MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015183	TCA	2	6	863236	863241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292298
17002	NC_015183	CGG	2	6	863276	863281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292298
17003	NC_015183	TCGA	2	8	863289	863296	25 %	25 %	25 %	25 %	325292298
17004	NC_015183	TGC	2	6	863297	863302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292298
17005	NC_015183	CGGCAT	2	12	863342	863353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325292298
17006	NC_015183	GAAT	2	8	863402	863409	50 %	25 %	25 %	0 %	325292298
17007	NC_015183	GGC	2	6	863475	863480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292298
17008	NC_015183	CCAG	2	8	863494	863501	25 %	0 %	25 %	50 %	325292298
17009	NC_015183	CTG	2	6	863536	863541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292298
17010	NC_015183	TGG	2	6	863587	863592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292298
17011	NC_015183	CCG	2	6	863598	863603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292298
17012	NC_015183	AGGA	2	8	863640	863647	50 %	0 %	50 %	0 %	325292298
17013	NC_015183	AAC	2	6	863688	863693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292299
17014	NC_015183	TGG	2	6	863723	863728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292299
17015	NC_015183	TGG	2	6	863768	863773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292299
17016	NC_015183	GTC	2	6	863794	863799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292299
17017	NC_015183	CGC	2	6	863811	863816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292299
17018	NC_015183	CG	3	6	863905	863910	0 %	0 %	50 %	50 %	325292299
17019	NC_015183	CGAAAC	2	12	863967	863978	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325292299
17020	NC_015183	CGG	2	6	863990	863995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292299
17021	NC_015183	GCG	2	6	864025	864030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292299
17022	NC_015183	GCA	2	6	864045	864050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292299
17023	NC_015183	A	6	6	864079	864084	100 %	0 %	0 %	0 %	325292299
17024	NC_015183	AGGCG	2	10	864099	864108	20 %	0 %	60 %	20 %	325292299
17025	NC_015183	GCT	2	6	864133	864138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292299
17026	NC_015183	CAT	2	6	864141	864146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292299
17027	NC_015183	TTC	2	6	864148	864153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292299
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17029	NC_015183	CGA	2	6	864188	864193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292299
17030	NC_015183	GGC	2	6	864204	864209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292299
17031	NC_015183	CGC	2	6	864234	864239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292299
17032	NC_015183	GGC	3	9	864274	864282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292299
17033	NC_015183	GCC	2	6	864367	864372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292299
17034	NC_015183	CAG	2	6	864412	864417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292299
17035	NC_015183	GAA	2	6	864549	864554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292299
17036	NC_015183	ATCG	2	8	864561	864568	25 %	25 %	25 %	25 %	325292299
17037	NC_015183	CCG	2	6	864731	864736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292300
17038	NC_015183	TGG	2	6	864749	864754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292300
17039	NC_015183	AAG	2	6	864771	864776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292300
17040	NC_015183	CGC	2	6	864850	864855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292300
17041	NC_015183	GGA	2	6	864926	864931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292300
17042	NC_015183	GCG	2	6	864956	864961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292300
17043	NC_015183	TGG	2	6	865024	865029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292300
17044	NC_015183	GC	3	6	865175	865180	0 %	0 %	50 %	50 %	325292301
17045	NC_015183	CGG	3	9	865260	865268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292301
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17049	NC_015183	GAC	2	6	865397	865402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292301
17050	NC_015183	CG	4	8	865446	865453	0 %	0 %	50 %	50 %	325292301
17051	NC_015183	AGC	2	6	865463	865468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292301
17052	NC_015183	GGC	2	6	865488	865493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292301
17053	NC_015183	GCTGA	2	10	865522	865531	20 %	20 %	40 %	20 %	325292301
17054	NC_015183	CGG	2	6	865572	865577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292301
17055	NC_015183	GCGTC	2	10	865635	865644	0 %	20 %	40 %	40 %	325292301
17056	NC_015183	CGC	2	6	865718	865723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292301
17057	NC_015183	GC	4	8	865730	865737	0 %	0 %	50 %	50 %	325292301
17058	NC_015183	GGC	2	6	865741	865746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292301
17059	NC_015183	TGCG	2	8	865751	865758	0 %	25 %	50 %	25 %	325292301
17060	NC_015183	GTC	2	6	865777	865782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292301
17061	NC_015183	CGA	2	6	865795	865800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292301
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17067	NC_015183	CGGT	2	8	866066	866073	0 %	25 %	50 %	25 %	325292301
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17071	NC_015183	GCGT	2	8	866669	866676	0 %	25 %	50 %	25 %	325292302
17072	NC_015183	GC	3	6	866713	866718	0 %	0 %	50 %	50 %	325292302
17073	NC_015183	CTT	2	6	866828	866833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292303
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17087	NC_015183	CTG	2	6	867568	867573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292304
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17100	NC_015183	GC	3	6	868123	868128	0 %	0 %	50 %	50 %	325292305
17101	NC_015183	CGG	3	9	868214	868222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292305
17102	NC_015183	TGA	2	6	868311	868316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292305
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17106	NC_015183	GCA	2	6	868401	868406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292305
17107	NC_015183	GGC	2	6	868419	868424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292305
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17110	NC_015183	TCT	2	6	868557	868562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292305
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17115	NC_015183	GGGGC	2	10	868685	868694	0 %	0 %	80 %	20 %	325292305
17116	NC_015183	CG	3	6	868800	868805	0 %	0 %	50 %	50 %	325292305
17117	NC_015183	GGC	2	6	868834	868839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292305
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17356	NC_015183	GGGC	2	8	880391	880398	0 %	0 %	75 %	25 %	325292318
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17477	NC_015183	CGG	2	6	886863	886868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292325
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17479	NC_015183	ATC	2	6	886898	886903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292325
17480	NC_015183	TGCGG	2	10	886917	886926	0 %	20 %	60 %	20 %	325292325
17481	NC_015183	TCCA	2	8	886932	886939	25 %	25 %	0 %	50 %	325292325
17482	NC_015183	GTG	2	6	886992	886997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292325
17483	NC_015183	GCG	2	6	886998	887003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292325
17484	NC_015183	GCA	2	6	887023	887028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292325
17485	NC_015183	TGA	2	6	887076	887081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292325
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17487	NC_015183	GAA	2	6	887120	887125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292325
17488	NC_015183	TTGG	2	8	887207	887214	0 %	50 %	50 %	0 %	325292325
17489	NC_015183	TGG	2	6	887281	887286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292325
17490	NC_015183	CGT	2	6	887356	887361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292325
17491	NC_015183	GAT	2	6	887370	887375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292325
17492	NC_015183	GGT	2	6	887444	887449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292325
17493	NC_015183	GC	5	10	887476	887485	0 %	0 %	50 %	50 %	325292325
17494	NC_015183	GATC	2	8	887608	887615	25 %	25 %	25 %	25 %	325292325
17495	NC_015183	GCCGGT	2	12	887618	887629	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325292325
17496	NC_015183	GAC	2	6	887636	887641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292325
17497	NC_015183	CTC	2	6	887681	887686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292325
17498	NC_015183	TGC	2	6	887696	887701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292325
17499	NC_015183	GGTG	2	8	887767	887774	0 %	25 %	75 %	0 %	325292325
17500	NC_015183	CCG	2	6	887802	887807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292325

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