MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_015183	GCG	3	9	2068494	2068502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293513
40002	NC_015183	CAT	2	6	2068516	2068521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293513
40003	NC_015183	GTC	2	6	2068547	2068552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293513
40004	NC_015183	CCA	2	6	2068608	2068613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293513
40005	NC_015183	CGG	3	9	2068663	2068671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293513
40006	NC_015183	CTG	2	6	2068711	2068716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293513
40007	NC_015183	GCCA	2	8	2068789	2068796	25 %	0 %	25 %	50 %	325293513
40008	NC_015183	GAT	2	6	2068882	2068887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293513
40009	NC_015183	GCC	2	6	2068923	2068928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293513
40010	NC_015183	GCATCA	2	12	2068989	2069000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325293513
40011	NC_015183	CG	3	6	2069104	2069109	0 %	0 %	50 %	50 %	325293514
40012	NC_015183	CGG	2	6	2069137	2069142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293514
40013	NC_015183	CGG	2	6	2069206	2069211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293514
40014	NC_015183	CGA	2	6	2069229	2069234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293514
40015	NC_015183	CCGA	2	8	2069277	2069284	25 %	0 %	25 %	50 %	325293514
40016	NC_015183	AGC	2	6	2069330	2069335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293514
40017	NC_015183	GCC	2	6	2069381	2069386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293514
40018	NC_015183	T	6	6	2069392	2069397	0 %	100 %	0 %	0 %	325293514
40019	NC_015183	CTG	2	6	2069510	2069515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293514
40020	NC_015183	CTTCC	2	10	2069539	2069548	0 %	40 %	0 %	60 %	325293514
40021	NC_015183	GCA	2	6	2069618	2069623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293514
40022	NC_015183	A	6	6	2069623	2069628	100 %	0 %	0 %	0 %	325293514
40023	NC_015183	GGCATC	2	12	2069641	2069652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325293514
40024	NC_015183	CAG	2	6	2069655	2069660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293514
40025	NC_015183	GCT	2	6	2070062	2070067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293515
40026	NC_015183	GGC	2	6	2070077	2070082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293515
40027	NC_015183	GC	3	6	2070212	2070217	0 %	0 %	50 %	50 %	325293515
40028	NC_015183	GCA	2	6	2070404	2070409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293515
40029	NC_015183	AGC	2	6	2070472	2070477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293515
40030	NC_015183	CGTC	2	8	2070494	2070501	0 %	25 %	25 %	50 %	325293515
40031	NC_015183	GTG	2	6	2070514	2070519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293515
40032	NC_015183	ATC	2	6	2070528	2070533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293515
40033	NC_015183	CGA	2	6	2070571	2070576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293515
40034	NC_015183	TTA	2	6	2070578	2070583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293515
40035	NC_015183	CGA	2	6	2070587	2070592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293515
40036	NC_015183	ATG	2	6	2070616	2070621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293515
40037	NC_015183	GCG	2	6	2070644	2070649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293515
40038	NC_015183	CAC	3	9	2070774	2070782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293516
40039	NC_015183	CAGG	2	8	2070807	2070814	25 %	0 %	50 %	25 %	325293516
40040	NC_015183	CGG	2	6	2070843	2070848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
40041	NC_015183	TCA	2	6	2070869	2070874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293516
40042	NC_015183	TTC	2	6	2070910	2070915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293516
40043	NC_015183	CCG	2	6	2070916	2070921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293516
40044	NC_015183	TGA	2	6	2070941	2070946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293516
40045	NC_015183	CGC	2	6	2070966	2070971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293516
40046	NC_015183	GGC	2	6	2070994	2070999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
40047	NC_015183	CCA	2	6	2071109	2071114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293516
40048	NC_015183	TGC	2	6	2071154	2071159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293516
40049	NC_015183	CGG	2	6	2071173	2071178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
40050	NC_015183	CGC	2	6	2071225	2071230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293516
40051	NC_015183	CT	3	6	2071264	2071269	0 %	50 %	0 %	50 %	325293516
40052	NC_015183	CAT	2	6	2071275	2071280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293516
40053	NC_015183	GCA	2	6	2071324	2071329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293516
40054	NC_015183	GGC	2	6	2071335	2071340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
40055	NC_015183	CGG	2	6	2071368	2071373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
40056	NC_015183	GCTG	2	8	2071406	2071413	0 %	25 %	50 %	25 %	325293516
40057	NC_015183	AAGTCG	2	12	2071444	2071455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293516
40058	NC_015183	GCG	2	6	2071502	2071507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
40059	NC_015183	GCT	2	6	2071521	2071526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293516
40060	NC_015183	TCG	2	6	2071550	2071555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293516
40061	NC_015183	TGA	2	6	2071565	2071570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293516
40062	NC_015183	AC	3	6	2071601	2071606	50 %	0 %	0 %	50 %	325293516
40063	NC_015183	GGCA	2	8	2071620	2071627	25 %	0 %	50 %	25 %	325293516
40064	NC_015183	TCA	2	6	2071661	2071666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293516
40065	NC_015183	GATC	2	8	2071680	2071687	25 %	25 %	25 %	25 %	325293516
40066	NC_015183	TTC	2	6	2071705	2071710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293516
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40069	NC_015183	GC	3	6	2071851	2071856	0 %	0 %	50 %	50 %	325293516
40070	NC_015183	CGG	2	6	2071920	2071925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
40071	NC_015183	CGC	2	6	2071998	2072003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293516
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40075	NC_015183	CGCC	2	8	2072394	2072401	0 %	0 %	25 %	75 %	325293517
40076	NC_015183	TGG	2	6	2072406	2072411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293517
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40097	NC_015183	GAC	2	6	2073286	2073291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293517
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40100	NC_015183	TCG	2	6	2073378	2073383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293517
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40103	NC_015183	CCG	2	6	2073432	2073437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293517
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40105	NC_015183	TGA	2	6	2073468	2073473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293517
40106	NC_015183	TCG	3	9	2073528	2073536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293517
40107	NC_015183	GAT	2	6	2073556	2073561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293517
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40113	NC_015183	TCA	2	6	2073729	2073734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293517
40114	NC_015183	ACC	2	6	2073749	2073754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293517
40115	NC_015183	GCGG	3	12	2073837	2073848	0 %	0 %	75 %	25 %	325293517
40116	NC_015183	CTG	2	6	2073850	2073855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293517
40117	NC_015183	GC	3	6	2073856	2073861	0 %	0 %	50 %	50 %	325293517
40118	NC_015183	AGC	2	6	2074007	2074012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293517
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40147	NC_015183	CGC	2	6	2075379	2075384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293517
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40201	NC_015183	T	8	8	2077777	2077784	0 %	100 %	0 %	0 %	325293519
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40208	NC_015183	TCAC	2	8	2078366	2078373	25 %	25 %	0 %	50 %	325293520
40209	NC_015183	AGGC	2	8	2078406	2078413	25 %	0 %	50 %	25 %	325293520
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40219	NC_015183	GCTG	2	8	2079233	2079240	0 %	25 %	50 %	25 %	325293521
40220	NC_015183	GGC	2	6	2079263	2079268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293521
40221	NC_015183	CGTCG	2	10	2079271	2079280	0 %	20 %	40 %	40 %	325293521
40222	NC_015183	GGC	2	6	2079293	2079298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293521
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40225	NC_015183	CG	3	6	2079501	2079506	0 %	0 %	50 %	50 %	325293521
40226	NC_015183	CAC	2	6	2079541	2079546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293521
40227	NC_015183	GGC	2	6	2080039	2080044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293522
40228	NC_015183	CCG	2	6	2080071	2080076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293522
40229	NC_015183	ATG	2	6	2080082	2080087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293522
40230	NC_015183	TGC	2	6	2080089	2080094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293522
40231	NC_015183	CGG	2	6	2080101	2080106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293522
40232	NC_015183	CGG	2	6	2080125	2080130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293522
40233	NC_015183	CGG	2	6	2080137	2080142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293522
40234	NC_015183	CGG	2	6	2080155	2080160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293522
40235	NC_015183	CTA	2	6	2080176	2080181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293522
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40238	NC_015183	GCT	2	6	2080208	2080213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293522
40239	NC_015183	CCG	2	6	2080224	2080229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293522
40240	NC_015183	ATG	2	6	2080244	2080249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293522
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40243	NC_015183	ATG	2	6	2080752	2080757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293523
40244	NC_015183	CG	3	6	2080795	2080800	0 %	0 %	50 %	50 %	325293523
40245	NC_015183	GTC	2	6	2080872	2080877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293523
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40250	NC_015183	ATG	2	6	2081337	2081342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293523
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40296	NC_015183	CTG	2	6	2084104	2084109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293526
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40346	NC_015183	AAAG	2	8	2086372	2086379	75 %	0 %	25 %	0 %	325293527
40347	NC_015183	GCA	2	6	2086399	2086404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293527
40348	NC_015183	TCCCT	2	10	2086427	2086436	0 %	40 %	0 %	60 %	325293527
40349	NC_015183	CG	3	6	2086705	2086710	0 %	0 %	50 %	50 %	325293528
40350	NC_015183	CTG	2	6	2086721	2086726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293528
40351	NC_015183	CTT	2	6	2086732	2086737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293528
40352	NC_015183	ATGCCG	2	12	2086758	2086769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325293528
40353	NC_015183	TTC	2	6	2086790	2086795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293528
40354	NC_015183	GCGAG	2	10	2086807	2086816	20 %	0 %	60 %	20 %	325293528
40355	NC_015183	GTC	3	9	2086824	2086832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293528
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40358	NC_015183	GCA	2	6	2087044	2087049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293528
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40375	NC_015183	TCG	3	9	2087892	2087900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293528
40376	NC_015183	CTT	2	6	2087905	2087910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293528
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40450	NC_015183	ACCG	2	8	2092254	2092261	25 %	0 %	25 %	50 %	325293531
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40456	NC_015183	CG	4	8	2092604	2092611	0 %	0 %	50 %	50 %	325293531
40457	NC_015183	TCG	2	6	2092724	2092729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293531
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40459	NC_015183	TGAA	2	8	2092817	2092824	50 %	25 %	25 %	0 %	325293531
40460	NC_015183	GTC	2	6	2092843	2092848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293531
40461	NC_015183	CCG	2	6	2092934	2092939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293531
40462	NC_015183	TTTCC	2	10	2092971	2092980	0 %	60 %	0 %	40 %	325293531
40463	NC_015183	TCA	2	6	2093039	2093044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293531
40464	NC_015183	CCA	2	6	2093079	2093084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293531
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40466	NC_015183	CCA	2	6	2093133	2093138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293531
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40473	NC_015183	CTG	2	6	2093383	2093388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293531
40474	NC_015183	GA	3	6	2093392	2093397	50 %	0 %	50 %	0 %	325293531
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40491	NC_015183	CGA	2	6	2094201	2094206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293532
40492	NC_015183	ACG	2	6	2094242	2094247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293532
40493	NC_015183	TCA	2	6	2094318	2094323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293532
40494	NC_015183	ATG	3	9	2094329	2094337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293532
40495	NC_015183	ATG	2	6	2094350	2094355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293532
40496	NC_015183	GCA	2	6	2094387	2094392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293532
40497	NC_015183	A	6	6	2094396	2094401	100 %	0 %	0 %	0 %	325293532
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40499	NC_015183	CGC	2	6	2094454	2094459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293532
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