MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 40984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015508	CCG	2	6	624294	624299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715933
11502	NC_015508	AGC	2	6	624395	624400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715933
11503	NC_015508	GAC	2	6	624484	624489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715933
11504	NC_015508	TGC	2	6	624511	624516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715933
11505	NC_015508	GC	3	6	624557	624562	0 %	0 %	50 %	50 %	332715933
11506	NC_015508	TGC	2	6	624618	624623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715933
11507	NC_015508	CGA	2	6	624681	624686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715933
11508	NC_015508	GCC	2	6	624722	624727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715933
11509	NC_015508	CCG	2	6	624729	624734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715933
11510	NC_015508	CACCGT	2	12	624777	624788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332715933
11511	NC_015508	GCA	2	6	624798	624803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715933
11512	NC_015508	CGG	2	6	624859	624864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715933
11513	NC_015508	CGA	2	6	624909	624914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715933
11514	NC_015508	GCAT	2	8	624923	624930	25 %	25 %	25 %	25 %	332715933
11515	NC_015508	GCC	2	6	624962	624967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715934
11516	NC_015508	GCC	2	6	625086	625091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715934
11517	NC_015508	TTC	2	6	625092	625097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715934
11518	NC_015508	AGCGCC	2	12	625209	625220	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	332715934
11519	NC_015508	CGC	2	6	625244	625249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715934
11520	NC_015508	TGA	2	6	625312	625317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715934
11521	NC_015508	GCC	2	6	625322	625327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715934
11522	NC_015508	GC	3	6	625328	625333	0 %	0 %	50 %	50 %	332715934
11523	NC_015508	CG	3	6	625335	625340	0 %	0 %	50 %	50 %	332715934
11524	NC_015508	TCA	2	6	625363	625368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715934
11525	NC_015508	TTC	2	6	625415	625420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715934
11526	NC_015508	TTG	2	6	625461	625466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715934
11527	NC_015508	GCC	2	6	625481	625486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715934
11528	NC_015508	GTCA	2	8	625532	625539	25 %	25 %	25 %	25 %	332715934
11529	NC_015508	ATATCG	2	12	625602	625613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332715934
11530	NC_015508	GAT	2	6	625616	625621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715934
11531	NC_015508	GCG	2	6	625677	625682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715934
11532	NC_015508	TTC	2	6	625704	625709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715934
11533	NC_015508	CG	3	6	626003	626008	0 %	0 %	50 %	50 %	332715935
11534	NC_015508	CTG	2	6	626063	626068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715935
11535	NC_015508	TGC	2	6	626078	626083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715935
11536	NC_015508	CTG	2	6	626090	626095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715935
11537	NC_015508	CGA	2	6	626134	626139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715935
11538	NC_015508	CGG	2	6	626188	626193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715935
11539	NC_015508	ATG	2	6	626196	626201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715935
11540	NC_015508	GGC	2	6	626277	626282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715935
11541	NC_015508	TTC	2	6	626325	626330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715935
11542	NC_015508	CTT	2	6	626369	626374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715935
11543	NC_015508	GTG	2	6	626376	626381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715935
11544	NC_015508	CGC	2	6	626582	626587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715935
11545	NC_015508	CGGG	2	8	626590	626597	0 %	0 %	75 %	25 %	332715935
11546	NC_015508	AGG	2	6	626602	626607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715935
11547	NC_015508	TCA	2	6	626608	626613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715935
11548	NC_015508	GCTC	2	8	626647	626654	0 %	25 %	25 %	50 %	332715935
11549	NC_015508	CCA	2	6	626691	626696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715935
11550	NC_015508	GGCC	2	8	626848	626855	0 %	0 %	50 %	50 %	332715935
11551	NC_015508	ACGGC	2	10	626905	626914	20 %	0 %	40 %	40 %	332715935
11552	NC_015508	GATCG	2	10	626948	626957	20 %	20 %	40 %	20 %	332715935
11553	NC_015508	CGTAAT	2	12	626968	626979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332715935
11554	NC_015508	ATC	2	6	626990	626995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715935
11555	NC_015508	AGCC	3	12	627002	627013	25 %	0 %	25 %	50 %	332715935
11556	NC_015508	CCG	2	6	627042	627047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715935
11557	NC_015508	ATG	2	6	627054	627059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715935
11558	NC_015508	GCC	2	6	627068	627073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715935
11559	NC_015508	TGG	2	6	627076	627081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715935
11560	NC_015508	GGT	2	6	627089	627094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715935
11561	NC_015508	ATG	2	6	627183	627188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715935
11562	NC_015508	TTG	2	6	627201	627206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715935
11563	NC_015508	TTC	2	6	627224	627229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715935
11564	NC_015508	GAC	3	9	627270	627278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715935
11565	NC_015508	GGA	2	6	627621	627626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715936
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11567	NC_015508	CGA	2	6	627710	627715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715936
11568	NC_015508	GCG	2	6	627767	627772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715936
11569	NC_015508	CGCC	2	8	627773	627780	0 %	0 %	25 %	75 %	332715936
11570	NC_015508	CG	3	6	627798	627803	0 %	0 %	50 %	50 %	332715936
11571	NC_015508	GCG	2	6	627806	627811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715936
11572	NC_015508	CGG	2	6	627830	627835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715936
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11576	NC_015508	GCG	2	6	628131	628136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715936
11577	NC_015508	GAT	2	6	628210	628215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715936
11578	NC_015508	CTG	2	6	628237	628242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715936
11579	NC_015508	GAA	2	6	628252	628257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715936
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11581	NC_015508	GCGCG	2	10	628341	628350	0 %	0 %	60 %	40 %	332715936
11582	NC_015508	GCCA	2	8	628357	628364	25 %	0 %	25 %	50 %	332715936
11583	NC_015508	CCGGCG	2	12	628427	628438	0 %	0 %	50 %	50 %	332715936
11584	NC_015508	GCC	3	9	628466	628474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715936
11585	NC_015508	GCAT	2	8	628478	628485	25 %	25 %	25 %	25 %	332715936
11586	NC_015508	GC	3	6	628520	628525	0 %	0 %	50 %	50 %	332715936
11587	NC_015508	GGA	2	6	628605	628610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715936
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11589	NC_015508	GC	3	6	628647	628652	0 %	0 %	50 %	50 %	332715937
11590	NC_015508	TCTGC	2	10	628684	628693	0 %	40 %	20 %	40 %	332715937
11591	NC_015508	GC	3	6	628709	628714	0 %	0 %	50 %	50 %	332715937
11592	NC_015508	CCG	2	6	628721	628726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715937
11593	NC_015508	CGC	2	6	628727	628732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715937
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11598	NC_015508	CGG	2	6	628880	628885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715937
11599	NC_015508	ATC	2	6	628888	628893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715937
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11601	NC_015508	CG	3	6	629058	629063	0 %	0 %	50 %	50 %	332715937
11602	NC_015508	GCC	2	6	629094	629099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715937
11603	NC_015508	GTGCCG	2	12	629142	629153	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332715937
11604	NC_015508	GGC	2	6	629154	629159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715937
11605	NC_015508	GGC	2	6	629201	629206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715937
11606	NC_015508	GCA	2	6	629243	629248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715937
11607	NC_015508	GTC	2	6	629322	629327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715937
11608	NC_015508	AGC	2	6	629423	629428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715937
11609	NC_015508	CGG	2	6	629540	629545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715937
11610	NC_015508	GC	3	6	629593	629598	0 %	0 %	50 %	50 %	332715937
11611	NC_015508	TGA	2	6	629627	629632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715937
11612	NC_015508	CTACAG	2	12	629657	629668	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332715937
11613	NC_015508	CTG	2	6	629763	629768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715937
11614	NC_015508	GGA	2	6	629819	629824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715937
11615	NC_015508	CGC	2	6	629834	629839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715937
11616	NC_015508	GCG	2	6	629868	629873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715937
11617	NC_015508	GCT	2	6	629887	629892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715937
11618	NC_015508	TGC	2	6	630018	630023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715938
11619	NC_015508	GAT	2	6	630037	630042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715938
11620	NC_015508	CTT	2	6	630157	630162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715938
11621	NC_015508	TCG	2	6	630189	630194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715938
11622	NC_015508	GCG	2	6	630195	630200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715938
11623	NC_015508	CGG	2	6	630220	630225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715938
11624	NC_015508	ATTGCG	2	12	630227	630238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332715938
11625	NC_015508	CAT	2	6	630280	630285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715938
11626	NC_015508	ATC	2	6	630287	630292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715938
11627	NC_015508	CTT	2	6	630298	630303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715938
11628	NC_015508	GCC	2	6	630310	630315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715938
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11630	NC_015508	GAA	2	6	630334	630339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715938
11631	NC_015508	CTT	2	6	630385	630390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715938
11632	NC_015508	GCT	2	6	630427	630432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715938
11633	NC_015508	CAT	4	12	630436	630447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715938
11634	NC_015508	GAAG	2	8	630520	630527	50 %	0 %	50 %	0 %	332715938
11635	NC_015508	GATG	2	8	630535	630542	25 %	25 %	50 %	0 %	332715938
11636	NC_015508	TCA	2	6	630552	630557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715938
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11639	NC_015508	GGC	2	6	630671	630676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715938
11640	NC_015508	ACG	2	6	630735	630740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715938
11641	NC_015508	CGG	2	6	630742	630747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715938
11642	NC_015508	CAT	2	6	630763	630768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715938
11643	NC_015508	CGT	2	6	630772	630777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715938
11644	NC_015508	TCG	2	6	630789	630794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715938
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11646	NC_015508	TGC	2	6	630915	630920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715939
11647	NC_015508	TTC	2	6	630923	630928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715939
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11649	NC_015508	ATC	2	6	631094	631099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715939
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11657	NC_015508	ATGG	2	8	631370	631377	25 %	25 %	50 %	0 %	332715939
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11734	NC_015508	CGAG	2	8	635073	635080	25 %	0 %	50 %	25 %	332715943
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11973	NC_015508	CG	3	6	647166	647171	0 %	0 %	50 %	50 %	332715954
11974	NC_015508	CGT	2	6	647283	647288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715955
11975	NC_015508	CAA	2	6	647295	647300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715955
11976	NC_015508	CTG	2	6	647314	647319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715955
11977	NC_015508	ATC	2	6	647332	647337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715955
11978	NC_015508	TCT	2	6	647354	647359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715955
11979	NC_015508	TCG	2	6	647426	647431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715955
11980	NC_015508	CCG	2	6	647447	647452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715955
11981	NC_015508	CGG	2	6	647552	647557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715955
11982	NC_015508	GTG	2	6	647566	647571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715955
11983	NC_015508	ATG	2	6	647596	647601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715955
11984	NC_015508	TGGC	2	8	647630	647637	0 %	25 %	50 %	25 %	332715955
11985	NC_015508	TGTTCA	2	12	647648	647659	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332715955
11986	NC_015508	CAT	2	6	647703	647708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715955
11987	NC_015508	GCT	2	6	647718	647723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715955
11988	NC_015508	TGC	2	6	647741	647746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715955
11989	NC_015508	CGCAGC	2	12	647754	647765	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	332715955
11990	NC_015508	T	6	6	647794	647799	0 %	100 %	0 %	0 %	332715955
11991	NC_015508	GGC	2	6	647838	647843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715955
11992	NC_015508	GCT	2	6	647895	647900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715955
11993	NC_015508	CTT	2	6	647913	647918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715955
11994	NC_015508	CTG	2	6	647920	647925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715955
11995	NC_015508	GTC	2	6	647926	647931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715955
11996	NC_015508	CTT	2	6	647946	647951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715955
11997	NC_015508	CAT	2	6	647964	647969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715955
11998	NC_015508	GGC	3	9	647983	647991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715955
11999	NC_015508	ATG	2	6	648032	648037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715955
12000	NC_015508	CCG	2	6	648065	648070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715955

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