MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_015183	CCA	2	6	2533927	2533932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293949
49002	NC_015183	CGA	3	9	2533948	2533956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293949
49003	NC_015183	ATC	2	6	2534024	2534029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293949
49004	NC_015183	TCA	2	6	2534303	2534308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293950
49005	NC_015183	TCGC	2	8	2534344	2534351	0 %	25 %	25 %	50 %	325293950
49006	NC_015183	CCG	2	6	2534369	2534374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293950
49007	NC_015183	CAG	2	6	2534418	2534423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293950
49008	NC_015183	CTG	2	6	2534425	2534430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293950
49009	NC_015183	GGT	3	9	2534442	2534450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293950
49010	NC_015183	TGTC	2	8	2534454	2534461	0 %	50 %	25 %	25 %	325293950
49011	NC_015183	ATC	2	6	2534554	2534559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293950
49012	NC_015183	ACA	2	6	2534597	2534602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293950
49013	NC_015183	CAA	2	6	2534643	2534648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293950
49014	NC_015183	TTG	2	6	2534791	2534796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293950
49015	NC_015183	GCCG	2	8	2534818	2534825	0 %	0 %	50 %	50 %	325293950
49016	NC_015183	CTGG	2	8	2534826	2534833	0 %	25 %	50 %	25 %	325293950
49017	NC_015183	AGG	2	6	2534834	2534839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293950
49018	NC_015183	TCC	2	6	2534859	2534864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293950
49019	NC_015183	ACC	2	6	2534878	2534883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293950
49020	NC_015183	GAC	2	6	2534893	2534898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293950
49021	NC_015183	GCG	2	6	2534996	2535001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293950
49022	NC_015183	GC	3	6	2535061	2535066	0 %	0 %	50 %	50 %	325293950
49023	NC_015183	CAG	2	6	2535096	2535101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293950
49024	NC_015183	ATT	2	6	2535119	2535124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293950
49025	NC_015183	GCG	2	6	2535131	2535136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293950
49026	NC_015183	CGGCT	2	10	2535253	2535262	0 %	20 %	40 %	40 %	325293950
49027	NC_015183	CCCA	2	8	2535274	2535281	25 %	0 %	0 %	75 %	325293950
49028	NC_015183	CGC	2	6	2535308	2535313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293950
49029	NC_015183	CGT	2	6	2535438	2535443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293950
49030	NC_015183	TCT	2	6	2535447	2535452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293950
49031	NC_015183	TCG	2	6	2535470	2535475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293950
49032	NC_015183	GGA	2	6	2535496	2535501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293950
49033	NC_015183	TGCC	2	8	2535567	2535574	0 %	25 %	25 %	50 %	325293950
49034	NC_015183	GCC	2	6	2535589	2535594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293950
49035	NC_015183	TGAA	2	8	2535623	2535630	50 %	25 %	25 %	0 %	325293950
49036	NC_015183	GTA	2	6	2535667	2535672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293950
49037	NC_015183	CGA	2	6	2535689	2535694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293950
49038	NC_015183	CCAAGG	2	12	2535776	2535787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293950
49039	NC_015183	GCC	2	6	2535796	2535801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293950
49040	NC_015183	CAT	2	6	2535822	2535827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293950
49041	NC_015183	GCGAA	2	10	2535855	2535864	40 %	0 %	40 %	20 %	325293950
49042	NC_015183	A	6	6	2535863	2535868	100 %	0 %	0 %	0 %	325293950
49043	NC_015183	AGA	2	6	2535918	2535923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293950
49044	NC_015183	GAGC	2	8	2535924	2535931	25 %	0 %	50 %	25 %	325293950
49045	NC_015183	CGGT	2	8	2536005	2536012	0 %	25 %	50 %	25 %	325293951
49046	NC_015183	CCGGCA	2	12	2536024	2536035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325293951
49047	NC_015183	GAT	2	6	2536051	2536056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293951
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49049	NC_015183	GCC	2	6	2536182	2536187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293951
49050	NC_015183	AGA	2	6	2536256	2536261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293951
49051	NC_015183	GC	3	6	2536267	2536272	0 %	0 %	50 %	50 %	325293951
49052	NC_015183	GCG	2	6	2536298	2536303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293951
49053	NC_015183	GTCC	2	8	2536464	2536471	0 %	25 %	25 %	50 %	325293951
49054	NC_015183	TGA	2	6	2536550	2536555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293952
49055	NC_015183	GCG	2	6	2536564	2536569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293952
49056	NC_015183	GCG	2	6	2536610	2536615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293952
49057	NC_015183	ATA	2	6	2536773	2536778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293952
49058	NC_015183	CGC	3	9	2536787	2536795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293952
49059	NC_015183	TTC	2	6	2536852	2536857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293952
49060	NC_015183	GACC	2	8	2536868	2536875	25 %	0 %	25 %	50 %	325293952
49061	NC_015183	ATGAC	2	10	2536942	2536951	40 %	20 %	20 %	20 %	325293952
49062	NC_015183	TCG	2	6	2536994	2536999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293952
49063	NC_015183	GATC	2	8	2537039	2537046	25 %	25 %	25 %	25 %	325293952
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49065	NC_015183	CCGGG	2	10	2537069	2537078	0 %	0 %	60 %	40 %	325293952
49066	NC_015183	CGC	2	6	2537112	2537117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293952
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49070	NC_015183	GTCG	2	8	2537451	2537458	0 %	25 %	50 %	25 %	325293952
49071	NC_015183	GGT	2	6	2537469	2537474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293952
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49075	NC_015183	ATCG	2	8	2537709	2537716	25 %	25 %	25 %	25 %	325293952
49076	NC_015183	CGA	2	6	2537747	2537752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293952
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49082	NC_015183	GCG	2	6	2538193	2538198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293953
49083	NC_015183	GC	3	6	2538242	2538247	0 %	0 %	50 %	50 %	325293953
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49090	NC_015183	CG	3	6	2538610	2538615	0 %	0 %	50 %	50 %	325293953
49091	NC_015183	ATC	2	6	2538667	2538672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293953
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49098	NC_015183	CGC	2	6	2539053	2539058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293953
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49105	NC_015183	GCA	2	6	2539295	2539300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293954
49106	NC_015183	GAAA	2	8	2539367	2539374	75 %	0 %	25 %	0 %	325293954
49107	NC_015183	CGA	2	6	2539418	2539423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293954
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49112	NC_015183	CAT	2	6	2539725	2539730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293954
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49114	NC_015183	CG	3	6	2539799	2539804	0 %	0 %	50 %	50 %	325293954
49115	NC_015183	CGG	2	6	2539816	2539821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293954
49116	NC_015183	TCA	2	6	2539825	2539830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293954
49117	NC_015183	ACC	2	6	2539866	2539871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293955
49118	NC_015183	TGG	2	6	2539877	2539882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293955
49119	NC_015183	CCT	2	6	2539907	2539912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293955
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49121	NC_015183	CAA	2	6	2539943	2539948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293955
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49123	NC_015183	ACC	2	6	2540015	2540020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293955
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49127	NC_015183	TTC	2	6	2540157	2540162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293955
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49139	NC_015183	TTC	2	6	2541115	2541120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293956
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49145	NC_015183	A	6	6	2541439	2541444	100 %	0 %	0 %	0 %	325293956
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49152	NC_015183	TGC	2	6	2541673	2541678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293956
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49156	NC_015183	CGA	2	6	2541767	2541772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293956
49157	NC_015183	GCC	2	6	2541816	2541821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293956
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49201	NC_015183	CTG	2	6	2543771	2543776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293957
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49205	NC_015183	TCGC	2	8	2544017	2544024	0 %	25 %	25 %	50 %	325293957
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49208	NC_015183	ATC	2	6	2544242	2544247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293957
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49215	NC_015183	A	6	6	2544572	2544577	100 %	0 %	0 %	0 %	325293957
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49217	NC_015183	CTGG	2	8	2544616	2544623	0 %	25 %	50 %	25 %	325293957
49218	NC_015183	GCA	2	6	2544643	2544648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293957
49219	NC_015183	GC	3	6	2544675	2544680	0 %	0 %	50 %	50 %	325293957
49220	NC_015183	CGT	2	6	2544688	2544693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293957
49221	NC_015183	TGC	2	6	2544808	2544813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293958
49222	NC_015183	CTGATC	2	12	2544852	2544863	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293958
49223	NC_015183	CAT	2	6	2544881	2544886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293958
49224	NC_015183	GCC	2	6	2544893	2544898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293958
49225	NC_015183	ATT	2	6	2544904	2544909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293958
49226	NC_015183	GC	3	6	2544932	2544937	0 %	0 %	50 %	50 %	325293958
49227	NC_015183	GAG	2	6	2544969	2544974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293958
49228	NC_015183	CAT	2	6	2545139	2545144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293958
49229	NC_015183	TCA	2	6	2545402	2545407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293958
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49231	NC_015183	CCG	2	6	2545436	2545441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293958
49232	NC_015183	GC	3	6	2545445	2545450	0 %	0 %	50 %	50 %	325293958
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49342	NC_015183	ATG	2	6	2550886	2550891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293963
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49344	NC_015183	C	7	7	2550959	2550965	0 %	0 %	0 %	100 %	325293963
49345	NC_015183	AAC	2	6	2551029	2551034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293963
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49347	NC_015183	GGC	2	6	2551076	2551081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293963
49348	NC_015183	TTC	2	6	2551086	2551091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293963
49349	NC_015183	CAC	2	6	2551137	2551142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293963
49350	NC_015183	CGC	2	6	2551155	2551160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293963
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49354	NC_015183	CG	3	6	2551202	2551207	0 %	0 %	50 %	50 %	325293963
49355	NC_015183	GC	3	6	2551225	2551230	0 %	0 %	50 %	50 %	325293963
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49449	NC_015183	GCA	2	6	2555364	2555369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293966
49450	NC_015183	ACG	3	9	2555423	2555431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293966
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49454	NC_015183	TGCC	2	8	2555601	2555608	0 %	25 %	25 %	50 %	325293966
49455	NC_015183	CG	3	6	2555773	2555778	0 %	0 %	50 %	50 %	325293966
49456	NC_015183	TG	3	6	2555780	2555785	0 %	50 %	50 %	0 %	325293966
49457	NC_015183	GGC	2	6	2555903	2555908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293966
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49459	NC_015183	GTGAAG	2	12	2556041	2556052	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325293966
49460	NC_015183	ATG	2	6	2556116	2556121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293966
49461	NC_015183	AGT	2	6	2556162	2556167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293967
49462	NC_015183	GCG	2	6	2556195	2556200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293967
49463	NC_015183	CCTGC	2	10	2556201	2556210	0 %	20 %	20 %	60 %	325293967
49464	NC_015183	GGCA	2	8	2556230	2556237	25 %	0 %	50 %	25 %	325293967
49465	NC_015183	CGC	2	6	2556240	2556245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293967
49466	NC_015183	GCTTC	2	10	2556333	2556342	0 %	40 %	20 %	40 %	325293967
49467	NC_015183	GCC	2	6	2556365	2556370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293967
49468	NC_015183	TGCG	2	8	2556386	2556393	0 %	25 %	50 %	25 %	325293967
49469	NC_015183	GCCT	2	8	2556475	2556482	0 %	25 %	25 %	50 %	325293967
49470	NC_015183	TGA	2	6	2556540	2556545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293967
49471	NC_015183	TGCG	2	8	2556554	2556561	0 %	25 %	50 %	25 %	325293967
49472	NC_015183	GTCGT	2	10	2556644	2556653	0 %	40 %	40 %	20 %	325293967
49473	NC_015183	GCA	2	6	2556671	2556676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293967
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49475	NC_015183	CCA	2	6	2556834	2556839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293967
49476	NC_015183	ACC	2	6	2556842	2556847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293967
49477	NC_015183	CGCC	2	8	2556894	2556901	0 %	0 %	25 %	75 %	325293967
49478	NC_015183	ACG	2	6	2556911	2556916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293967
49479	NC_015183	TCCTG	2	10	2556930	2556939	0 %	40 %	20 %	40 %	325293967
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49483	NC_015183	CCG	2	6	2557183	2557188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293968
49484	NC_015183	GAT	2	6	2557206	2557211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293968
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49489	NC_015183	GAT	2	6	2557382	2557387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293968
49490	NC_015183	CTTC	2	8	2557393	2557400	0 %	50 %	0 %	50 %	325293968
49491	NC_015183	TCA	3	9	2557414	2557422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293968
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49494	NC_015183	TCG	2	6	2557566	2557571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293968
49495	NC_015183	GCA	2	6	2557597	2557602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293968
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49499	NC_015183	GCGG	2	8	2557793	2557800	0 %	0 %	75 %	25 %	325293968
49500	NC_015183	GAT	2	6	2557808	2557813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293968

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