MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 40984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015508	GCC	2	6	522628	522633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715829
9502	NC_015508	ATA	2	6	522654	522659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715829
9503	NC_015508	CG	3	6	522685	522690	0 %	0 %	50 %	50 %	332715829
9504	NC_015508	GC	4	8	522706	522713	0 %	0 %	50 %	50 %	332715829
9505	NC_015508	GGC	2	6	522747	522752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715829
9506	NC_015508	GCA	2	6	522758	522763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715829
9507	NC_015508	GGC	2	6	522784	522789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715829
9508	NC_015508	GCC	2	6	522884	522889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715829
9509	NC_015508	CG	3	6	523020	523025	0 %	0 %	50 %	50 %	332715829
9510	NC_015508	CCA	2	6	523049	523054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715829
9511	NC_015508	GTGGC	2	10	523352	523361	0 %	20 %	60 %	20 %	332715830
9512	NC_015508	CCG	2	6	523421	523426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715830
9513	NC_015508	CGG	2	6	523472	523477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715830
9514	NC_015508	CGG	2	6	523610	523615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715830
9515	NC_015508	TCG	2	6	523688	523693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715830
9516	NC_015508	CCG	2	6	523736	523741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715830
9517	NC_015508	GTC	2	6	523800	523805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715830
9518	NC_015508	AGC	2	6	523861	523866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715830
9519	NC_015508	GCC	2	6	523960	523965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715830
9520	NC_015508	CGC	2	6	523971	523976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715830
9521	NC_015508	TCG	2	6	523985	523990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715830
9522	NC_015508	T	6	6	524043	524048	0 %	100 %	0 %	0 %	332715830
9523	NC_015508	AGGA	2	8	524109	524116	50 %	0 %	50 %	0 %	332715831
9524	NC_015508	CGT	2	6	524156	524161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715831
9525	NC_015508	TGG	2	6	524167	524172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715831
9526	NC_015508	TCA	2	6	524218	524223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715831
9527	NC_015508	ATC	2	6	524292	524297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715831
9528	NC_015508	CTT	2	6	524353	524358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715831
9529	NC_015508	ATG	2	6	524394	524399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715831
9530	NC_015508	GC	3	6	524431	524436	0 %	0 %	50 %	50 %	332715831
9531	NC_015508	ATG	2	6	524505	524510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715831
9532	NC_015508	CAC	2	6	524519	524524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715831
9533	NC_015508	GCG	2	6	524551	524556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715831
9534	NC_015508	GAC	2	6	524615	524620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715831
9535	NC_015508	CATGAC	2	12	524621	524632	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332715831
9536	NC_015508	CGG	2	6	524649	524654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715831
9537	NC_015508	GCC	2	6	524660	524665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715831
9538	NC_015508	CTG	2	6	524681	524686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715831
9539	NC_015508	A	6	6	524816	524821	100 %	0 %	0 %	0 %	332715831
9540	NC_015508	CGA	2	6	524890	524895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715832
9541	NC_015508	AGA	2	6	524919	524924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715832
9542	NC_015508	GCC	2	6	524955	524960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715832
9543	NC_015508	GCA	2	6	524971	524976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715832
9544	NC_015508	TTC	2	6	524988	524993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715832
9545	NC_015508	ATC	2	6	524994	524999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715832
9546	NC_015508	CCG	2	6	525021	525026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715832
9547	NC_015508	TGC	2	6	525079	525084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715832
9548	NC_015508	GCCA	2	8	525136	525143	25 %	0 %	25 %	50 %	332715832
9549	NC_015508	CG	3	6	525157	525162	0 %	0 %	50 %	50 %	332715832
9550	NC_015508	CAC	2	6	525251	525256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715832
9551	NC_015508	AGC	2	6	525273	525278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715832
9552	NC_015508	GC	3	6	525316	525321	0 %	0 %	50 %	50 %	332715832
9553	NC_015508	GAT	2	6	525371	525376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715832
9554	NC_015508	TGG	3	9	525427	525435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715832
9555	NC_015508	GGC	2	6	525503	525508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715832
9556	NC_015508	GAC	2	6	525623	525628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715832
9557	NC_015508	T	7	7	525744	525750	0 %	100 %	0 %	0 %	332715832
9558	NC_015508	CGA	2	6	525882	525887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715833
9559	NC_015508	CAG	2	6	525921	525926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715833
9560	NC_015508	GAAC	2	8	525950	525957	50 %	0 %	25 %	25 %	332715833
9561	NC_015508	GAT	2	6	526007	526012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715833
9562	NC_015508	TCG	2	6	526053	526058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715833
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9564	NC_015508	CAAGGC	2	12	526198	526209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715833
9565	NC_015508	CGC	2	6	526210	526215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715833
9566	NC_015508	CCTT	2	8	526230	526237	0 %	50 %	0 %	50 %	332715833
9567	NC_015508	CGG	2	6	526276	526281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715833
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9569	NC_015508	CTT	2	6	526382	526387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715833
9570	NC_015508	TGA	2	6	526393	526398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715833
9571	NC_015508	TCC	2	6	526422	526427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715833
9572	NC_015508	ATC	2	6	526479	526484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715833
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9578	NC_015508	CGA	2	6	526687	526692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715833
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9582	NC_015508	CGCC	2	8	526816	526823	0 %	0 %	25 %	75 %	332715833
9583	NC_015508	CTT	2	6	526832	526837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715833
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9585	NC_015508	CGG	2	6	527106	527111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715833
9586	NC_015508	TTG	2	6	527121	527126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715833
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9588	NC_015508	AAACCG	2	12	527370	527381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332715834
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9590	NC_015508	CGC	2	6	527455	527460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715834
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9592	NC_015508	CCGG	2	8	527525	527532	0 %	0 %	50 %	50 %	332715834
9593	NC_015508	CGC	2	6	527874	527879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715835
9594	NC_015508	GCAG	2	8	527946	527953	25 %	0 %	50 %	25 %	332715835
9595	NC_015508	CCG	2	6	527964	527969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715835
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9598	NC_015508	CGAC	2	8	528220	528227	25 %	0 %	25 %	50 %	332715835
9599	NC_015508	ACT	2	6	528278	528283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715835
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9601	NC_015508	CGG	2	6	528431	528436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715836
9602	NC_015508	CG	3	6	528475	528480	0 %	0 %	50 %	50 %	332715836
9603	NC_015508	TTCAT	2	10	528501	528510	20 %	60 %	0 %	20 %	332715836
9604	NC_015508	CAG	2	6	528521	528526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715836
9605	NC_015508	CCTT	2	8	528534	528541	0 %	50 %	0 %	50 %	332715836
9606	NC_015508	ACG	2	6	528555	528560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715836
9607	NC_015508	GCT	3	9	528661	528669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715836
9608	NC_015508	GCC	2	6	528671	528676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715836
9609	NC_015508	GC	3	6	528737	528742	0 %	0 %	50 %	50 %	332715836
9610	NC_015508	CAC	2	6	528776	528781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715836
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9615	NC_015508	CAG	2	6	529138	529143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715837
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9617	NC_015508	GAC	2	6	529269	529274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715837
9618	NC_015508	ACCG	2	8	529287	529294	25 %	0 %	25 %	50 %	332715837
9619	NC_015508	GGC	2	6	529352	529357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715837
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9984	NC_015508	CGGCA	2	10	548994	549003	20 %	0 %	40 %	40 %	332715853
9985	NC_015508	CGA	2	6	549015	549020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715853
9986	NC_015508	CCTG	2	8	549078	549085	0 %	25 %	25 %	50 %	332715853
9987	NC_015508	ATC	2	6	549176	549181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715853
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9989	NC_015508	TAT	2	6	549368	549373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715854
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9991	NC_015508	GCA	2	6	549429	549434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715854
9992	NC_015508	GC	3	6	549451	549456	0 %	0 %	50 %	50 %	332715854
9993	NC_015508	CTG	2	6	549481	549486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715854
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9996	NC_015508	GCT	2	6	549524	549529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715854
9997	NC_015508	GGCT	2	8	549543	549550	0 %	25 %	50 %	25 %	332715854
9998	NC_015508	CAA	2	6	549608	549613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715854
9999	NC_015508	GCA	2	6	549660	549665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715854
10000	NC_015508	TTC	2	6	549734	549739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715854

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