MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_015850	GCC	2	6	712815	712820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781454
13503	NC_015850	CGT	2	6	712889	712894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781454
13504	NC_015850	ATG	2	6	712957	712962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781454
13505	NC_015850	GC	3	6	712972	712977	0 %	0 %	50 %	50 %	340781454
13506	NC_015850	GCGG	2	8	712991	712998	0 %	0 %	75 %	25 %	340781454
13507	NC_015850	TCG	2	6	713002	713007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781454
13508	NC_015850	CGCGC	2	10	713066	713075	0 %	0 %	40 %	60 %	340781454
13509	NC_015850	TGA	2	6	713084	713089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781454
13510	NC_015850	GTGG	2	8	713097	713104	0 %	25 %	75 %	0 %	340781454
13511	NC_015850	GAC	2	6	713205	713210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781454
13512	NC_015850	CCG	2	6	713338	713343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781454
13513	NC_015850	TGG	2	6	713356	713361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781454
13514	NC_015850	CTCGGC	2	12	713370	713381	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340781454
13515	NC_015850	GAA	2	6	713402	713407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781454
13516	NC_015850	TGGC	2	8	713413	713420	0 %	25 %	50 %	25 %	340781454
13517	NC_015850	GC	3	6	713419	713424	0 %	0 %	50 %	50 %	340781454
13518	NC_015850	GAGC	2	8	713563	713570	25 %	0 %	50 %	25 %	340781455
13519	NC_015850	GGC	2	6	713581	713586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781455
13520	NC_015850	CGC	2	6	713614	713619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781455
13521	NC_015850	GGC	2	6	713626	713631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781455
13522	NC_015850	GCCTGG	2	12	713658	713669	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340781455
13523	NC_015850	GGA	2	6	713749	713754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781455
13524	NC_015850	GAA	2	6	713771	713776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781455
13525	NC_015850	CGC	2	6	713791	713796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781455
13526	NC_015850	AGGA	2	8	713805	713812	50 %	0 %	50 %	0 %	340781455
13527	NC_015850	CGAGAT	2	12	713857	713868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340781455
13528	NC_015850	GGC	2	6	713881	713886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781455
13529	NC_015850	CAT	3	9	713896	713904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781455
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13531	NC_015850	CG	3	6	713946	713951	0 %	0 %	50 %	50 %	340781455
13532	NC_015850	CGC	2	6	714031	714036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781455
13533	NC_015850	TCG	2	6	714173	714178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781456
13534	NC_015850	GTGG	2	8	714202	714209	0 %	25 %	75 %	0 %	340781456
13535	NC_015850	TCA	2	6	714218	714223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781456
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13537	NC_015850	GGCG	2	8	714390	714397	0 %	0 %	75 %	25 %	340781456
13538	NC_015850	GC	3	6	714406	714411	0 %	0 %	50 %	50 %	340781456
13539	NC_015850	TGG	2	6	714440	714445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781456
13540	NC_015850	GGC	2	6	714540	714545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781456
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13543	NC_015850	CAT	2	6	714705	714710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781456
13544	NC_015850	GGT	2	6	714738	714743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781456
13545	NC_015850	CCTC	2	8	714752	714759	0 %	25 %	0 %	75 %	340781456
13546	NC_015850	TCTGGC	2	12	714831	714842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781456
13547	NC_015850	TGG	3	9	714845	714853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781456
13548	NC_015850	GC	3	6	714880	714885	0 %	0 %	50 %	50 %	340781456
13549	NC_015850	AGC	2	6	714908	714913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781456
13550	NC_015850	TGG	4	12	714932	714943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781456
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13553	NC_015850	GTG	2	6	715119	715124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781457
13554	NC_015850	TTG	2	6	715176	715181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781457
13555	NC_015850	CGTGGT	2	12	715211	715222	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340781457
13556	NC_015850	C	7	7	715231	715237	0 %	0 %	0 %	100 %	340781457
13557	NC_015850	CGC	2	6	715334	715339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781457
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13560	NC_015850	GC	3	6	715548	715553	0 %	0 %	50 %	50 %	340781457
13561	NC_015850	CCT	2	6	715567	715572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781457
13562	NC_015850	GAC	2	6	715595	715600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781457
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13565	NC_015850	GCA	2	6	716015	716020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781458
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13569	NC_015850	GACCA	2	10	716243	716252	40 %	0 %	20 %	40 %	340781458
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13589	NC_015850	CTT	2	6	717124	717129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781459
13590	NC_015850	GAT	2	6	717130	717135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781459
13591	NC_015850	AAG	2	6	717143	717148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781459
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13598	NC_015850	GCC	2	6	717713	717718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781459
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13601	NC_015850	CAG	2	6	717793	717798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781459
13602	NC_015850	GGT	2	6	717799	717804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781459
13603	NC_015850	TTC	2	6	717824	717829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781459
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13606	NC_015850	GGA	2	6	718036	718041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781459
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13609	NC_015850	AGA	2	6	718340	718345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781459
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13617	NC_015850	GCGG	2	8	718982	718989	0 %	0 %	75 %	25 %	340781460
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