MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_015183	GAC	2	6	1640791	1640796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293078
32003	NC_015183	GATC	2	8	1640829	1640836	25 %	25 %	25 %	25 %	325293078
32004	NC_015183	AAGA	2	8	1640851	1640858	75 %	0 %	25 %	0 %	325293078
32005	NC_015183	ACG	2	6	1640916	1640921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293078
32006	NC_015183	CCAG	2	8	1640939	1640946	25 %	0 %	25 %	50 %	325293078
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32009	NC_015183	CG	3	6	1641036	1641041	0 %	0 %	50 %	50 %	325293078
32010	NC_015183	CGC	2	6	1641049	1641054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293078
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32012	NC_015183	GAA	2	6	1641064	1641069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293078
32013	NC_015183	GC	3	6	1641102	1641107	0 %	0 %	50 %	50 %	325293078
32014	NC_015183	CGG	2	6	1641111	1641116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293078
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32017	NC_015183	GAT	2	6	1641238	1641243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293078
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32020	NC_015183	GAT	2	6	1641475	1641480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293078
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32043	NC_015183	GCTGAC	2	12	1642756	1642767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325293080
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32106	NC_015183	TCTGT	2	10	1645680	1645689	0 %	60 %	20 %	20 %	325293082
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32114	NC_015183	TCG	2	6	1646121	1646126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293083
32115	NC_015183	CGC	2	6	1646167	1646172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293083
32116	NC_015183	GGA	2	6	1646233	1646238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293083
32117	NC_015183	GAA	2	6	1646245	1646250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293083
32118	NC_015183	CGC	2	6	1646313	1646318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293083
32119	NC_015183	TTC	2	6	1646348	1646353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293083
32120	NC_015183	GCTC	2	8	1646380	1646387	0 %	25 %	25 %	50 %	325293083
32121	NC_015183	ATG	2	6	1646413	1646418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293083
32122	NC_015183	GC	3	6	1646500	1646505	0 %	0 %	50 %	50 %	325293084
32123	NC_015183	CAT	2	6	1646536	1646541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293084
32124	NC_015183	GGCG	2	8	1646589	1646596	0 %	0 %	75 %	25 %	325293084
32125	NC_015183	CAT	2	6	1646634	1646639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293084
32126	NC_015183	GCG	2	6	1646651	1646656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293084
32127	NC_015183	CGCC	2	8	1646685	1646692	0 %	0 %	25 %	75 %	325293084
32128	NC_015183	CAT	2	6	1646808	1646813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293084
32129	NC_015183	GCC	2	6	1646821	1646826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293084
32130	NC_015183	GAT	2	6	1646869	1646874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293084
32131	NC_015183	GGC	2	6	1647266	1647271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293085
32132	NC_015183	CGT	2	6	1647295	1647300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293085
32133	NC_015183	GCT	2	6	1647328	1647333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293085
32134	NC_015183	CGG	2	6	1647370	1647375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293085
32135	NC_015183	TTG	2	6	1647450	1647455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293085
32136	NC_015183	GAGC	2	8	1647508	1647515	25 %	0 %	50 %	25 %	325293085
32137	NC_015183	CTT	2	6	1647530	1647535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293085
32138	NC_015183	ACGGT	2	10	1647574	1647583	20 %	20 %	40 %	20 %	325293085
32139	NC_015183	GTCG	2	8	1647683	1647690	0 %	25 %	50 %	25 %	325293085
32140	NC_015183	ACC	2	6	1647827	1647832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293085
32141	NC_015183	GGC	2	6	1647837	1647842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293085
32142	NC_015183	GCA	2	6	1647916	1647921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293085
32143	NC_015183	TCTGG	2	10	1647931	1647940	0 %	40 %	40 %	20 %	325293085
32144	NC_015183	TCG	2	6	1647960	1647965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293085
32145	NC_015183	GGC	2	6	1648004	1648009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293085
32146	NC_015183	CGC	2	6	1648064	1648069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293085
32147	NC_015183	GCA	2	6	1648090	1648095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293085
32148	NC_015183	TCG	2	6	1648129	1648134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293085
32149	NC_015183	AGA	2	6	1648163	1648168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293085
32150	NC_015183	ACGG	2	8	1648202	1648209	25 %	0 %	50 %	25 %	325293085
32151	NC_015183	GGT	2	6	1648214	1648219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293085
32152	NC_015183	CTG	2	6	1648247	1648252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293085
32153	NC_015183	TGC	2	6	1648259	1648264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293085
32154	NC_015183	GA	3	6	1648265	1648270	50 %	0 %	50 %	0 %	325293085
32155	NC_015183	CCG	2	6	1648348	1648353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293085
32156	NC_015183	GCCGAA	2	12	1648389	1648400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293085
32157	NC_015183	CCG	2	6	1648434	1648439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293085
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32159	NC_015183	GCC	2	6	1648481	1648486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293085
32160	NC_015183	ACC	2	6	1648508	1648513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293085
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32162	NC_015183	GTC	2	6	1648584	1648589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293085
32163	NC_015183	ATCCG	2	10	1648590	1648599	20 %	20 %	20 %	40 %	325293085
32164	NC_015183	CGC	2	6	1648755	1648760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293085
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32166	NC_015183	CTTC	2	8	1649086	1649093	0 %	50 %	0 %	50 %	325293086
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32169	NC_015183	GCC	2	6	1649171	1649176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293086
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32172	NC_015183	CGA	2	6	1649230	1649235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293086
32173	NC_015183	TGC	2	6	1649269	1649274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293086
32174	NC_015183	GAC	2	6	1649291	1649296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293086
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32180	NC_015183	GCG	2	6	1649575	1649580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293086
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32184	NC_015183	GCG	2	6	1649754	1649759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293087
32185	NC_015183	TAA	2	6	1649843	1649848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293087
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32188	NC_015183	CAT	2	6	1649931	1649936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293087
32189	NC_015183	ATTGAG	2	12	1649956	1649967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293087
32190	NC_015183	TCA	2	6	1649994	1649999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293087
32191	NC_015183	GCA	2	6	1650006	1650011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293087
32192	NC_015183	ACG	2	6	1650047	1650052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293087
32193	NC_015183	ATG	2	6	1650230	1650235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293087
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32195	NC_015183	GA	3	6	1650305	1650310	50 %	0 %	50 %	0 %	325293087
32196	NC_015183	GGTC	2	8	1650336	1650343	0 %	25 %	50 %	25 %	325293087
32197	NC_015183	CGT	2	6	1650423	1650428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293087
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32199	NC_015183	CGT	3	9	1650734	1650742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293088
32200	NC_015183	CGG	2	6	1650782	1650787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293088
32201	NC_015183	TCG	2	6	1650818	1650823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293088
32202	NC_015183	GTC	2	6	1650828	1650833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293088
32203	NC_015183	GCGCC	2	10	1650858	1650867	0 %	0 %	40 %	60 %	325293088
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32205	NC_015183	GC	4	8	1650951	1650958	0 %	0 %	50 %	50 %	325293088
32206	NC_015183	CTT	2	6	1651022	1651027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293088
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32210	NC_015183	CCG	2	6	1651250	1651255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293088
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32212	NC_015183	GCTG	2	8	1651436	1651443	0 %	25 %	50 %	25 %	325293088
32213	NC_015183	CAC	2	6	1651575	1651580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293088
32214	NC_015183	TCG	2	6	1651612	1651617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293088
32215	NC_015183	CGT	2	6	1651646	1651651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293088
32216	NC_015183	CGG	2	6	1651658	1651663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293088
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32218	NC_015183	GC	3	6	1651687	1651692	0 %	0 %	50 %	50 %	325293088
32219	NC_015183	TTC	2	6	1651750	1651755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293088
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32221	NC_015183	GCGAC	2	10	1651794	1651803	20 %	0 %	40 %	40 %	325293088
32222	NC_015183	TCG	2	6	1651843	1651848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293088
32223	NC_015183	GCT	2	6	1651860	1651865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293088
32224	NC_015183	GCGCC	2	10	1651879	1651888	0 %	0 %	40 %	60 %	325293088
32225	NC_015183	TGC	2	6	1651896	1651901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293088
32226	NC_015183	TCG	2	6	1651946	1651951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293088
32227	NC_015183	GCA	2	6	1652085	1652090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293089
32228	NC_015183	GCAG	2	8	1652145	1652152	25 %	0 %	50 %	25 %	325293089
32229	NC_015183	GGC	2	6	1652181	1652186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293089
32230	NC_015183	GTG	2	6	1652283	1652288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293089
32231	NC_015183	ATG	2	6	1652334	1652339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293089
32232	NC_015183	TGC	2	6	1652403	1652408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293089
32233	NC_015183	GAA	2	6	1652417	1652422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293089
32234	NC_015183	GAA	3	9	1652441	1652449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293089
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32237	NC_015183	CG	3	6	1652513	1652518	0 %	0 %	50 %	50 %	325293089
32238	NC_015183	GAA	3	9	1652621	1652629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293089
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32241	NC_015183	CGA	2	6	1652758	1652763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293089
32242	NC_015183	GCGGCT	2	12	1652821	1652832	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325293089
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32245	NC_015183	TGC	2	6	1653027	1653032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293090
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32253	NC_015183	CGA	2	6	1653256	1653261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293090
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32339	NC_015183	GCA	2	6	1657408	1657413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293095
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32342	NC_015183	CTGG	2	8	1657551	1657558	0 %	25 %	50 %	25 %	325293095
32343	NC_015183	TTC	2	6	1657563	1657568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293095
32344	NC_015183	CGT	2	6	1657631	1657636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293095
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32346	NC_015183	ACG	2	6	1657786	1657791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293095
32347	NC_015183	CAC	2	6	1657812	1657817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293095
32348	NC_015183	CGG	2	6	1657835	1657840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293095
32349	NC_015183	ATG	2	6	1657843	1657848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293095
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32449	NC_015183	AGCGA	2	10	1663264	1663273	40 %	0 %	40 %	20 %	325293098
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32454	NC_015183	GCTGCG	2	12	1663530	1663541	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325293098
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32459	NC_015183	ATGG	2	8	1664219	1664226	25 %	25 %	50 %	0 %	325293099
32460	NC_015183	GAG	2	6	1664265	1664270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293099
32461	NC_015183	CG	3	6	1664418	1664423	0 %	0 %	50 %	50 %	325293099
32462	NC_015183	ACG	2	6	1664424	1664429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293099
32463	NC_015183	GAA	2	6	1664480	1664485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293099
32464	NC_015183	CGG	2	6	1664518	1664523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293099
32465	NC_015183	ATTTCA	2	12	1664611	1664622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325293099
32466	NC_015183	ATC	2	6	1664775	1664780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293100
32467	NC_015183	CG	3	6	1664811	1664816	0 %	0 %	50 %	50 %	325293100
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32469	NC_015183	CGT	2	6	1664928	1664933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293100
32470	NC_015183	CTT	2	6	1665012	1665017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293100
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32474	NC_015183	AGC	2	6	1665196	1665201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293100
32475	NC_015183	GAA	2	6	1665210	1665215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293100
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32480	NC_015183	ATG	2	6	1665520	1665525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293100
32481	NC_015183	TC	3	6	1665572	1665577	0 %	50 %	0 %	50 %	325293101
32482	NC_015183	CCG	2	6	1665628	1665633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293101
32483	NC_015183	AC	3	6	1665650	1665655	50 %	0 %	0 %	50 %	325293101
32484	NC_015183	GCA	2	6	1665668	1665673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293101
32485	NC_015183	GGT	2	6	1665691	1665696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293101
32486	NC_015183	CTTGAC	2	12	1666131	1666142	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293102
32487	NC_015183	CCGCA	2	10	1666211	1666220	20 %	0 %	20 %	60 %	325293102
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32489	NC_015183	AGG	2	6	1666255	1666260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293102
32490	NC_015183	CGC	2	6	1666424	1666429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293102
32491	NC_015183	ACCG	2	8	1666509	1666516	25 %	0 %	25 %	50 %	325293102
32492	NC_015183	CAGT	2	8	1666546	1666553	25 %	25 %	25 %	25 %	325293102
32493	NC_015183	ACCGA	2	10	1666561	1666570	40 %	0 %	20 %	40 %	325293102
32494	NC_015183	GCC	2	6	1666659	1666664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293102
32495	NC_015183	GA	3	6	1666682	1666687	50 %	0 %	50 %	0 %	325293102
32496	NC_015183	CGG	2	6	1666692	1666697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293102
32497	NC_015183	CTC	2	6	1666709	1666714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293102
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32499	NC_015183	GC	3	6	1666810	1666815	0 %	0 %	50 %	50 %	325293102
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