MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015183	TGC	2	6	964191	964196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292402
19002	NC_015183	CGAT	2	8	964259	964266	25 %	25 %	25 %	25 %	325292402
19003	NC_015183	GC	3	6	964308	964313	0 %	0 %	50 %	50 %	325292402
19004	NC_015183	TTCG	2	8	964414	964421	0 %	50 %	25 %	25 %	325292402
19005	NC_015183	ATCTG	2	10	964440	964449	20 %	40 %	20 %	20 %	325292402
19006	NC_015183	TCT	2	6	964582	964587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292403
19007	NC_015183	CCCG	2	8	964590	964597	0 %	0 %	25 %	75 %	325292403
19008	NC_015183	TCA	2	6	964611	964616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292403
19009	NC_015183	TCG	2	6	964731	964736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292403
19010	NC_015183	GCC	2	6	964829	964834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
19011	NC_015183	GCA	2	6	964960	964965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292403
19012	NC_015183	GCA	2	6	964969	964974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292403
19013	NC_015183	CGG	2	6	964999	965004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
19014	NC_015183	GGC	2	6	965108	965113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
19015	NC_015183	GTTGCC	2	12	965168	965179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292403
19016	NC_015183	TGC	2	6	965189	965194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292403
19017	NC_015183	CGGC	2	8	965310	965317	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
19018	NC_015183	GCG	2	6	965385	965390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
19019	NC_015183	GCC	2	6	965424	965429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
19020	NC_015183	GAA	2	6	965435	965440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292403
19021	NC_015183	GCCCG	2	10	965453	965462	0 %	0 %	40 %	60 %	325292403
19022	NC_015183	CCG	2	6	965470	965475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
19023	NC_015183	AAT	2	6	965488	965493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292403
19024	NC_015183	CCAG	2	8	965591	965598	25 %	0 %	25 %	50 %	325292403
19025	NC_015183	CGC	2	6	965692	965697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
19026	NC_015183	GC	3	6	965696	965701	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
19027	NC_015183	GAT	2	6	965702	965707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292403
19028	NC_015183	CGC	2	6	965709	965714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
19029	NC_015183	CCA	2	6	965720	965725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292403
19030	NC_015183	TGC	2	6	965777	965782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292403
19031	NC_015183	CTG	2	6	965798	965803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292403
19032	NC_015183	GC	3	6	965822	965827	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
19033	NC_015183	CAG	2	6	965873	965878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292403
19034	NC_015183	GCA	2	6	965902	965907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292403
19035	NC_015183	CGG	2	6	965908	965913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
19036	NC_015183	ATCC	2	8	965996	966003	25 %	25 %	0 %	50 %	325292403
19037	NC_015183	CGG	2	6	966016	966021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
19038	NC_015183	CCGG	2	8	966178	966185	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
19039	NC_015183	GC	3	6	966255	966260	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
19040	NC_015183	GCTC	2	8	966289	966296	0 %	25 %	25 %	50 %	325292403
19041	NC_015183	CGG	2	6	966313	966318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
19042	NC_015183	CGTGT	2	10	966414	966423	0 %	40 %	40 %	20 %	325292403
19043	NC_015183	CAG	2	6	966535	966540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292403
19044	NC_015183	CGGCA	2	10	966566	966575	20 %	0 %	40 %	40 %	325292403
19045	NC_015183	GGCC	2	8	966589	966596	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
19046	NC_015183	GCC	2	6	966627	966632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
19047	NC_015183	TCA	2	6	966667	966672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292403
19048	NC_015183	CTT	2	6	966692	966697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292403
19049	NC_015183	TG	3	6	966981	966986	0 %	50 %	50 %	0 %	325292404
19050	NC_015183	GCC	2	6	967118	967123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292404
19051	NC_015183	GCA	2	6	967149	967154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292404
19052	NC_015183	ACG	2	6	967175	967180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292404
19053	NC_015183	GCG	2	6	967244	967249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292404
19054	NC_015183	CAA	2	6	967282	967287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292404
19055	NC_015183	GCT	2	6	967342	967347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292404
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19060	NC_015183	TCG	2	6	967518	967523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292404
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19065	NC_015183	TGA	2	6	967920	967925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292404
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19067	NC_015183	GTG	2	6	968118	968123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292405
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19070	NC_015183	TCA	2	6	968287	968292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292405
19071	NC_015183	GCCGC	2	10	968339	968348	0 %	0 %	40 %	60 %	325292405
19072	NC_015183	TGC	2	6	968359	968364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292405
19073	NC_015183	GC	3	6	968390	968395	0 %	0 %	50 %	50 %	325292405
19074	NC_015183	ACTGGC	2	12	968471	968482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325292405
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19089	NC_015183	TCG	2	6	969223	969228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292406
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19102	NC_015183	GTC	2	6	969462	969467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292406
19103	NC_015183	CG	3	6	969485	969490	0 %	0 %	50 %	50 %	325292406
19104	NC_015183	TTG	2	6	969505	969510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292406
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19109	NC_015183	TGT	2	6	969700	969705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292406
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19114	NC_015183	CTT	2	6	969822	969827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292406
19115	NC_015183	CCAGCC	2	12	969920	969931	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325292406
19116	NC_015183	GC	3	6	970083	970088	0 %	0 %	50 %	50 %	325292406
19117	NC_015183	GA	3	6	970107	970112	50 %	0 %	50 %	0 %	325292406
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19119	NC_015183	TCG	2	6	970198	970203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292406
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19238	NC_015183	GAA	2	6	976782	976787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292413
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19356	NC_015183	CTG	2	6	982915	982920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292420
19357	NC_015183	CTG	2	6	982972	982977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292420
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19471	NC_015183	AGC	2	6	988071	988076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292424
19472	NC_015183	GCC	2	6	988110	988115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292424
19473	NC_015183	GCA	2	6	988124	988129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292424
19474	NC_015183	GAT	2	6	988131	988136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292424
19475	NC_015183	TGC	2	6	988139	988144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292424
19476	NC_015183	TTC	2	6	988206	988211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292424
19477	NC_015183	GTCG	2	8	988335	988342	0 %	25 %	50 %	25 %	325292424
19478	NC_015183	CGC	2	6	988358	988363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292424
19479	NC_015183	TCG	2	6	988412	988417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292424
19480	NC_015183	CG	3	6	988476	988481	0 %	0 %	50 %	50 %	325292424
19481	NC_015183	GTCGC	2	10	988534	988543	0 %	20 %	40 %	40 %	325292424
19482	NC_015183	GAT	2	6	988551	988556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292424
19483	NC_015183	CGC	2	6	988559	988564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292424
19484	NC_015183	TTC	2	6	988644	988649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292424
19485	NC_015183	TCG	2	6	988667	988672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292424
19486	NC_015183	TCT	2	6	988696	988701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292424
19487	NC_015183	GCG	2	6	988724	988729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292424
19488	NC_015183	TCG	2	6	988813	988818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292424
19489	NC_015183	CG	3	6	988830	988835	0 %	0 %	50 %	50 %	325292424
19490	NC_015183	GC	4	8	988850	988857	0 %	0 %	50 %	50 %	325292424
19491	NC_015183	ATC	2	6	989104	989109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292424
19492	NC_015183	GAT	2	6	989433	989438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292425
19493	NC_015183	GTT	2	6	989451	989456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292425
19494	NC_015183	TGC	2	6	989475	989480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292425
19495	NC_015183	GCA	2	6	989575	989580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292425
19496	NC_015183	CTG	2	6	989587	989592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292425
19497	NC_015183	CG	3	6	989672	989677	0 %	0 %	50 %	50 %	325292425
19498	NC_015183	CGT	2	6	989799	989804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292425
19499	NC_015183	GC	3	6	989864	989869	0 %	0 %	50 %	50 %	325292425
19500	NC_015183	CGC	3	9	989867	989875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292425

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