MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015850	GCC	2	6	805785	805790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781540
15002	NC_015850	A	7	7	805801	805807	100 %	0 %	0 %	0 %	340781540
15003	NC_015850	GCT	2	6	805821	805826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781540
15004	NC_015850	GCCC	2	8	805833	805840	0 %	0 %	25 %	75 %	340781540
15005	NC_015850	ATC	2	6	805855	805860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781540
15006	NC_015850	CCA	2	6	805896	805901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781540
15007	NC_015850	TGC	2	6	805953	805958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781540
15008	NC_015850	GGC	2	6	805968	805973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781540
15009	NC_015850	GGC	2	6	805983	805988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781540
15010	NC_015850	AGC	2	6	806006	806011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781540
15011	NC_015850	GGC	2	6	806025	806030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781540
15012	NC_015850	GCC	2	6	806035	806040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781540
15013	NC_015850	GCA	2	6	806046	806051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781540
15014	NC_015850	TAT	2	6	806140	806145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781540
15015	NC_015850	GGC	2	6	806166	806171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781540
15016	NC_015850	GATA	2	8	806332	806339	50 %	25 %	25 %	0 %	340781540
15017	NC_015850	CGGG	2	8	806532	806539	0 %	0 %	75 %	25 %	340781541
15018	NC_015850	GAA	2	6	806643	806648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781541
15019	NC_015850	TCC	3	9	806663	806671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781541
15020	NC_015850	TCCA	2	8	806762	806769	25 %	25 %	0 %	50 %	340781541
15021	NC_015850	CGA	2	6	808617	808622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781543
15022	NC_015850	TTGC	2	8	808699	808706	0 %	50 %	25 %	25 %	340781543
15023	NC_015850	ACTC	2	8	808755	808762	25 %	25 %	0 %	50 %	340781543
15024	NC_015850	AGG	2	6	808793	808798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781543
15025	NC_015850	AGCG	2	8	808842	808849	25 %	0 %	50 %	25 %	340781543
15026	NC_015850	ACC	2	6	808864	808869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781543
15027	NC_015850	CAT	2	6	809031	809036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781543
15028	NC_015850	T	6	6	809036	809041	0 %	100 %	0 %	0 %	340781543
15029	NC_015850	GC	3	6	809064	809069	0 %	0 %	50 %	50 %	340781543
15030	NC_015850	CGC	2	6	809093	809098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781543
15031	NC_015850	ACC	2	6	809122	809127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781543
15032	NC_015850	GCG	2	6	809179	809184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781543
15033	NC_015850	ATT	2	6	809218	809223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781543
15034	NC_015850	GAG	2	6	809281	809286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781543
15035	NC_015850	CAT	2	6	809359	809364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781543
15036	NC_015850	GAG	2	6	809380	809385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781543
15037	NC_015850	TTGG	2	8	809479	809486	0 %	50 %	50 %	0 %	340781543
15038	NC_015850	G	6	6	809524	809529	0 %	0 %	100 %	0 %	340781543
15039	NC_015850	CAT	2	6	809539	809544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781543
15040	NC_015850	GC	3	6	809614	809619	0 %	0 %	50 %	50 %	340781543
15041	NC_015850	CGA	2	6	809658	809663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781543
15042	NC_015850	GCA	2	6	809739	809744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781543
15043	NC_015850	CGC	2	6	809805	809810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781543
15044	NC_015850	CGGC	2	8	809836	809843	0 %	0 %	50 %	50 %	340781543
15045	NC_015850	GC	3	6	810040	810045	0 %	0 %	50 %	50 %	340781544
15046	NC_015850	CGG	2	6	810073	810078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781544
15047	NC_015850	GC	3	6	810160	810165	0 %	0 %	50 %	50 %	340781544
15048	NC_015850	CAT	2	6	810189	810194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781544
15049	NC_015850	GTC	2	6	810365	810370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15050	NC_015850	GC	3	6	810378	810383	0 %	0 %	50 %	50 %	340781545
15051	NC_015850	GCC	2	6	810396	810401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781545
15052	NC_015850	CAG	2	6	810446	810451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15053	NC_015850	GCGCCT	2	12	810490	810501	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340781545
15054	NC_015850	CGG	2	6	810519	810524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781545
15055	NC_015850	TTC	2	6	810584	810589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781545
15056	NC_015850	TGCGG	2	10	810616	810625	0 %	20 %	60 %	20 %	340781545
15057	NC_015850	CACC	2	8	810643	810650	25 %	0 %	0 %	75 %	340781545
15058	NC_015850	AGAC	2	8	810695	810702	50 %	0 %	25 %	25 %	340781545
15059	NC_015850	CTC	2	6	810716	810721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781545
15060	NC_015850	GTC	2	6	810722	810727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15061	NC_015850	TCG	2	6	810729	810734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15062	NC_015850	CAG	2	6	810806	810811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15063	NC_015850	CAG	2	6	810827	810832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15064	NC_015850	TTC	2	6	810833	810838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781545
15065	NC_015850	CGA	2	6	810894	810899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15066	NC_015850	CGG	2	6	810961	810966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781545
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15068	NC_015850	G	6	6	811120	811125	0 %	0 %	100 %	0 %	340781545
15069	NC_015850	CCGC	2	8	811132	811139	0 %	0 %	25 %	75 %	340781545
15070	NC_015850	A	6	6	811188	811193	100 %	0 %	0 %	0 %	340781545
15071	NC_015850	GAA	2	6	811214	811219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781545
15072	NC_015850	GCC	2	6	811226	811231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781545
15073	NC_015850	TGA	2	6	811287	811292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781545
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15077	NC_015850	GGT	2	6	811480	811485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781545
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15079	NC_015850	CGG	3	9	811582	811590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781545
15080	NC_015850	CGC	2	6	811591	811596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781545
15081	NC_015850	TCG	2	6	811617	811622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15082	NC_015850	T	7	7	811648	811654	0 %	100 %	0 %	0 %	340781545
15083	NC_015850	GC	3	6	811681	811686	0 %	0 %	50 %	50 %	340781545
15084	NC_015850	CCA	2	6	811708	811713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781545
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15086	NC_015850	GC	3	6	811827	811832	0 %	0 %	50 %	50 %	340781545
15087	NC_015850	CGT	2	6	811906	811911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15088	NC_015850	GC	3	6	811928	811933	0 %	0 %	50 %	50 %	340781545
15089	NC_015850	CGA	2	6	812014	812019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15090	NC_015850	CTG	2	6	812132	812137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781545
15091	NC_015850	CG	3	6	812157	812162	0 %	0 %	50 %	50 %	340781545
15092	NC_015850	TTG	2	6	812166	812171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781545
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15094	NC_015850	TGA	2	6	812242	812247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781545
15095	NC_015850	GCCGGC	2	12	812264	812275	0 %	0 %	50 %	50 %	340781545
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15101	NC_015850	GACA	2	8	812464	812471	50 %	0 %	25 %	25 %	340781546
15102	NC_015850	AGA	2	6	812562	812567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781546
15103	NC_015850	GAAC	2	8	812568	812575	50 %	0 %	25 %	25 %	340781546
15104	NC_015850	CGG	2	6	812592	812597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781546
15105	NC_015850	CTG	2	6	812609	812614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781546
15106	NC_015850	GAT	2	6	812626	812631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781546
15107	NC_015850	AGC	2	6	812636	812641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781546
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15109	NC_015850	GA	3	6	812727	812732	50 %	0 %	50 %	0 %	340781546
15110	NC_015850	TGA	2	6	812754	812759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781546
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15113	NC_015850	GGT	2	6	812838	812843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781546
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15120	NC_015850	TGA	2	6	813105	813110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781546
15121	NC_015850	GCA	2	6	813183	813188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781546
15122	NC_015850	TGC	2	6	813286	813291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781547
15123	NC_015850	GAC	2	6	813318	813323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781547
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15132	NC_015850	GTC	2	6	813570	813575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781547
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15134	NC_015850	TGC	2	6	813611	813616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781547
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15151	NC_015850	GCG	2	6	814678	814683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781548
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15226	NC_015850	GC	3	6	817992	817997	0 %	0 %	50 %	50 %	340781552
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15231	NC_015850	GGC	2	6	818060	818065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781552
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15233	NC_015850	CGA	2	6	818487	818492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781553
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15240	NC_015850	CGC	2	6	818802	818807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781554
15241	NC_015850	AGA	3	9	818855	818863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781554
15242	NC_015850	GAGC	2	8	818906	818913	25 %	0 %	50 %	25 %	340781554
15243	NC_015850	AAG	2	6	818985	818990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781554
15244	NC_015850	ATC	2	6	818997	819002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781554
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15269	NC_015850	GCG	2	6	819804	819809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781554
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15476	NC_015850	CGG	2	6	829804	829809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781567
15477	NC_015850	CTG	2	6	829857	829862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781567
15478	NC_015850	GCT	2	6	829916	829921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781567
15479	NC_015850	GTC	2	6	830010	830015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781567
15480	NC_015850	CGG	2	6	830026	830031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781567
15481	NC_015850	CCT	2	6	830080	830085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781567
15482	NC_015850	G	6	6	830119	830124	0 %	0 %	100 %	0 %	340781567
15483	NC_015850	TCG	2	6	830128	830133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781567
15484	NC_015850	GGGT	2	8	830164	830171	0 %	25 %	75 %	0 %	340781567
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15490	NC_015850	GGC	2	6	830465	830470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781567
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15492	NC_015850	GAC	2	6	830570	830575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781568
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15499	NC_015850	CGG	2	6	830744	830749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781568
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