MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_015183	TGC	3	9	1270182	1270190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292702
25002	NC_015183	CGA	2	6	1270278	1270283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292702
25003	NC_015183	GGCT	2	8	1270310	1270317	0 %	25 %	50 %	25 %	325292702
25004	NC_015183	CA	3	6	1270382	1270387	50 %	0 %	0 %	50 %	325292702
25005	NC_015183	TCC	2	6	1270394	1270399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292702
25006	NC_015183	GAT	2	6	1270421	1270426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292702
25007	NC_015183	TCGT	2	8	1270474	1270481	0 %	50 %	25 %	25 %	325292702
25008	NC_015183	GGC	2	6	1270490	1270495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292702
25009	NC_015183	ACC	2	6	1270508	1270513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292702
25010	NC_015183	ACCG	2	8	1270540	1270547	25 %	0 %	25 %	50 %	325292702
25011	NC_015183	CAG	2	6	1270565	1270570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292702
25012	NC_015183	TGC	2	6	1270611	1270616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292702
25013	NC_015183	GC	3	6	1270615	1270620	0 %	0 %	50 %	50 %	325292702
25014	NC_015183	CCA	2	6	1270702	1270707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292702
25015	NC_015183	GCACC	2	10	1270770	1270779	20 %	0 %	20 %	60 %	325292702
25016	NC_015183	GCG	3	9	1270842	1270850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292702
25017	NC_015183	TCG	2	6	1270972	1270977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292703
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25019	NC_015183	GGC	2	6	1271033	1271038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292703
25020	NC_015183	ATG	2	6	1271071	1271076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292703
25021	NC_015183	GAC	2	6	1271124	1271129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292703
25022	NC_015183	GCG	2	6	1271142	1271147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292703
25023	NC_015183	GGC	2	6	1271186	1271191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292703
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25028	NC_015183	AG	3	6	1271422	1271427	50 %	0 %	50 %	0 %	325292703
25029	NC_015183	TCG	2	6	1271541	1271546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292704
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25033	NC_015183	GGC	3	9	1271820	1271828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292704
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25039	NC_015183	CAT	2	6	1272008	1272013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292704
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25042	NC_015183	GTCCT	2	10	1272096	1272105	0 %	40 %	20 %	40 %	325292705
25043	NC_015183	TTG	2	6	1272213	1272218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292705
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25046	NC_015183	GGC	2	6	1272416	1272421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292705
25047	NC_015183	CGT	3	9	1272491	1272499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292705
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25052	NC_015183	TCG	2	6	1272693	1272698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292705
25053	NC_015183	CTC	2	6	1272728	1272733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292705
25054	NC_015183	CCT	2	6	1272748	1272753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292705
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25059	NC_015183	GGA	2	6	1273414	1273419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292706
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25101	NC_015183	TCG	2	6	1275308	1275313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292707
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25230	NC_015183	GCCG	2	8	1281209	1281216	0 %	0 %	50 %	50 %	325292708
25231	NC_015183	CGCC	2	8	1281248	1281255	0 %	0 %	25 %	75 %	325292708
25232	NC_015183	TGC	2	6	1281289	1281294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292708
25233	NC_015183	TGC	2	6	1281317	1281322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292708
25234	NC_015183	GAC	2	6	1281345	1281350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292708
25235	NC_015183	CGG	4	12	1281421	1281432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292708
25236	NC_015183	GGA	2	6	1281437	1281442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292708
25237	NC_015183	TTG	2	6	1281671	1281676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292709
25238	NC_015183	GCG	3	9	1281773	1281781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292709
25239	NC_015183	CCTGTG	2	12	1281782	1281793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292709
25240	NC_015183	CGG	2	6	1281837	1281842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292709
25241	NC_015183	TTC	2	6	1282315	1282320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292710
25242	NC_015183	GC	3	6	1282335	1282340	0 %	0 %	50 %	50 %	325292710
25243	NC_015183	GCAA	2	8	1282543	1282550	50 %	0 %	25 %	25 %	325292710
25244	NC_015183	GCG	3	9	1282584	1282592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292710
25245	NC_015183	CGC	2	6	1282685	1282690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292710
25246	NC_015183	GCT	2	6	1282760	1282765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292710
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25248	NC_015183	AATAGG	2	12	1282802	1282813	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325292710
25249	NC_015183	GCA	2	6	1283028	1283033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292711
25250	NC_015183	TG	3	6	1283035	1283040	0 %	50 %	50 %	0 %	325292711
25251	NC_015183	TAT	2	6	1283086	1283091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292711
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25253	NC_015183	GAG	2	6	1283183	1283188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292711
25254	NC_015183	ATC	2	6	1283198	1283203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292711
25255	NC_015183	CGG	2	6	1283209	1283214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292711
25256	NC_015183	CCCG	2	8	1283223	1283230	0 %	0 %	25 %	75 %	325292711
25257	NC_015183	TGC	2	6	1283271	1283276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292711
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25260	NC_015183	GGCG	2	8	1283362	1283369	0 %	0 %	75 %	25 %	325292711
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25262	NC_015183	GC	4	8	1283435	1283442	0 %	0 %	50 %	50 %	325292711
25263	NC_015183	CAT	2	6	1283452	1283457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292711
25264	NC_015183	GC	3	6	1283482	1283487	0 %	0 %	50 %	50 %	325292711
25265	NC_015183	CGGTTT	2	12	1283581	1283592	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325292711
25266	NC_015183	GC	3	6	1283627	1283632	0 %	0 %	50 %	50 %	325292711
25267	NC_015183	CCTG	2	8	1283656	1283663	0 %	25 %	25 %	50 %	325292711
25268	NC_015183	CAG	2	6	1283742	1283747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292711
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25274	NC_015183	CGA	2	6	1284090	1284095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292712
25275	NC_015183	TCG	3	9	1284146	1284154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292712
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25286	NC_015183	ATC	2	6	1284920	1284925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292714
25287	NC_015183	ATG	2	6	1285055	1285060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292714
25288	NC_015183	GCC	2	6	1285108	1285113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292714
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25291	NC_015183	GTC	2	6	1285195	1285200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292714
25292	NC_015183	CGA	2	6	1285254	1285259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292714
25293	NC_015183	CGT	2	6	1285305	1285310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292714
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25295	NC_015183	GGC	2	6	1285372	1285377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292714
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25301	NC_015183	TGA	2	6	1285692	1285697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292715
25302	NC_015183	CTG	2	6	1285750	1285755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292715
25303	NC_015183	CGA	2	6	1285803	1285808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292715
25304	NC_015183	CGGC	2	8	1285843	1285850	0 %	0 %	50 %	50 %	325292715
25305	NC_015183	GC	3	6	1285871	1285876	0 %	0 %	50 %	50 %	325292715
25306	NC_015183	CGG	2	6	1285935	1285940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292715
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25313	NC_015183	GCGG	2	8	1286140	1286147	0 %	0 %	75 %	25 %	325292715
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25329	NC_015183	GC	3	6	1286944	1286949	0 %	0 %	50 %	50 %	325292716
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25333	NC_015183	GGT	2	6	1287065	1287070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292716
25334	NC_015183	CAG	2	6	1287114	1287119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292716
25335	NC_015183	GAT	2	6	1287121	1287126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292716
25336	NC_015183	GGCG	2	8	1287254	1287261	0 %	0 %	75 %	25 %	325292716
25337	NC_015183	GAA	2	6	1287273	1287278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292716
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25339	NC_015183	CAT	2	6	1287321	1287326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292716
25340	NC_015183	GC	3	6	1287328	1287333	0 %	0 %	50 %	50 %	325292716
25341	NC_015183	GTC	2	6	1287354	1287359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292716
25342	NC_015183	CAG	2	6	1287420	1287425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292716
25343	NC_015183	CGG	2	6	1287432	1287437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292716
25344	NC_015183	TCG	2	6	1287457	1287462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292716
25345	NC_015183	GGC	2	6	1287483	1287488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292716
25346	NC_015183	TCG	2	6	1287520	1287525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292716
25347	NC_015183	AGG	2	6	1287548	1287553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292716
25348	NC_015183	AGC	2	6	1287646	1287651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292716
25349	NC_015183	AGC	2	6	1287661	1287666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292716
25350	NC_015183	CGA	2	6	1287683	1287688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292716
25351	NC_015183	CGT	2	6	1287851	1287856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292716
25352	NC_015183	GAC	2	6	1287920	1287925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292716
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25355	NC_015183	GCCC	2	8	1287972	1287979	0 %	0 %	25 %	75 %	325292716
25356	NC_015183	CTGT	2	8	1288066	1288073	0 %	50 %	25 %	25 %	325292716
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25366	NC_015183	GC	3	6	1288466	1288471	0 %	0 %	50 %	50 %	325292717
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25449	NC_015183	TCG	2	6	1292275	1292280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292721
25450	NC_015183	TCTCGA	2	12	1292345	1292356	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325292721
25451	NC_015183	GC	3	6	1292422	1292427	0 %	0 %	50 %	50 %	325292721
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25455	NC_015183	TTC	2	6	1292563	1292568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292721
25456	NC_015183	CGT	2	6	1292603	1292608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292721
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25463	NC_015183	GGC	2	6	1292913	1292918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292721
25464	NC_015183	CAA	2	6	1292933	1292938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292721
25465	NC_015183	TGT	2	6	1292956	1292961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292721
25466	NC_015183	CTG	2	6	1292973	1292978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292721
25467	NC_015183	GGCCC	2	10	1292984	1292993	0 %	0 %	40 %	60 %	325292721
25468	NC_015183	CG	3	6	1293042	1293047	0 %	0 %	50 %	50 %	325292721
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25471	NC_015183	CG	4	8	1293266	1293273	0 %	0 %	50 %	50 %	325292721
25472	NC_015183	ATGCC	2	10	1293274	1293283	20 %	20 %	20 %	40 %	325292721
25473	NC_015183	GGC	2	6	1293288	1293293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292721
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25475	NC_015183	CGG	2	6	1293361	1293366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292721
25476	NC_015183	CATGGT	2	12	1293371	1293382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325292721
25477	NC_015183	CCG	2	6	1293411	1293416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292721
25478	NC_015183	TTC	2	6	1293444	1293449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292721
25479	NC_015183	ACC	2	6	1293450	1293455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292721
25480	NC_015183	CGG	2	6	1293518	1293523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292721
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25483	NC_015183	CAG	2	6	1293615	1293620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292721
25484	NC_015183	GAAG	2	8	1293665	1293672	50 %	0 %	50 %	0 %	325292721
25485	NC_015183	CCG	2	6	1293697	1293702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292721
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25489	NC_015183	TCG	2	6	1293844	1293849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292721
25490	NC_015183	CGT	2	6	1293857	1293862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292721
25491	NC_015183	GGAC	2	8	1293875	1293882	25 %	0 %	50 %	25 %	325292721
25492	NC_015183	CGG	2	6	1293976	1293981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292721
25493	NC_015183	ACA	2	6	1294054	1294059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292721
25494	NC_015183	CGG	2	6	1294068	1294073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292722
25495	NC_015183	GAT	2	6	1294360	1294365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292723
25496	NC_015183	TGCA	2	8	1294379	1294386	25 %	25 %	25 %	25 %	325292723
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25499	NC_015183	TCAT	2	8	1294521	1294528	25 %	50 %	0 %	25 %	325292723
25500	NC_015183	T	6	6	1294540	1294545	0 %	100 %	0 %	0 %	325292723

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