MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_015183	GCT	2	6	2223863	2223868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293657
43002	NC_015183	GCC	2	6	2224150	2224155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293658
43003	NC_015183	CCA	2	6	2224164	2224169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293658
43004	NC_015183	GGAC	2	8	2224193	2224200	25 %	0 %	50 %	25 %	325293658
43005	NC_015183	CAC	2	6	2224246	2224251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293658
43006	NC_015183	AGA	2	6	2224277	2224282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293658
43007	NC_015183	TC	3	6	2224293	2224298	0 %	50 %	0 %	50 %	325293658
43008	NC_015183	AGA	2	6	2224307	2224312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293658
43009	NC_015183	ATC	2	6	2224406	2224411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293658
43010	NC_015183	GCA	2	6	2224416	2224421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293658
43011	NC_015183	CGG	2	6	2224453	2224458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293658
43012	NC_015183	GA	3	6	2224534	2224539	50 %	0 %	50 %	0 %	325293658
43013	NC_015183	ATC	2	6	2224577	2224582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293658
43014	NC_015183	GC	3	6	2224584	2224589	0 %	0 %	50 %	50 %	325293658
43015	NC_015183	TTTC	2	8	2224908	2224915	0 %	75 %	0 %	25 %	325293659
43016	NC_015183	AAG	2	6	2224945	2224950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293659
43017	NC_015183	AGG	2	6	2224965	2224970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293659
43018	NC_015183	GC	3	6	2224974	2224979	0 %	0 %	50 %	50 %	325293659
43019	NC_015183	GGC	2	6	2225183	2225188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293659
43020	NC_015183	CCG	2	6	2225196	2225201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293659
43021	NC_015183	ACC	2	6	2225222	2225227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293659
43022	NC_015183	GAT	2	6	2225257	2225262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293659
43023	NC_015183	AAG	2	6	2225267	2225272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293659
43024	NC_015183	GAA	2	6	2225276	2225281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293659
43025	NC_015183	CG	3	6	2225324	2225329	0 %	0 %	50 %	50 %	325293659
43026	NC_015183	AGA	2	6	2225367	2225372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293659
43027	NC_015183	CCA	2	6	2225394	2225399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293659
43028	NC_015183	ATC	2	6	2225492	2225497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293659
43029	NC_015183	CG	3	6	2225552	2225557	0 %	0 %	50 %	50 %	325293659
43030	NC_015183	GCG	2	6	2225582	2225587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293659
43031	NC_015183	GGC	2	6	2225666	2225671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293659
43032	NC_015183	GCT	2	6	2225695	2225700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293659
43033	NC_015183	CGA	2	6	2225719	2225724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293659
43034	NC_015183	ATC	2	6	2225759	2225764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293659
43035	NC_015183	GC	3	6	2225768	2225773	0 %	0 %	50 %	50 %	325293659
43036	NC_015183	AGA	2	6	2225781	2225786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293659
43037	NC_015183	TTG	2	6	2225860	2225865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293660
43038	NC_015183	GCC	2	6	2225866	2225871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293660
43039	NC_015183	GCTTCC	2	12	2225881	2225892	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325293660
43040	NC_015183	TCG	2	6	2225908	2225913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293660
43041	NC_015183	CAGG	2	8	2225918	2225925	25 %	0 %	50 %	25 %	325293660
43042	NC_015183	ATCG	2	8	2225934	2225941	25 %	25 %	25 %	25 %	325293660
43043	NC_015183	TGGA	2	8	2225968	2225975	25 %	25 %	50 %	0 %	325293660
43044	NC_015183	CAG	2	6	2225976	2225981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293660
43045	NC_015183	GAT	2	6	2225985	2225990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293660
43046	NC_015183	CTGAC	2	10	2226028	2226037	20 %	20 %	20 %	40 %	325293660
43047	NC_015183	CTG	2	6	2226054	2226059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293660
43048	NC_015183	TGG	2	6	2226092	2226097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293660
43049	NC_015183	CG	3	6	2226148	2226153	0 %	0 %	50 %	50 %	325293660
43050	NC_015183	CGG	2	6	2226228	2226233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293660
43051	NC_015183	GCCA	2	8	2226376	2226383	25 %	0 %	25 %	50 %	325293660
43052	NC_015183	GAC	2	6	2226433	2226438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293660
43053	NC_015183	ACA	2	6	2226463	2226468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293660
43054	NC_015183	GGA	2	6	2226516	2226521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293660
43055	NC_015183	GAA	2	6	2226642	2226647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293660
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43058	NC_015183	GAC	2	6	2226795	2226800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293660
43059	NC_015183	CAG	2	6	2226837	2226842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293660
43060	NC_015183	AAC	2	6	2226907	2226912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293660
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43063	NC_015183	GAAA	2	8	2227103	2227110	75 %	0 %	25 %	0 %	325293660
43064	NC_015183	GCC	2	6	2227319	2227324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293661
43065	NC_015183	GCA	2	6	2227343	2227348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
43066	NC_015183	CGG	2	6	2227430	2227435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293661
43067	NC_015183	CGA	2	6	2227445	2227450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
43068	NC_015183	TCA	2	6	2227475	2227480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293661
43069	NC_015183	GCG	2	6	2227491	2227496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293661
43070	NC_015183	TGA	2	6	2227544	2227549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293661
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43073	NC_015183	GCA	2	6	2227604	2227609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
43074	NC_015183	GC	3	6	2227660	2227665	0 %	0 %	50 %	50 %	325293661
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43077	NC_015183	CAA	2	6	2227787	2227792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293661
43078	NC_015183	TGA	2	6	2227805	2227810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293661
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43081	NC_015183	GCA	2	6	2227919	2227924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
43082	NC_015183	GAA	2	6	2227937	2227942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293661
43083	NC_015183	CTC	2	6	2227977	2227982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293661
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43085	NC_015183	CCG	2	6	2227996	2228001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293661
43086	NC_015183	ACG	2	6	2228011	2228016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
43087	NC_015183	CGAG	2	8	2228033	2228040	25 %	0 %	50 %	25 %	325293661
43088	NC_015183	CGC	2	6	2228063	2228068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293661
43089	NC_015183	AGC	2	6	2228221	2228226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
43090	NC_015183	GCG	2	6	2228293	2228298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293661
43091	NC_015183	CAA	2	6	2228339	2228344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293661
43092	NC_015183	CCG	2	6	2228357	2228362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293661
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43099	NC_015183	TTC	2	6	2228860	2228865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293662
43100	NC_015183	GC	3	6	2228900	2228905	0 %	0 %	50 %	50 %	325293662
43101	NC_015183	TCG	3	9	2228932	2228940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293662
43102	NC_015183	ATG	2	6	2229007	2229012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293662
43103	NC_015183	CGC	2	6	2229013	2229018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293662
43104	NC_015183	CTC	2	6	2229054	2229059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293662
43105	NC_015183	T	6	6	2229118	2229123	0 %	100 %	0 %	0 %	325293662
43106	NC_015183	CTG	2	6	2229177	2229182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293662
43107	NC_015183	GC	3	6	2229199	2229204	0 %	0 %	50 %	50 %	325293662
43108	NC_015183	CGG	2	6	2229243	2229248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293662
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43110	NC_015183	CCG	2	6	2229293	2229298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293662
43111	NC_015183	CGCC	2	8	2229320	2229327	0 %	0 %	25 %	75 %	325293662
43112	NC_015183	TGA	2	6	2229329	2229334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293662
43113	NC_015183	TCG	2	6	2229364	2229369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293662
43114	NC_015183	CGT	2	6	2229428	2229433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293662
43115	NC_015183	TCC	2	6	2229436	2229441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293662
43116	NC_015183	GTG	2	6	2229475	2229480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293662
43117	NC_015183	TTC	2	6	2229558	2229563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293662
43118	NC_015183	ACA	2	6	2229685	2229690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293663
43119	NC_015183	TGA	2	6	2229803	2229808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293663
43120	NC_015183	CCA	2	6	2229818	2229823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293663
43121	NC_015183	CGC	2	6	2229864	2229869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293663
43122	NC_015183	GC	3	6	2229878	2229883	0 %	0 %	50 %	50 %	325293663
43123	NC_015183	TCA	2	6	2229923	2229928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293663
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43125	NC_015183	CCG	2	6	2229956	2229961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293663
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43132	NC_015183	ATC	2	6	2230437	2230442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293663
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43136	NC_015183	CGG	2	6	2230649	2230654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293663
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43140	NC_015183	GGCG	2	8	2231083	2231090	0 %	0 %	75 %	25 %	325293664
43141	NC_015183	ACC	2	6	2231099	2231104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293664
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43146	NC_015183	TTCC	2	8	2231274	2231281	0 %	50 %	0 %	50 %	325293664
43147	NC_015183	TGA	2	6	2231306	2231311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293664
43148	NC_015183	ATC	2	6	2231332	2231337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293664
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43153	NC_015183	CGC	2	6	2231491	2231496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293665
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43202	NC_015183	CGG	2	6	2234034	2234039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293667
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43208	NC_015183	CACCT	2	10	2234323	2234332	20 %	20 %	0 %	60 %	325293667
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43214	NC_015183	CAT	2	6	2234538	2234543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293667
43215	NC_015183	CGT	2	6	2234550	2234555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293667
43216	NC_015183	CG	4	8	2234584	2234591	0 %	0 %	50 %	50 %	325293667
43217	NC_015183	CAGG	2	8	2234592	2234599	25 %	0 %	50 %	25 %	325293667
43218	NC_015183	CAA	2	6	2234613	2234618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293667
43219	NC_015183	ATC	2	6	2234629	2234634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293667
43220	NC_015183	GGCG	2	8	2234700	2234707	0 %	0 %	75 %	25 %	325293667
43221	NC_015183	GGC	2	6	2234752	2234757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293667
43222	NC_015183	GGT	2	6	2234796	2234801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293667
43223	NC_015183	GCC	2	6	2234884	2234889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293667
43224	NC_015183	ATGGC	2	10	2234909	2234918	20 %	20 %	40 %	20 %	325293667
43225	NC_015183	GAA	2	6	2234989	2234994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293667
43226	NC_015183	TCA	2	6	2235056	2235061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293667
43227	NC_015183	CCG	3	9	2235092	2235100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293667
43228	NC_015183	TAT	2	6	2235160	2235165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293667
43229	NC_015183	TCGA	2	8	2235196	2235203	25 %	25 %	25 %	25 %	325293667
43230	NC_015183	ATG	2	6	2235223	2235228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293667
43231	NC_015183	GAC	2	6	2235327	2235332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293667
43232	NC_015183	GGA	2	6	2235333	2235338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293667
43233	NC_015183	TGG	2	6	2235343	2235348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293667
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43333	NC_015183	CTG	2	6	2240310	2240315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293672
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43340	NC_015183	CG	3	6	2240875	2240880	0 %	0 %	50 %	50 %	325293672
43341	NC_015183	CGCC	2	8	2240971	2240978	0 %	0 %	25 %	75 %	325293672
43342	NC_015183	GTG	2	6	2240997	2241002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293672
43343	NC_015183	GAA	2	6	2241015	2241020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293672
43344	NC_015183	CGA	2	6	2241044	2241049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293672
43345	NC_015183	CGT	2	6	2241056	2241061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293672
43346	NC_015183	GC	3	6	2241094	2241099	0 %	0 %	50 %	50 %	325293672
43347	NC_015183	TCG	2	6	2241336	2241341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293673
43348	NC_015183	CGT	2	6	2241346	2241351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293673
43349	NC_015183	GCC	2	6	2241412	2241417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293673
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43351	NC_015183	GTC	2	6	2241500	2241505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293673
43352	NC_015183	GAT	3	9	2241520	2241528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293673
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43359	NC_015183	CCG	2	6	2241943	2241948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293673
43360	NC_015183	TGT	2	6	2241993	2241998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293673
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43458	NC_015183	TG	4	8	2246830	2246837	0 %	50 %	50 %	0 %	325293679
43459	NC_015183	CCAG	2	8	2246933	2246940	25 %	0 %	25 %	50 %	325293679
43460	NC_015183	CG	3	6	2246954	2246959	0 %	0 %	50 %	50 %	325293679
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43462	NC_015183	GCG	2	6	2247034	2247039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293679
43463	NC_015183	TCC	2	6	2247079	2247084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293679
43464	NC_015183	GC	4	8	2247086	2247093	0 %	0 %	50 %	50 %	325293679
43465	NC_015183	GCG	2	6	2247256	2247261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293679
43466	NC_015183	GGC	2	6	2247285	2247290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293679
43467	NC_015183	TCG	2	6	2247372	2247377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293680
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43470	NC_015183	CGA	2	6	2247567	2247572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293680
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43474	NC_015183	TTG	2	6	2247713	2247718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293681
43475	NC_015183	GCG	2	6	2247793	2247798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293681
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43488	NC_015183	ACC	2	6	2248244	2248249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293682
43489	NC_015183	AAT	2	6	2248266	2248271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293682
43490	NC_015183	TGC	2	6	2248325	2248330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293682
43491	NC_015183	CAT	2	6	2248393	2248398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293682
43492	NC_015183	GAA	2	6	2248424	2248429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293682
43493	NC_015183	TGAA	2	8	2248451	2248458	50 %	25 %	25 %	0 %	325293682
43494	NC_015183	GGC	2	6	2248474	2248479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293682
43495	NC_015183	CATC	2	8	2248482	2248489	25 %	25 %	0 %	50 %	325293682
43496	NC_015183	GCC	2	6	2248572	2248577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293683
43497	NC_015183	GAC	2	6	2248584	2248589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293683
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43499	NC_015183	CGT	2	6	2248650	2248655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293683
43500	NC_015183	CCA	2	6	2248670	2248675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293683

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