MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015850	GGA	2	6	582424	582429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781316
11002	NC_015850	CGT	2	6	582439	582444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781316
11003	NC_015850	GCC	2	6	582488	582493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781316
11004	NC_015850	GC	4	8	582539	582546	0 %	0 %	50 %	50 %	340781316
11005	NC_015850	GC	3	6	582555	582560	0 %	0 %	50 %	50 %	340781316
11006	NC_015850	GGC	2	6	582688	582693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781316
11007	NC_015850	CTG	2	6	582695	582700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781316
11008	NC_015850	GCG	2	6	582745	582750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781317
11009	NC_015850	GC	3	6	582775	582780	0 %	0 %	50 %	50 %	340781317
11010	NC_015850	GGC	2	6	582870	582875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781317
11011	NC_015850	GCG	2	6	582882	582887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781317
11012	NC_015850	CGATGC	2	12	582894	582905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340781317
11013	NC_015850	GAC	2	6	583030	583035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781317
11014	NC_015850	CGT	2	6	583043	583048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781317
11015	NC_015850	GCA	2	6	583050	583055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781317
11016	NC_015850	TCGG	2	8	583064	583071	0 %	25 %	50 %	25 %	340781317
11017	NC_015850	CCG	2	6	583079	583084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781317
11018	NC_015850	CCGTA	2	10	583131	583140	20 %	20 %	20 %	40 %	340781317
11019	NC_015850	TGG	2	6	583205	583210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781317
11020	NC_015850	CTGCT	2	10	583213	583222	0 %	40 %	20 %	40 %	340781317
11021	NC_015850	CGT	2	6	583245	583250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781317
11022	NC_015850	GCA	2	6	583268	583273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781317
11023	NC_015850	CAAA	2	8	583359	583366	75 %	0 %	0 %	25 %	340781317
11024	NC_015850	GCC	2	6	583406	583411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781317
11025	NC_015850	CGA	2	6	583442	583447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781317
11026	NC_015850	CGC	2	6	583472	583477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781317
11027	NC_015850	CCAC	2	8	583499	583506	25 %	0 %	0 %	75 %	340781317
11028	NC_015850	CAC	3	9	583733	583741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781318
11029	NC_015850	CCG	2	6	583789	583794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781318
11030	NC_015850	CTG	2	6	583841	583846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781318
11031	NC_015850	CTG	2	6	583853	583858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781318
11032	NC_015850	CAC	2	6	583919	583924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781318
11033	NC_015850	TGG	2	6	583929	583934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781318
11034	NC_015850	GCC	2	6	584016	584021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781318
11035	NC_015850	T	6	6	584044	584049	0 %	100 %	0 %	0 %	340781318
11036	NC_015850	GAGCG	2	10	584114	584123	20 %	0 %	60 %	20 %	340781318
11037	NC_015850	TGC	2	6	584125	584130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781318
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11039	NC_015850	GCG	2	6	584232	584237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781318
11040	NC_015850	GCG	2	6	584308	584313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781318
11041	NC_015850	CAC	2	6	584378	584383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781318
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11043	NC_015850	GCC	2	6	584495	584500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781318
11044	NC_015850	CAG	2	6	584633	584638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781318
11045	NC_015850	CAG	2	6	584708	584713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781318
11046	NC_015850	CCA	2	6	584740	584745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781318
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11050	NC_015850	GAC	2	6	584804	584809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781318
11051	NC_015850	GCG	2	6	584814	584819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781318
11052	NC_015850	TCT	2	6	584872	584877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781318
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11054	NC_015850	GAA	2	6	584924	584929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781318
11055	NC_015850	TGC	2	6	584983	584988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781318
11056	NC_015850	TGC	2	6	584992	584997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781318
11057	NC_015850	ACC	2	6	585006	585011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781318
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11059	NC_015850	CG	3	6	585066	585071	0 %	0 %	50 %	50 %	340781318
11060	NC_015850	CCTG	2	8	585075	585082	0 %	25 %	25 %	50 %	340781318
11061	NC_015850	GCCGTG	2	12	585105	585116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340781318
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11064	NC_015850	CCA	2	6	585445	585450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781319
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11068	NC_015850	GC	4	8	585526	585533	0 %	0 %	50 %	50 %	340781319
11069	NC_015850	CAG	2	6	585542	585547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781319
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11091	NC_015850	TCC	2	6	586476	586481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781320
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11100	NC_015850	GCG	2	6	586772	586777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781320
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11102	NC_015850	GTT	2	6	586805	586810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781320
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11106	NC_015850	GGCG	2	8	586888	586895	0 %	0 %	75 %	25 %	340781320
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11110	NC_015850	GCC	2	6	587136	587141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781321
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11114	NC_015850	GCCG	2	8	587271	587278	0 %	0 %	50 %	50 %	340781321
11115	NC_015850	GAG	2	6	587289	587294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781321
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11227	NC_015850	CGTC	2	8	593265	593272	0 %	25 %	25 %	50 %	340781328
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11354	NC_015850	GCGGT	2	10	600500	600509	0 %	20 %	60 %	20 %	340781337
11355	NC_015850	TCG	2	6	600602	600607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781337
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11476	NC_015850	GAC	2	6	605986	605991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781340
11477	NC_015850	ATGC	2	8	605995	606002	25 %	25 %	25 %	25 %	340781340
11478	NC_015850	CAG	2	6	606034	606039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781340
11479	NC_015850	GGC	2	6	606046	606051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781340
11480	NC_015850	TGG	2	6	606063	606068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781340
11481	NC_015850	CGA	2	6	606153	606158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781340
11482	NC_015850	CATCGA	2	12	606270	606281	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340781340
11483	NC_015850	GAA	2	6	606372	606377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781341
11484	NC_015850	GTATCG	2	12	606391	606402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340781341
11485	NC_015850	GGTCCT	2	12	606421	606432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781341
11486	NC_015850	GCG	2	6	606592	606597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781341
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11488	NC_015850	TC	3	6	606684	606689	0 %	50 %	0 %	50 %	340781341
11489	NC_015850	GTG	3	9	606762	606770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781341
11490	NC_015850	TCG	2	6	606856	606861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781341
11491	NC_015850	GC	3	6	606896	606901	0 %	0 %	50 %	50 %	340781341
11492	NC_015850	ACCAAG	2	12	606963	606974	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	340781341
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11495	NC_015850	TCA	2	6	607144	607149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781341
11496	NC_015850	AAC	2	6	607155	607160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781341
11497	NC_015850	CAT	2	6	607196	607201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781341
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