MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Archaeoglobus veneficus SNP6 chromosome

Total Repeats: 34462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015320	CTC	2	6	37	42	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399921
2	NC_015320	GTA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399921
3	NC_015320	CTC	2	6	135	140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399921
4	NC_015320	TCTT	2	8	209	216	0 %	75 %	0 %	25 %	327399921
5	NC_015320	TC	3	6	232	237	0 %	50 %	0 %	50 %	327399921
6	NC_015320	GTCTAT	2	12	267	278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	327399921
7	NC_015320	CTG	2	6	440	445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
8	NC_015320	ATT	2	6	487	492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399921
9	NC_015320	GCA	2	6	557	562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399921
10	NC_015320	TCT	2	6	589	594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399921
11	NC_015320	TCC	2	6	610	615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399921
12	NC_015320	TTC	2	6	640	645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399921
13	NC_015320	ATC	2	6	723	728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399921
14	NC_015320	AGC	2	6	760	765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399921
15	NC_015320	GA	3	6	772	777	50 %	0 %	50 %	0 %	327399921
16	NC_015320	TCTGC	2	10	782	791	0 %	40 %	20 %	40 %	327399921
17	NC_015320	TGC	2	6	831	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
18	NC_015320	GT	4	8	931	938	0 %	50 %	50 %	0 %	327399921
19	NC_015320	CTT	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399921
20	NC_015320	TCTT	2	8	1115	1122	0 %	75 %	0 %	25 %	327399921
21	NC_015320	CCT	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399921
22	NC_015320	CT	3	6	1142	1147	0 %	50 %	0 %	50 %	327399921
23	NC_015320	CTG	2	6	1197	1202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
24	NC_015320	CT	3	6	1227	1232	0 %	50 %	0 %	50 %	327399921
25	NC_015320	TA	3	6	1290	1295	50 %	50 %	0 %	0 %	327399921
26	NC_015320	TC	3	6	1296	1301	0 %	50 %	0 %	50 %	327399921
27	NC_015320	CAT	2	6	1355	1360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399921
28	NC_015320	CGT	2	6	1421	1426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
29	NC_015320	CAA	2	6	1547	1552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399921
30	NC_015320	TTG	2	6	1595	1600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399921
31	NC_015320	ACT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399921
32	NC_015320	TCT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399921
33	NC_015320	TGC	2	6	1728	1733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
34	NC_015320	A	6	6	1738	1743	100 %	0 %	0 %	0 %	327399921
35	NC_015320	TTCTCT	2	12	1787	1798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399921
36	NC_015320	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399921
37	NC_015320	CAACC	2	10	1965	1974	40 %	0 %	0 %	60 %	327399921
38	NC_015320	GAT	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399921
39	NC_015320	AAG	2	6	2014	2019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399921
40	NC_015320	CTT	2	6	2066	2071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399921
41	NC_015320	GCCT	2	8	2148	2155	0 %	25 %	25 %	50 %	327399921
42	NC_015320	TCCC	2	8	2233	2240	0 %	25 %	0 %	75 %	327399921
43	NC_015320	AGT	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399921
44	NC_015320	CTG	2	6	2284	2289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
45	NC_015320	CCG	2	6	2317	2322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327399921
46	NC_015320	CGT	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
47	NC_015320	TCG	2	6	2353	2358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
48	NC_015320	TTTC	2	8	2392	2399	0 %	75 %	0 %	25 %	327399921
49	NC_015320	GGT	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327399921
50	NC_015320	CTG	2	6	2490	2495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
51	NC_015320	CTC	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399921
52	NC_015320	CAA	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399921
53	NC_015320	CAGC	2	8	2573	2580	25 %	0 %	25 %	50 %	327399921
54	NC_015320	TCG	2	6	2620	2625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
55	NC_015320	TGT	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399921
56	NC_015320	CGA	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399921
57	NC_015320	TCA	2	6	2905	2910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399921
58	NC_015320	AAC	2	6	2931	2936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399921
59	NC_015320	TC	3	6	2950	2955	0 %	50 %	0 %	50 %	327399921
60	NC_015320	TGT	2	6	2991	2996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399921
61	NC_015320	CCACA	2	10	3002	3011	40 %	0 %	0 %	60 %	327399921
62	NC_015320	CCT	2	6	3036	3041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399921
63	NC_015320	TC	3	6	3044	3049	0 %	50 %	0 %	50 %	327399921
64	NC_015320	TC	3	6	3173	3178	0 %	50 %	0 %	50 %	327399921
65	NC_015320	GA	3	6	3257	3262	50 %	0 %	50 %	0 %	327399921
66	NC_015320	CAG	2	6	3276	3281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399921
67	NC_015320	TCTG	2	8	3293	3300	0 %	50 %	25 %	25 %	327399921
68	NC_015320	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	327399921
69	NC_015320	CGCT	2	8	3353	3360	0 %	25 %	25 %	50 %	327399921
70	NC_015320	GAA	2	6	3369	3374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399921
71	NC_015320	CT	3	6	3431	3436	0 %	50 %	0 %	50 %	327399921
72	NC_015320	CAA	2	6	3452	3457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399921
73	NC_015320	GAG	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327399921
74	NC_015320	AAG	2	6	3472	3477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399921
75	NC_015320	CT	3	6	3507	3512	0 %	50 %	0 %	50 %	327399921
76	NC_015320	CTT	2	6	3561	3566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399921
77	NC_015320	GAG	2	6	3588	3593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327399921
78	NC_015320	TCG	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
79	NC_015320	TTGT	2	8	3604	3611	0 %	75 %	25 %	0 %	327399921
80	NC_015320	GAA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399921
81	NC_015320	AATA	2	8	3663	3670	75 %	25 %	0 %	0 %	327399921
82	NC_015320	GTT	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399921
83	NC_015320	AAG	2	6	3871	3876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399921
84	NC_015320	T	6	6	4218	4223	0 %	100 %	0 %	0 %	327399921
85	NC_015320	CAC	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399921
86	NC_015320	GATG	2	8	4281	4288	25 %	25 %	50 %	0 %	327399921
87	NC_015320	TCT	2	6	4357	4362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399921
88	NC_015320	CTC	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399921
89	NC_015320	CTG	2	6	4389	4394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
90	NC_015320	ATG	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399921
91	NC_015320	CTG	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
92	NC_015320	GTT	2	6	4559	4564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399921
93	NC_015320	CTC	2	6	4565	4570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399921
94	NC_015320	GCTG	2	8	4607	4614	0 %	25 %	50 %	25 %	327399921
95	NC_015320	CTC	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399921
96	NC_015320	AAAC	2	8	4643	4650	75 %	0 %	0 %	25 %	327399921
97	NC_015320	CGG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327399921
98	NC_015320	TGAGC	2	10	4688	4697	20 %	20 %	40 %	20 %	327399921
99	NC_015320	AAC	2	6	4716	4721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399921
100	NC_015320	CTG	2	6	4732	4737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
101	NC_015320	TGC	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
102	NC_015320	TAC	2	6	4755	4760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399921
103	NC_015320	TGA	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399921
104	NC_015320	CGT	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
105	NC_015320	TTCG	2	8	4935	4942	0 %	50 %	25 %	25 %	327399921
106	NC_015320	TCA	2	6	4949	4954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399921
107	NC_015320	AG	3	6	5035	5040	50 %	0 %	50 %	0 %	327399921
108	NC_015320	GTA	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399921
109	NC_015320	TTCC	2	8	5109	5116	0 %	50 %	0 %	50 %	327399921
110	NC_015320	GCT	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399921
111	NC_015320	CAA	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399922
112	NC_015320	GAC	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399922
113	NC_015320	GCT	2	6	5332	5337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399922
114	NC_015320	GCA	2	6	5350	5355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399922
115	NC_015320	CCAA	2	8	5440	5447	50 %	0 %	0 %	50 %	327399922
116	NC_015320	CTT	2	6	5535	5540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399922
117	NC_015320	CGT	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399922
118	NC_015320	CGA	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399922
119	NC_015320	CCT	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399922
120	NC_015320	GAA	2	6	5640	5645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399922
121	NC_015320	ACG	2	6	5651	5656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399922
122	NC_015320	AAT	2	6	5658	5663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399922
123	NC_015320	TTC	2	6	5740	5745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399922
124	NC_015320	AG	3	6	5751	5756	50 %	0 %	50 %	0 %	327399922
125	NC_015320	GCCGA	2	10	5785	5794	20 %	0 %	40 %	40 %	327399922
126	NC_015320	AAGC	2	8	5859	5866	50 %	0 %	25 %	25 %	327399922
127	NC_015320	AGAA	2	8	5919	5926	75 %	0 %	25 %	0 %	327399922
128	NC_015320	AG	3	6	5935	5940	50 %	0 %	50 %	0 %	327399922
129	NC_015320	CGT	2	6	5991	5996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399922
130	NC_015320	AGA	2	6	6078	6083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399922
131	NC_015320	CTG	2	6	6142	6147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399922
132	NC_015320	AG	3	6	6202	6207	50 %	0 %	50 %	0 %	327399922
133	NC_015320	AGG	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327399922
134	NC_015320	AG	3	6	6296	6301	50 %	0 %	50 %	0 %	327399922
135	NC_015320	TCG	3	9	6311	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399922
136	NC_015320	CTTC	2	8	6345	6352	0 %	50 %	0 %	50 %	327399922
137	NC_015320	AAG	2	6	6439	6444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399923
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162	NC_015320	CTG	2	6	8476	8481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399925
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253	NC_015320	CTC	2	6	12865	12870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399932
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255	NC_015320	GGAG	2	8	13010	13017	25 %	0 %	75 %	0 %	327399932
256	NC_015320	ATT	2	6	13033	13038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399932
257	NC_015320	ATCCAA	2	12	13173	13184	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	327399932
258	NC_015320	TGT	2	6	13196	13201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399932
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263	NC_015320	CTT	2	6	13903	13908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399933
264	NC_015320	TC	4	8	13944	13951	0 %	50 %	0 %	50 %	327399933
265	NC_015320	CTT	2	6	13967	13972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399933
266	NC_015320	CTC	2	6	14529	14534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327399934
267	NC_015320	CGT	2	6	14538	14543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399934
268	NC_015320	CGG	3	9	14689	14697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327399935
269	NC_015320	CTCA	2	8	14731	14738	25 %	25 %	0 %	50 %	327399935
270	NC_015320	T	6	6	14774	14779	0 %	100 %	0 %	0 %	327399935
271	NC_015320	ACTAT	2	10	14792	14801	40 %	40 %	0 %	20 %	327399935
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273	NC_015320	T	6	6	14882	14887	0 %	100 %	0 %	0 %	327399935
274	NC_015320	AAC	2	6	15017	15022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399936
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280	NC_015320	TAC	2	6	15183	15188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399936
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283	NC_015320	AAT	2	6	15239	15244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399936
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291	NC_015320	GAG	2	6	15588	15593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327399936
292	NC_015320	GTG	2	6	15627	15632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327399936
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296	NC_015320	GT	3	6	16178	16183	0 %	50 %	50 %	0 %	327399938
297	NC_015320	CTG	2	6	16225	16230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399938
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299	NC_015320	ACC	2	6	16269	16274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399938
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379	NC_015320	TTC	2	6	20350	20355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399943
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381	NC_015320	ACA	2	6	20392	20397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399943
382	NC_015320	T	6	6	20398	20403	0 %	100 %	0 %	0 %	327399943
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389	NC_015320	CGT	2	6	20904	20909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399944
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394	NC_015320	GCG	2	6	21080	21085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327399944
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