MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_015183	AAC	2	6	1804211	1804216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293245
35002	NC_015183	CAC	2	6	1804274	1804279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293245
35003	NC_015183	TCA	2	6	1804398	1804403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293245
35004	NC_015183	ATG	2	6	1804427	1804432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293245
35005	NC_015183	GGC	2	6	1804466	1804471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293245
35006	NC_015183	CGC	2	6	1804656	1804661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293246
35007	NC_015183	AGC	2	6	1804662	1804667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293246
35008	NC_015183	TGC	2	6	1804671	1804676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293246
35009	NC_015183	TCC	2	6	1804705	1804710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293246
35010	NC_015183	CGA	2	6	1804730	1804735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293246
35011	NC_015183	CTG	2	6	1804764	1804769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293246
35012	NC_015183	AACTC	2	10	1804817	1804826	40 %	20 %	0 %	40 %	325293246
35013	NC_015183	GGC	2	6	1804996	1805001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293246
35014	NC_015183	GCT	2	6	1805006	1805011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293246
35015	NC_015183	CCT	2	6	1805190	1805195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293247
35016	NC_015183	AGA	2	6	1805231	1805236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293247
35017	NC_015183	TCG	2	6	1805237	1805242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293247
35018	NC_015183	GCAAG	2	10	1805253	1805262	40 %	0 %	40 %	20 %	325293247
35019	NC_015183	TGCCA	2	10	1805277	1805286	20 %	20 %	20 %	40 %	325293247
35020	NC_015183	GGC	2	6	1805307	1805312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293247
35021	NC_015183	GCC	2	6	1805658	1805663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293248
35022	NC_015183	GCG	2	6	1805750	1805755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293248
35023	NC_015183	GCC	2	6	1805794	1805799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293248
35024	NC_015183	CGGCAT	2	12	1805822	1805833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325293248
35025	NC_015183	CGG	2	6	1805835	1805840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293248
35026	NC_015183	GCT	2	6	1805890	1805895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293248
35027	NC_015183	GC	3	6	1805912	1805917	0 %	0 %	50 %	50 %	325293248
35028	NC_015183	GA	3	6	1805946	1805951	50 %	0 %	50 %	0 %	325293248
35029	NC_015183	GGCG	2	8	1806006	1806013	0 %	0 %	75 %	25 %	325293248
35030	NC_015183	TGC	2	6	1806081	1806086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293248
35031	NC_015183	TGA	2	6	1806089	1806094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293248
35032	NC_015183	GCC	2	6	1806172	1806177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293248
35033	NC_015183	CGG	2	6	1806187	1806192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293248
35034	NC_015183	TGG	2	6	1806200	1806205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293248
35035	NC_015183	GAT	2	6	1806232	1806237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293248
35036	NC_015183	GAT	2	6	1806270	1806275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293248
35037	NC_015183	CGG	2	6	1806287	1806292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293248
35038	NC_015183	GAG	2	6	1806322	1806327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293248
35039	NC_015183	CGG	3	9	1806328	1806336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293248
35040	NC_015183	GGA	2	6	1806378	1806383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293248
35041	NC_015183	TCG	3	9	1806452	1806460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293248
35042	NC_015183	CCG	2	6	1806482	1806487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293248
35043	NC_015183	GAT	2	6	1806552	1806557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293248
35044	NC_015183	CGG	2	6	1806561	1806566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293248
35045	NC_015183	GCG	2	6	1806611	1806616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293248
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35048	NC_015183	GAC	2	6	1806802	1806807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293248
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35051	NC_015183	GCA	2	6	1807074	1807079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293249
35052	NC_015183	GCA	2	6	1807128	1807133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293249
35053	NC_015183	TGACA	2	10	1807145	1807154	40 %	20 %	20 %	20 %	325293249
35054	NC_015183	GCC	3	9	1807158	1807166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293249
35055	NC_015183	CTCG	2	8	1807211	1807218	0 %	25 %	25 %	50 %	325293249
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35083	NC_015183	TCG	2	6	1808803	1808808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293250
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35097	NC_015183	GC	3	6	1809462	1809467	0 %	0 %	50 %	50 %	325293250
35098	NC_015183	GCC	2	6	1809477	1809482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293250
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35101	NC_015183	CTC	2	6	1809677	1809682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293250
35102	NC_015183	GGC	2	6	1809684	1809689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293250
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35104	NC_015183	CGA	2	6	1809736	1809741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293250
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35114	NC_015183	GCA	3	9	1810170	1810178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293251
35115	NC_015183	GGT	2	6	1810407	1810412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293252
35116	NC_015183	TGC	2	6	1810413	1810418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293252
35117	NC_015183	AGG	2	6	1810435	1810440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293252
35118	NC_015183	CAG	2	6	1810463	1810468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293252
35119	NC_015183	GCG	2	6	1810603	1810608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293252
35120	NC_015183	GGATC	2	10	1810654	1810663	20 %	20 %	40 %	20 %	325293252
35121	NC_015183	CAG	2	6	1810748	1810753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293252
35122	NC_015183	GCAGC	2	10	1810762	1810771	20 %	0 %	40 %	40 %	325293252
35123	NC_015183	CCA	2	6	1810773	1810778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293252
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35127	NC_015183	AGC	2	6	1811088	1811093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293252
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35133	NC_015183	CGA	2	6	1811236	1811241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293252
35134	NC_015183	GCCGCA	2	12	1811247	1811258	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325293252
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35138	NC_015183	GCC	2	6	1811454	1811459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293252
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35142	NC_015183	CGT	2	6	1811687	1811692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293253
35143	NC_015183	CGC	2	6	1811742	1811747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293253
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35145	NC_015183	GGC	2	6	1811784	1811789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293253
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35149	NC_015183	CCG	3	9	1811872	1811880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293253
35150	NC_015183	GCA	2	6	1811884	1811889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293253
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35153	NC_015183	TCG	2	6	1812710	1812715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293254
35154	NC_015183	AG	3	6	1812733	1812738	50 %	0 %	50 %	0 %	325293254
35155	NC_015183	CGCGG	2	10	1812793	1812802	0 %	0 %	60 %	40 %	325293254
35156	NC_015183	CG	3	6	1812932	1812937	0 %	0 %	50 %	50 %	325293255
35157	NC_015183	CAT	2	6	1813011	1813016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293255
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35172	NC_015183	TCA	2	6	1813628	1813633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293255
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35190	NC_015183	ACG	2	6	1814579	1814584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293256
35191	NC_015183	TCTGCG	2	12	1814589	1814600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293256
35192	NC_015183	CGG	2	6	1814607	1814612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293256
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35195	NC_015183	ACC	2	6	1814774	1814779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293256
35196	NC_015183	ATCCGC	2	12	1814788	1814799	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325293256
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35199	NC_015183	CAG	2	6	1814898	1814903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293256
35200	NC_015183	GCC	3	9	1814996	1815004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293256
35201	NC_015183	GA	3	6	1815022	1815027	50 %	0 %	50 %	0 %	325293256
35202	NC_015183	GCA	2	6	1815105	1815110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293257
35203	NC_015183	GCC	2	6	1815145	1815150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293257
35204	NC_015183	GTC	2	6	1815152	1815157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293257
35205	NC_015183	GCC	2	6	1815199	1815204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293257
35206	NC_015183	ATG	2	6	1815211	1815216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293257
35207	NC_015183	GAT	2	6	1815234	1815239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293257
35208	NC_015183	ATTG	2	8	1815316	1815323	25 %	50 %	25 %	0 %	325293257
35209	NC_015183	ATCTTG	2	12	1815332	1815343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325293257
35210	NC_015183	GGC	2	6	1815352	1815357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293257
35211	NC_015183	GCG	2	6	1815367	1815372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293257
35212	NC_015183	GAT	2	6	1815529	1815534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293257
35213	NC_015183	TGACGG	2	12	1815555	1815566	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325293257
35214	NC_015183	AGC	2	6	1815569	1815574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293257
35215	NC_015183	GATC	2	8	1815624	1815631	25 %	25 %	25 %	25 %	325293257
35216	NC_015183	AGA	2	6	1815728	1815733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293257
35217	NC_015183	GCG	2	6	1815734	1815739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293257
35218	NC_015183	GGC	2	6	1815849	1815854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293257
35219	NC_015183	CTT	2	6	1815921	1815926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293258
35220	NC_015183	AGGG	2	8	1815931	1815938	25 %	0 %	75 %	0 %	325293258
35221	NC_015183	GCA	2	6	1816045	1816050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293258
35222	NC_015183	CAGC	2	8	1816087	1816094	25 %	0 %	25 %	50 %	325293258
35223	NC_015183	CGC	3	9	1816169	1816177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293258
35224	NC_015183	GCA	2	6	1816219	1816224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293258
35225	NC_015183	TCG	2	6	1816239	1816244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293258
35226	NC_015183	TCA	2	6	1816246	1816251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293258
35227	NC_015183	GCCA	2	8	1816265	1816272	25 %	0 %	25 %	50 %	325293258
35228	NC_015183	GCC	2	6	1816277	1816282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293258
35229	NC_015183	GAA	2	6	1816286	1816291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293258
35230	NC_015183	GAA	2	6	1816298	1816303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293258
35231	NC_015183	GCCGC	2	10	1816382	1816391	0 %	0 %	40 %	60 %	325293258
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35245	NC_015183	GC	3	6	1817245	1817250	0 %	0 %	50 %	50 %	325293259
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35328	NC_015183	AGATC	2	10	1821291	1821300	40 %	20 %	20 %	20 %	325293263
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35332	NC_015183	GC	4	8	1821491	1821498	0 %	0 %	50 %	50 %	325293263
35333	NC_015183	ATATCG	2	12	1821500	1821511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325293263
35334	NC_015183	GC	3	6	1821658	1821663	0 %	0 %	50 %	50 %	325293263
35335	NC_015183	CGC	2	6	1821678	1821683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293263
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35337	NC_015183	TCCA	2	8	1821892	1821899	25 %	25 %	0 %	50 %	325293263
35338	NC_015183	CCA	3	9	1821897	1821905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293263
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35340	NC_015183	GAG	2	6	1821988	1821993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293263
35341	NC_015183	AGG	2	6	1822001	1822006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293263
35342	NC_015183	GCAA	2	8	1822052	1822059	50 %	0 %	25 %	25 %	325293263
35343	NC_015183	CTG	2	6	1822081	1822086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293263
35344	NC_015183	CCCG	2	8	1822087	1822094	0 %	0 %	25 %	75 %	325293263
35345	NC_015183	GTTCC	2	10	1822127	1822136	0 %	40 %	20 %	40 %	325293263
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35351	NC_015183	CCGG	2	8	1822433	1822440	0 %	0 %	50 %	50 %	325293264
35352	NC_015183	CGA	2	6	1822476	1822481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293264
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35430	NC_015183	TGA	2	6	1826780	1826785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293271
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35448	NC_015183	CGA	2	6	1827671	1827676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293272
35449	NC_015183	AGC	2	6	1827689	1827694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293272
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35452	NC_015183	TCG	3	9	1827833	1827841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293272
35453	NC_015183	GCC	2	6	1827842	1827847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293272
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35455	NC_015183	TCG	2	6	1827917	1827922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293272
35456	NC_015183	GGTCA	2	10	1827931	1827940	20 %	20 %	40 %	20 %	325293272
35457	NC_015183	ATCC	2	8	1828005	1828012	25 %	25 %	0 %	50 %	325293272
35458	NC_015183	ATG	2	6	1828033	1828038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293272
35459	NC_015183	CCA	2	6	1828073	1828078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293272
35460	NC_015183	GAA	2	6	1828126	1828131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293272
35461	NC_015183	CAT	2	6	1828173	1828178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293272
35462	NC_015183	CGA	2	6	1828197	1828202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293272
35463	NC_015183	CGG	2	6	1828230	1828235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293272
35464	NC_015183	TGA	2	6	1828313	1828318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293272
35465	NC_015183	TGAAGC	2	12	1828353	1828364	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293272
35466	NC_015183	CACGG	2	10	1828369	1828378	20 %	0 %	40 %	40 %	325293272
35467	NC_015183	GAC	2	6	1828483	1828488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293272
35468	NC_015183	GCA	2	6	1828510	1828515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293272
35469	NC_015183	CTC	2	6	1828576	1828581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293272
35470	NC_015183	CCA	2	6	1828607	1828612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293272
35471	NC_015183	GGC	2	6	1828656	1828661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293272
35472	NC_015183	TCT	2	6	1829014	1829019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293273
35473	NC_015183	CG	3	6	1829035	1829040	0 %	0 %	50 %	50 %	325293273
35474	NC_015183	GATG	2	8	1829053	1829060	25 %	25 %	50 %	0 %	325293273
35475	NC_015183	GC	3	6	1829262	1829267	0 %	0 %	50 %	50 %	325293273
35476	NC_015183	TTA	2	6	1829273	1829278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293273
35477	NC_015183	T	6	6	1829289	1829294	0 %	100 %	0 %	0 %	325293273
35478	NC_015183	TGGC	2	8	1829368	1829375	0 %	25 %	50 %	25 %	325293273
35479	NC_015183	TCACT	2	10	1829447	1829456	20 %	40 %	0 %	40 %	325293273
35480	NC_015183	GCG	2	6	1829457	1829462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293273
35481	NC_015183	GACC	2	8	1829552	1829559	25 %	0 %	25 %	50 %	325293273
35482	NC_015183	TGA	2	6	1829588	1829593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293273
35483	NC_015183	GGC	2	6	1829615	1829620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293273
35484	NC_015183	CT	3	6	1829776	1829781	0 %	50 %	0 %	50 %	325293274
35485	NC_015183	TGCC	2	8	1829789	1829796	0 %	25 %	25 %	50 %	325293274
35486	NC_015183	GGAT	2	8	1829805	1829812	25 %	25 %	50 %	0 %	325293274
35487	NC_015183	GCG	2	6	1829824	1829829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293274
35488	NC_015183	AGC	2	6	1829874	1829879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293274
35489	NC_015183	GGGAT	2	10	1830066	1830075	20 %	20 %	60 %	0 %	325293274
35490	NC_015183	GCC	2	6	1830180	1830185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293275
35491	NC_015183	GCC	2	6	1830224	1830229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293275
35492	NC_015183	CCG	2	6	1830255	1830260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293275
35493	NC_015183	GCC	2	6	1830266	1830271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293275
35494	NC_015183	GCA	2	6	1830339	1830344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293275
35495	NC_015183	CTTGC	2	10	1830351	1830360	0 %	40 %	20 %	40 %	325293275
35496	NC_015183	CAG	2	6	1830380	1830385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293275
35497	NC_015183	ACG	2	6	1830387	1830392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293275
35498	NC_015183	CTG	2	6	1830491	1830496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293275
35499	NC_015183	CGT	2	6	1830499	1830504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293275
35500	NC_015183	CGA	2	6	1830518	1830523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293275

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