MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_015183	TCGT	2	8	1481890	1481897	0 %	50 %	25 %	25 %	325292922
29002	NC_015183	GCG	2	6	1481926	1481931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292922
29003	NC_015183	GCC	2	6	1481932	1481937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292922
29004	NC_015183	CCG	2	6	1481948	1481953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292922
29005	NC_015183	TCG	2	6	1481993	1481998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292922
29006	NC_015183	GCGTG	2	10	1482009	1482018	0 %	20 %	60 %	20 %	325292922
29007	NC_015183	TCT	2	6	1482113	1482118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292922
29008	NC_015183	CTGGA	2	10	1482128	1482137	20 %	20 %	40 %	20 %	325292922
29009	NC_015183	CTTCC	2	10	1482220	1482229	0 %	40 %	0 %	60 %	325292922
29010	NC_015183	GGC	2	6	1482235	1482240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292922
29011	NC_015183	GCTCAT	2	12	1482310	1482321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325292922
29012	NC_015183	GCC	2	6	1482433	1482438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292922
29013	NC_015183	A	6	6	1482475	1482480	100 %	0 %	0 %	0 %	325292922
29014	NC_015183	CGA	2	6	1482486	1482491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292922
29015	NC_015183	CGG	2	6	1482605	1482610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292922
29016	NC_015183	GATC	2	8	1482611	1482618	25 %	25 %	25 %	25 %	325292922
29017	NC_015183	CGG	2	6	1482755	1482760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292922
29018	NC_015183	GAT	2	6	1482825	1482830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292922
29019	NC_015183	GGC	2	6	1482924	1482929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292923
29020	NC_015183	GGC	2	6	1482950	1482955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292923
29021	NC_015183	CAG	2	6	1482973	1482978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292923
29022	NC_015183	TG	3	6	1483024	1483029	0 %	50 %	50 %	0 %	325292923
29023	NC_015183	CGG	2	6	1483059	1483064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292923
29024	NC_015183	CGATAT	2	12	1483077	1483088	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325292923
29025	NC_015183	TGC	3	9	1483140	1483148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292923
29026	NC_015183	GCG	2	6	1483224	1483229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292923
29027	NC_015183	GGC	2	6	1483331	1483336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292923
29028	NC_015183	GAT	2	6	1483339	1483344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292923
29029	NC_015183	CG	3	6	1483494	1483499	0 %	0 %	50 %	50 %	325292923
29030	NC_015183	CCG	2	6	1483536	1483541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292923
29031	NC_015183	ACG	2	6	1483604	1483609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292923
29032	NC_015183	CGT	2	6	1483621	1483626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292923
29033	NC_015183	CTGG	2	8	1483657	1483664	0 %	25 %	50 %	25 %	325292923
29034	NC_015183	TCG	2	6	1483682	1483687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292923
29035	NC_015183	CTG	2	6	1483765	1483770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292923
29036	NC_015183	GC	3	6	1483827	1483832	0 %	0 %	50 %	50 %	325292923
29037	NC_015183	GGT	2	6	1483840	1483845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292923
29038	NC_015183	CTTCG	2	10	1483906	1483915	0 %	40 %	20 %	40 %	325292923
29039	NC_015183	GCAT	2	8	1484373	1484380	25 %	25 %	25 %	25 %	325292924
29040	NC_015183	CAT	2	6	1484455	1484460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292924
29041	NC_015183	TCC	2	6	1484468	1484473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292924
29042	NC_015183	CGAC	2	8	1484538	1484545	25 %	0 %	25 %	50 %	325292924
29043	NC_015183	CAT	2	6	1484590	1484595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292924
29044	NC_015183	CTG	2	6	1485020	1485025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292924
29045	NC_015183	CGT	2	6	1485055	1485060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292924
29046	NC_015183	CAT	2	6	1485071	1485076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292924
29047	NC_015183	GCG	2	6	1485084	1485089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292924
29048	NC_015183	GCG	2	6	1485183	1485188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292924
29049	NC_015183	GGT	2	6	1485205	1485210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292924
29050	NC_015183	TTC	2	6	1485221	1485226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292924
29051	NC_015183	TGG	2	6	1485245	1485250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292924
29052	NC_015183	CGG	2	6	1485252	1485257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292924
29053	NC_015183	TCT	2	6	1485405	1485410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292924
29054	NC_015183	A	6	6	1485465	1485470	100 %	0 %	0 %	0 %	325292924
29055	NC_015183	GCG	2	6	1485528	1485533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292924
29056	NC_015183	TCT	2	6	1485580	1485585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292924
29057	NC_015183	TCC	2	6	1485686	1485691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292924
29058	NC_015183	GCG	2	6	1485714	1485719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292924
29059	NC_015183	TGG	2	6	1485729	1485734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292924
29060	NC_015183	GAG	2	6	1485752	1485757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292924
29061	NC_015183	CAA	2	6	1485763	1485768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292924
29062	NC_015183	A	6	6	1485827	1485832	100 %	0 %	0 %	0 %	325292924
29063	NC_015183	GCC	2	6	1485833	1485838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292924
29064	NC_015183	TGG	2	6	1485851	1485856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292924
29065	NC_015183	AGA	2	6	1486095	1486100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292924
29066	NC_015183	CGG	2	6	1486105	1486110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292924
29067	NC_015183	CAG	2	6	1486193	1486198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292924
29068	NC_015183	ACT	2	6	1486224	1486229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292924
29069	NC_015183	CGG	3	9	1486318	1486326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292924
29070	NC_015183	TGC	2	6	1486345	1486350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292924
29071	NC_015183	CCG	2	6	1486351	1486356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292924
29072	NC_015183	TTC	2	6	1486358	1486363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292924
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29074	NC_015183	GGC	2	6	1486534	1486539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292924
29075	NC_015183	GCCT	2	8	1486566	1486573	0 %	25 %	25 %	50 %	325292924
29076	NC_015183	CAT	2	6	1486631	1486636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292924
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29083	NC_015183	ATC	2	6	1487309	1487314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292925
29084	NC_015183	ACA	2	6	1487331	1487336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292925
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29087	NC_015183	GCG	2	6	1487481	1487486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292925
29088	NC_015183	GCC	2	6	1487564	1487569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292925
29089	NC_015183	CAT	2	6	1487599	1487604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292925
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29092	NC_015183	GAC	2	6	1487722	1487727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292925
29093	NC_015183	CG	3	6	1487822	1487827	0 %	0 %	50 %	50 %	325292925
29094	NC_015183	GCG	2	6	1487845	1487850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292925
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29098	NC_015183	TTC	2	6	1488276	1488281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292926
29099	NC_015183	TGC	2	6	1488298	1488303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292926
29100	NC_015183	GCC	2	6	1488324	1488329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292926
29101	NC_015183	ACG	2	6	1488330	1488335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292926
29102	NC_015183	ACC	2	6	1488371	1488376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292926
29103	NC_015183	AAG	2	6	1488392	1488397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292926
29104	NC_015183	CAG	2	6	1488429	1488434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292926
29105	NC_015183	CGT	2	6	1488437	1488442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292926
29106	NC_015183	TCG	2	6	1488447	1488452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292926
29107	NC_015183	CCG	2	6	1488454	1488459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292926
29108	NC_015183	TCA	2	6	1488534	1488539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292926
29109	NC_015183	TCG	2	6	1488558	1488563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292926
29110	NC_015183	TAAA	2	8	1488581	1488588	75 %	25 %	0 %	0 %	325292926
29111	NC_015183	GC	3	6	1488723	1488728	0 %	0 %	50 %	50 %	325292927
29112	NC_015183	GAA	2	6	1488730	1488735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292927
29113	NC_015183	CGA	2	6	1488776	1488781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292927
29114	NC_015183	GA	3	6	1488833	1488838	50 %	0 %	50 %	0 %	325292927
29115	NC_015183	GCG	2	6	1488866	1488871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292927
29116	NC_015183	AGGC	2	8	1488897	1488904	25 %	0 %	50 %	25 %	325292927
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29464	NC_015183	GAA	2	6	1505578	1505583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292944
29465	NC_015183	GCC	2	6	1505584	1505589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292944
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29486	NC_015183	CGG	2	6	1506708	1506713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292944
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29494	NC_015183	GC	3	6	1507281	1507286	0 %	0 %	50 %	50 %	325292946
29495	NC_015183	ACAT	2	8	1507372	1507379	50 %	25 %	0 %	25 %	325292946
29496	NC_015183	GTCA	2	8	1507393	1507400	25 %	25 %	25 %	25 %	325292946
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29499	NC_015183	GAGGT	2	10	1507483	1507492	20 %	20 %	60 %	0 %	325292946
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