MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Archaeoglobus veneficus SNP6 chromosome

Total Repeats: 34462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_015320	TCAC	2	8	1355440	1355447	25 %	25 %	0 %	50 %	327401401
24503	NC_015320	CAG	2	6	1355451	1355456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401401
24504	NC_015320	AAGT	2	8	1355576	1355583	50 %	25 %	25 %	0 %	327401401
24505	NC_015320	AT	3	6	1355584	1355589	50 %	50 %	0 %	0 %	327401401
24506	NC_015320	CGT	3	9	1355648	1355656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401401
24507	NC_015320	CT	3	6	1355676	1355681	0 %	50 %	0 %	50 %	327401401
24508	NC_015320	ATA	2	6	1355698	1355703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327401401
24509	NC_015320	AAC	2	6	1355737	1355742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327401401
24510	NC_015320	TGG	2	6	1355964	1355969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327401402
24511	NC_015320	TAC	2	6	1355992	1355997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327401402
24512	NC_015320	TGGA	2	8	1356003	1356010	25 %	25 %	50 %	0 %	327401402
24513	NC_015320	GCAGA	2	10	1356012	1356021	40 %	0 %	40 %	20 %	327401402
24514	NC_015320	TC	3	6	1356093	1356098	0 %	50 %	0 %	50 %	327401402
24515	NC_015320	TTC	2	6	1356112	1356117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401402
24516	NC_015320	CGAGA	2	10	1356123	1356132	40 %	0 %	40 %	20 %	327401402
24517	NC_015320	TCC	2	6	1356221	1356226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401402
24518	NC_015320	CTT	2	6	1356232	1356237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401402
24519	NC_015320	TCC	2	6	1356350	1356355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401403
24520	NC_015320	TGG	2	6	1356413	1356418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327401403
24521	NC_015320	TTC	2	6	1356421	1356426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401403
24522	NC_015320	CAT	2	6	1356465	1356470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327401403
24523	NC_015320	CA	3	6	1356496	1356501	50 %	0 %	0 %	50 %	327401403
24524	NC_015320	AGG	2	6	1356605	1356610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327401403
24525	NC_015320	GAG	2	6	1356622	1356627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327401403
24526	NC_015320	AG	3	6	1356626	1356631	50 %	0 %	50 %	0 %	327401403
24527	NC_015320	CCGAT	2	10	1356743	1356752	20 %	20 %	20 %	40 %	327401404
24528	NC_015320	ATA	2	6	1356838	1356843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327401404
24529	NC_015320	GAG	2	6	1356867	1356872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327401404
24530	NC_015320	GGC	2	6	1356903	1356908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327401404
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24532	NC_015320	GCA	2	6	1356975	1356980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401404
24533	NC_015320	TCG	2	6	1356989	1356994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401404
24534	NC_015320	AGG	2	6	1357063	1357068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327401404
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24536	NC_015320	GAAA	2	8	1357108	1357115	75 %	0 %	25 %	0 %	327401404
24537	NC_015320	CGA	2	6	1357287	1357292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401404
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24547	NC_015320	CAT	2	6	1357695	1357700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327401404
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24551	NC_015320	GA	3	6	1357893	1357898	50 %	0 %	50 %	0 %	327401404
24552	NC_015320	GCA	2	6	1357982	1357987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401404
24553	NC_015320	TGC	2	6	1358204	1358209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401404
24554	NC_015320	TGA	2	6	1358217	1358222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327401404
24555	NC_015320	CGA	2	6	1358244	1358249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401404
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24557	NC_015320	TGA	2	6	1358428	1358433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327401405
24558	NC_015320	GAA	2	6	1358434	1358439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401405
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24561	NC_015320	GAG	2	6	1358565	1358570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327401405
24562	NC_015320	AG	3	6	1358569	1358574	50 %	0 %	50 %	0 %	327401405
24563	NC_015320	A	7	7	1358582	1358588	100 %	0 %	0 %	0 %	327401405
24564	NC_015320	AAG	2	6	1358682	1358687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401405
24565	NC_015320	AG	3	6	1358769	1358774	50 %	0 %	50 %	0 %	327401405
24566	NC_015320	AG	3	6	1358821	1358826	50 %	0 %	50 %	0 %	327401405
24567	NC_015320	AGTA	2	8	1358857	1358864	50 %	25 %	25 %	0 %	327401405
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24571	NC_015320	CTTT	2	8	1359163	1359170	0 %	75 %	0 %	25 %	327401406
24572	NC_015320	GAA	2	6	1359202	1359207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401406
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24577	NC_015320	TTG	2	6	1359287	1359292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327401406
24578	NC_015320	TTTG	2	8	1359334	1359341	0 %	75 %	25 %	0 %	327401406
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24583	NC_015320	AG	3	6	1359579	1359584	50 %	0 %	50 %	0 %	327401406
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24587	NC_015320	TAT	2	6	1359905	1359910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327401407
24588	NC_015320	CAA	2	6	1359982	1359987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327401407
24589	NC_015320	TCCA	2	8	1360001	1360008	25 %	25 %	0 %	50 %	327401407
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24591	NC_015320	CTTC	2	8	1360060	1360067	0 %	50 %	0 %	50 %	327401407
24592	NC_015320	TTG	2	6	1360131	1360136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327401407
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24597	NC_015320	CT	3	6	1360322	1360327	0 %	50 %	0 %	50 %	327401407
24598	NC_015320	AT	3	6	1360349	1360354	50 %	50 %	0 %	0 %	327401407
24599	NC_015320	GAG	2	6	1360566	1360571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327401408
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24601	NC_015320	TTC	2	6	1360676	1360681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401409
24602	NC_015320	CAA	2	6	1360731	1360736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327401409
24603	NC_015320	ATG	2	6	1360751	1360756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327401409
24604	NC_015320	GCA	2	6	1360799	1360804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401409
24605	NC_015320	TCG	2	6	1360821	1360826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401409
24606	NC_015320	CTTC	2	8	1360834	1360841	0 %	50 %	0 %	50 %	327401409
24607	NC_015320	CGC	2	6	1360942	1360947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327401409
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24609	NC_015320	A	6	6	1361019	1361024	100 %	0 %	0 %	0 %	327401409
24610	NC_015320	ACT	2	6	1361057	1361062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327401409
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24616	NC_015320	GGCT	2	8	1361519	1361526	0 %	25 %	50 %	25 %	327401409
24617	NC_015320	GCA	2	6	1361555	1361560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401409
24618	NC_015320	TCC	2	6	1361597	1361602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401409
24619	NC_015320	TGA	2	6	1361694	1361699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327401409
24620	NC_015320	GTC	2	6	1361731	1361736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401409
24621	NC_015320	TCC	2	6	1361758	1361763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401409
24622	NC_015320	GC	3	6	1361800	1361805	0 %	0 %	50 %	50 %	327401409
24623	NC_015320	AAT	2	6	1361842	1361847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327401409
24624	NC_015320	AGC	2	6	1361940	1361945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401409
24625	NC_015320	AGA	2	6	1361955	1361960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401409
24626	NC_015320	ACG	2	6	1362129	1362134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401410
24627	NC_015320	ATCAT	2	10	1362150	1362159	40 %	40 %	0 %	20 %	327401410
24628	NC_015320	TAT	2	6	1362164	1362169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327401410
24629	NC_015320	TCCC	2	8	1362174	1362181	0 %	25 %	0 %	75 %	327401410
24630	NC_015320	CCT	2	6	1362298	1362303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401410
24631	NC_015320	TCC	2	6	1362363	1362368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401410
24632	NC_015320	CCA	2	6	1362406	1362411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327401410
24633	NC_015320	ACG	2	6	1362432	1362437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401410
24634	NC_015320	CT	4	8	1362547	1362554	0 %	50 %	0 %	50 %	327401410
24635	NC_015320	TCG	2	6	1362606	1362611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401410
24636	NC_015320	AG	3	6	1362624	1362629	50 %	0 %	50 %	0 %	327401410
24637	NC_015320	TAC	2	6	1362638	1362643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327401410
24638	NC_015320	CAG	2	6	1362776	1362781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401410
24639	NC_015320	AGTT	2	8	1362824	1362831	25 %	50 %	25 %	0 %	327401411
24640	NC_015320	GAG	2	6	1362859	1362864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327401411
24641	NC_015320	AGC	2	6	1362907	1362912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401411
24642	NC_015320	GAA	2	6	1362927	1362932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401411
24643	NC_015320	CAT	2	6	1362940	1362945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327401411
24644	NC_015320	TGC	2	6	1362994	1362999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401411
24645	NC_015320	CTT	2	6	1363034	1363039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401411
24646	NC_015320	TC	4	8	1363040	1363047	0 %	50 %	0 %	50 %	327401411
24647	NC_015320	CATTGC	2	12	1363060	1363071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	327401411
24648	NC_015320	CTG	2	6	1363159	1363164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401411
24649	NC_015320	TCG	2	6	1363202	1363207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401411
24650	NC_015320	GTT	2	6	1363238	1363243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327401411
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24653	NC_015320	GAA	2	6	1363438	1363443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401411
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24656	NC_015320	TCC	2	6	1363725	1363730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401412
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24671	NC_015320	CTT	2	6	1364623	1364628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401412
24672	NC_015320	ATGCCA	2	12	1364646	1364657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	327401412
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24674	NC_015320	TCG	2	6	1364721	1364726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401412
24675	NC_015320	GCCT	2	8	1364765	1364772	0 %	25 %	25 %	50 %	327401412
24676	NC_015320	TTCC	2	8	1364848	1364855	0 %	50 %	0 %	50 %	327401412
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24680	NC_015320	CGG	2	6	1365040	1365045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327401412
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24682	NC_015320	GC	3	6	1365087	1365092	0 %	0 %	50 %	50 %	327401412
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24684	NC_015320	GGCT	2	8	1365394	1365401	0 %	25 %	50 %	25 %	327401413
24685	NC_015320	TA	3	6	1365415	1365420	50 %	50 %	0 %	0 %	327401413
24686	NC_015320	AGG	2	6	1365521	1365526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327401413
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24688	NC_015320	GA	3	6	1365592	1365597	50 %	0 %	50 %	0 %	327401413
24689	NC_015320	A	6	6	1365615	1365620	100 %	0 %	0 %	0 %	327401413
24690	NC_015320	AG	3	6	1365628	1365633	50 %	0 %	50 %	0 %	327401413
24691	NC_015320	CTC	2	6	1365703	1365708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401413
24692	NC_015320	ATGG	2	8	1365772	1365779	25 %	25 %	50 %	0 %	327401413
24693	NC_015320	TG	3	6	1365793	1365798	0 %	50 %	50 %	0 %	327401413
24694	NC_015320	GAT	2	6	1365856	1365861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327401413
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24697	NC_015320	CATA	2	8	1366088	1366095	50 %	25 %	0 %	25 %	327401413
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24700	NC_015320	GAG	2	6	1366221	1366226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327401413
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24702	NC_015320	CGA	2	6	1366449	1366454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401413
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24704	NC_015320	GA	3	6	1366539	1366544	50 %	0 %	50 %	0 %	327401413
24705	NC_015320	CGA	2	6	1366692	1366697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401413
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24710	NC_015320	AG	4	8	1366822	1366829	50 %	0 %	50 %	0 %	327401413
24711	NC_015320	GCT	2	6	1366842	1366847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401413
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24713	NC_015320	AG	3	6	1366930	1366935	50 %	0 %	50 %	0 %	327401413
24714	NC_015320	CAA	2	6	1366946	1366951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327401413
24715	NC_015320	AAG	2	6	1366975	1366980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401413
24716	NC_015320	ACAG	2	8	1367029	1367036	50 %	0 %	25 %	25 %	327401413
24717	NC_015320	GAA	2	6	1367046	1367051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401413
24718	NC_015320	GAA	2	6	1367076	1367081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401413
24719	NC_015320	GA	3	6	1367109	1367114	50 %	0 %	50 %	0 %	327401413
24720	NC_015320	GATAGA	2	12	1367130	1367141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	327401413
24721	NC_015320	TAC	2	6	1367146	1367151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327401413
24722	NC_015320	TTC	2	6	1367161	1367166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401413
24723	NC_015320	AGA	2	6	1367174	1367179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401413
24724	NC_015320	GAA	2	6	1367204	1367209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401413
24725	NC_015320	TCG	2	6	1367210	1367215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401413
24726	NC_015320	AAG	2	6	1367232	1367237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401413
24727	NC_015320	ATA	2	6	1367287	1367292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327401413
24728	NC_015320	ATC	2	6	1367383	1367388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327401413
24729	NC_015320	GGC	2	6	1367445	1367450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327401413
24730	NC_015320	A	6	6	1367464	1367469	100 %	0 %	0 %	0 %	327401413
24731	NC_015320	TCG	2	6	1367504	1367509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401413
24732	NC_015320	TTG	2	6	1367585	1367590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327401413
24733	NC_015320	ACT	2	6	1367624	1367629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327401413
24734	NC_015320	GTG	2	6	1367653	1367658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327401413
24735	NC_015320	GA	3	6	1367671	1367676	50 %	0 %	50 %	0 %	327401413
24736	NC_015320	AG	3	6	1367707	1367712	50 %	0 %	50 %	0 %	327401413
24737	NC_015320	GTA	2	6	1367736	1367741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327401413
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24834	NC_015320	TC	3	6	1373489	1373494	0 %	50 %	0 %	50 %	327401417
24835	NC_015320	AGC	2	6	1373507	1373512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401417
24836	NC_015320	AGGGT	2	10	1373571	1373580	20 %	20 %	60 %	0 %	327401417
24837	NC_015320	AAG	2	6	1373590	1373595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401417
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24839	NC_015320	GCC	2	6	1373690	1373695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327401417
24840	NC_015320	ACG	2	6	1373733	1373738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401417
24841	NC_015320	AGA	2	6	1373778	1373783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401417
24842	NC_015320	AG	3	6	1373786	1373791	50 %	0 %	50 %	0 %	327401417
24843	NC_015320	GTT	2	6	1373846	1373851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327401417
24844	NC_015320	TTG	2	6	1373859	1373864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327401417
24845	NC_015320	TGC	2	6	1373940	1373945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401417
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24847	NC_015320	TGC	2	6	1373995	1374000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401417
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24966	NC_015320	TCC	2	6	1380279	1380284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401425
24967	NC_015320	CTGC	2	8	1380292	1380299	0 %	25 %	25 %	50 %	327401425
24968	NC_015320	TC	3	6	1380451	1380456	0 %	50 %	0 %	50 %	327401425
24969	NC_015320	TCT	2	6	1380477	1380482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401425
24970	NC_015320	TGC	2	6	1380512	1380517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401425
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24973	NC_015320	TTC	2	6	1380736	1380741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401426
24974	NC_015320	TCC	2	6	1380760	1380765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401426
24975	NC_015320	TCT	3	9	1380778	1380786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401426
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24981	NC_015320	CTT	2	6	1381092	1381097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401426
24982	NC_015320	ATG	2	6	1381100	1381105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327401426
24983	NC_015320	CAG	2	6	1381180	1381185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327401426
24984	NC_015320	TGC	2	6	1381202	1381207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401426
24985	NC_015320	GTC	2	6	1381288	1381293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401426
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24990	NC_015320	CCT	2	6	1381596	1381601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327401426
24991	NC_015320	GCG	2	6	1381643	1381648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327401426
24992	NC_015320	CTT	3	9	1381828	1381836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401426
24993	NC_015320	TCG	2	6	1381928	1381933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327401426
24994	NC_015320	TAA	2	6	1381934	1381939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327401426
24995	NC_015320	ATGC	2	8	1381946	1381953	25 %	25 %	25 %	25 %	327401426
24996	NC_015320	CGC	2	6	1382124	1382129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327401426
24997	NC_015320	ACGAA	2	10	1382156	1382165	60 %	0 %	20 %	20 %	327401426
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24999	NC_015320	AGA	2	6	1382361	1382366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327401427
25000	NC_015320	TTC	2	6	1382377	1382382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327401427

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