MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_015183	GGA	2	6	1013573	1013578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292451
20003	NC_015183	C	6	6	1013596	1013601	0 %	0 %	0 %	100 %	325292451
20004	NC_015183	CGC	2	6	1013620	1013625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292451
20005	NC_015183	GCG	2	6	1013638	1013643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292451
20006	NC_015183	CG	3	6	1013714	1013719	0 %	0 %	50 %	50 %	325292451
20007	NC_015183	CGC	2	6	1013731	1013736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292451
20008	NC_015183	CCG	2	6	1013745	1013750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292451
20009	NC_015183	GGT	2	6	1013756	1013761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292451
20010	NC_015183	GACA	2	8	1013799	1013806	50 %	0 %	25 %	25 %	325292452
20011	NC_015183	GCCA	2	8	1013853	1013860	25 %	0 %	25 %	50 %	325292452
20012	NC_015183	CGTT	2	8	1013878	1013885	0 %	50 %	25 %	25 %	325292452
20013	NC_015183	GCA	2	6	1013903	1013908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292452
20014	NC_015183	AGAC	2	8	1014007	1014014	50 %	0 %	25 %	25 %	325292452
20015	NC_015183	ACGG	2	8	1014031	1014038	25 %	0 %	50 %	25 %	325292452
20016	NC_015183	GTC	3	9	1014406	1014414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292453
20017	NC_015183	TCG	2	6	1014472	1014477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292453
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20019	NC_015183	TTC	2	6	1014580	1014585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292453
20020	NC_015183	GCG	2	6	1014604	1014609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292453
20021	NC_015183	GGC	2	6	1014648	1014653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292453
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20028	NC_015183	GCA	2	6	1014896	1014901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292453
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20031	NC_015183	TG	3	6	1015220	1015225	0 %	50 %	50 %	0 %	325292453
20032	NC_015183	CG	4	8	1015238	1015245	0 %	0 %	50 %	50 %	325292453
20033	NC_015183	CTG	2	6	1015251	1015256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292453
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20045	NC_015183	ACAT	2	8	1015684	1015691	50 %	25 %	0 %	25 %	325292453
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20052	NC_015183	CG	3	6	1016322	1016327	0 %	0 %	50 %	50 %	325292454
20053	NC_015183	GCC	2	6	1016372	1016377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292454
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20058	NC_015183	TGC	2	6	1016918	1016923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292455
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20115	NC_015183	GCG	2	6	1019337	1019342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292457
20116	NC_015183	CTT	2	6	1019362	1019367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292457
20117	NC_015183	CGG	2	6	1019440	1019445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292457
20118	NC_015183	CCG	2	6	1019523	1019528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292457
20119	NC_015183	CGT	2	6	1019545	1019550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292457
20120	NC_015183	CGC	2	6	1019566	1019571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292457
20121	NC_015183	CGGCG	3	15	1019629	1019643	0 %	0 %	60 %	40 %	325292457
20122	NC_015183	CGAG	2	8	1019647	1019654	25 %	0 %	50 %	25 %	325292457
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20126	NC_015183	CCA	2	6	1019962	1019967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292457
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20128	NC_015183	GAT	2	6	1020089	1020094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292457
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20130	NC_015183	GCC	2	6	1020156	1020161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292457
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20146	NC_015183	T	6	6	1020819	1020824	0 %	100 %	0 %	0 %	325292458
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20216	NC_015183	G	6	6	1024118	1024123	0 %	0 %	100 %	0 %	325292462
20217	NC_015183	CTG	3	9	1024124	1024132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292462
20218	NC_015183	CGC	2	6	1024152	1024157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292462
20219	NC_015183	A	6	6	1024163	1024168	100 %	0 %	0 %	0 %	325292462
20220	NC_015183	CTG	2	6	1024289	1024294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292462
20221	NC_015183	CGT	2	6	1024312	1024317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292462
20222	NC_015183	GAT	2	6	1025752	1025757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292463
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20224	NC_015183	TCGGA	2	10	1025811	1025820	20 %	20 %	40 %	20 %	325292463
20225	NC_015183	CG	3	6	1025826	1025831	0 %	0 %	50 %	50 %	325292463
20226	NC_015183	CTC	2	6	1025854	1025859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292463
20227	NC_015183	CAC	2	6	1025875	1025880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292463
20228	NC_015183	TCGA	2	8	1025894	1025901	25 %	25 %	25 %	25 %	325292463
20229	NC_015183	GA	3	6	1025961	1025966	50 %	0 %	50 %	0 %	325292463
20230	NC_015183	GAT	2	6	1025980	1025985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292463
20231	NC_015183	GTG	2	6	1026023	1026028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292463
20232	NC_015183	TCA	2	6	1026078	1026083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292463
20233	NC_015183	ACC	2	6	1026098	1026103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292463
20234	NC_015183	ACGGGC	2	12	1026136	1026147	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325292463
20235	NC_015183	ACC	2	6	1026169	1026174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292463
20236	NC_015183	CAT	2	6	1026205	1026210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292463
20237	NC_015183	CGA	2	6	1026222	1026227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292463
20238	NC_015183	CGG	2	6	1026260	1026265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292463
20239	NC_015183	GAC	2	6	1026323	1026328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292463
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20241	NC_015183	CGA	2	6	1026348	1026353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292463
20242	NC_015183	CGC	2	6	1026354	1026359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292463
20243	NC_015183	GAAC	2	8	1026373	1026380	50 %	0 %	25 %	25 %	325292463
20244	NC_015183	TGG	2	6	1026432	1026437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292463
20245	NC_015183	GAC	2	6	1026462	1026467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292463
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20250	NC_015183	GGC	2	6	1026660	1026665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292463
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20252	NC_015183	GCG	2	6	1026705	1026710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292463
20253	NC_015183	CAT	2	6	1026711	1026716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292463
20254	NC_015183	GAC	2	6	1026727	1026732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292463
20255	NC_015183	GC	3	6	1026753	1026758	0 %	0 %	50 %	50 %	325292463
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20259	NC_015183	GAT	2	6	1026928	1026933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292463
20260	NC_015183	CGCC	2	8	1026936	1026943	0 %	0 %	25 %	75 %	325292463
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20262	NC_015183	CGT	2	6	1027017	1027022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292463
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20322	NC_015183	CGTG	2	8	1029751	1029758	0 %	25 %	50 %	25 %	325292466
20323	NC_015183	GAC	2	6	1029766	1029771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292466
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20327	NC_015183	CAG	2	6	1029941	1029946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292466
20328	NC_015183	CGC	2	6	1029952	1029957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292466
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20330	NC_015183	GC	3	6	1029996	1030001	0 %	0 %	50 %	50 %	325292466
20331	NC_015183	TCA	2	6	1030050	1030055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292466
20332	NC_015183	ATC	2	6	1030175	1030180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292466
20333	NC_015183	GATC	2	8	1030243	1030250	25 %	25 %	25 %	25 %	325292466
20334	NC_015183	ATG	2	6	1030359	1030364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292466
20335	NC_015183	CGC	2	6	1030451	1030456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292466
20336	NC_015183	TCA	2	6	1030512	1030517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292466
20337	NC_015183	GGT	2	6	1030627	1030632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292466
20338	NC_015183	CGG	2	6	1030674	1030679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292466
20339	NC_015183	TCG	4	12	1030958	1030969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292467
20340	NC_015183	GAA	2	6	1030990	1030995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292467
20341	NC_015183	CGG	2	6	1031040	1031045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292467
20342	NC_015183	CTT	2	6	1031079	1031084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292467
20343	NC_015183	GTGCAG	2	12	1031131	1031142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325292467
20344	NC_015183	GTTCA	2	10	1031179	1031188	20 %	40 %	20 %	20 %	325292467
20345	NC_015183	ACG	2	6	1031234	1031239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292467
20346	NC_015183	AGC	2	6	1031245	1031250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292467
20347	NC_015183	ACG	2	6	1031291	1031296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292467
20348	NC_015183	GC	3	6	1031375	1031380	0 %	0 %	50 %	50 %	325292467
20349	NC_015183	TTG	2	6	1031399	1031404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292467
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20351	NC_015183	GC	3	6	1031414	1031419	0 %	0 %	50 %	50 %	325292467
20352	NC_015183	GCA	2	6	1031436	1031441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292467
20353	NC_015183	TTG	2	6	1031498	1031503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292467
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20447	NC_015183	CAT	2	6	1035566	1035571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292473
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20456	NC_015183	GCACG	2	10	1036136	1036145	20 %	0 %	40 %	40 %	325292474
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20458	NC_015183	GGC	2	6	1036169	1036174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292474
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20460	NC_015183	CAA	2	6	1036286	1036291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292474
20461	NC_015183	CGA	2	6	1036331	1036336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292474
20462	NC_015183	GAT	2	6	1036406	1036411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292474
20463	NC_015183	GCC	2	6	1036414	1036419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292474
20464	NC_015183	TCG	2	6	1036450	1036455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292474
20465	NC_015183	CAT	2	6	1036631	1036636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292474
20466	NC_015183	GGC	2	6	1036749	1036754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292474
20467	NC_015183	GAT	2	6	1036760	1036765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292474
20468	NC_015183	ATC	2	6	1037160	1037165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292475
20469	NC_015183	GTT	2	6	1037186	1037191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292475
20470	NC_015183	GAA	3	9	1037261	1037269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292475
20471	NC_015183	GAC	2	6	1037288	1037293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292475
20472	NC_015183	CGGAA	2	10	1037653	1037662	40 %	0 %	40 %	20 %	325292476
20473	NC_015183	GCT	2	6	1037677	1037682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292476
20474	NC_015183	TCGAAG	2	12	1037718	1037729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325292476
20475	NC_015183	TGGA	2	8	1037801	1037808	25 %	25 %	50 %	0 %	325292476
20476	NC_015183	AGC	2	6	1037817	1037822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292476
20477	NC_015183	GATC	2	8	1037827	1037834	25 %	25 %	25 %	25 %	325292476
20478	NC_015183	GCC	3	9	1037855	1037863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292476
20479	NC_015183	CGG	2	6	1037947	1037952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292476
20480	NC_015183	CGC	2	6	1038002	1038007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292476
20481	NC_015183	TGC	2	6	1038139	1038144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292476
20482	NC_015183	GAT	2	6	1038148	1038153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292476
20483	NC_015183	TCG	2	6	1038336	1038341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292476
20484	NC_015183	GC	3	6	1038368	1038373	0 %	0 %	50 %	50 %	325292476
20485	NC_015183	GTC	2	6	1038395	1038400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292476
20486	NC_015183	ATCAC	2	10	1038426	1038435	40 %	20 %	0 %	40 %	325292476
20487	NC_015183	GATGGC	2	12	1038449	1038460	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325292476
20488	NC_015183	GC	3	6	1038490	1038495	0 %	0 %	50 %	50 %	325292476
20489	NC_015183	CCA	2	6	1038543	1038548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292476
20490	NC_015183	TGGT	2	8	1038585	1038592	0 %	50 %	50 %	0 %	325292476
20491	NC_015183	TCT	2	6	1038643	1038648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292476
20492	NC_015183	AGC	2	6	1038652	1038657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292476
20493	NC_015183	ACA	2	6	1038699	1038704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292476
20494	NC_015183	CCG	2	6	1038710	1038715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292476
20495	NC_015183	GATC	2	8	1038751	1038758	25 %	25 %	25 %	25 %	325292476
20496	NC_015183	GC	3	6	1038773	1038778	0 %	0 %	50 %	50 %	325292476
20497	NC_015183	GGC	2	6	1038821	1038826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292476
20498	NC_015183	CCTC	2	8	1038834	1038841	0 %	25 %	0 %	75 %	325292476
20499	NC_015183	ACG	2	6	1039098	1039103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292477
20500	NC_015183	GGA	2	6	1039110	1039115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292477

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