MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_015183	CTG	2	6	2473264	2473269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293901
48002	NC_015183	GCT	2	6	2473284	2473289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293901
48003	NC_015183	GGC	2	6	2473336	2473341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293901
48004	NC_015183	CGG	2	6	2473362	2473367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293901
48005	NC_015183	GCA	2	6	2473460	2473465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293901
48006	NC_015183	GC	4	8	2473535	2473542	0 %	0 %	50 %	50 %	325293901
48007	NC_015183	CGG	2	6	2473551	2473556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293901
48008	NC_015183	AGA	2	6	2473568	2473573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293901
48009	NC_015183	TCT	2	6	2473608	2473613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293901
48010	NC_015183	GAC	2	6	2473679	2473684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293901
48011	NC_015183	GC	3	6	2473687	2473692	0 %	0 %	50 %	50 %	325293901
48012	NC_015183	CGAGGC	2	12	2473756	2473767	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325293901
48013	NC_015183	GGA	2	6	2473843	2473848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293901
48014	NC_015183	TGCC	2	8	2473992	2473999	0 %	25 %	25 %	50 %	325293901
48015	NC_015183	GC	3	6	2474032	2474037	0 %	0 %	50 %	50 %	325293901
48016	NC_015183	GCT	2	6	2474137	2474142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293901
48017	NC_015183	CAG	2	6	2474209	2474214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293901
48018	NC_015183	TCA	2	6	2474234	2474239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293901
48019	NC_015183	GCC	2	6	2474240	2474245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293901
48020	NC_015183	TTC	2	6	2474257	2474262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293901
48021	NC_015183	ACG	2	6	2474346	2474351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293901
48022	NC_015183	GCGA	2	8	2474354	2474361	25 %	0 %	50 %	25 %	325293901
48023	NC_015183	ATC	2	6	2474395	2474400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293901
48024	NC_015183	CG	4	8	2474446	2474453	0 %	0 %	50 %	50 %	325293901
48025	NC_015183	GCC	2	6	2474522	2474527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293901
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48027	NC_015183	GCA	2	6	2474555	2474560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293901
48028	NC_015183	GAT	2	6	2474563	2474568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293901
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48030	NC_015183	GCCG	2	8	2474698	2474705	0 %	0 %	50 %	50 %	325293901
48031	NC_015183	CG	3	6	2474808	2474813	0 %	0 %	50 %	50 %	325293902
48032	NC_015183	GAA	2	6	2474869	2474874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293902
48033	NC_015183	TGA	2	6	2474896	2474901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293902
48034	NC_015183	CCGC	2	8	2474917	2474924	0 %	0 %	25 %	75 %	325293902
48035	NC_015183	CGG	3	9	2474942	2474950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293902
48036	NC_015183	GCTG	2	8	2474954	2474961	0 %	25 %	50 %	25 %	325293902
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48041	NC_015183	AG	3	6	2475304	2475309	50 %	0 %	50 %	0 %	325293902
48042	NC_015183	CCT	2	6	2475339	2475344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293903
48043	NC_015183	TGA	2	6	2475462	2475467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293903
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48045	NC_015183	GAT	2	6	2475484	2475489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293903
48046	NC_015183	GAC	2	6	2475532	2475537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293903
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48049	NC_015183	TCG	2	6	2475650	2475655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293903
48050	NC_015183	CCG	2	6	2475684	2475689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293903
48051	NC_015183	AAC	2	6	2475705	2475710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293903
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48053	NC_015183	GAT	2	6	2475739	2475744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293903
48054	NC_015183	CAC	2	6	2475841	2475846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293903
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48056	NC_015183	GCA	2	6	2475921	2475926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293903
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48058	NC_015183	GCCG	2	8	2476090	2476097	0 %	0 %	50 %	50 %	325293903
48059	NC_015183	T	6	6	2476113	2476118	0 %	100 %	0 %	0 %	325293903
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48074	NC_015183	AACCGG	2	12	2476814	2476825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293903
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48083	NC_015183	CGG	2	6	2477357	2477362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293904
48084	NC_015183	GC	4	8	2477368	2477375	0 %	0 %	50 %	50 %	325293904
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48097	NC_015183	TCA	2	6	2477961	2477966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293905
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48099	NC_015183	GTT	2	6	2478023	2478028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293906
48100	NC_015183	CGC	2	6	2478117	2478122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293906
48101	NC_015183	ACA	2	6	2478160	2478165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293906
48102	NC_015183	CTT	2	6	2478195	2478200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293906
48103	NC_015183	AG	3	6	2478218	2478223	50 %	0 %	50 %	0 %	325293906
48104	NC_015183	CGA	2	6	2478245	2478250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293906
48105	NC_015183	GCC	2	6	2478324	2478329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293906
48106	NC_015183	GCA	2	6	2478350	2478355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293906
48107	NC_015183	TCA	2	6	2478421	2478426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293906
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48109	NC_015183	AGAT	2	8	2478502	2478509	50 %	25 %	25 %	0 %	325293906
48110	NC_015183	GAT	2	6	2478633	2478638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293906
48111	NC_015183	GC	3	6	2478696	2478701	0 %	0 %	50 %	50 %	325293906
48112	NC_015183	CT	3	6	2478808	2478813	0 %	50 %	0 %	50 %	325293906
48113	NC_015183	GGCC	2	8	2478832	2478839	0 %	0 %	50 %	50 %	325293906
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48115	NC_015183	CCA	2	6	2478941	2478946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293906
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48220	NC_015183	CGG	2	6	2485550	2485555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293911
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48223	NC_015183	TGC	2	6	2485805	2485810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293912
48224	NC_015183	TCG	2	6	2485882	2485887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293912
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48226	NC_015183	A	6	6	2485973	2485978	100 %	0 %	0 %	0 %	325293912
48227	NC_015183	TCGG	2	8	2485992	2485999	0 %	25 %	50 %	25 %	325293912
48228	NC_015183	TTG	2	6	2486073	2486078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293912
48229	NC_015183	ACG	2	6	2486118	2486123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293912
48230	NC_015183	GATC	2	8	2486195	2486202	25 %	25 %	25 %	25 %	325293912
48231	NC_015183	GCA	2	6	2486223	2486228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293912
48232	NC_015183	TCG	2	6	2486407	2486412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293912
48233	NC_015183	AGTCT	2	10	2486622	2486631	20 %	40 %	20 %	20 %	325293913
48234	NC_015183	GGT	2	6	2486648	2486653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293913
48235	NC_015183	TCA	2	6	2486748	2486753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293913
48236	NC_015183	CT	3	6	2486800	2486805	0 %	50 %	0 %	50 %	325293913
48237	NC_015183	G	6	6	2486811	2486816	0 %	0 %	100 %	0 %	325293913
48238	NC_015183	ATC	2	6	2486831	2486836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293913
48239	NC_015183	CTG	2	6	2486840	2486845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293913
48240	NC_015183	TTCTT	2	10	2486846	2486855	0 %	80 %	0 %	20 %	325293913
48241	NC_015183	TGC	2	6	2486896	2486901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293913
48242	NC_015183	TCA	2	6	2486925	2486930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293913
48243	NC_015183	CAT	2	6	2486935	2486940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293913
48244	NC_015183	CAT	3	9	2487067	2487075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293913
48245	NC_015183	AAC	2	6	2487110	2487115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293913
48246	NC_015183	GC	3	6	2487178	2487183	0 %	0 %	50 %	50 %	325293913
48247	NC_015183	TCTT	2	8	2487225	2487232	0 %	75 %	0 %	25 %	325293913
48248	NC_015183	CGT	2	6	2487241	2487246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293913
48249	NC_015183	CAT	2	6	2487262	2487267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293913
48250	NC_015183	GCT	2	6	2487521	2487526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293914
48251	NC_015183	TAC	2	6	2487546	2487551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293914
48252	NC_015183	GTG	2	6	2487593	2487598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293914
48253	NC_015183	GC	3	6	2487615	2487620	0 %	0 %	50 %	50 %	325293914
48254	NC_015183	ATGGCG	2	12	2487630	2487641	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325293914
48255	NC_015183	GCC	2	6	2487651	2487656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293914
48256	NC_015183	ATT	2	6	2487683	2487688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293914
48257	NC_015183	CCG	2	6	2487752	2487757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293914
48258	NC_015183	CTGC	2	8	2487789	2487796	0 %	25 %	25 %	50 %	325293914
48259	NC_015183	TCG	2	6	2487817	2487822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293914
48260	NC_015183	TGA	2	6	2487886	2487891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293914
48261	NC_015183	TCA	2	6	2487946	2487951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293914
48262	NC_015183	GC	3	6	2488008	2488013	0 %	0 %	50 %	50 %	325293914
48263	NC_015183	TGTCA	2	10	2488157	2488166	20 %	40 %	20 %	20 %	325293915
48264	NC_015183	TCA	2	6	2488226	2488231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293915
48265	NC_015183	CCG	2	6	2488298	2488303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293915
48266	NC_015183	GAAC	2	8	2488305	2488312	50 %	0 %	25 %	25 %	325293915
48267	NC_015183	GCA	2	6	2488354	2488359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293915
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48269	NC_015183	GATA	2	8	2488553	2488560	50 %	25 %	25 %	0 %	325293915
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48272	NC_015183	CTC	2	6	2488653	2488658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293915
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48282	NC_015183	GCC	2	6	2489200	2489205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293915
48283	NC_015183	GCCT	2	8	2489226	2489233	0 %	25 %	25 %	50 %	325293915
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48288	NC_015183	CAAC	2	8	2489763	2489770	50 %	0 %	0 %	50 %	325293916
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48293	NC_015183	GAG	2	6	2490219	2490224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293916
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48300	NC_015183	CAGCG	2	10	2490539	2490548	20 %	0 %	40 %	40 %	325293916
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48303	NC_015183	CG	3	6	2490883	2490888	0 %	0 %	50 %	50 %	325293917
48304	NC_015183	GGAT	2	8	2490933	2490940	25 %	25 %	50 %	0 %	325293917
48305	NC_015183	CTTC	2	8	2491050	2491057	0 %	50 %	0 %	50 %	325293917
48306	NC_015183	AGGC	2	8	2491083	2491090	25 %	0 %	50 %	25 %	325293917
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48312	NC_015183	TGC	2	6	2491314	2491319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293917
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48317	NC_015183	T	8	8	2496359	2496366	0 %	100 %	0 %	0 %	325293918
48318	NC_015183	CCAC	2	8	2496398	2496405	25 %	0 %	0 %	75 %	325293918
48319	NC_015183	GC	4	8	2496434	2496441	0 %	0 %	50 %	50 %	325293918
48320	NC_015183	AGCGA	2	10	2496449	2496458	40 %	0 %	40 %	20 %	325293918
48321	NC_015183	TCAA	2	8	2496489	2496496	50 %	25 %	0 %	25 %	325293918
48322	NC_015183	TAC	2	6	2499176	2499181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293919
48323	NC_015183	TATCA	2	10	2499229	2499238	40 %	40 %	0 %	20 %	325293919
48324	NC_015183	GTC	2	6	2499380	2499385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293919
48325	NC_015183	GTG	2	6	2499419	2499424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293919
48326	NC_015183	CAC	2	6	2499445	2499450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293919
48327	NC_015183	CGA	2	6	2499561	2499566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293919
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48329	NC_015183	ACG	2	6	2499588	2499593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293919
48330	NC_015183	GCCG	2	8	2499604	2499611	0 %	0 %	50 %	50 %	325293919
48331	NC_015183	GAA	2	6	2499622	2499627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293919
48332	NC_015183	TCG	2	6	2499723	2499728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293919
48333	NC_015183	CGA	2	6	2499778	2499783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293919
48334	NC_015183	CAG	2	6	2499799	2499804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293919
48335	NC_015183	AG	3	6	2499832	2499837	50 %	0 %	50 %	0 %	325293919
48336	NC_015183	CGGC	2	8	2499854	2499861	0 %	0 %	50 %	50 %	325293919
48337	NC_015183	GAC	2	6	2499920	2499925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293919
48338	NC_015183	TA	3	6	2499969	2499974	50 %	50 %	0 %	0 %	325293919
48339	NC_015183	CGA	2	6	2500015	2500020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293919
48340	NC_015183	CGC	2	6	2500032	2500037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293919
48341	NC_015183	GAA	2	6	2500125	2500130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293920
48342	NC_015183	CCG	2	6	2500163	2500168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293920
48343	NC_015183	CGG	2	6	2500177	2500182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293920
48344	NC_015183	GAA	2	6	2500201	2500206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293920
48345	NC_015183	CGC	2	6	2500251	2500256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293920
48346	NC_015183	GAA	2	6	2500302	2500307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293920
48347	NC_015183	TCG	2	6	2500313	2500318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293920
48348	NC_015183	AAC	2	6	2500427	2500432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293920
48349	NC_015183	TA	3	6	2500459	2500464	50 %	50 %	0 %	0 %	325293920
48350	NC_015183	TGA	2	6	2500478	2500483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293920
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48359	NC_015183	CAT	2	6	2501073	2501078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293921
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48373	NC_015183	GAC	2	6	2501556	2501561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293921
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48377	NC_015183	CGG	2	6	2501652	2501657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293921
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48432	NC_015183	CTG	2	6	2503788	2503793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293922
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48448	NC_015183	TCC	2	6	2504415	2504420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293922
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48450	NC_015183	GCCG	2	8	2504448	2504455	0 %	0 %	50 %	50 %	325293922
48451	NC_015183	GAC	2	6	2504535	2504540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293922
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48453	NC_015183	TCC	2	6	2504589	2504594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293922
48454	NC_015183	CGC	2	6	2504620	2504625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293922
48455	NC_015183	CCG	2	6	2504674	2504679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293922
48456	NC_015183	TGGCA	2	10	2504755	2504764	20 %	20 %	40 %	20 %	325293922
48457	NC_015183	GGTG	2	8	2504903	2504910	0 %	25 %	75 %	0 %	325293922
48458	NC_015183	TTC	2	6	2504937	2504942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293922
48459	NC_015183	ACGA	2	8	2504949	2504956	50 %	0 %	25 %	25 %	325293922
48460	NC_015183	CTG	2	6	2504976	2504981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293922
48461	NC_015183	TGG	2	6	2505061	2505066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293922
48462	NC_015183	GGC	2	6	2505068	2505073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293922
48463	NC_015183	GGC	2	6	2505080	2505085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293922
48464	NC_015183	CTGCGC	2	12	2505090	2505101	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325293922
48465	NC_015183	ATC	2	6	2505105	2505110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293922
48466	NC_015183	TCGC	2	8	2505117	2505124	0 %	25 %	25 %	50 %	325293922
48467	NC_015183	CGT	2	6	2505137	2505142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293922
48468	NC_015183	GGT	2	6	2505207	2505212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293922
48469	NC_015183	TTC	2	6	2505240	2505245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293922
48470	NC_015183	TCA	2	6	2505262	2505267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293922
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48473	NC_015183	CTA	2	6	2505456	2505461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293923
48474	NC_015183	CAG	2	6	2505577	2505582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293923
48475	NC_015183	TGG	2	6	2505590	2505595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293923
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48480	NC_015183	CGC	2	6	2505943	2505948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293923
48481	NC_015183	TAT	2	6	2505968	2505973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293923
48482	NC_015183	CGC	2	6	2506013	2506018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293923
48483	NC_015183	GTC	2	6	2506076	2506081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293923
48484	NC_015183	TCG	2	6	2506187	2506192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293923
48485	NC_015183	GC	4	8	2506232	2506239	0 %	0 %	50 %	50 %	325293923
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48489	NC_015183	TGG	2	6	2506474	2506479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293923
48490	NC_015183	GAA	2	6	2506565	2506570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293923
48491	NC_015183	GCC	2	6	2506586	2506591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293923
48492	NC_015183	CAGC	2	8	2506668	2506675	25 %	0 %	25 %	50 %	325293923
48493	NC_015183	CGT	2	6	2506689	2506694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293923
48494	NC_015183	CGGT	2	8	2506721	2506728	0 %	25 %	50 %	25 %	325293923
48495	NC_015183	GAC	2	6	2506765	2506770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293923
48496	NC_015183	GAA	2	6	2506837	2506842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293923
48497	NC_015183	CCG	2	6	2506845	2506850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293923
48498	NC_015183	GC	3	6	2507004	2507009	0 %	0 %	50 %	50 %	325293924
48499	NC_015183	GCG	2	6	2507065	2507070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293924
48500	NC_015183	GAA	3	9	2507115	2507123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293924

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