MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015184	CTC	2	6	496017	496022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168832
8502	NC_015184	GCC	2	6	496026	496031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168832
8503	NC_015184	ATC	2	6	496047	496052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168832
8504	NC_015184	CGT	2	6	496059	496064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168832
8505	NC_015184	CTT	3	9	496080	496088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168832
8506	NC_015184	CG	3	6	496119	496124	0 %	0 %	50 %	50 %	325168832
8507	NC_015184	TCC	2	6	496153	496158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168832
8508	NC_015184	ACC	2	6	496201	496206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168832
8509	NC_015184	CGCT	2	8	496309	496316	0 %	25 %	25 %	50 %	325168832
8510	NC_015184	CG	3	6	496346	496351	0 %	0 %	50 %	50 %	325168832
8511	NC_015184	CAC	2	6	496380	496385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168832
8512	NC_015184	GCT	2	6	496402	496407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168832
8513	NC_015184	CGAG	2	8	496463	496470	25 %	0 %	50 %	25 %	325168832
8514	NC_015184	T	6	6	496477	496482	0 %	100 %	0 %	0 %	325168832
8515	NC_015184	GATGT	2	10	496587	496596	20 %	40 %	40 %	0 %	325168832
8516	NC_015184	GC	3	6	496969	496974	0 %	0 %	50 %	50 %	325168833
8517	NC_015184	TGC	2	6	496995	497000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168833
8518	NC_015184	CCA	3	9	497004	497012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168833
8519	NC_015184	TTG	2	6	497123	497128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168833
8520	NC_015184	TCA	2	6	497159	497164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168833
8521	NC_015184	GAT	2	6	497187	497192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168833
8522	NC_015184	C	7	7	497196	497202	0 %	0 %	0 %	100 %	325168833
8523	NC_015184	CTC	2	6	497239	497244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168833
8524	NC_015184	TCG	2	6	497316	497321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168833
8525	NC_015184	GCC	2	6	497366	497371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168833
8526	NC_015184	GC	4	8	497381	497388	0 %	0 %	50 %	50 %	325168833
8527	NC_015184	GCT	2	6	497434	497439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168833
8528	NC_015184	ATG	2	6	497462	497467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168833
8529	NC_015184	GCC	2	6	497470	497475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168833
8530	NC_015184	CGG	2	6	497499	497504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168833
8531	NC_015184	TG	3	6	497616	497621	0 %	50 %	50 %	0 %	325168833
8532	NC_015184	GAG	2	6	497964	497969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168834
8533	NC_015184	TGC	2	6	498005	498010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168834
8534	NC_015184	CGT	2	6	498116	498121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168834
8535	NC_015184	GCC	3	9	498228	498236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168834
8536	NC_015184	TTG	2	6	498247	498252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168834
8537	NC_015184	CGCCAT	2	12	498278	498289	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325168834
8538	NC_015184	GTC	2	6	498351	498356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168834
8539	NC_015184	ACA	2	6	498412	498417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168834
8540	NC_015184	TGA	2	6	498436	498441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168834
8541	NC_015184	GGC	2	6	498462	498467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168834
8542	NC_015184	ATGGA	2	10	498516	498525	40 %	20 %	40 %	0 %	325168834
8543	NC_015184	GAC	2	6	498600	498605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168834
8544	NC_015184	GC	3	6	498673	498678	0 %	0 %	50 %	50 %	325168834
8545	NC_015184	TCT	3	9	498739	498747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168834
8546	NC_015184	GCTG	2	8	498851	498858	0 %	25 %	50 %	25 %	325168834
8547	NC_015184	GAA	3	9	498872	498880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168834
8548	NC_015184	GGCC	2	8	498893	498900	0 %	0 %	50 %	50 %	325168834
8549	NC_015184	CTG	2	6	498930	498935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168834
8550	NC_015184	GGC	2	6	499139	499144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168835
8551	NC_015184	CGA	2	6	499156	499161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168835
8552	NC_015184	TTGCC	2	10	499195	499204	0 %	40 %	20 %	40 %	325168835
8553	NC_015184	TCA	2	6	499233	499238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168835
8554	NC_015184	CAC	2	6	499328	499333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168835
8555	NC_015184	GC	3	6	499574	499579	0 %	0 %	50 %	50 %	325168835
8556	NC_015184	ATC	2	6	499583	499588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168835
8557	NC_015184	CGA	2	6	499599	499604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168835
8558	NC_015184	AGCG	2	8	499718	499725	25 %	0 %	50 %	25 %	325168835
8559	NC_015184	AAG	2	6	499748	499753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168835
8560	NC_015184	CGA	2	6	499780	499785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168835
8561	NC_015184	CG	3	6	499799	499804	0 %	0 %	50 %	50 %	325168835
8562	NC_015184	CTC	2	6	499845	499850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168835
8563	NC_015184	TC	3	6	499888	499893	0 %	50 %	0 %	50 %	325168835
8564	NC_015184	TCG	2	6	499944	499949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168835
8565	NC_015184	GGA	2	6	500104	500109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168835
8566	NC_015184	ATCG	2	8	500140	500147	25 %	25 %	25 %	25 %	325168835
8567	NC_015184	TCA	2	6	500196	500201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168835
8568	NC_015184	CGA	2	6	500215	500220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168835
8569	NC_015184	CGG	2	6	500293	500298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168835
8570	NC_015184	GCTG	2	8	500325	500332	0 %	25 %	50 %	25 %	325168835
8571	NC_015184	CAT	2	6	500410	500415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168835
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8573	NC_015184	TGA	2	6	500451	500456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168835
8574	NC_015184	CGA	2	6	500461	500466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168835
8575	NC_015184	GTG	2	6	500498	500503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168835
8576	NC_015184	TGA	2	6	500527	500532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168835
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8578	NC_015184	TAT	2	6	500633	500638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168836
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8582	NC_015184	GCT	2	6	500717	500722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168836
8583	NC_015184	CTG	2	6	500763	500768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168836
8584	NC_015184	TGA	2	6	500770	500775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168836
8585	NC_015184	CGG	2	6	500780	500785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168836
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8587	NC_015184	GGCT	2	8	500902	500909	0 %	25 %	50 %	25 %	325168836
8588	NC_015184	GAT	2	6	500948	500953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168836
8589	NC_015184	GATC	2	8	500980	500987	25 %	25 %	25 %	25 %	325168836
8590	NC_015184	TCG	2	6	501010	501015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168836
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8592	NC_015184	GGC	2	6	501210	501215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168836
8593	NC_015184	CGA	2	6	501256	501261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168836
8594	NC_015184	TCT	2	6	501262	501267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168836
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8601	NC_015184	CAT	2	6	501595	501600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168837
8602	NC_015184	TTCG	2	8	501607	501614	0 %	50 %	25 %	25 %	325168837
8603	NC_015184	ACA	3	9	501639	501647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168837
8604	NC_015184	TGA	2	6	501687	501692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168837
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8606	NC_015184	ATG	2	6	501782	501787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168837
8607	NC_015184	CGG	2	6	501802	501807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168837
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8609	NC_015184	ATC	2	6	501848	501853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168837
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8618	NC_015184	TCG	2	6	502158	502163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168837
8619	NC_015184	CAT	2	6	502171	502176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168837
8620	NC_015184	CTG	2	6	502187	502192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168837
8621	NC_015184	GCA	2	6	502244	502249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168837
8622	NC_015184	ATG	2	6	502277	502282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168837
8623	NC_015184	GGC	2	6	502412	502417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168837
8624	NC_015184	CATCGC	2	12	502453	502464	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325168837
8625	NC_015184	TGC	2	6	502479	502484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168837
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8640	NC_015184	CGCC	2	8	503060	503067	0 %	0 %	25 %	75 %	325168838
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8732	NC_015184	CGG	2	6	507771	507776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168841
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8862	NC_015184	GGC	2	6	515080	515085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168849
8863	NC_015184	CCT	2	6	515127	515132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168849
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8979	NC_015184	GCCA	2	8	521684	521691	25 %	0 %	25 %	50 %	325168855
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8981	NC_015184	ACA	2	6	521734	521739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168855
8982	NC_015184	ACC	2	6	521746	521751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168855
8983	NC_015184	GCG	2	6	521803	521808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168855
8984	NC_015184	CGGA	2	8	521822	521829	25 %	0 %	50 %	25 %	325168855
8985	NC_015184	GCG	2	6	521854	521859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168855
8986	NC_015184	GGC	2	6	521923	521928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168855
8987	NC_015184	TGC	2	6	521956	521961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168855
8988	NC_015184	TGA	2	6	521996	522001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168855
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8990	NC_015184	CCG	2	6	522026	522031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168855
8991	NC_015184	GCT	2	6	522055	522060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168855
8992	NC_015184	CGC	2	6	522093	522098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168855
8993	NC_015184	TCA	2	6	522119	522124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168855
8994	NC_015184	TGA	2	6	522206	522211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168856
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8996	NC_015184	GAT	2	6	522248	522253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168856
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8999	NC_015184	CTGCCG	2	12	522372	522383	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325168856
9000	NC_015184	GTT	2	6	522389	522394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168856

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