MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_015183	CCATG	2	10	1588809	1588818	20 %	20 %	20 %	40 %	325293029
31002	NC_015183	ACG	2	6	1588834	1588839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293029
31003	NC_015183	CTG	2	6	1588873	1588878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293029
31004	NC_015183	CGA	2	6	1589135	1589140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293030
31005	NC_015183	CGC	2	6	1589172	1589177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293030
31006	NC_015183	CGG	2	6	1589205	1589210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293030
31007	NC_015183	TGCCC	2	10	1589234	1589243	0 %	20 %	20 %	60 %	325293030
31008	NC_015183	GTC	2	6	1589278	1589283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293030
31009	NC_015183	TCC	2	6	1589300	1589305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293030
31010	NC_015183	CGC	3	9	1589319	1589327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293030
31011	NC_015183	GCCC	2	8	1589375	1589382	0 %	0 %	25 %	75 %	325293030
31012	NC_015183	CAA	2	6	1589406	1589411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293030
31013	NC_015183	CA	3	6	1589478	1589483	50 %	0 %	0 %	50 %	325293030
31014	NC_015183	CCG	2	6	1589484	1589489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293030
31015	NC_015183	CGC	2	6	1589535	1589540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293030
31016	NC_015183	CCG	2	6	1589564	1589569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293030
31017	NC_015183	CG	3	6	1589568	1589573	0 %	0 %	50 %	50 %	325293030
31018	NC_015183	GAT	2	6	1589727	1589732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293030
31019	NC_015183	CGC	2	6	1589737	1589742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293030
31020	NC_015183	GCC	2	6	1589768	1589773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293030
31021	NC_015183	CCG	2	6	1589801	1589806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293030
31022	NC_015183	GAT	2	6	1589818	1589823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293030
31023	NC_015183	CGC	2	6	1589908	1589913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293030
31024	NC_015183	CCG	2	6	1589928	1589933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293030
31025	NC_015183	GGC	3	9	1590199	1590207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293031
31026	NC_015183	CGG	2	6	1590339	1590344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293031
31027	NC_015183	T	6	6	1590347	1590352	0 %	100 %	0 %	0 %	325293031
31028	NC_015183	ACC	2	6	1590386	1590391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293031
31029	NC_015183	ATCG	2	8	1590397	1590404	25 %	25 %	25 %	25 %	325293031
31030	NC_015183	CGGC	2	8	1590418	1590425	0 %	0 %	50 %	50 %	325293031
31031	NC_015183	CAC	2	6	1590547	1590552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293031
31032	NC_015183	ACCGCA	2	12	1590698	1590709	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325293031
31033	NC_015183	AGC	2	6	1590710	1590715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293031
31034	NC_015183	TCA	2	6	1590750	1590755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293031
31035	NC_015183	CGC	2	6	1590819	1590824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293032
31036	NC_015183	TTG	2	6	1590869	1590874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293032
31037	NC_015183	TGC	2	6	1590897	1590902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293032
31038	NC_015183	CG	3	6	1591020	1591025	0 %	0 %	50 %	50 %	325293032
31039	NC_015183	TCG	2	6	1591049	1591054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293032
31040	NC_015183	GC	4	8	1591168	1591175	0 %	0 %	50 %	50 %	325293032
31041	NC_015183	TCG	2	6	1591181	1591186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293032
31042	NC_015183	CG	3	6	1591215	1591220	0 %	0 %	50 %	50 %	325293032
31043	NC_015183	CACC	2	8	1591245	1591252	25 %	0 %	0 %	75 %	325293032
31044	NC_015183	CGAC	2	8	1591275	1591282	25 %	0 %	25 %	50 %	325293032
31045	NC_015183	CG	3	6	1591297	1591302	0 %	0 %	50 %	50 %	325293032
31046	NC_015183	CAC	2	6	1591306	1591311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293032
31047	NC_015183	CGC	2	6	1591330	1591335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293032
31048	NC_015183	GC	3	6	1591345	1591350	0 %	0 %	50 %	50 %	325293032
31049	NC_015183	ATG	2	6	1591370	1591375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293032
31050	NC_015183	GAAGCG	2	12	1591391	1591402	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325293032
31051	NC_015183	GGT	2	6	1591525	1591530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293032
31052	NC_015183	CGG	2	6	1591701	1591706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293032
31053	NC_015183	AAG	2	6	1591711	1591716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293032
31054	NC_015183	CGG	2	6	1591749	1591754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293032
31055	NC_015183	CGC	2	6	1591758	1591763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293032
31056	NC_015183	TTG	2	6	1591799	1591804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293032
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31058	NC_015183	TCG	2	6	1591925	1591930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293032
31059	NC_015183	CAC	2	6	1592026	1592031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293032
31060	NC_015183	GCG	3	9	1592090	1592098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293032
31061	NC_015183	GTC	2	6	1592184	1592189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293033
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31063	NC_015183	GC	3	6	1592205	1592210	0 %	0 %	50 %	50 %	325293033
31064	NC_015183	GTC	2	6	1592244	1592249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293033
31065	NC_015183	CCA	2	6	1592279	1592284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293033
31066	NC_015183	CTT	2	6	1592289	1592294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293033
31067	NC_015183	GC	3	6	1592388	1592393	0 %	0 %	50 %	50 %	325293033
31068	NC_015183	CCG	2	6	1592411	1592416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293033
31069	NC_015183	GC	5	10	1592480	1592489	0 %	0 %	50 %	50 %	325293033
31070	NC_015183	GCC	2	6	1592511	1592516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293033
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31072	NC_015183	CTG	2	6	1592679	1592684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293033
31073	NC_015183	CAT	2	6	1592712	1592717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293033
31074	NC_015183	GTC	2	6	1592721	1592726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293033
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31078	NC_015183	CCA	2	6	1593048	1593053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293034
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31083	NC_015183	CCG	2	6	1593119	1593124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293034
31084	NC_015183	CCG	2	6	1593141	1593146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293034
31085	NC_015183	CGA	2	6	1593147	1593152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293034
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31088	NC_015183	GGC	2	6	1593280	1593285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293034
31089	NC_015183	GCG	2	6	1593296	1593301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293034
31090	NC_015183	TTC	2	6	1593409	1593414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293034
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31097	NC_015183	GC	3	6	1593629	1593634	0 %	0 %	50 %	50 %	325293034
31098	NC_015183	GCC	2	6	1593665	1593670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293034
31099	NC_015183	GC	3	6	1593705	1593710	0 %	0 %	50 %	50 %	325293034
31100	NC_015183	GAC	2	6	1593766	1593771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293034
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31103	NC_015183	GATC	2	8	1593984	1593991	25 %	25 %	25 %	25 %	325293034
31104	NC_015183	ACCGG	2	10	1593995	1594004	20 %	0 %	40 %	40 %	325293034
31105	NC_015183	GCC	3	9	1594093	1594101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293034
31106	NC_015183	CGT	2	6	1594110	1594115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293034
31107	NC_015183	CA	3	6	1594385	1594390	50 %	0 %	0 %	50 %	325293035
31108	NC_015183	TG	3	6	1594446	1594451	0 %	50 %	50 %	0 %	325293035
31109	NC_015183	CGG	2	6	1594523	1594528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293035
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31112	NC_015183	GCC	2	6	1594569	1594574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293035
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31219	NC_015183	CG	3	6	1598857	1598862	0 %	0 %	50 %	50 %	325293037
31220	NC_015183	GGC	2	6	1598876	1598881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293037
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31232	NC_015183	GGC	2	6	1599398	1599403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293038
31233	NC_015183	GAT	2	6	1599414	1599419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293038
31234	NC_015183	CGC	2	6	1599446	1599451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293038
31235	NC_015183	GC	3	6	1599492	1599497	0 %	0 %	50 %	50 %	325293038
31236	NC_015183	CCG	2	6	1599555	1599560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293038
31237	NC_015183	TGCG	2	8	1599621	1599628	0 %	25 %	50 %	25 %	325293038
31238	NC_015183	TTC	2	6	1599645	1599650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293038
31239	NC_015183	CGC	2	6	1599670	1599675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293038
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31244	NC_015183	A	6	6	1599978	1599983	100 %	0 %	0 %	0 %	325293038
31245	NC_015183	GCA	2	6	1599995	1600000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293038
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31248	NC_015183	AAC	2	6	1600050	1600055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293038
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31252	NC_015183	CGA	2	6	1600346	1600351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293039
31253	NC_015183	GC	4	8	1600435	1600442	0 %	0 %	50 %	50 %	325293039
31254	NC_015183	CAC	2	6	1600515	1600520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293039
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31260	NC_015183	GCC	2	6	1600747	1600752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293039
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31262	NC_015183	GGAA	2	8	1600792	1600799	50 %	0 %	50 %	0 %	325293039
31263	NC_015183	CGG	2	6	1600816	1600821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293039
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31271	NC_015183	CGT	2	6	1601529	1601534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293040
31272	NC_015183	GAC	2	6	1601545	1601550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293040
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31302	NC_015183	CTT	2	6	1603457	1603462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293042
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31304	NC_015183	TTC	2	6	1603626	1603631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293042
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31319	NC_015183	CGG	2	6	1604406	1604411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293042
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31323	NC_015183	TCG	2	6	1604943	1604948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293043
31324	NC_015183	GTC	2	6	1604958	1604963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293043
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31331	NC_015183	GC	3	6	1605130	1605135	0 %	0 %	50 %	50 %	325293043
31332	NC_015183	TC	3	6	1605170	1605175	0 %	50 %	0 %	50 %	325293043
31333	NC_015183	CTG	2	6	1605198	1605203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293043
31334	NC_015183	CGGC	2	8	1605206	1605213	0 %	0 %	50 %	50 %	325293043
31335	NC_015183	CCA	2	6	1605232	1605237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293043
31336	NC_015183	GGCCTT	2	12	1605273	1605284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293043
31337	NC_015183	GCT	2	6	1605317	1605322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293043
31338	NC_015183	GCG	2	6	1605326	1605331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293043
31339	NC_015183	CGC	2	6	1605362	1605367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293043
31340	NC_015183	GGCC	2	8	1605395	1605402	0 %	0 %	50 %	50 %	325293043
31341	NC_015183	ATT	2	6	1605427	1605432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293043
31342	NC_015183	CAT	2	6	1605455	1605460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293043
31343	NC_015183	ATG	2	6	1605465	1605470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293043
31344	NC_015183	GACCT	2	10	1605582	1605591	20 %	20 %	20 %	40 %	325293043
31345	NC_015183	CGC	2	6	1605599	1605604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293043
31346	NC_015183	GCC	2	6	1605609	1605614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293043
31347	NC_015183	TCA	2	6	1605637	1605642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293043
31348	NC_015183	TGA	2	6	1605646	1605651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293043
31349	NC_015183	CT	3	6	1605693	1605698	0 %	50 %	0 %	50 %	325293043
31350	NC_015183	CCGAT	2	10	1605700	1605709	20 %	20 %	20 %	40 %	325293043
31351	NC_015183	CGG	2	6	1605758	1605763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293043
31352	NC_015183	GCA	2	6	1605826	1605831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293043
31353	NC_015183	AT	3	6	1605845	1605850	50 %	50 %	0 %	0 %	325293043
31354	NC_015183	CCG	2	6	1605851	1605856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293043
31355	NC_015183	CTT	2	6	1605878	1605883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293043
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31372	NC_015183	GTC	2	6	1606416	1606421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293043
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31433	NC_015183	TGC	2	6	1609772	1609777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293047
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31450	NC_015183	TCAA	2	8	1610966	1610973	50 %	25 %	0 %	25 %	325293048
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31463	NC_015183	GTCC	2	8	1611707	1611714	0 %	25 %	25 %	50 %	325293049
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31465	NC_015183	GC	3	6	1611886	1611891	0 %	0 %	50 %	50 %	325293049
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31467	NC_015183	GCT	2	6	1612077	1612082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293049
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31492	NC_015183	GA	3	6	1612808	1612813	50 %	0 %	50 %	0 %	325293050
31493	NC_015183	TTC	2	6	1612855	1612860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293050
31494	NC_015183	CTT	3	9	1612866	1612874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293050
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31497	NC_015183	CGA	2	6	1612959	1612964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293050
31498	NC_015183	TCG	2	6	1612994	1612999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293050
31499	NC_015183	TCG	2	6	1613123	1613128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293050
31500	NC_015183	CAG	2	6	1613139	1613144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293050

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