MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_015183	AAG	2	6	1066239	1066244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292503
21003	NC_015183	GCAC	2	8	1066329	1066336	25 %	0 %	25 %	50 %	325292503
21004	NC_015183	ACC	2	6	1066355	1066360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292503
21005	NC_015183	CTTC	2	8	1066456	1066463	0 %	50 %	0 %	50 %	325292503
21006	NC_015183	GCG	2	6	1066478	1066483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292503
21007	NC_015183	CAT	2	6	1066499	1066504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292503
21008	NC_015183	GTC	2	6	1066511	1066516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292503
21009	NC_015183	CCA	3	9	1066588	1066596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292503
21010	NC_015183	GCC	2	6	1066598	1066603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292503
21011	NC_015183	ATG	2	6	1066620	1066625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292503
21012	NC_015183	CTT	2	6	1066778	1066783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292503
21013	NC_015183	CGC	2	6	1066786	1066791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292503
21014	NC_015183	AGC	2	6	1066838	1066843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292503
21015	NC_015183	TCC	2	6	1066860	1066865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292503
21016	NC_015183	GTC	2	6	1066904	1066909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292503
21017	NC_015183	GCC	2	6	1067036	1067041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292503
21018	NC_015183	GATG	2	8	1067047	1067054	25 %	25 %	50 %	0 %	325292503
21019	NC_015183	CCT	2	6	1067068	1067073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292503
21020	NC_015183	GCCG	2	8	1067078	1067085	0 %	0 %	50 %	50 %	325292503
21021	NC_015183	CGG	2	6	1067143	1067148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292503
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21024	NC_015183	AGA	2	6	1067319	1067324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292503
21025	NC_015183	CG	3	6	1067378	1067383	0 %	0 %	50 %	50 %	325292503
21026	NC_015183	AGT	2	6	1067437	1067442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292503
21027	NC_015183	GC	3	6	1067450	1067455	0 %	0 %	50 %	50 %	325292503
21028	NC_015183	CTG	2	6	1067497	1067502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292503
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21032	NC_015183	CTT	2	6	1067702	1067707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292503
21033	NC_015183	AGCG	2	8	1067709	1067716	25 %	0 %	50 %	25 %	325292503
21034	NC_015183	CGT	2	6	1067737	1067742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292503
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21036	NC_015183	TCG	2	6	1067913	1067918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292503
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21042	NC_015183	TCG	2	6	1068095	1068100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292504
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21054	NC_015183	GCC	2	6	1068690	1068695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292504
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21115	NC_015183	CGGG	2	8	1072239	1072246	0 %	0 %	75 %	25 %	325292508
21116	NC_015183	GCT	2	6	1072315	1072320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292508
21117	NC_015183	TCA	2	6	1072341	1072346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292508
21118	NC_015183	TCA	2	6	1072353	1072358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292508
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21219	NC_015183	GCC	3	9	1078674	1078682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292515
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21228	NC_015183	GCA	2	6	1079056	1079061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292515
21229	NC_015183	GAA	2	6	1079124	1079129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292515
21230	NC_015183	ACG	2	6	1079149	1079154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292515
21231	NC_015183	GGC	2	6	1079250	1079255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292515
21232	NC_015183	GCC	2	6	1079301	1079306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292515
21233	NC_015183	GCC	2	6	1079310	1079315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292515
21234	NC_015183	CGC	2	6	1079338	1079343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292515
21235	NC_015183	CCG	2	6	1079354	1079359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292515
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21239	NC_015183	ATC	2	6	1079990	1079995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292516
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21242	NC_015183	AT	3	6	1080046	1080051	50 %	50 %	0 %	0 %	325292516
21243	NC_015183	GCA	2	6	1080061	1080066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292516
21244	NC_015183	CTG	2	6	1080092	1080097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292516
21245	NC_015183	GCT	2	6	1080148	1080153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292516
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21248	NC_015183	GTC	2	6	1080239	1080244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292516
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21250	NC_015183	CTG	2	6	1080266	1080271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292516
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21253	NC_015183	TTA	2	6	1080418	1080423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292516
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21269	NC_015183	ACCGG	2	10	1081171	1081180	20 %	0 %	40 %	40 %	325292517
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21329	NC_015183	CCG	2	6	1083601	1083606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292518
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21333	NC_015183	CGGA	2	8	1083742	1083749	25 %	0 %	50 %	25 %	325292518
21334	NC_015183	GAA	2	6	1083780	1083785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292518
21335	NC_015183	GCA	2	6	1083797	1083802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292518
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21338	NC_015183	TTC	2	6	1083884	1083889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292518
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21340	NC_015183	TCGTC	2	10	1083985	1083994	0 %	40 %	20 %	40 %	325292519
21341	NC_015183	CG	3	6	1084013	1084018	0 %	0 %	50 %	50 %	325292519
21342	NC_015183	CCG	2	6	1084020	1084025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292519
21343	NC_015183	CAGGCG	2	12	1084148	1084159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325292519
21344	NC_015183	GAAGCC	2	12	1084226	1084237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292519
21345	NC_015183	GGC	2	6	1084346	1084351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292519
21346	NC_015183	GCG	2	6	1084389	1084394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292519
21347	NC_015183	CGG	2	6	1084414	1084419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292519
21348	NC_015183	CGA	2	6	1084461	1084466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292519
21349	NC_015183	GCT	2	6	1084501	1084506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292519
21350	NC_015183	GGC	2	6	1084507	1084512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292519
21351	NC_015183	GGC	2	6	1084541	1084546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292519
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21356	NC_015183	GCT	2	6	1084855	1084860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292519
21357	NC_015183	CGA	2	6	1084870	1084875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292519
21358	NC_015183	GC	3	6	1084910	1084915	0 %	0 %	50 %	50 %	325292519
21359	NC_015183	GAG	2	6	1084961	1084966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292519
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21368	NC_015183	CGT	2	6	1085236	1085241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292519
21369	NC_015183	TCT	2	6	1085247	1085252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292519
21370	NC_015183	GTC	2	6	1085270	1085275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292519
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21372	NC_015183	TCG	2	6	1085325	1085330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292519
21373	NC_015183	GGAC	2	8	1085368	1085375	25 %	0 %	50 %	25 %	325292519
21374	NC_015183	GCA	2	6	1085380	1085385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292519
21375	NC_015183	TTGA	2	8	1085514	1085521	25 %	50 %	25 %	0 %	325292520
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21380	NC_015183	GCA	2	6	1085721	1085726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292520
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21390	NC_015183	AGC	2	6	1086399	1086404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292521
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21413	NC_015183	CGT	2	6	1087563	1087568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292523
21414	NC_015183	CTT	2	6	1087630	1087635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292523
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21418	NC_015183	GACCT	2	10	1087840	1087849	20 %	20 %	20 %	40 %	325292523
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21420	NC_015183	ACC	2	6	1087924	1087929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292523
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21423	NC_015183	CCCA	2	8	1088096	1088103	25 %	0 %	0 %	75 %	325292523
21424	NC_015183	TGG	2	6	1088273	1088278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292523
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21428	NC_015183	CGT	2	6	1088479	1088484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292523
21429	NC_015183	TGC	2	6	1088527	1088532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292523
21430	NC_015183	GAT	2	6	1088533	1088538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292523
21431	NC_015183	TGG	2	6	1088652	1088657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292523
21432	NC_015183	GGC	2	6	1088805	1088810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292524
21433	NC_015183	AC	3	6	1088835	1088840	50 %	0 %	0 %	50 %	325292524
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21435	NC_015183	TGA	2	6	1089200	1089205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292524
21436	NC_015183	GTC	2	6	1089225	1089230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292524
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21439	NC_015183	CGA	2	6	1089338	1089343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292524
21440	NC_015183	GATGAA	2	12	1089348	1089359	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325292524
21441	NC_015183	CAG	2	6	1089426	1089431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292524
21442	NC_015183	CGCGCA	2	12	1089434	1089445	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325292524
21443	NC_015183	TGA	2	6	1089446	1089451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292524
21444	NC_015183	GAT	2	6	1089456	1089461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292524
21445	NC_015183	AGA	2	6	1089578	1089583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292524
21446	NC_015183	GAT	2	6	1089597	1089602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292524
21447	NC_015183	GCA	2	6	1089662	1089667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292524
21448	NC_015183	GC	3	6	1089731	1089736	0 %	0 %	50 %	50 %	325292524
21449	NC_015183	CGC	3	9	1089734	1089742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292524
21450	NC_015183	CGC	2	6	1089767	1089772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292524
21451	NC_015183	CAC	2	6	1089795	1089800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292524
21452	NC_015183	GCA	2	6	1089815	1089820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292524
21453	NC_015183	GCG	2	6	1090048	1090053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292525
21454	NC_015183	GTC	2	6	1090064	1090069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292525
21455	NC_015183	GGC	2	6	1090100	1090105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292525
21456	NC_015183	CATCGA	2	12	1090192	1090203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325292525
21457	NC_015183	CCAG	2	8	1090220	1090227	25 %	0 %	25 %	50 %	325292525
21458	NC_015183	CCA	2	6	1090350	1090355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292525
21459	NC_015183	GCT	2	6	1090390	1090395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292525
21460	NC_015183	GCT	2	6	1090400	1090405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292525
21461	NC_015183	GCAT	2	8	1090428	1090435	25 %	25 %	25 %	25 %	325292525
21462	NC_015183	GTC	2	6	1090506	1090511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292525
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21471	NC_015183	GCT	3	9	1091187	1091195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292526
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