MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015850	TGG	2	6	552382	552387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
10502	NC_015850	CG	4	8	552454	552461	0 %	0 %	50 %	50 %	340781278
10503	NC_015850	GAGGTG	2	12	552468	552479	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	340781278
10504	NC_015850	GGC	2	6	552552	552557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
10505	NC_015850	GC	3	6	552632	552637	0 %	0 %	50 %	50 %	340781279
10506	NC_015850	TGC	2	6	552768	552773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781279
10507	NC_015850	GCG	2	6	552778	552783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
10508	NC_015850	GCT	2	6	552858	552863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781279
10509	NC_015850	GGC	2	6	552864	552869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
10510	NC_015850	CTT	2	6	552915	552920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781279
10511	NC_015850	GCTG	2	8	552935	552942	0 %	25 %	50 %	25 %	340781279
10512	NC_015850	GGGCCC	2	12	552974	552985	0 %	0 %	50 %	50 %	340781279
10513	NC_015850	CGG	2	6	553044	553049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
10514	NC_015850	GCCTGG	2	12	553114	553125	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340781279
10515	NC_015850	CG	3	6	553144	553149	0 %	0 %	50 %	50 %	340781279
10516	NC_015850	GGC	2	6	553155	553160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
10517	NC_015850	TGC	2	6	553172	553177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781279
10518	NC_015850	GCG	2	6	553234	553239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
10519	NC_015850	CTC	2	6	553252	553257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781279
10520	NC_015850	CGC	2	6	553343	553348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781279
10521	NC_015850	CACGC	2	10	553450	553459	20 %	0 %	20 %	60 %	340781279
10522	NC_015850	GCCA	2	8	553480	553487	25 %	0 %	25 %	50 %	340781279
10523	NC_015850	TAC	2	6	553495	553500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781279
10524	NC_015850	GCC	2	6	553504	553509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781279
10525	NC_015850	CGCTG	2	10	553532	553541	0 %	20 %	40 %	40 %	340781279
10526	NC_015850	AGC	2	6	553550	553555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781279
10527	NC_015850	GTG	2	6	553741	553746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781279
10528	NC_015850	CTG	2	6	553762	553767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781279
10529	NC_015850	GGC	2	6	553827	553832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
10530	NC_015850	CCA	2	6	553871	553876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781279
10531	NC_015850	CCG	2	6	553889	553894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781279
10532	NC_015850	TCG	2	6	553937	553942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781279
10533	NC_015850	ACC	2	6	553981	553986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781279
10534	NC_015850	CTGGCG	2	12	554038	554049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340781279
10535	NC_015850	TGG	2	6	554050	554055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781279
10536	NC_015850	TTGC	2	8	554505	554512	0 %	50 %	25 %	25 %	340781280
10537	NC_015850	TGG	2	6	554571	554576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781280
10538	NC_015850	CCCAGG	2	12	554662	554673	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340781280
10539	NC_015850	AGC	2	6	554711	554716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781280
10540	NC_015850	GGA	2	6	554811	554816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781280
10541	NC_015850	CGA	2	6	554822	554827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781280
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10544	NC_015850	GCC	2	6	554871	554876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781280
10545	NC_015850	GGC	2	6	554940	554945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781280
10546	NC_015850	CTG	2	6	554991	554996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781280
10547	NC_015850	GC	3	6	555029	555034	0 %	0 %	50 %	50 %	340781280
10548	NC_015850	GGC	2	6	555044	555049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781280
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10550	NC_015850	CCA	2	6	555100	555105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781280
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10552	NC_015850	CCT	2	6	555119	555124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781280
10553	NC_015850	GGA	2	6	555125	555130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781280
10554	NC_015850	TGG	2	6	555193	555198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781280
10555	NC_015850	GCT	2	6	555242	555247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781280
10556	NC_015850	GCTG	2	8	555289	555296	0 %	25 %	50 %	25 %	340781280
10557	NC_015850	GCCG	2	8	555333	555340	0 %	0 %	50 %	50 %	340781280
10558	NC_015850	CTG	2	6	555375	555380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781280
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10560	NC_015850	TTAC	2	8	555813	555820	25 %	50 %	0 %	25 %	340781281
10561	NC_015850	TGA	2	6	555847	555852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781281
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10572	NC_015850	GAC	2	6	556551	556556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781281
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10585	NC_015850	CAA	2	6	557272	557277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781281
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10592	NC_015850	TAA	2	6	557530	557535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340781282
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10598	NC_015850	A	7	7	557939	557945	100 %	0 %	0 %	0 %	340781282
10599	NC_015850	GTTCTC	2	12	558354	558365	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340781283
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10601	NC_015850	GC	4	8	558834	558841	0 %	0 %	50 %	50 %	340781284
10602	NC_015850	AG	3	6	558854	558859	50 %	0 %	50 %	0 %	340781284
10603	NC_015850	GA	3	6	558901	558906	50 %	0 %	50 %	0 %	340781284
10604	NC_015850	TCCA	2	8	558912	558919	25 %	25 %	0 %	50 %	340781284
10605	NC_015850	CCG	2	6	558934	558939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781284
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10607	NC_015850	ACC	2	6	558975	558980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781284
10608	NC_015850	CAG	3	9	559041	559049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781284
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10614	NC_015850	T	6	6	559626	559631	0 %	100 %	0 %	0 %	340781285
10615	NC_015850	CAT	2	6	559652	559657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781285
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10617	NC_015850	TGC	2	6	559727	559732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781285
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