MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 40984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015508	CCG	2	6	34236	34241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715409
502	NC_015508	CGT	2	6	34251	34256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715409
503	NC_015508	AT	3	6	34305	34310	50 %	50 %	0 %	0 %	332715410
504	NC_015508	TGA	2	6	34473	34478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715410
505	NC_015508	GCT	2	6	34506	34511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715410
506	NC_015508	TTC	2	6	34525	34530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715410
507	NC_015508	T	6	6	34627	34632	0 %	100 %	0 %	0 %	332715410
508	NC_015508	ATA	2	6	34741	34746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715410
509	NC_015508	ACCC	2	8	34787	34794	25 %	0 %	0 %	75 %	332715410
510	NC_015508	GCA	2	6	34856	34861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715410
511	NC_015508	T	6	6	34875	34880	0 %	100 %	0 %	0 %	332715410
512	NC_015508	GTT	2	6	34959	34964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715410
513	NC_015508	CGC	2	6	34974	34979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715410
514	NC_015508	CGC	3	9	35004	35012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715410
515	NC_015508	GGC	2	6	35026	35031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715410
516	NC_015508	CTG	2	6	35049	35054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715410
517	NC_015508	GGCC	2	8	35058	35065	0 %	0 %	50 %	50 %	332715410
518	NC_015508	AAC	2	6	35108	35113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715410
519	NC_015508	CTG	2	6	35316	35321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715410
520	NC_015508	AAG	2	6	35331	35336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715410
521	NC_015508	CTT	2	6	35385	35390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715410
522	NC_015508	GCC	2	6	35397	35402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715410
523	NC_015508	CA	3	6	35685	35690	50 %	0 %	0 %	50 %	332715411
524	NC_015508	GAC	2	6	35750	35755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715411
525	NC_015508	GATCTC	2	12	35774	35785	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332715412
526	NC_015508	AC	3	6	36022	36027	50 %	0 %	0 %	50 %	332715412
527	NC_015508	TTC	2	6	36045	36050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715412
528	NC_015508	CGA	2	6	36052	36057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715412
529	NC_015508	CAT	2	6	36194	36199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715412
530	NC_015508	CCA	2	6	36204	36209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715412
531	NC_015508	GTG	2	6	36218	36223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715412
532	NC_015508	GTT	2	6	36224	36229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715412
533	NC_015508	TTA	2	6	36273	36278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715412
534	NC_015508	T	6	6	36307	36312	0 %	100 %	0 %	0 %	332715412
535	NC_015508	GGCA	2	8	36434	36441	25 %	0 %	50 %	25 %	332715412
536	NC_015508	CAC	2	6	36473	36478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715412
537	NC_015508	GAT	2	6	36548	36553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715412
538	NC_015508	GCC	2	6	36557	36562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715412
539	NC_015508	GCCC	2	8	36572	36579	0 %	0 %	25 %	75 %	332715412
540	NC_015508	CTT	2	6	36620	36625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715412
541	NC_015508	CGA	2	6	36703	36708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715412
542	NC_015508	TTG	2	6	36742	36747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715412
543	NC_015508	GA	3	6	36831	36836	50 %	0 %	50 %	0 %	332715412
544	NC_015508	TGA	2	6	36859	36864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715412
545	NC_015508	CTT	2	6	37015	37020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715412
546	NC_015508	TCG	2	6	37063	37068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715412
547	NC_015508	CGCC	2	8	37141	37148	0 %	0 %	25 %	75 %	332715412
548	NC_015508	CCG	2	6	37172	37177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715412
549	NC_015508	CGA	2	6	37205	37210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715412
550	NC_015508	TCCC	2	8	37232	37239	0 %	25 %	0 %	75 %	332715412
551	NC_015508	AGCC	2	8	37263	37270	25 %	0 %	25 %	50 %	332715412
552	NC_015508	CGG	2	6	37350	37355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715412
553	NC_015508	GGC	3	9	37407	37415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715412
554	NC_015508	GAT	2	6	37418	37423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715412
555	NC_015508	CCG	2	6	37483	37488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715412
556	NC_015508	TCCA	2	8	37494	37501	25 %	25 %	0 %	50 %	332715412
557	NC_015508	CGC	2	6	37518	37523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715412
558	NC_015508	GGA	2	6	37584	37589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715412
559	NC_015508	CCG	2	6	37635	37640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715412
560	NC_015508	GCC	2	6	37684	37689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715412
561	NC_015508	CCT	2	6	37714	37719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715412
562	NC_015508	GCAC	2	8	37725	37732	25 %	0 %	25 %	50 %	332715412
563	NC_015508	GAC	2	6	37860	37865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715412
564	NC_015508	GTA	2	6	37941	37946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715413
565	NC_015508	GCC	2	6	38001	38006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715413
566	NC_015508	TTG	2	6	38026	38031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715413
567	NC_015508	GGC	2	6	38135	38140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715413
568	NC_015508	GATGC	2	10	38184	38193	20 %	20 %	40 %	20 %	332715413
569	NC_015508	ATC	2	6	38283	38288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715413
570	NC_015508	GCTG	2	8	38315	38322	0 %	25 %	50 %	25 %	332715413
571	NC_015508	GCT	2	6	38346	38351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715413
572	NC_015508	CAC	2	6	38548	38553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715414
573	NC_015508	GCC	2	6	38623	38628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715414
574	NC_015508	TCCGC	2	10	38707	38716	0 %	20 %	20 %	60 %	332715414
575	NC_015508	ACCG	2	8	38720	38727	25 %	0 %	25 %	50 %	332715414
576	NC_015508	AAC	2	6	38750	38755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715414
577	NC_015508	A	6	6	38768	38773	100 %	0 %	0 %	0 %	332715414
578	NC_015508	TCG	3	9	38911	38919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715415
579	NC_015508	AGG	2	6	38929	38934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715415
580	NC_015508	ATC	2	6	38937	38942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715415
581	NC_015508	GCG	2	6	38950	38955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715415
582	NC_015508	GTT	2	6	38957	38962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715415
583	NC_015508	GTC	2	6	38963	38968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715415
584	NC_015508	ACTTC	2	10	38980	38989	20 %	40 %	0 %	40 %	332715415
585	NC_015508	CAG	2	6	39074	39079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715415
586	NC_015508	CCGG	2	8	39146	39153	0 %	0 %	50 %	50 %	332715415
587	NC_015508	TGG	2	6	39175	39180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715415
588	NC_015508	AAG	2	6	39181	39186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715415
589	NC_015508	GCA	2	6	39246	39251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715415
590	NC_015508	CAG	2	6	39256	39261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715415
591	NC_015508	ATCC	2	8	39305	39312	25 %	25 %	0 %	50 %	332715415
592	NC_015508	TTC	2	6	39323	39328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715415
593	NC_015508	ACA	2	6	39567	39572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715416
594	NC_015508	GGC	2	6	39627	39632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715416
595	NC_015508	AGG	2	6	39633	39638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715416
596	NC_015508	GC	4	8	39690	39697	0 %	0 %	50 %	50 %	332715416
597	NC_015508	GAA	2	6	39829	39834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715416
598	NC_015508	GTG	2	6	39984	39989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715416
599	NC_015508	CGC	2	6	40141	40146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715416
600	NC_015508	GCG	2	6	40171	40176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715416
601	NC_015508	AGC	2	6	40185	40190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715416
602	NC_015508	TCG	2	6	40228	40233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715416
603	NC_015508	GCC	2	6	40247	40252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715416
604	NC_015508	GCGA	2	8	40266	40273	25 %	0 %	50 %	25 %	332715416
605	NC_015508	CAA	2	6	40309	40314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715416
606	NC_015508	A	7	7	40317	40323	100 %	0 %	0 %	0 %	332715416
607	NC_015508	CGGC	2	8	40324	40331	0 %	0 %	50 %	50 %	332715416
608	NC_015508	GCG	2	6	40334	40339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715416
609	NC_015508	CGGAT	2	10	40340	40349	20 %	20 %	40 %	20 %	332715416
610	NC_015508	GCA	2	6	40395	40400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715416
611	NC_015508	CAC	2	6	40409	40414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715416
612	NC_015508	ACG	2	6	40503	40508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715416
613	NC_015508	GCG	2	6	40509	40514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715416
614	NC_015508	TC	3	6	40547	40552	0 %	50 %	0 %	50 %	332715416
615	NC_015508	GA	3	6	40591	40596	50 %	0 %	50 %	0 %	332715416
616	NC_015508	GCT	2	6	40621	40626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715416
617	NC_015508	CGT	2	6	40651	40656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715416
618	NC_015508	ATC	2	6	40670	40675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715416
619	NC_015508	CGCT	2	8	40788	40795	0 %	25 %	25 %	50 %	332715416
620	NC_015508	GC	3	6	40803	40808	0 %	0 %	50 %	50 %	332715416
621	NC_015508	CG	3	6	40893	40898	0 %	0 %	50 %	50 %	332715416
622	NC_015508	ACGA	2	8	40946	40953	50 %	0 %	25 %	25 %	332715416
623	NC_015508	GTC	2	6	41010	41015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715416
624	NC_015508	ACG	2	6	41048	41053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715416
625	NC_015508	CTT	2	6	41081	41086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715416
626	NC_015508	GTC	2	6	41100	41105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715416
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628	NC_015508	GGC	2	6	41269	41274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715416
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