MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_015183	TTC	2	6	2196515	2196520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293635
42502	NC_015183	CCG	2	6	2196605	2196610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293635
42503	NC_015183	AGA	2	6	2196653	2196658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293635
42504	NC_015183	CCG	2	6	2196677	2196682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293635
42505	NC_015183	GC	3	6	2196726	2196731	0 %	0 %	50 %	50 %	325293635
42506	NC_015183	ATGA	2	8	2196844	2196851	50 %	25 %	25 %	0 %	325293635
42507	NC_015183	CTT	2	6	2196859	2196864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293635
42508	NC_015183	CGC	2	6	2196892	2196897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293635
42509	NC_015183	CTG	2	6	2196907	2196912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293635
42510	NC_015183	GTC	2	6	2196913	2196918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293635
42511	NC_015183	ATC	2	6	2196989	2196994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293635
42512	NC_015183	GACCG	2	10	2197048	2197057	20 %	0 %	40 %	40 %	325293635
42513	NC_015183	ACG	2	6	2197058	2197063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293635
42514	NC_015183	AC	3	6	2197101	2197106	50 %	0 %	0 %	50 %	325293635
42515	NC_015183	CGC	2	6	2197119	2197124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293635
42516	NC_015183	GCC	2	6	2197165	2197170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293635
42517	NC_015183	CTT	2	6	2197171	2197176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293635
42518	NC_015183	GGC	2	6	2197228	2197233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293635
42519	NC_015183	GCG	2	6	2197248	2197253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293635
42520	NC_015183	TGCGAA	2	12	2197291	2197302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293635
42521	NC_015183	CAG	2	6	2197639	2197644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293636
42522	NC_015183	GCC	2	6	2197721	2197726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293636
42523	NC_015183	ATC	2	6	2197752	2197757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293636
42524	NC_015183	GGCG	2	8	2197805	2197812	0 %	0 %	75 %	25 %	325293636
42525	NC_015183	GCC	2	6	2197884	2197889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293636
42526	NC_015183	GC	3	6	2197920	2197925	0 %	0 %	50 %	50 %	325293636
42527	NC_015183	GGA	2	6	2197955	2197960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293636
42528	NC_015183	CGATCT	2	12	2197961	2197972	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293636
42529	NC_015183	GGA	2	6	2198000	2198005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293636
42530	NC_015183	CAA	2	6	2198012	2198017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293636
42531	NC_015183	CG	3	6	2198036	2198041	0 %	0 %	50 %	50 %	325293636
42532	NC_015183	GCG	2	6	2198083	2198088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293636
42533	NC_015183	AGG	2	6	2198116	2198121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293636
42534	NC_015183	ATC	2	6	2198226	2198231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293636
42535	NC_015183	TCG	2	6	2198287	2198292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293636
42536	NC_015183	GGA	2	6	2198333	2198338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293636
42537	NC_015183	TCG	2	6	2198516	2198521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293636
42538	NC_015183	CGA	2	6	2198555	2198560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293636
42539	NC_015183	CGC	2	6	2198672	2198677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293636
42540	NC_015183	TGA	2	6	2198680	2198685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293636
42541	NC_015183	TCG	2	6	2198728	2198733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293636
42542	NC_015183	TGCGGC	2	12	2198753	2198764	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325293636
42543	NC_015183	GCC	2	6	2198767	2198772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293636
42544	NC_015183	GCA	2	6	2198934	2198939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293637
42545	NC_015183	TGC	2	6	2198944	2198949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293637
42546	NC_015183	TCT	2	6	2198950	2198955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293637
42547	NC_015183	T	7	7	2198992	2198998	0 %	100 %	0 %	0 %	325293637
42548	NC_015183	AAT	2	6	2199019	2199024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293637
42549	NC_015183	GC	3	6	2199066	2199071	0 %	0 %	50 %	50 %	325293637
42550	NC_015183	ACCG	2	8	2199131	2199138	25 %	0 %	25 %	50 %	325293637
42551	NC_015183	CCA	2	6	2199151	2199156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293637
42552	NC_015183	ATC	2	6	2199168	2199173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293637
42553	NC_015183	GCG	2	6	2199213	2199218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293637
42554	NC_015183	ACA	2	6	2199849	2199854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293638
42555	NC_015183	GCG	2	6	2199901	2199906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293638
42556	NC_015183	GGC	2	6	2199923	2199928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293638
42557	NC_015183	TCA	2	6	2199967	2199972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293638
42558	NC_015183	CGG	2	6	2199979	2199984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293638
42559	NC_015183	CTG	2	6	2200055	2200060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293638
42560	NC_015183	GAT	2	6	2200076	2200081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293638
42561	NC_015183	CGCC	2	8	2200083	2200090	0 %	0 %	25 %	75 %	325293638
42562	NC_015183	CAT	2	6	2200094	2200099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293638
42563	NC_015183	TGAC	2	8	2200140	2200147	25 %	25 %	25 %	25 %	325293638
42564	NC_015183	TTC	2	6	2200161	2200166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293638
42565	NC_015183	GGC	2	6	2200201	2200206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293638
42566	NC_015183	GC	4	8	2200275	2200282	0 %	0 %	50 %	50 %	325293638
42567	NC_015183	GCT	2	6	2200294	2200299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293638
42568	NC_015183	GCC	2	6	2200304	2200309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293638
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42570	NC_015183	CCA	2	6	2200372	2200377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293638
42571	NC_015183	TGCGCT	2	12	2200378	2200389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293638
42572	NC_015183	GCA	2	6	2200453	2200458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293638
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42574	NC_015183	CAC	2	6	2200577	2200582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293638
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42582	NC_015183	ACC	2	6	2200979	2200984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293639
42583	NC_015183	CGAAAG	2	12	2200987	2200998	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325293639
42584	NC_015183	GCG	2	6	2201031	2201036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293639
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42587	NC_015183	GAT	2	6	2201332	2201337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293639
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42591	NC_015183	CCGA	2	8	2201447	2201454	25 %	0 %	25 %	50 %	325293639
42592	NC_015183	CGA	2	6	2201490	2201495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293639
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42594	NC_015183	GAAA	2	8	2201557	2201564	75 %	0 %	25 %	0 %	325293639
42595	NC_015183	GAA	2	6	2201572	2201577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293639
42596	NC_015183	A	6	6	2201576	2201581	100 %	0 %	0 %	0 %	325293639
42597	NC_015183	CCT	2	6	2201610	2201615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293639
42598	NC_015183	CTT	2	6	2201976	2201981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293640
42599	NC_015183	CGG	2	6	2201984	2201989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293640
42600	NC_015183	CGC	3	9	2202075	2202083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293640
42601	NC_015183	CAT	2	6	2202098	2202103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293640
42602	NC_015183	TCG	2	6	2202218	2202223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293640
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42605	NC_015183	CG	3	6	2202342	2202347	0 %	0 %	50 %	50 %	325293640
42606	NC_015183	GGA	2	6	2202375	2202380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293640
42607	NC_015183	ACC	2	6	2202385	2202390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293640
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42610	NC_015183	GTC	2	6	2202609	2202614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293640
42611	NC_015183	GA	3	6	2202712	2202717	50 %	0 %	50 %	0 %	325293640
42612	NC_015183	CAG	2	6	2202750	2202755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293640
42613	NC_015183	TGG	2	6	2202773	2202778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293640
42614	NC_015183	TGC	2	6	2202873	2202878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293640
42615	NC_015183	GCG	2	6	2203175	2203180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293641
42616	NC_015183	TGT	2	6	2203203	2203208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293641
42617	NC_015183	GCC	2	6	2203262	2203267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293641
42618	NC_015183	GAC	2	6	2203271	2203276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293641
42619	NC_015183	GTCGC	2	10	2203295	2203304	0 %	20 %	40 %	40 %	325293641
42620	NC_015183	GTC	2	6	2203315	2203320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293641
42621	NC_015183	TCT	2	6	2203353	2203358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293641
42622	NC_015183	CGA	2	6	2203555	2203560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293641
42623	NC_015183	CGA	2	6	2203602	2203607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293641
42624	NC_015183	AAGG	2	8	2203643	2203650	50 %	0 %	50 %	0 %	325293641
42625	NC_015183	CGG	2	6	2203666	2203671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293641
42626	NC_015183	GCC	3	9	2203695	2203703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293641
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42628	NC_015183	GCT	2	6	2203887	2203892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293642
42629	NC_015183	CCT	2	6	2203895	2203900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293642
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42631	NC_015183	ATG	2	6	2204041	2204046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293642
42632	NC_015183	ACTG	2	8	2204117	2204124	25 %	25 %	25 %	25 %	325293642
42633	NC_015183	CGT	2	6	2204144	2204149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293642
42634	NC_015183	CGC	2	6	2204158	2204163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293642
42635	NC_015183	GGCATG	2	12	2204169	2204180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325293642
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42638	NC_015183	GCC	2	6	2204635	2204640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293643
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42643	NC_015183	TGC	2	6	2204859	2204864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293643
42644	NC_015183	TCG	2	6	2204903	2204908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293643
42645	NC_015183	GCC	3	9	2204911	2204919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293643
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42652	NC_015183	GC	3	6	2205142	2205147	0 %	0 %	50 %	50 %	325293643
42653	NC_015183	ACACCG	2	12	2205208	2205219	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325293643
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42672	NC_015183	CAG	2	6	2206122	2206127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293644
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42683	NC_015183	ACTG	2	8	2206668	2206675	25 %	25 %	25 %	25 %	325293645
42684	NC_015183	CGA	2	6	2206705	2206710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293645
42685	NC_015183	CGA	2	6	2206723	2206728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293645
42686	NC_015183	GAAAC	2	10	2206770	2206779	60 %	0 %	20 %	20 %	325293645
42687	NC_015183	ATC	2	6	2206829	2206834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293645
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42691	NC_015183	CGA	2	6	2207037	2207042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293645
42692	NC_015183	CA	3	6	2207435	2207440	50 %	0 %	0 %	50 %	325293646
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42700	NC_015183	GCA	2	6	2207647	2207652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293646
42701	NC_015183	CGG	2	6	2207717	2207722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293646
42702	NC_015183	GCG	2	6	2207743	2207748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293646
42703	NC_015183	CAA	2	6	2207792	2207797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293646
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42705	NC_015183	GGC	2	6	2207925	2207930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293646
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42711	NC_015183	GGC	2	6	2208219	2208224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293646
42712	NC_015183	GA	3	6	2208260	2208265	50 %	0 %	50 %	0 %	325293646
42713	NC_015183	GACA	2	8	2208395	2208402	50 %	0 %	25 %	25 %	325293646
42714	NC_015183	CAA	2	6	2208479	2208484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293646
42715	NC_015183	TCG	2	6	2208532	2208537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293646
42716	NC_015183	CGG	2	6	2208563	2208568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293646
42717	NC_015183	GCA	2	6	2208572	2208577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293646
42718	NC_015183	CGG	2	6	2208590	2208595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293646
42719	NC_015183	TACGAT	2	12	2208771	2208782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325293646
42720	NC_015183	ACA	2	6	2208814	2208819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293646
42721	NC_015183	GCT	2	6	2208866	2208871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293646
42722	NC_015183	ACG	2	6	2208880	2208885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293646
42723	NC_015183	CAA	2	6	2209091	2209096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293646
42724	NC_015183	CGA	2	6	2209129	2209134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293646
42725	NC_015183	CGG	2	6	2209151	2209156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293646
42726	NC_015183	CGCAAC	2	12	2209185	2209196	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325293646
42727	NC_015183	CTT	2	6	2209250	2209255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293646
42728	NC_015183	GCTT	2	8	2209268	2209275	0 %	50 %	25 %	25 %	325293646
42729	NC_015183	ACAG	2	8	2209293	2209300	50 %	0 %	25 %	25 %	325293646
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42845	NC_015183	CGC	2	6	2215497	2215502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293650
42846	NC_015183	ATC	2	6	2215564	2215569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293650
42847	NC_015183	CGC	2	6	2215579	2215584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293650
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42903	NC_015183	CCGC	2	8	2219102	2219109	0 %	0 %	25 %	75 %	325293653
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42932	NC_015183	GC	3	6	2220380	2220385	0 %	0 %	50 %	50 %	325293654
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42948	NC_015183	CCA	2	6	2221396	2221401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293655
42949	NC_015183	GCCC	2	8	2221418	2221425	0 %	0 %	25 %	75 %	325293655
42950	NC_015183	TGC	2	6	2221450	2221455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293655
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42953	NC_015183	CGG	2	6	2221953	2221958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293656
42954	NC_015183	GC	3	6	2221959	2221964	0 %	0 %	50 %	50 %	325293656
42955	NC_015183	GGC	3	9	2221994	2222002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293656
42956	NC_015183	CGGC	2	8	2222009	2222016	0 %	0 %	50 %	50 %	325293656
42957	NC_015183	TGC	2	6	2222023	2222028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293656
42958	NC_015183	GCG	2	6	2222073	2222078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293656
42959	NC_015183	GAT	2	6	2222100	2222105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293656
42960	NC_015183	CGGCA	2	10	2222151	2222160	20 %	0 %	40 %	40 %	325293656
42961	NC_015183	TTG	2	6	2222248	2222253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293656
42962	NC_015183	CGG	2	6	2222264	2222269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293656
42963	NC_015183	CAC	2	6	2222346	2222351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293656
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42965	NC_015183	GCG	2	6	2222427	2222432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293656
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42967	NC_015183	TGA	2	6	2222555	2222560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293656
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42979	NC_015183	GCA	2	6	2222897	2222902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293656
42980	NC_015183	CGG	2	6	2222921	2222926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293656
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42989	NC_015183	GGC	2	6	2223387	2223392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293657
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42992	NC_015183	CGC	2	6	2223501	2223506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293657
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42994	NC_015183	GCCG	2	8	2223582	2223589	0 %	0 %	50 %	50 %	325293657
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