MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_015850	CCA	2	6	1133202	1133207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781870
21002	NC_015850	GGT	2	6	1133275	1133280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781870
21003	NC_015850	TCGCGC	2	12	1133370	1133381	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340781870
21004	NC_015850	GCG	2	6	1133396	1133401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781870
21005	NC_015850	ACA	2	6	1133419	1133424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781870
21006	NC_015850	GCA	2	6	1133440	1133445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781870
21007	NC_015850	CAG	2	6	1133447	1133452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781870
21008	NC_015850	AGC	2	6	1133453	1133458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781870
21009	NC_015850	G	6	6	1133485	1133490	0 %	0 %	100 %	0 %	340781870
21010	NC_015850	GAC	2	6	1133492	1133497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781870
21011	NC_015850	GCCCCA	2	12	1133528	1133539	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	340781870
21012	NC_015850	CCAG	2	8	1133604	1133611	25 %	0 %	25 %	50 %	340781870
21013	NC_015850	GCC	2	6	1133631	1133636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781870
21014	NC_015850	AAAG	2	8	1133677	1133684	75 %	0 %	25 %	0 %	340781870
21015	NC_015850	CGC	2	6	1133711	1133716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781870
21016	NC_015850	GGA	2	6	1133748	1133753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781870
21017	NC_015850	TGC	2	6	1133758	1133763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781870
21018	NC_015850	GCC	2	6	1133795	1133800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781870
21019	NC_015850	CGC	2	6	1133963	1133968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781870
21020	NC_015850	CCA	2	6	1133986	1133991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781870
21021	NC_015850	CTG	2	6	1133999	1134004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781870
21022	NC_015850	GCA	2	6	1134028	1134033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781870
21023	NC_015850	AGC	2	6	1134057	1134062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781870
21024	NC_015850	AAGGCC	2	12	1134539	1134550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781871
21025	NC_015850	TGC	4	12	1134584	1134595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781871
21026	NC_015850	AGA	2	6	1134736	1134741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781871
21027	NC_015850	C	6	6	1134778	1134783	0 %	0 %	0 %	100 %	340781871
21028	NC_015850	GCA	2	6	1134792	1134797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781871
21029	NC_015850	CAGC	2	8	1134883	1134890	25 %	0 %	25 %	50 %	340781871
21030	NC_015850	CCGCA	2	10	1134944	1134953	20 %	0 %	20 %	60 %	340781871
21031	NC_015850	GCT	2	6	1134989	1134994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781871
21032	NC_015850	GCC	2	6	1135023	1135028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781871
21033	NC_015850	TGG	2	6	1135176	1135181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781871
21034	NC_015850	TAC	2	6	1135196	1135201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781871
21035	NC_015850	GTA	2	6	1135216	1135221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781871
21036	NC_015850	TG	3	6	1135281	1135286	0 %	50 %	50 %	0 %	340781871
21037	NC_015850	CAG	3	9	1135298	1135306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781871
21038	NC_015850	CAC	2	6	1135370	1135375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781871
21039	NC_015850	GCC	2	6	1135407	1135412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781871
21040	NC_015850	AGC	2	6	1135436	1135441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781871
21041	NC_015850	CCA	2	6	1135546	1135551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781871
21042	NC_015850	CGA	2	6	1135567	1135572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781871
21043	NC_015850	CTC	2	6	1135824	1135829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781872
21044	NC_015850	CCGC	2	8	1135934	1135941	0 %	0 %	25 %	75 %	340781872
21045	NC_015850	CCG	2	6	1135954	1135959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781872
21046	NC_015850	ACCAA	2	10	1135962	1135971	60 %	0 %	0 %	40 %	340781872
21047	NC_015850	GCA	2	6	1135985	1135990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781872
21048	NC_015850	CGG	2	6	1136012	1136017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781872
21049	NC_015850	GA	3	6	1136111	1136116	50 %	0 %	50 %	0 %	340781872
21050	NC_015850	GCCA	2	8	1136257	1136264	25 %	0 %	25 %	50 %	340781872
21051	NC_015850	CAA	2	6	1136286	1136291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781872
21052	NC_015850	ATG	2	6	1136317	1136322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781872
21053	NC_015850	TGA	2	6	1136342	1136347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781872
21054	NC_015850	GAA	2	6	1136523	1136528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781873
21055	NC_015850	CGC	2	6	1136541	1136546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781873
21056	NC_015850	GATG	2	8	1136582	1136589	25 %	25 %	50 %	0 %	340781873
21057	NC_015850	TGC	2	6	1136680	1136685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781873
21058	NC_015850	TGC	2	6	1136758	1136763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781873
21059	NC_015850	CCG	2	6	1136828	1136833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781873
21060	NC_015850	AGA	2	6	1136893	1136898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781873
21061	NC_015850	TGC	2	6	1136908	1136913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781873
21062	NC_015850	AGG	2	6	1136914	1136919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781873
21063	NC_015850	CCA	2	6	1136959	1136964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781873
21064	NC_015850	CCA	2	6	1137001	1137006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781873
21065	NC_015850	CGG	2	6	1137088	1137093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781873
21066	NC_015850	ATC	2	6	1137106	1137111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781873
21067	NC_015850	GAG	2	6	1137138	1137143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781873
21068	NC_015850	GGT	2	6	1137146	1137151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781873
21069	NC_015850	GGC	2	6	1137197	1137202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781873
21070	NC_015850	GCG	2	6	1137227	1137232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781873
21071	NC_015850	GGC	2	6	1137260	1137265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781873
21072	NC_015850	CGA	2	6	1137351	1137356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781873
21073	NC_015850	GCTCA	2	10	1137387	1137396	20 %	20 %	20 %	40 %	340781873
21074	NC_015850	GAG	2	6	1137431	1137436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781873
21075	NC_015850	ATC	2	6	1138060	1138065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781874
21076	NC_015850	CGA	2	6	1138087	1138092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781874
21077	NC_015850	AG	3	6	1138123	1138128	50 %	0 %	50 %	0 %	340781874
21078	NC_015850	TCC	2	6	1138278	1138283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781874
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21081	NC_015850	CCT	2	6	1138342	1138347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781874
21082	NC_015850	GAC	2	6	1138388	1138393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781874
21083	NC_015850	TGC	2	6	1138523	1138528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781875
21084	NC_015850	GCG	2	6	1138529	1138534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781875
21085	NC_015850	CCTTC	2	10	1138566	1138575	0 %	40 %	0 %	60 %	340781875
21086	NC_015850	TCG	2	6	1138584	1138589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781875
21087	NC_015850	CG	4	8	1138613	1138620	0 %	0 %	50 %	50 %	340781875
21088	NC_015850	CGG	2	6	1138649	1138654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781875
21089	NC_015850	GCGCC	2	10	1138680	1138689	0 %	0 %	40 %	60 %	340781875
21090	NC_015850	CTT	2	6	1138701	1138706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781875
21091	NC_015850	GC	3	6	1138782	1138787	0 %	0 %	50 %	50 %	340781875
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21096	NC_015850	CGGC	2	8	1138988	1138995	0 %	0 %	50 %	50 %	340781875
21097	NC_015850	CG	3	6	1139009	1139014	0 %	0 %	50 %	50 %	340781875
21098	NC_015850	TGG	2	6	1139030	1139035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781875
21099	NC_015850	GCT	2	6	1139037	1139042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781875
21100	NC_015850	GAC	2	6	1139053	1139058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781875
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21102	NC_015850	CGG	2	6	1139105	1139110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781875
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21105	NC_015850	ACG	2	6	1139198	1139203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781875
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21107	NC_015850	GTGGA	2	10	1139341	1139350	20 %	20 %	60 %	0 %	340781875
21108	NC_015850	CG	3	6	1139371	1139376	0 %	0 %	50 %	50 %	340781875
21109	NC_015850	GGGCC	2	10	1139410	1139419	0 %	0 %	60 %	40 %	340781875
21110	NC_015850	CTG	2	6	1139452	1139457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781875
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21113	NC_015850	GTATCG	2	12	1139501	1139512	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340781875
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21115	NC_015850	CGC	2	6	1139569	1139574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781875
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21462	NC_015850	GTCG	2	8	1162070	1162077	0 %	25 %	50 %	25 %	340781899
21463	NC_015850	AGCG	2	8	1162078	1162085	25 %	0 %	50 %	25 %	340781899
21464	NC_015850	GTC	2	6	1162138	1162143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781899
21465	NC_015850	GAC	2	6	1162196	1162201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781899
21466	NC_015850	TGA	2	6	1162217	1162222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781899
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21493	NC_015850	A	6	6	1163868	1163873	100 %	0 %	0 %	0 %	340781901
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21495	NC_015850	TGG	2	6	1163964	1163969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781901
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21499	NC_015850	GCGG	2	8	1165251	1165258	0 %	0 %	75 %	25 %	340781903
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