MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015850	TCG	2	6	527164	527169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781258
10003	NC_015850	AGC	2	6	527266	527271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781258
10004	NC_015850	GCT	2	6	527288	527293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781258
10005	NC_015850	GGT	2	6	527336	527341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781258
10006	NC_015850	CGG	2	6	527359	527364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781258
10007	NC_015850	AGA	2	6	527366	527371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781258
10008	NC_015850	ATGCG	2	10	527410	527419	20 %	20 %	40 %	20 %	340781258
10009	NC_015850	TTG	2	6	527434	527439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781258
10010	NC_015850	TGGT	2	8	527503	527510	0 %	50 %	50 %	0 %	340781258
10011	NC_015850	CAG	2	6	527535	527540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781258
10012	NC_015850	CGC	2	6	527585	527590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781258
10013	NC_015850	GC	4	8	527589	527596	0 %	0 %	50 %	50 %	340781258
10014	NC_015850	ACT	2	6	527597	527602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781258
10015	NC_015850	CTG	2	6	527785	527790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781259
10016	NC_015850	ACA	2	6	527861	527866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781259
10017	NC_015850	ATT	2	6	527917	527922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781259
10018	NC_015850	GAC	2	6	528025	528030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781259
10019	NC_015850	TGG	2	6	528152	528157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781259
10020	NC_015850	GTT	2	6	528219	528224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781259
10021	NC_015850	TGG	2	6	528315	528320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781259
10022	NC_015850	TCCG	2	8	528322	528329	0 %	25 %	25 %	50 %	340781259
10023	NC_015850	GGT	2	6	528348	528353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781259
10024	NC_015850	GGT	2	6	528363	528368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781259
10025	NC_015850	AGT	2	6	528444	528449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781259
10026	NC_015850	CAG	2	6	528592	528597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781259
10027	NC_015850	CTG	2	6	528636	528641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781259
10028	NC_015850	GATT	2	8	528701	528708	25 %	50 %	25 %	0 %	340781259
10029	NC_015850	ATG	2	6	528733	528738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781259
10030	NC_015850	GCG	2	6	528914	528919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781259
10031	NC_015850	CAGG	2	8	529029	529036	25 %	0 %	50 %	25 %	340781259
10032	NC_015850	GAAG	2	8	529079	529086	50 %	0 %	50 %	0 %	340781259
10033	NC_015850	ATA	2	6	529118	529123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340781259
10034	NC_015850	GA	4	8	529142	529149	50 %	0 %	50 %	0 %	340781259
10035	NC_015850	A	7	7	529163	529169	100 %	0 %	0 %	0 %	340781259
10036	NC_015850	CGG	2	6	529890	529895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
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10038	NC_015850	CGG	2	6	529955	529960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
10039	NC_015850	CG	3	6	530024	530029	0 %	0 %	50 %	50 %	340781260
10040	NC_015850	GCG	2	6	530061	530066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
10041	NC_015850	CGG	3	9	530084	530092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
10042	NC_015850	TGA	2	6	530093	530098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781260
10043	NC_015850	GGCGC	2	10	530121	530130	0 %	0 %	60 %	40 %	340781260
10044	NC_015850	TGA	2	6	530138	530143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781260
10045	NC_015850	TCG	2	6	530227	530232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781260
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10047	NC_015850	CGCC	2	8	530422	530429	0 %	0 %	25 %	75 %	340781260
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10050	NC_015850	GGC	2	6	530688	530693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
10051	NC_015850	CTG	2	6	530775	530780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781260
10052	NC_015850	CCA	2	6	530798	530803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781260
10053	NC_015850	TA	3	6	530841	530846	50 %	50 %	0 %	0 %	340781260
10054	NC_015850	GCA	2	6	530993	530998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781260
10055	NC_015850	GTG	2	6	531021	531026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781260
10056	NC_015850	GAT	2	6	531030	531035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781260
10057	NC_015850	TCT	2	6	531044	531049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781260
10058	NC_015850	GAG	2	6	531060	531065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781260
10059	NC_015850	CGG	3	9	531089	531097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
10060	NC_015850	CGT	2	6	531128	531133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781260
10061	NC_015850	GCG	2	6	531142	531147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
10062	NC_015850	GAT	2	6	531195	531200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781260
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10065	NC_015850	TGC	2	6	531267	531272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781260
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10069	NC_015850	TCG	2	6	531499	531504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781261
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10071	NC_015850	GCCA	2	8	531565	531572	25 %	0 %	25 %	50 %	340781261
10072	NC_015850	ACC	2	6	531580	531585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781261
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10074	NC_015850	TGC	2	6	531686	531691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781261
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10076	NC_015850	CG	3	6	531719	531724	0 %	0 %	50 %	50 %	340781261
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10085	NC_015850	TCG	2	6	532238	532243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781261
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10088	NC_015850	GAG	2	6	532637	532642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781262
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10090	NC_015850	AAG	2	6	532701	532706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781262
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10093	NC_015850	CAG	2	6	532841	532846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781262
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10096	NC_015850	CGAT	2	8	533124	533131	25 %	25 %	25 %	25 %	340781262
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10101	NC_015850	GCA	2	6	533434	533439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781262
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10104	NC_015850	G	6	6	533495	533500	0 %	0 %	100 %	0 %	340781262
10105	NC_015850	GC	3	6	533625	533630	0 %	0 %	50 %	50 %	340781262
10106	NC_015850	CCGAG	2	10	533645	533654	20 %	0 %	40 %	40 %	340781262
10107	NC_015850	CTG	2	6	533669	533674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781262
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10109	NC_015850	TCG	2	6	533697	533702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781262
10110	NC_015850	ACG	2	6	533703	533708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781262
10111	NC_015850	CGA	2	6	533755	533760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781262
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10113	NC_015850	TAGC	2	8	533832	533839	25 %	25 %	25 %	25 %	340781262
10114	NC_015850	GCG	2	6	533884	533889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781262
10115	NC_015850	A	7	7	533910	533916	100 %	0 %	0 %	0 %	340781262
10116	NC_015850	CAG	2	6	533996	534001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781262
10117	NC_015850	GC	3	6	534024	534029	0 %	0 %	50 %	50 %	340781262
10118	NC_015850	TCC	2	6	534108	534113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781262
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10120	NC_015850	AGCC	2	8	534120	534127	25 %	0 %	25 %	50 %	340781262
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10241	NC_015850	CGA	2	6	540525	540530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781268
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10245	NC_015850	TAC	2	6	540688	540693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781268
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10480	NC_015850	TGG	2	6	551779	551784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
10481	NC_015850	TGA	2	6	551824	551829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781278
10482	NC_015850	ATC	2	6	551880	551885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781278
10483	NC_015850	GTG	2	6	551892	551897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
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