MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 40984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015508	CAT	2	6	549740	549745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715854
10002	NC_015508	CCT	2	6	549836	549841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715854
10003	NC_015508	TCGA	2	8	549867	549874	25 %	25 %	25 %	25 %	332715854
10004	NC_015508	GCA	2	6	549896	549901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715854
10005	NC_015508	CAG	2	6	549924	549929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715854
10006	NC_015508	CA	4	8	549961	549968	50 %	0 %	0 %	50 %	332715854
10007	NC_015508	GAG	2	6	550047	550052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715854
10008	NC_015508	CCT	2	6	550085	550090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715854
10009	NC_015508	AAC	2	6	550128	550133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715854
10010	NC_015508	CTG	2	6	550239	550244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715854
10011	NC_015508	CGA	2	6	550277	550282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715854
10012	NC_015508	TGC	2	6	550285	550290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715854
10013	NC_015508	TCG	2	6	550320	550325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715854
10014	NC_015508	GATC	2	8	550328	550335	25 %	25 %	25 %	25 %	332715854
10015	NC_015508	CG	3	6	550377	550382	0 %	0 %	50 %	50 %	332715855
10016	NC_015508	AAC	2	6	550410	550415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715855
10017	NC_015508	GCGCG	2	10	550474	550483	0 %	0 %	60 %	40 %	332715855
10018	NC_015508	TTG	2	6	550502	550507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715855
10019	NC_015508	CTG	2	6	550508	550513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715855
10020	NC_015508	TGC	2	6	550551	550556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715855
10021	NC_015508	CGC	2	6	550557	550562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715855
10022	NC_015508	CTT	2	6	550667	550672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715855
10023	NC_015508	TCG	3	9	550677	550685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715855
10024	NC_015508	GCC	2	6	550709	550714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715855
10025	NC_015508	CG	3	6	550748	550753	0 %	0 %	50 %	50 %	332715855
10026	NC_015508	GCT	2	6	550777	550782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715855
10027	NC_015508	GAT	2	6	550783	550788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715855
10028	NC_015508	TGG	2	6	550896	550901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715855
10029	NC_015508	CCT	2	6	550962	550967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715855
10030	NC_015508	CTGGC	2	10	551006	551015	0 %	20 %	40 %	40 %	332715855
10031	NC_015508	GGC	2	6	551041	551046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715855
10032	NC_015508	CCCGA	2	10	551091	551100	20 %	0 %	20 %	60 %	332715855
10033	NC_015508	TGA	2	6	551106	551111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715855
10034	NC_015508	AGG	2	6	551215	551220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715855
10035	NC_015508	GCG	2	6	551320	551325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715856
10036	NC_015508	TTC	2	6	551327	551332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715856
10037	NC_015508	TGC	2	6	551363	551368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715856
10038	NC_015508	CGC	2	6	551373	551378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715856
10039	NC_015508	CAG	2	6	551416	551421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715856
10040	NC_015508	CGGC	2	8	551522	551529	0 %	0 %	50 %	50 %	332715856
10041	NC_015508	ATG	2	6	551537	551542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715856
10042	NC_015508	GGC	2	6	551617	551622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715856
10043	NC_015508	TGC	2	6	551675	551680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715856
10044	NC_015508	CGA	2	6	551682	551687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715856
10045	NC_015508	TCG	2	6	551747	551752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715856
10046	NC_015508	TCCT	2	8	551767	551774	0 %	50 %	0 %	50 %	332715856
10047	NC_015508	ATG	2	6	551827	551832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715856
10048	NC_015508	CAG	2	6	551854	551859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715856
10049	NC_015508	CCGCGC	2	12	551878	551889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715856
10050	NC_015508	CGC	2	6	551900	551905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715856
10051	NC_015508	ATG	2	6	552015	552020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
10052	NC_015508	CGA	2	6	552055	552060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715857
10053	NC_015508	GCC	2	6	552072	552077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715857
10054	NC_015508	TCA	2	6	552154	552159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715857
10055	NC_015508	TGA	2	6	552172	552177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
10056	NC_015508	AGA	2	6	552190	552195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715857
10057	NC_015508	CGC	2	6	552289	552294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715857
10058	NC_015508	ACC	2	6	552306	552311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715857
10059	NC_015508	GAA	2	6	552341	552346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715857
10060	NC_015508	GAT	2	6	552359	552364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
10061	NC_015508	GAT	2	6	552392	552397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
10062	NC_015508	GCCC	2	8	552398	552405	0 %	0 %	25 %	75 %	332715857
10063	NC_015508	TGA	2	6	552412	552417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
10064	NC_015508	TTC	2	6	552426	552431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715857
10065	NC_015508	ATG	2	6	552558	552563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
10066	NC_015508	TCA	2	6	552666	552671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715857
10067	NC_015508	ACG	2	6	552715	552720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715857
10068	NC_015508	TGC	2	6	552758	552763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715857
10069	NC_015508	CAG	2	6	552773	552778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715857
10070	NC_015508	GAC	2	6	552785	552790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715857
10071	NC_015508	TCC	2	6	552822	552827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715858
10072	NC_015508	AACTGG	2	12	552839	552850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332715858
10073	NC_015508	CCG	3	9	552977	552985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715858
10074	NC_015508	AGG	2	6	552989	552994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715858
10075	NC_015508	TCGG	2	8	553136	553143	0 %	25 %	50 %	25 %	332715858
10076	NC_015508	CCA	2	6	553192	553197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715858
10077	NC_015508	GAC	2	6	553204	553209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715858
10078	NC_015508	GTT	2	6	553442	553447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715858
10079	NC_015508	CAC	2	6	553450	553455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715858
10080	NC_015508	CAG	2	6	553459	553464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715858
10081	NC_015508	GCG	2	6	553563	553568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715858
10082	NC_015508	ATC	2	6	553589	553594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715858
10083	NC_015508	AAAG	2	8	553608	553615	75 %	0 %	25 %	0 %	332715858
10084	NC_015508	CTT	2	6	553669	553674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715858
10085	NC_015508	CGC	2	6	553816	553821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715859
10086	NC_015508	GAT	2	6	553847	553852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715859
10087	NC_015508	GCC	2	6	553917	553922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715859
10088	NC_015508	TCCA	2	8	554037	554044	25 %	25 %	0 %	50 %	332715859
10089	NC_015508	GCG	2	6	554064	554069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715859
10090	NC_015508	GC	3	6	554139	554144	0 %	0 %	50 %	50 %	332715859
10091	NC_015508	AG	3	6	554272	554277	50 %	0 %	50 %	0 %	332715859
10092	NC_015508	ATCG	2	8	554342	554349	25 %	25 %	25 %	25 %	332715859
10093	NC_015508	CGC	2	6	554407	554412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715859
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10100	NC_015508	GCG	2	6	554764	554769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715859
10101	NC_015508	CG	4	8	554768	554775	0 %	0 %	50 %	50 %	332715859
10102	NC_015508	CGG	2	6	554812	554817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715859
10103	NC_015508	GAACG	2	10	554840	554849	40 %	0 %	40 %	20 %	332715859
10104	NC_015508	CGT	2	6	554861	554866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715859
10105	NC_015508	TTG	2	6	554895	554900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715859
10106	NC_015508	GCA	2	6	554904	554909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715859
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10108	NC_015508	CCA	2	6	554954	554959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715859
10109	NC_015508	CAA	2	6	555013	555018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715859
10110	NC_015508	ATG	2	6	555153	555158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715860
10111	NC_015508	CG	3	6	555205	555210	0 %	0 %	50 %	50 %	332715860
10112	NC_015508	CTC	2	6	555281	555286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715860
10113	NC_015508	CAC	2	6	555412	555417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715860
10114	NC_015508	CGA	2	6	555454	555459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715860
10115	NC_015508	GCA	2	6	555465	555470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715860
10116	NC_015508	CGA	2	6	555505	555510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715860
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10118	NC_015508	GCG	2	6	555541	555546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715860
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10238	NC_015508	TCT	2	6	561841	561846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715865
10239	NC_015508	GGC	2	6	561847	561852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715865
10240	NC_015508	GC	3	6	561851	561856	0 %	0 %	50 %	50 %	332715865
10241	NC_015508	GCG	2	6	561908	561913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715865
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10346	NC_015508	ATCG	2	8	567525	567532	25 %	25 %	25 %	25 %	332715870
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10476	NC_015508	GGA	2	6	573544	573549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715875
10477	NC_015508	GC	4	8	573557	573564	0 %	0 %	50 %	50 %	332715875
10478	NC_015508	CTGG	2	8	573604	573611	0 %	25 %	50 %	25 %	332715875
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