MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015850	AG	3	6	658350	658355	50 %	0 %	50 %	0 %	340781404
12502	NC_015850	GCCATC	2	12	658396	658407	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340781404
12503	NC_015850	GCC	2	6	658455	658460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781404
12504	NC_015850	CCA	2	6	658529	658534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781404
12505	NC_015850	GGTT	2	8	658546	658553	0 %	50 %	50 %	0 %	340781404
12506	NC_015850	CGG	2	6	658619	658624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781404
12507	NC_015850	GTG	2	6	658633	658638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781404
12508	NC_015850	TGG	2	6	658772	658777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781404
12509	NC_015850	ACC	2	6	658786	658791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781404
12510	NC_015850	TCA	2	6	658799	658804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781404
12511	NC_015850	CGT	2	6	658840	658845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781404
12512	NC_015850	TC	3	6	658914	658919	0 %	50 %	0 %	50 %	340781404
12513	NC_015850	CTCG	2	8	658920	658927	0 %	25 %	25 %	50 %	340781404
12514	NC_015850	GAG	2	6	659035	659040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781404
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12516	NC_015850	GGC	2	6	659122	659127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781404
12517	NC_015850	GAG	2	6	659254	659259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781404
12518	NC_015850	TCA	2	6	659571	659576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781405
12519	NC_015850	CAT	2	6	659602	659607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781405
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12521	NC_015850	GC	3	6	659621	659626	0 %	0 %	50 %	50 %	340781405
12522	NC_015850	GGC	2	6	659662	659667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781405
12523	NC_015850	GGT	2	6	659668	659673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781405
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12531	NC_015850	CGA	2	6	659914	659919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781405
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12533	NC_015850	GCGTT	2	10	660066	660075	0 %	40 %	40 %	20 %	340781405
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12536	NC_015850	GC	3	6	660190	660195	0 %	0 %	50 %	50 %	340781405
12537	NC_015850	TGC	2	6	660216	660221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781405
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12539	NC_015850	GCGG	2	8	660322	660329	0 %	0 %	75 %	25 %	340781405
12540	NC_015850	GCG	2	6	660332	660337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781405
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12543	NC_015850	CTGG	2	8	660800	660807	0 %	25 %	50 %	25 %	340781406
12544	NC_015850	CGC	2	6	660810	660815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781406
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12548	NC_015850	GGCG	2	8	661113	661120	0 %	0 %	75 %	25 %	340781406
12549	NC_015850	A	6	6	661208	661213	100 %	0 %	0 %	0 %	340781406
12550	NC_015850	TAT	2	6	661225	661230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781406
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12553	NC_015850	TGC	2	6	661373	661378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781406
12554	NC_015850	GGCCGC	2	12	661391	661402	0 %	0 %	50 %	50 %	340781406
12555	NC_015850	GCGG	2	8	661470	661477	0 %	0 %	75 %	25 %	340781406
12556	NC_015850	CCT	2	6	661562	661567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781406
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12560	NC_015850	CGG	2	6	661673	661678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781406
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12602	NC_015850	CTG	2	6	663332	663337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781409
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12604	NC_015850	TCC	2	6	663456	663461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781409
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12612	NC_015850	GGC	2	6	663784	663789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781409
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12620	NC_015850	CCG	2	6	664276	664281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781409
12621	NC_015850	TCC	2	6	664299	664304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781409
12622	NC_015850	GCT	2	6	664340	664345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781409
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12727	NC_015850	GTG	3	9	670252	670260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781416
12728	NC_015850	GAGGAA	2	12	670360	670371	50 %	0 %	50 %	0 %	340781416
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12730	NC_015850	GC	3	6	670441	670446	0 %	0 %	50 %	50 %	340781416
12731	NC_015850	CGT	2	6	670462	670467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781416
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12733	NC_015850	GGC	2	6	670532	670537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781416
12734	NC_015850	GTGAGG	2	12	670544	670555	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	340781416
12735	NC_015850	CGG	2	6	670571	670576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781416
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12977	NC_015850	GCT	2	6	685058	685063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781429
12978	NC_015850	CGC	2	6	685169	685174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781429
12979	NC_015850	GCG	2	6	685197	685202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781429
12980	NC_015850	CCCGT	2	10	685207	685216	0 %	20 %	20 %	60 %	340781429
12981	NC_015850	TTC	2	6	685223	685228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781429
12982	NC_015850	AGAA	2	8	685236	685243	75 %	0 %	25 %	0 %	340781429
12983	NC_015850	TGG	2	6	685257	685262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781429
12984	NC_015850	GAT	2	6	685301	685306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781429
12985	NC_015850	GGGC	2	8	685378	685385	0 %	0 %	75 %	25 %	340781429
12986	NC_015850	CCG	2	6	685390	685395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781429
12987	NC_015850	GC	3	6	685467	685472	0 %	0 %	50 %	50 %	340781430
12988	NC_015850	CCG	2	6	685525	685530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781430
12989	NC_015850	CGCCA	2	10	685621	685630	20 %	0 %	20 %	60 %	340781430
12990	NC_015850	ATG	2	6	685640	685645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781430
12991	NC_015850	GCC	2	6	685650	685655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781430
12992	NC_015850	ATG	2	6	685682	685687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781430
12993	NC_015850	GCG	2	6	685696	685701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781430
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12995	NC_015850	CCG	2	6	685724	685729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781430
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12997	NC_015850	GTG	2	6	685769	685774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781430
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12999	NC_015850	GGCTCC	2	12	685802	685813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340781430
13000	NC_015850	TCG	2	6	685841	685846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781430

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