MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_015183	TGC	2	6	1370054	1370059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292797
27002	NC_015183	GCG	2	6	1370075	1370080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292797
27003	NC_015183	CGA	2	6	1370112	1370117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292797
27004	NC_015183	TCC	2	6	1370137	1370142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292797
27005	NC_015183	GCC	2	6	1370143	1370148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292797
27006	NC_015183	ACG	2	6	1370183	1370188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292797
27007	NC_015183	CCG	2	6	1370228	1370233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292797
27008	NC_015183	CGG	2	6	1370256	1370261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292797
27009	NC_015183	ATG	2	6	1370269	1370274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292797
27010	NC_015183	TTC	2	6	1370275	1370280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292797
27011	NC_015183	GAA	2	6	1370286	1370291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292797
27012	NC_015183	GAC	2	6	1370389	1370394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292797
27013	NC_015183	ATT	2	6	1370480	1370485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292798
27014	NC_015183	T	6	6	1370672	1370677	0 %	100 %	0 %	0 %	325292798
27015	NC_015183	TGC	2	6	1370713	1370718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292798
27016	NC_015183	CGT	2	6	1370769	1370774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292798
27017	NC_015183	GTG	2	6	1370875	1370880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292798
27018	NC_015183	GATT	2	8	1371045	1371052	25 %	50 %	25 %	0 %	325292799
27019	NC_015183	G	6	6	1371091	1371096	0 %	0 %	100 %	0 %	325292799
27020	NC_015183	GCTG	2	8	1371103	1371110	0 %	25 %	50 %	25 %	325292799
27021	NC_015183	CGG	2	6	1371140	1371145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292799
27022	NC_015183	GC	3	6	1371200	1371205	0 %	0 %	50 %	50 %	325292799
27023	NC_015183	GCA	2	6	1371543	1371548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292800
27024	NC_015183	GGC	2	6	1371549	1371554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292800
27025	NC_015183	TCGGT	2	10	1371559	1371568	0 %	40 %	40 %	20 %	325292800
27026	NC_015183	TTG	2	6	1371682	1371687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292800
27027	NC_015183	GGC	2	6	1371691	1371696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292800
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27030	NC_015183	TGG	2	6	1371841	1371846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292800
27031	NC_015183	CGG	2	6	1371856	1371861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292800
27032	NC_015183	CGA	2	6	1371998	1372003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292801
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27034	NC_015183	GACG	2	8	1372118	1372125	25 %	0 %	50 %	25 %	325292801
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27036	NC_015183	GC	3	6	1372242	1372247	0 %	0 %	50 %	50 %	325292801
27037	NC_015183	TGC	3	9	1372249	1372257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292801
27038	NC_015183	GAC	2	6	1372263	1372268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292801
27039	NC_015183	GCCG	2	8	1372289	1372296	0 %	0 %	50 %	50 %	325292801
27040	NC_015183	GGC	2	6	1372311	1372316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292801
27041	NC_015183	TGC	2	6	1372445	1372450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292801
27042	NC_015183	AAG	2	6	1372488	1372493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292801
27043	NC_015183	CTGG	2	8	1372550	1372557	0 %	25 %	50 %	25 %	325292801
27044	NC_015183	GAG	2	6	1372608	1372613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292801
27045	NC_015183	CTGG	2	8	1372673	1372680	0 %	25 %	50 %	25 %	325292801
27046	NC_015183	CCA	2	6	1372706	1372711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292801
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27048	NC_015183	TGCA	2	8	1372822	1372829	25 %	25 %	25 %	25 %	325292801
27049	NC_015183	GGC	2	6	1372857	1372862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292801
27050	NC_015183	GC	3	6	1372876	1372881	0 %	0 %	50 %	50 %	325292801
27051	NC_015183	CATCGC	2	12	1373108	1373119	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325292802
27052	NC_015183	GC	3	6	1373156	1373161	0 %	0 %	50 %	50 %	325292802
27053	NC_015183	ACC	2	6	1373188	1373193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292802
27054	NC_015183	CGG	2	6	1373371	1373376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292802
27055	NC_015183	GTC	2	6	1373454	1373459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292802
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27059	NC_015183	AGGC	2	8	1373557	1373564	25 %	0 %	50 %	25 %	325292802
27060	NC_015183	CGT	2	6	1373573	1373578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292802
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27062	NC_015183	CGATC	2	10	1373705	1373714	20 %	20 %	20 %	40 %	325292803
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27065	NC_015183	CGCC	2	8	1373833	1373840	0 %	0 %	25 %	75 %	325292803
27066	NC_015183	AAG	2	6	1373841	1373846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292803
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27072	NC_015183	A	6	6	1374201	1374206	100 %	0 %	0 %	0 %	325292803
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27083	NC_015183	GCG	2	6	1374628	1374633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292804
27084	NC_015183	ACG	2	6	1374711	1374716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292804
27085	NC_015183	CG	3	6	1374736	1374741	0 %	0 %	50 %	50 %	325292804
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27089	NC_015183	TCGA	2	8	1374900	1374907	25 %	25 %	25 %	25 %	325292804
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27099	NC_015183	ACC	2	6	1375435	1375440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292805
27100	NC_015183	GCC	2	6	1375441	1375446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292805
27101	NC_015183	AGC	2	6	1375447	1375452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292805
27102	NC_015183	TCC	2	6	1375591	1375596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292805
27103	NC_015183	CG	3	6	1375605	1375610	0 %	0 %	50 %	50 %	325292805
27104	NC_015183	GAG	2	6	1375836	1375841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292806
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27106	NC_015183	ATCCG	2	10	1375860	1375869	20 %	20 %	20 %	40 %	325292806
27107	NC_015183	TGCA	2	8	1375978	1375985	25 %	25 %	25 %	25 %	325292806
27108	NC_015183	TGA	2	6	1376000	1376005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292806
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27229	NC_015183	GC	3	6	1382813	1382818	0 %	0 %	50 %	50 %	325292816
27230	NC_015183	GC	3	6	1382993	1382998	0 %	0 %	50 %	50 %	325292817
27231	NC_015183	CGA	4	12	1383069	1383080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292817
27232	NC_015183	GGA	2	6	1383081	1383086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292817
27233	NC_015183	GCG	2	6	1383159	1383164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292817
27234	NC_015183	CAT	2	6	1383189	1383194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292817
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27245	NC_015183	GTCA	2	8	1383708	1383715	25 %	25 %	25 %	25 %	325292818
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27256	NC_015183	CGT	2	6	1385876	1385881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292820
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27330	NC_015183	CTGGC	2	10	1391066	1391075	0 %	20 %	40 %	40 %	325292825
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27337	NC_015183	TGGG	2	8	1391545	1391552	0 %	25 %	75 %	0 %	325292826
27338	NC_015183	CTT	3	9	1391588	1391596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292826
27339	NC_015183	TCA	2	6	1391626	1391631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292826
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27341	NC_015183	CTGG	2	8	1391735	1391742	0 %	25 %	50 %	25 %	325292826
27342	NC_015183	GT	3	6	1391764	1391769	0 %	50 %	50 %	0 %	325292826
27343	NC_015183	TCA	2	6	1391779	1391784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292826
27344	NC_015183	TCT	2	6	1391884	1391889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292826
27345	NC_015183	TTC	2	6	1391898	1391903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292826
27346	NC_015183	CGT	2	6	1391936	1391941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292826
27347	NC_015183	CGG	2	6	1392004	1392009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292826
27348	NC_015183	CAGC	2	8	1392010	1392017	25 %	0 %	25 %	50 %	325292826
27349	NC_015183	GTC	2	6	1392026	1392031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292826
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27464	NC_015183	ATTC	2	8	1397945	1397952	25 %	50 %	0 %	25 %	325292831
27465	NC_015183	ATCA	2	8	1397992	1397999	50 %	25 %	0 %	25 %	325292831
27466	NC_015183	TGT	2	6	1398006	1398011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292831
27467	NC_015183	GAT	2	6	1398015	1398020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292831
27468	NC_015183	AGGA	2	8	1398137	1398144	50 %	0 %	50 %	0 %	325292831
27469	NC_015183	GACC	2	8	1398147	1398154	25 %	0 %	25 %	50 %	325292831
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27471	NC_015183	TCT	2	6	1398424	1398429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292832
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27473	NC_015183	T	6	6	1398491	1398496	0 %	100 %	0 %	0 %	325292832
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27478	NC_015183	GCC	2	6	1398687	1398692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292832
27479	NC_015183	TGA	2	6	1398694	1398699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292832
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27483	NC_015183	TCG	2	6	1398851	1398856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292833
27484	NC_015183	GAA	2	6	1398892	1398897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292833
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27489	NC_015183	TCCG	2	8	1399037	1399044	0 %	25 %	25 %	50 %	325292833
27490	NC_015183	GAT	2	6	1399177	1399182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292833
27491	NC_015183	TCC	2	6	1399214	1399219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292833
27492	NC_015183	GGC	2	6	1399252	1399257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292833
27493	NC_015183	CCG	2	6	1399263	1399268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292833
27494	NC_015183	CAG	2	6	1399324	1399329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292833
27495	NC_015183	TCA	2	6	1399341	1399346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292833
27496	NC_015183	CTT	2	6	1399356	1399361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292834
27497	NC_015183	AGG	2	6	1399430	1399435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292834
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27499	NC_015183	ATGCCC	2	12	1399555	1399566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325292834
27500	NC_015183	GTTC	2	8	1399661	1399668	0 %	50 %	25 %	25 %	325292834

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