MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_015183	TCA	2	6	2119602	2119607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293555
41002	NC_015183	CGTC	2	8	2119642	2119649	0 %	25 %	25 %	50 %	325293555
41003	NC_015183	CGT	2	6	2119781	2119786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293555
41004	NC_015183	CGA	2	6	2119789	2119794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293555
41005	NC_015183	CCG	2	6	2119806	2119811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293555
41006	NC_015183	CCA	2	6	2119819	2119824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293555
41007	NC_015183	GAC	2	6	2119859	2119864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293555
41008	NC_015183	CGA	2	6	2119927	2119932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293555
41009	NC_015183	TTTCG	2	10	2120027	2120036	0 %	60 %	20 %	20 %	325293555
41010	NC_015183	GGC	2	6	2120057	2120062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293555
41011	NC_015183	TGG	2	6	2120167	2120172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293555
41012	NC_015183	GA	3	6	2120190	2120195	50 %	0 %	50 %	0 %	325293555
41013	NC_015183	AAGG	2	8	2120204	2120211	50 %	0 %	50 %	0 %	325293555
41014	NC_015183	TTC	2	6	2120620	2120625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293556
41015	NC_015183	TGG	2	6	2120630	2120635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293556
41016	NC_015183	CG	3	6	2120711	2120716	0 %	0 %	50 %	50 %	325293556
41017	NC_015183	A	6	6	2120851	2120856	100 %	0 %	0 %	0 %	325293556
41018	NC_015183	TCA	2	6	2120969	2120974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293556
41019	NC_015183	AGGC	2	8	2120996	2121003	25 %	0 %	50 %	25 %	325293556
41020	NC_015183	GCC	2	6	2121037	2121042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293556
41021	NC_015183	CGA	2	6	2121072	2121077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293556
41022	NC_015183	GGCA	2	8	2121112	2121119	25 %	0 %	50 %	25 %	325293556
41023	NC_015183	CTG	2	6	2121148	2121153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293556
41024	NC_015183	CGA	2	6	2121191	2121196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293556
41025	NC_015183	CGCT	2	8	2121204	2121211	0 %	25 %	25 %	50 %	325293556
41026	NC_015183	AGCCG	2	10	2121300	2121309	20 %	0 %	40 %	40 %	325293556
41027	NC_015183	CCAGA	2	10	2121321	2121330	40 %	0 %	20 %	40 %	325293556
41028	NC_015183	GCC	2	6	2121575	2121580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293557
41029	NC_015183	GTC	3	9	2121587	2121595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293557
41030	NC_015183	GCC	2	6	2121602	2121607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293557
41031	NC_015183	CG	3	6	2121688	2121693	0 %	0 %	50 %	50 %	325293557
41032	NC_015183	GGCG	2	8	2121694	2121701	0 %	0 %	75 %	25 %	325293557
41033	NC_015183	TCT	2	6	2121720	2121725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293557
41034	NC_015183	TCA	2	6	2121738	2121743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293557
41035	NC_015183	GGC	2	6	2121755	2121760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293557
41036	NC_015183	CGC	2	6	2121797	2121802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293557
41037	NC_015183	TGC	2	6	2121975	2121980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293558
41038	NC_015183	CGC	2	6	2121988	2121993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293558
41039	NC_015183	TCG	2	6	2122014	2122019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293558
41040	NC_015183	TCG	2	6	2122059	2122064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293558
41041	NC_015183	GCC	2	6	2122082	2122087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293558
41042	NC_015183	TGC	2	6	2122095	2122100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293558
41043	NC_015183	A	6	6	2122127	2122132	100 %	0 %	0 %	0 %	325293558
41044	NC_015183	CGC	2	6	2122134	2122139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293558
41045	NC_015183	CGG	2	6	2122156	2122161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293558
41046	NC_015183	CGG	2	6	2122189	2122194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293558
41047	NC_015183	CGA	2	6	2122197	2122202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293558
41048	NC_015183	GCA	2	6	2122204	2122209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293558
41049	NC_015183	CGT	2	6	2122288	2122293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293558
41050	NC_015183	TGA	2	6	2122338	2122343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293558
41051	NC_015183	GCG	2	6	2122371	2122376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293558
41052	NC_015183	CAT	2	6	2122411	2122416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293558
41053	NC_015183	CTT	2	6	2122423	2122428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293558
41054	NC_015183	TCGTT	2	10	2122456	2122465	0 %	60 %	20 %	20 %	325293558
41055	NC_015183	CT	4	8	2122516	2122523	0 %	50 %	0 %	50 %	325293558
41056	NC_015183	TCC	2	6	2122613	2122618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293558
41057	NC_015183	GTC	2	6	2122640	2122645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293558
41058	NC_015183	CGC	2	6	2122665	2122670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293558
41059	NC_015183	TGAA	2	8	2122731	2122738	50 %	25 %	25 %	0 %	325293558
41060	NC_015183	CGC	2	6	2122780	2122785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293558
41061	NC_015183	TCG	2	6	2122794	2122799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293558
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41063	NC_015183	CCG	2	6	2122836	2122841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293558
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41066	NC_015183	TCA	2	6	2122947	2122952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293559
41067	NC_015183	A	6	6	2122969	2122974	100 %	0 %	0 %	0 %	325293559
41068	NC_015183	TTC	2	6	2123323	2123328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293560
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41074	NC_015183	CAT	2	6	2123687	2123692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293561
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41076	NC_015183	CCCG	2	8	2123745	2123752	0 %	0 %	25 %	75 %	325293561
41077	NC_015183	AGC	2	6	2123983	2123988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293561
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41082	NC_015183	CCG	2	6	2124145	2124150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293561
41083	NC_015183	CGA	2	6	2124155	2124160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293561
41084	NC_015183	CCTT	2	8	2124166	2124173	0 %	50 %	0 %	50 %	325293561
41085	NC_015183	AAT	2	6	2124225	2124230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293561
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41087	NC_015183	CGC	2	6	2124551	2124556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293562
41088	NC_015183	CGTT	2	8	2124587	2124594	0 %	50 %	25 %	25 %	325293562
41089	NC_015183	GCA	2	6	2124640	2124645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293562
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41091	NC_015183	AACCC	2	10	2124835	2124844	40 %	0 %	0 %	60 %	325293562
41092	NC_015183	AT	3	6	2124902	2124907	50 %	50 %	0 %	0 %	325293562
41093	NC_015183	GCA	2	6	2124958	2124963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293562
41094	NC_015183	ACG	2	6	2125027	2125032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293562
41095	NC_015183	GTCTAC	2	12	2125068	2125079	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293562
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41098	NC_015183	CGATA	2	10	2125398	2125407	40 %	20 %	20 %	20 %	325293563
41099	NC_015183	TTC	2	6	2125417	2125422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293563
41100	NC_015183	GC	4	8	2125479	2125486	0 %	0 %	50 %	50 %	325293563
41101	NC_015183	GGT	2	6	2125494	2125499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293563
41102	NC_015183	CAG	2	6	2125509	2125514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293563
41103	NC_015183	CGA	2	6	2125599	2125604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293563
41104	NC_015183	TGGC	2	8	2125622	2125629	0 %	25 %	50 %	25 %	325293563
41105	NC_015183	CCG	2	6	2125638	2125643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293563
41106	NC_015183	CTGGCG	2	12	2125681	2125692	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325293563
41107	NC_015183	GAGC	2	8	2125695	2125702	25 %	0 %	50 %	25 %	325293563
41108	NC_015183	C	7	7	2125841	2125847	0 %	0 %	0 %	100 %	325293564
41109	NC_015183	TCG	2	6	2125876	2125881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293564
41110	NC_015183	GAC	2	6	2125884	2125889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293564
41111	NC_015183	TCT	2	6	2125904	2125909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293564
41112	NC_015183	TGA	2	6	2126017	2126022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293564
41113	NC_015183	CCGC	2	8	2126095	2126102	0 %	0 %	25 %	75 %	325293564
41114	NC_015183	GCTGG	2	10	2126124	2126133	0 %	20 %	60 %	20 %	325293564
41115	NC_015183	GAT	2	6	2126145	2126150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293564
41116	NC_015183	CG	3	6	2126173	2126178	0 %	0 %	50 %	50 %	325293564
41117	NC_015183	CAA	2	6	2126195	2126200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293564
41118	NC_015183	GCG	2	6	2126207	2126212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293564
41119	NC_015183	AGGA	2	8	2126280	2126287	50 %	0 %	50 %	0 %	325293564
41120	NC_015183	GCG	2	6	2126291	2126296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293564
41121	NC_015183	TGC	2	6	2126341	2126346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293564
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41123	NC_015183	GAC	2	6	2126463	2126468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293564
41124	NC_015183	GCG	2	6	2126599	2126604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293565
41125	NC_015183	GC	3	6	2126618	2126623	0 %	0 %	50 %	50 %	325293565
41126	NC_015183	CGCT	2	8	2126670	2126677	0 %	25 %	25 %	50 %	325293565
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41131	NC_015183	ATC	2	6	2126799	2126804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293565
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41137	NC_015183	AAGAC	2	10	2127046	2127055	60 %	0 %	20 %	20 %	325293565
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41143	NC_015183	A	6	6	2127573	2127578	100 %	0 %	0 %	0 %	325293565
41144	NC_015183	ATC	2	6	2127609	2127614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293565
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41152	NC_015183	GCG	2	6	2128179	2128184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293566
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41155	NC_015183	CCAG	2	8	2128436	2128443	25 %	0 %	25 %	50 %	325293567
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41202	NC_015183	CAT	2	6	2130754	2130759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293571
41203	NC_015183	TC	3	6	2130791	2130796	0 %	50 %	0 %	50 %	325293571
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41223	NC_015183	CG	3	6	2131550	2131555	0 %	0 %	50 %	50 %	325293571
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41225	NC_015183	TCT	2	6	2131656	2131661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293572
41226	NC_015183	TTGCC	2	10	2131666	2131675	0 %	40 %	20 %	40 %	325293572
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41228	NC_015183	TCA	2	6	2131731	2131736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293572
41229	NC_015183	AGTC	2	8	2131747	2131754	25 %	25 %	25 %	25 %	325293572
41230	NC_015183	TGG	2	6	2131830	2131835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293572
41231	NC_015183	ATG	2	6	2131859	2131864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293572
41232	NC_015183	TGC	2	6	2131872	2131877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293572
41233	NC_015183	CCG	2	6	2131885	2131890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293572
41234	NC_015183	CAC	2	6	2131899	2131904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293572
41235	NC_015183	TGG	2	6	2131929	2131934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293572
41236	NC_015183	CGCT	2	8	2131971	2131978	0 %	25 %	25 %	50 %	325293572
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41245	NC_015183	GGC	2	6	2132288	2132293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293572
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41259	NC_015183	GCC	2	6	2133240	2133245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293573
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41261	NC_015183	GC	3	6	2133393	2133398	0 %	0 %	50 %	50 %	325293573
41262	NC_015183	GGC	2	6	2133450	2133455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293573
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41264	NC_015183	GGC	2	6	2133604	2133609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293573
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41276	NC_015183	CGCC	2	8	2134016	2134023	0 %	0 %	25 %	75 %	325293574
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41291	NC_015183	ATGG	2	8	2134604	2134611	25 %	25 %	50 %	0 %	325293574
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41302	NC_015183	ATC	2	6	2135319	2135324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293575
41303	NC_015183	GC	3	6	2135326	2135331	0 %	0 %	50 %	50 %	325293575
41304	NC_015183	CGC	2	6	2135347	2135352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293575
41305	NC_015183	GCA	2	6	2135464	2135469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293575
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41307	NC_015183	GCC	2	6	2135574	2135579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293575
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41309	NC_015183	CGC	2	6	2135606	2135611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293575
41310	NC_015183	GATGA	2	10	2135656	2135665	40 %	20 %	40 %	0 %	325293575
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41312	NC_015183	GTCCA	2	10	2136037	2136046	20 %	20 %	20 %	40 %	325293576
41313	NC_015183	ATC	2	6	2136065	2136070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293576
41314	NC_015183	TCA	2	6	2136083	2136088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293576
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41317	NC_015183	TCG	2	6	2136203	2136208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293576
41318	NC_015183	CCGA	2	8	2136292	2136299	25 %	0 %	25 %	50 %	325293576
41319	NC_015183	CAA	2	6	2136354	2136359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293576
41320	NC_015183	GTG	2	6	2136391	2136396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293576
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41322	NC_015183	CTG	2	6	2136430	2136435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293576
41323	NC_015183	TCG	2	6	2136440	2136445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293576
41324	NC_015183	CGA	2	6	2136525	2136530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293576
41325	NC_015183	ATC	2	6	2136532	2136537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293576
41326	NC_015183	CGG	2	6	2136543	2136548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293576
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41328	NC_015183	A	6	6	2136580	2136585	100 %	0 %	0 %	0 %	325293576
41329	NC_015183	CACG	2	8	2136612	2136619	25 %	0 %	25 %	50 %	325293576
41330	NC_015183	CGG	2	6	2136630	2136635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293576
41331	NC_015183	TCA	2	6	2136677	2136682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293576
41332	NC_015183	ACC	2	6	2136700	2136705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293576
41333	NC_015183	ACCGC	2	10	2136770	2136779	20 %	0 %	20 %	60 %	325293576
41334	NC_015183	CGG	2	6	2137069	2137074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293577
41335	NC_015183	GGC	3	9	2137090	2137098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293577
41336	NC_015183	CCA	2	6	2137111	2137116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293577
41337	NC_015183	GATGAC	2	12	2137200	2137211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293577
41338	NC_015183	CGT	2	6	2137243	2137248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293577
41339	NC_015183	CAC	2	6	2137273	2137278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293577
41340	NC_015183	GAT	2	6	2137327	2137332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293577
41341	NC_015183	CGG	2	6	2137338	2137343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293577
41342	NC_015183	TGC	2	6	2137347	2137352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293577
41343	NC_015183	CGCC	2	8	2137364	2137371	0 %	0 %	25 %	75 %	325293577
41344	NC_015183	GC	3	6	2137395	2137400	0 %	0 %	50 %	50 %	325293577
41345	NC_015183	GGA	2	6	2137441	2137446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293577
41346	NC_015183	GGC	2	6	2137487	2137492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293577
41347	NC_015183	CGCTGA	2	12	2137518	2137529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325293577
41348	NC_015183	CGGG	2	8	2137531	2137538	0 %	0 %	75 %	25 %	325293577
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41448	NC_015183	CAA	2	6	2142149	2142154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293581
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