MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_015850	GGT	2	6	854563	854568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781594
16003	NC_015850	GTC	3	9	854604	854612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781594
16004	NC_015850	GCGCGA	2	12	854692	854703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340781594
16005	NC_015850	GGT	2	6	854715	854720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781595
16006	NC_015850	CGT	2	6	854733	854738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781595
16007	NC_015850	TCGG	2	8	854824	854831	0 %	25 %	50 %	25 %	340781595
16008	NC_015850	TGG	3	9	854948	854956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781595
16009	NC_015850	GCG	2	6	855109	855114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781595
16010	NC_015850	GGCC	2	8	855120	855127	0 %	0 %	50 %	50 %	340781595
16011	NC_015850	GCG	2	6	855212	855217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781595
16012	NC_015850	GCC	2	6	855240	855245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781595
16013	NC_015850	ATG	2	6	855250	855255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781595
16014	NC_015850	CGGC	2	8	855257	855264	0 %	0 %	50 %	50 %	340781595
16015	NC_015850	GCG	2	6	855306	855311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781595
16016	NC_015850	GC	3	6	855345	855350	0 %	0 %	50 %	50 %	340781595
16017	NC_015850	TTCCG	2	10	855364	855373	0 %	40 %	20 %	40 %	340781595
16018	NC_015850	GGA	2	6	855384	855389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781595
16019	NC_015850	GGA	2	6	855396	855401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781595
16020	NC_015850	GCG	2	6	855408	855413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781595
16021	NC_015850	CCT	2	6	855441	855446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781595
16022	NC_015850	GTG	2	6	855507	855512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781596
16023	NC_015850	GCC	2	6	855552	855557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781596
16024	NC_015850	CG	3	6	855597	855602	0 %	0 %	50 %	50 %	340781596
16025	NC_015850	GCG	3	9	855600	855608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781596
16026	NC_015850	CTG	2	6	855654	855659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781596
16027	NC_015850	CGGG	2	8	855729	855736	0 %	0 %	75 %	25 %	340781596
16028	NC_015850	TGG	2	6	855748	855753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781596
16029	NC_015850	GGCCGA	2	12	855776	855787	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340781596
16030	NC_015850	GCC	2	6	855804	855809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781596
16031	NC_015850	GC	4	8	855845	855852	0 %	0 %	50 %	50 %	340781596
16032	NC_015850	TCA	2	6	855955	855960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781596
16033	NC_015850	CCGTG	2	10	856025	856034	0 %	20 %	40 %	40 %	340781596
16034	NC_015850	GGC	2	6	856040	856045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781596
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16039	NC_015850	CGG	2	6	856276	856281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781596
16040	NC_015850	GGGAG	2	10	856357	856366	20 %	0 %	80 %	0 %	340781596
16041	NC_015850	GCC	3	9	856377	856385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781596
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16045	NC_015850	CGC	2	6	856615	856620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781597
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16047	NC_015850	CACCTT	2	12	856726	856737	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	340781597
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16050	NC_015850	TAT	2	6	856805	856810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781597
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16052	NC_015850	CGC	2	6	856845	856850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781597
16053	NC_015850	CAT	2	6	856861	856866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781597
16054	NC_015850	CTT	2	6	857023	857028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781597
16055	NC_015850	CGG	2	6	857059	857064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781597
16056	NC_015850	TGG	2	6	857067	857072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781597
16057	NC_015850	CGC	2	6	857096	857101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781597
16058	NC_015850	CGA	2	6	857173	857178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781597
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16061	NC_015850	GC	3	6	857365	857370	0 %	0 %	50 %	50 %	340781597
16062	NC_015850	GCAG	2	8	857377	857384	25 %	0 %	50 %	25 %	340781597
16063	NC_015850	CTA	2	6	857404	857409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781597
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16068	NC_015850	CGCA	2	8	857650	857657	25 %	0 %	25 %	50 %	340781598
16069	NC_015850	AGC	2	6	857658	857663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781598
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16100	NC_015850	CGA	3	9	858654	858662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781598
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16108	NC_015850	A	6	6	858873	858878	100 %	0 %	0 %	0 %	340781599
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16235	NC_015850	GGCT	2	8	864739	864746	0 %	25 %	50 %	25 %	340781602
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16478	NC_015850	GCA	2	6	876605	876610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781614
16479	NC_015850	CCA	2	6	876622	876627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781614
16480	NC_015850	TCG	2	6	876679	876684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781614
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16482	NC_015850	AG	3	6	876715	876720	50 %	0 %	50 %	0 %	340781614
16483	NC_015850	GC	3	6	876747	876752	0 %	0 %	50 %	50 %	340781614
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