MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015184	AGGC	2	8	407218	407225	25 %	0 %	50 %	25 %	325168739
7002	NC_015184	TCG	2	6	407227	407232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168739
7003	NC_015184	ATG	2	6	407245	407250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168739
7004	NC_015184	TGGG	2	8	407277	407284	0 %	25 %	75 %	0 %	325168739
7005	NC_015184	AAGG	2	8	407358	407365	50 %	0 %	50 %	0 %	325168739
7006	NC_015184	CAT	2	6	407369	407374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168739
7007	NC_015184	TTG	2	6	407422	407427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168739
7008	NC_015184	CGCA	2	8	407501	407508	25 %	0 %	25 %	50 %	325168739
7009	NC_015184	CGGC	2	8	407522	407529	0 %	0 %	50 %	50 %	325168739
7010	NC_015184	AGG	2	6	407555	407560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168739
7011	NC_015184	CCA	2	6	407653	407658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168739
7012	NC_015184	GGC	2	6	407670	407675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168739
7013	NC_015184	TCA	2	6	407695	407700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168739
7014	NC_015184	GCC	2	6	407770	407775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168739
7015	NC_015184	GCG	2	6	407892	407897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168740
7016	NC_015184	GCTG	2	8	407909	407916	0 %	25 %	50 %	25 %	325168740
7017	NC_015184	CGG	2	6	408001	408006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168740
7018	NC_015184	ATC	2	6	408007	408012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168740
7019	NC_015184	TC	3	6	408023	408028	0 %	50 %	0 %	50 %	325168740
7020	NC_015184	CGAG	2	8	408056	408063	25 %	0 %	50 %	25 %	325168740
7021	NC_015184	CAC	2	6	408076	408081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168740
7022	NC_015184	TGC	2	6	408193	408198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168740
7023	NC_015184	CGT	2	6	408281	408286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168740
7024	NC_015184	GCG	2	6	408297	408302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168740
7025	NC_015184	GCACA	2	10	408312	408321	40 %	0 %	20 %	40 %	325168740
7026	NC_015184	CCG	2	6	408416	408421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168740
7027	NC_015184	GAAT	2	8	408443	408450	50 %	25 %	25 %	0 %	325168740
7028	NC_015184	TGG	2	6	408499	408504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168740
7029	NC_015184	GGCCT	2	10	408706	408715	0 %	20 %	40 %	40 %	325168741
7030	NC_015184	TCA	2	6	408724	408729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168741
7031	NC_015184	CGC	2	6	408792	408797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168741
7032	NC_015184	AAG	2	6	408811	408816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168741
7033	NC_015184	GC	3	6	408871	408876	0 %	0 %	50 %	50 %	325168741
7034	NC_015184	CTG	2	6	409144	409149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168742
7035	NC_015184	TTG	2	6	409198	409203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168742
7036	NC_015184	GCGA	2	8	409250	409257	25 %	0 %	50 %	25 %	325168742
7037	NC_015184	TGGA	2	8	409308	409315	25 %	25 %	50 %	0 %	325168742
7038	NC_015184	CGTC	2	8	409356	409363	0 %	25 %	25 %	50 %	325168742
7039	NC_015184	AGC	2	6	409412	409417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168742
7040	NC_015184	CAG	2	6	409437	409442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168742
7041	NC_015184	GAT	2	6	409471	409476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168742
7042	NC_015184	GCA	2	6	409510	409515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168742
7043	NC_015184	AAG	2	6	409553	409558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168742
7044	NC_015184	CAG	2	6	409675	409680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168742
7045	NC_015184	CG	3	6	409764	409769	0 %	0 %	50 %	50 %	325168742
7046	NC_015184	CAT	2	6	409785	409790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168742
7047	NC_015184	GTG	2	6	409818	409823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168742
7048	NC_015184	TGG	2	6	409944	409949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168743
7049	NC_015184	T	6	6	410077	410082	0 %	100 %	0 %	0 %	325168743
7050	NC_015184	TTGC	2	8	410097	410104	0 %	50 %	25 %	25 %	325168743
7051	NC_015184	TGT	2	6	410129	410134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168743
7052	NC_015184	GC	3	6	410135	410140	0 %	0 %	50 %	50 %	325168743
7053	NC_015184	GCCT	2	8	410166	410173	0 %	25 %	25 %	50 %	325168743
7054	NC_015184	ACC	2	6	410232	410237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168743
7055	NC_015184	CCG	2	6	410466	410471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168744
7056	NC_015184	ATG	2	6	410555	410560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168744
7057	NC_015184	CGG	2	6	410598	410603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168744
7058	NC_015184	CGGGC	2	10	410634	410643	0 %	0 %	60 %	40 %	325168744
7059	NC_015184	GC	3	6	410695	410700	0 %	0 %	50 %	50 %	325168745
7060	NC_015184	GCC	2	6	410717	410722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168745
7061	NC_015184	AAT	2	6	410729	410734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168745
7062	NC_015184	CCA	2	6	410760	410765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168745
7063	NC_015184	TTC	2	6	410766	410771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168745
7064	NC_015184	ATAA	2	8	410829	410836	75 %	25 %	0 %	0 %	325168745
7065	NC_015184	GCC	3	9	410877	410885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168745
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7067	NC_015184	TTC	2	6	410925	410930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168745
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7070	NC_015184	CTT	2	6	411031	411036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168745
7071	NC_015184	GCT	2	6	411071	411076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168745
7072	NC_015184	CCA	2	6	411098	411103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168745
7073	NC_015184	ATG	2	6	411157	411162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168745
7074	NC_015184	CGA	2	6	411164	411169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168745
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7081	NC_015184	CG	4	8	411488	411495	0 %	0 %	50 %	50 %	325168745
7082	NC_015184	CCA	2	6	411521	411526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168745
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7085	NC_015184	CG	4	8	411988	411995	0 %	0 %	50 %	50 %	325168746
7086	NC_015184	GC	3	6	412064	412069	0 %	0 %	50 %	50 %	325168746
7087	NC_015184	AC	3	6	412276	412281	50 %	0 %	0 %	50 %	325168746
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7093	NC_015184	GCT	2	6	412536	412541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168746
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7100	NC_015184	TGC	2	6	413252	413257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168748
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7102	NC_015184	GCC	2	6	413298	413303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168748
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7105	NC_015184	GCT	2	6	413416	413421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168748
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7113	NC_015184	AGGT	2	8	413830	413837	25 %	25 %	50 %	0 %	325168749
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7122	NC_015184	TCA	2	6	414175	414180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168749
7123	NC_015184	CG	3	6	414206	414211	0 %	0 %	50 %	50 %	325168749
7124	NC_015184	GCT	2	6	414345	414350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168750
7125	NC_015184	ACG	2	6	414373	414378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168750
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7127	NC_015184	TCGA	2	8	414543	414550	25 %	25 %	25 %	25 %	325168750
7128	NC_015184	TCC	2	6	414682	414687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168750
7129	NC_015184	GCA	2	6	414690	414695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168750
7130	NC_015184	TGA	2	6	414737	414742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168750
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7132	NC_015184	TCT	2	6	414767	414772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168750
7133	NC_015184	GCAAAA	2	12	414819	414830	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	325168750
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7135	NC_015184	TTCG	2	8	414873	414880	0 %	50 %	25 %	25 %	325168750
7136	NC_015184	CGACC	2	10	414913	414922	20 %	0 %	20 %	60 %	325168750
7137	NC_015184	GCA	2	6	414933	414938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168750
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7142	NC_015184	GC	3	6	415099	415104	0 %	0 %	50 %	50 %	325168750
7143	NC_015184	GTG	2	6	415146	415151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168750
7144	NC_015184	ACTG	2	8	415248	415255	25 %	25 %	25 %	25 %	325168750
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7147	NC_015184	CCG	2	6	415778	415783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168751
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7152	NC_015184	GCA	2	6	415964	415969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168751
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7155	NC_015184	CAG	2	6	416081	416086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168751
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7243	NC_015184	CG	3	6	421731	421736	0 %	0 %	50 %	50 %	325168760
7244	NC_015184	ACGC	2	8	421744	421751	25 %	0 %	25 %	50 %	325168760
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7363	NC_015184	GAA	2	6	428090	428095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168766
7364	NC_015184	TCC	2	6	428145	428150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168766
7365	NC_015184	ATG	2	6	428175	428180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168766
7366	NC_015184	GCA	2	6	428283	428288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168767
7367	NC_015184	AACG	2	8	428335	428342	50 %	0 %	25 %	25 %	325168767
7368	NC_015184	GTT	2	6	428551	428556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168767
7369	NC_015184	GAT	2	6	428578	428583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168767
7370	NC_015184	GAT	2	6	428589	428594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168767
7371	NC_015184	TGAA	2	8	428621	428628	50 %	25 %	25 %	0 %	325168767
7372	NC_015184	GAC	2	6	428647	428652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168767
7373	NC_015184	GCT	2	6	428816	428821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168767
7374	NC_015184	GCG	2	6	428843	428848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168767
7375	NC_015184	GC	3	6	428922	428927	0 %	0 %	50 %	50 %	325168768
7376	NC_015184	TG	3	6	428970	428975	0 %	50 %	50 %	0 %	325168768
7377	NC_015184	AGC	2	6	428982	428987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168768
7378	NC_015184	CTG	2	6	429002	429007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168768
7379	NC_015184	TTG	2	6	429053	429058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168768
7380	NC_015184	T	6	6	429060	429065	0 %	100 %	0 %	0 %	325168768
7381	NC_015184	AACGG	2	10	429106	429115	40 %	0 %	40 %	20 %	325168768
7382	NC_015184	GAA	2	6	429305	429310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168769
7383	NC_015184	CTCATC	2	12	429380	429391	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325168770
7384	NC_015184	AGA	2	6	429394	429399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168770
7385	NC_015184	ATT	2	6	429419	429424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168770
7386	NC_015184	CG	4	8	429436	429443	0 %	0 %	50 %	50 %	325168770
7387	NC_015184	CGT	2	6	429454	429459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168770
7388	NC_015184	CAT	2	6	429491	429496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168770
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7391	NC_015184	CGA	2	6	429658	429663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168770
7392	NC_015184	GTC	2	6	429668	429673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168770
7393	NC_015184	CGG	2	6	429722	429727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168770
7394	NC_015184	GGC	2	6	429871	429876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168770
7395	NC_015184	TCG	2	6	429909	429914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168770
7396	NC_015184	AGGCG	2	10	429931	429940	20 %	0 %	60 %	20 %	325168770
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7400	NC_015184	TGG	2	6	430138	430143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168771
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7402	NC_015184	GCT	3	9	430229	430237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168771
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7404	NC_015184	CGTGC	2	10	430356	430365	0 %	20 %	40 %	40 %	325168771
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7434	NC_015184	GTGC	2	8	432605	432612	0 %	25 %	50 %	25 %	325168773
7435	NC_015184	CGT	2	6	432637	432642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168773
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7483	NC_015184	CTG	2	6	434938	434943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168774
7484	NC_015184	TCG	2	6	434987	434992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168774
7485	NC_015184	GAT	2	6	435051	435056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168774
7486	NC_015184	CGT	2	6	435087	435092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168774
7487	NC_015184	GCCC	2	8	435126	435133	0 %	0 %	25 %	75 %	325168774
7488	NC_015184	CGCGG	2	10	435138	435147	0 %	0 %	60 %	40 %	325168774
7489	NC_015184	GA	3	6	435171	435176	50 %	0 %	50 %	0 %	325168774
7490	NC_015184	AAG	2	6	435296	435301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168775
7491	NC_015184	GC	3	6	435310	435315	0 %	0 %	50 %	50 %	325168775
7492	NC_015184	GTGG	2	8	435439	435446	0 %	25 %	75 %	0 %	325168775
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7497	NC_015184	TCG	2	6	435657	435662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168775
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7499	NC_015184	TCGG	2	8	435899	435906	0 %	25 %	50 %	25 %	325168776
7500	NC_015184	CAG	2	6	436042	436047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168776

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