MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_015183	GCA	3	9	1613147	1613155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293050
31502	NC_015183	TCG	2	6	1613246	1613251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293050
31503	NC_015183	CAG	2	6	1613328	1613333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293050
31504	NC_015183	CGC	2	6	1613334	1613339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293050
31505	NC_015183	CGG	2	6	1613397	1613402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293050
31506	NC_015183	CTT	2	6	1613410	1613415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293050
31507	NC_015183	CAA	2	6	1613484	1613489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293050
31508	NC_015183	ATG	2	6	1613711	1613716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293050
31509	NC_015183	TCT	2	6	1613730	1613735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293050
31510	NC_015183	CAGC	2	8	1613874	1613881	25 %	0 %	25 %	50 %	325293050
31511	NC_015183	CGCT	2	8	1614891	1614898	0 %	25 %	25 %	50 %	325293051
31512	NC_015183	GACC	2	8	1614947	1614954	25 %	0 %	25 %	50 %	325293051
31513	NC_015183	CGTCG	2	10	1614993	1615002	0 %	20 %	40 %	40 %	325293051
31514	NC_015183	CCG	2	6	1615009	1615014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293051
31515	NC_015183	CGTT	2	8	1615630	1615637	0 %	50 %	25 %	25 %	325293052
31516	NC_015183	CAAGA	2	10	1615955	1615964	60 %	0 %	20 %	20 %	325293053
31517	NC_015183	CGT	2	6	1615981	1615986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293053
31518	NC_015183	GCG	2	6	1615989	1615994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293053
31519	NC_015183	GCC	2	6	1616012	1616017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293053
31520	NC_015183	GCG	2	6	1616034	1616039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293053
31521	NC_015183	GCG	2	6	1616064	1616069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293053
31522	NC_015183	CGA	2	6	1616137	1616142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293053
31523	NC_015183	CGG	2	6	1616236	1616241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293053
31524	NC_015183	GCC	2	6	1616341	1616346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293053
31525	NC_015183	GCA	3	9	1616358	1616366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293053
31526	NC_015183	GGC	3	9	1616401	1616409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293053
31527	NC_015183	CTG	2	6	1616497	1616502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293053
31528	NC_015183	CGG	2	6	1616533	1616538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293053
31529	NC_015183	GAG	2	6	1616573	1616578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293053
31530	NC_015183	CTGC	2	8	1616662	1616669	0 %	25 %	25 %	50 %	325293053
31531	NC_015183	GCC	2	6	1616694	1616699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293053
31532	NC_015183	ACA	2	6	1616814	1616819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293053
31533	NC_015183	TGG	2	6	1616820	1616825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293053
31534	NC_015183	GC	3	6	1616850	1616855	0 %	0 %	50 %	50 %	325293053
31535	NC_015183	GGC	2	6	1616912	1616917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293053
31536	NC_015183	GCTGAA	2	12	1616965	1616976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293053
31537	NC_015183	GCC	2	6	1617103	1617108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293053
31538	NC_015183	CGG	2	6	1617148	1617153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293053
31539	NC_015183	ATG	2	6	1617168	1617173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293053
31540	NC_015183	TTCC	2	8	1617187	1617194	0 %	50 %	0 %	50 %	325293053
31541	NC_015183	GACAA	2	10	1617284	1617293	60 %	0 %	20 %	20 %	325293053
31542	NC_015183	CCG	2	6	1617515	1617520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293054
31543	NC_015183	GCGG	2	8	1617566	1617573	0 %	0 %	75 %	25 %	325293054
31544	NC_015183	CTT	2	6	1617605	1617610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293054
31545	NC_015183	A	7	7	1617669	1617675	100 %	0 %	0 %	0 %	325293054
31546	NC_015183	CCCA	2	8	1617705	1617712	25 %	0 %	0 %	75 %	325293054
31547	NC_015183	CTC	2	6	1617807	1617812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293054
31548	NC_015183	GATA	2	8	1617991	1617998	50 %	25 %	25 %	0 %	325293054
31549	NC_015183	AG	4	8	1618047	1618054	50 %	0 %	50 %	0 %	325293055
31550	NC_015183	GTG	2	6	1618101	1618106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293055
31551	NC_015183	GAA	2	6	1618108	1618113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293055
31552	NC_015183	AGA	2	6	1618140	1618145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293055
31553	NC_015183	CGG	2	6	1618153	1618158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293055
31554	NC_015183	CTTG	2	8	1618160	1618167	0 %	50 %	25 %	25 %	325293055
31555	NC_015183	GTA	2	6	1618206	1618211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293055
31556	NC_015183	GCAATG	2	12	1618227	1618238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293055
31557	NC_015183	CCTG	2	8	1618294	1618301	0 %	25 %	25 %	50 %	325293055
31558	NC_015183	CCG	2	6	1618306	1618311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293055
31559	NC_015183	GACG	2	8	1618316	1618323	25 %	0 %	50 %	25 %	325293055
31560	NC_015183	GCC	3	9	1618332	1618340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293055
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31562	NC_015183	GAA	2	6	1618391	1618396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293055
31563	NC_015183	GAT	2	6	1618415	1618420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293055
31564	NC_015183	CAG	2	6	1618430	1618435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293055
31565	NC_015183	CGG	2	6	1618468	1618473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293055
31566	NC_015183	ATG	2	6	1618573	1618578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293056
31567	NC_015183	GCG	3	9	1618603	1618611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293056
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31569	NC_015183	GCGTC	2	10	1618858	1618867	0 %	20 %	40 %	40 %	325293056
31570	NC_015183	T	6	6	1618868	1618873	0 %	100 %	0 %	0 %	325293056
31571	NC_015183	GTT	2	6	1618956	1618961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293056
31572	NC_015183	CTTCT	2	10	1618962	1618971	0 %	60 %	0 %	40 %	325293056
31573	NC_015183	GTA	2	6	1618972	1618977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293056
31574	NC_015183	CTG	2	6	1618980	1618985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293056
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31577	NC_015183	GCCA	2	8	1619141	1619148	25 %	0 %	25 %	50 %	325293056
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31584	NC_015183	A	7	7	1619674	1619680	100 %	0 %	0 %	0 %	325293056
31585	NC_015183	CGC	2	6	1620368	1620373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293057
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31588	NC_015183	CT	3	6	1620493	1620498	0 %	50 %	0 %	50 %	325293057
31589	NC_015183	TCG	2	6	1620556	1620561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293057
31590	NC_015183	AAG	2	6	1620591	1620596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293057
31591	NC_015183	CAGGGC	2	12	1620693	1620704	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325293057
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31593	NC_015183	GCT	2	6	1620766	1620771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293057
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31597	NC_015183	ATC	2	6	1620996	1621001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293057
31598	NC_015183	CAA	2	6	1621013	1621018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293057
31599	NC_015183	GAAG	2	8	1621070	1621077	50 %	0 %	50 %	0 %	325293057
31600	NC_015183	CGA	2	6	1621082	1621087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293057
31601	NC_015183	CGG	2	6	1621136	1621141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293057
31602	NC_015183	TCA	2	6	1621228	1621233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293057
31603	NC_015183	CGG	2	6	1621316	1621321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293057
31604	NC_015183	CG	4	8	1621322	1621329	0 %	0 %	50 %	50 %	325293057
31605	NC_015183	TCG	2	6	1621351	1621356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293057
31606	NC_015183	GATC	2	8	1621382	1621389	25 %	25 %	25 %	25 %	325293057
31607	NC_015183	GAT	2	6	1621391	1621396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293057
31608	NC_015183	CAA	2	6	1621424	1621429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293057
31609	NC_015183	CGT	2	6	1621469	1621474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293057
31610	NC_015183	CAT	2	6	1621779	1621784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293058
31611	NC_015183	TGA	2	6	1621819	1621824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293058
31612	NC_015183	CGA	2	6	1621829	1621834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293058
31613	NC_015183	TTC	2	6	1621846	1621851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293058
31614	NC_015183	GCC	2	6	1621864	1621869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293058
31615	NC_015183	GTC	2	6	1621890	1621895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293058
31616	NC_015183	TGC	2	6	1621948	1621953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293058
31617	NC_015183	TCC	2	6	1621965	1621970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293058
31618	NC_015183	GAA	2	6	1621971	1621976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293058
31619	NC_015183	GA	3	6	1622025	1622030	50 %	0 %	50 %	0 %	325293058
31620	NC_015183	T	6	6	1622062	1622067	0 %	100 %	0 %	0 %	325293058
31621	NC_015183	CGGCC	2	10	1622090	1622099	0 %	0 %	40 %	60 %	325293058
31622	NC_015183	CG	3	6	1622155	1622160	0 %	0 %	50 %	50 %	325293058
31623	NC_015183	CCGC	2	8	1622269	1622276	0 %	0 %	25 %	75 %	325293058
31624	NC_015183	TCT	2	6	1622336	1622341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293058
31625	NC_015183	GGC	2	6	1622369	1622374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293058
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31630	NC_015183	ATG	2	6	1622792	1622797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293059
31631	NC_015183	GCCG	2	8	1622826	1622833	0 %	0 %	50 %	50 %	325293059
31632	NC_015183	CTG	2	6	1622883	1622888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293060
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31635	NC_015183	GCG	2	6	1622917	1622922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293060
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31639	NC_015183	GTC	2	6	1623033	1623038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293060
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31641	NC_015183	GCA	2	6	1623134	1623139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293060
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31674	NC_015183	GGAT	2	8	1624375	1624382	25 %	25 %	50 %	0 %	325293060
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31679	NC_015183	TCG	2	6	1624490	1624495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293061
31680	NC_015183	ATG	2	6	1624523	1624528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293061
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31683	NC_015183	GGTGCG	2	12	1624648	1624659	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325293061
31684	NC_015183	CGC	2	6	1624686	1624691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293061
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31686	NC_015183	ATC	2	6	1624720	1624725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293061
31687	NC_015183	GCAG	2	8	1624881	1624888	25 %	0 %	50 %	25 %	325293061
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31691	NC_015183	CGC	2	6	1625159	1625164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293061
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31694	NC_015183	CG	3	6	1625321	1625326	0 %	0 %	50 %	50 %	325293061
31695	NC_015183	CAC	2	6	1625328	1625333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293061
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31701	NC_015183	GAAG	2	8	1625613	1625620	50 %	0 %	50 %	0 %	325293061
31702	NC_015183	TGG	2	6	1625624	1625629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293061
31703	NC_015183	C	7	7	1625777	1625783	0 %	0 %	0 %	100 %	325293062
31704	NC_015183	CAG	2	6	1625818	1625823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293062
31705	NC_015183	TCA	2	6	1625828	1625833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293062
31706	NC_015183	GCC	3	9	1625866	1625874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293062
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31708	NC_015183	GCC	2	6	1625893	1625898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293062
31709	NC_015183	CGC	2	6	1625970	1625975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293062
31710	NC_015183	CG	3	6	1625985	1625990	0 %	0 %	50 %	50 %	325293062
31711	NC_015183	GC	3	6	1626036	1626041	0 %	0 %	50 %	50 %	325293062
31712	NC_015183	TCC	2	6	1626080	1626085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293062
31713	NC_015183	CG	3	6	1626109	1626114	0 %	0 %	50 %	50 %	325293062
31714	NC_015183	CGA	2	6	1626225	1626230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293062
31715	NC_015183	CGC	2	6	1626271	1626276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293062
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31717	NC_015183	CG	3	6	1626309	1626314	0 %	0 %	50 %	50 %	325293062
31718	NC_015183	CGT	2	6	1626316	1626321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293062
31719	NC_015183	GC	3	6	1626420	1626425	0 %	0 %	50 %	50 %	325293062
31720	NC_015183	CGC	2	6	1626477	1626482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293062
31721	NC_015183	CGC	2	6	1626528	1626533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293062
31722	NC_015183	CGAAG	2	10	1626684	1626693	40 %	0 %	40 %	20 %	325293062
31723	NC_015183	GCA	2	6	1626716	1626721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293062
31724	NC_015183	CGGCG	2	10	1626789	1626798	0 %	0 %	60 %	40 %	325293062
31725	NC_015183	GCT	2	6	1626801	1626806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293062
31726	NC_015183	CGA	2	6	1626849	1626854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293062
31727	NC_015183	TCC	2	6	1626860	1626865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293062
31728	NC_015183	TCGA	2	8	1627043	1627050	25 %	25 %	25 %	25 %	325293063
31729	NC_015183	ATA	2	6	1627078	1627083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293063
31730	NC_015183	AGC	2	6	1627103	1627108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293063
31731	NC_015183	GCC	2	6	1627111	1627116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293063
31732	NC_015183	GAT	2	6	1627140	1627145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293063
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31772	NC_015183	CG	3	6	1629113	1629118	0 %	0 %	50 %	50 %	325293064
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31838	NC_015183	CG	3	6	1632730	1632735	0 %	0 %	50 %	50 %	325293071
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31843	NC_015183	GCC	2	6	1632910	1632915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293071
31844	NC_015183	ACC	2	6	1632940	1632945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293071
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31846	NC_015183	TGC	2	6	1633041	1633046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293071
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31848	NC_015183	ACC	2	6	1633138	1633143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293071
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31860	NC_015183	CGA	2	6	1633503	1633508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293071
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31954	NC_015183	ACG	2	6	1638675	1638680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293076
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31963	NC_015183	CGC	2	6	1639239	1639244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293077
31964	NC_015183	GGC	2	6	1639293	1639298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293077
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31999	NC_015183	GCG	2	6	1640648	1640653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293078
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