MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015183	CGG	2	6	814073	814078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292240
16002	NC_015183	TCA	2	6	814220	814225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292241
16003	NC_015183	GGC	2	6	814231	814236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292241
16004	NC_015183	CAA	2	6	814281	814286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292241
16005	NC_015183	GTC	2	6	814288	814293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292241
16006	NC_015183	GCC	3	9	814301	814309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292241
16007	NC_015183	GCC	2	6	814333	814338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292241
16008	NC_015183	CGAC	2	8	814370	814377	25 %	0 %	25 %	50 %	325292241
16009	NC_015183	TCA	2	6	814409	814414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292241
16010	NC_015183	TCA	2	6	814439	814444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292241
16011	NC_015183	CAT	2	6	814455	814460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292241
16012	NC_015183	GGA	2	6	814467	814472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292241
16013	NC_015183	CGG	2	6	814502	814507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292241
16014	NC_015183	CCA	2	6	814520	814525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292241
16015	NC_015183	CGG	2	6	814550	814555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292241
16016	NC_015183	TGC	2	6	814559	814564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292241
16017	NC_015183	AGC	2	6	814577	814582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292241
16018	NC_015183	TCC	2	6	814606	814611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292241
16019	NC_015183	TGG	2	6	814631	814636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292241
16020	NC_015183	CCA	2	6	814655	814660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292241
16021	NC_015183	CCAT	2	8	814667	814674	25 %	25 %	0 %	50 %	325292241
16022	NC_015183	GAAA	2	8	814704	814711	75 %	0 %	25 %	0 %	325292241
16023	NC_015183	GCC	2	6	814737	814742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292241
16024	NC_015183	GAC	2	6	814752	814757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292241
16025	NC_015183	CGA	2	6	814782	814787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292241
16026	NC_015183	GAAG	2	8	814854	814861	50 %	0 %	50 %	0 %	325292241
16027	NC_015183	CGC	2	6	814893	814898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292241
16028	NC_015183	GCAT	2	8	814940	814947	25 %	25 %	25 %	25 %	325292241
16029	NC_015183	TGC	2	6	815070	815075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292242
16030	NC_015183	GCGCG	2	10	815145	815154	0 %	0 %	60 %	40 %	325292242
16031	NC_015183	TGG	2	6	815180	815185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292242
16032	NC_015183	TCA	2	6	815204	815209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292242
16033	NC_015183	GGGC	2	8	815253	815260	0 %	0 %	75 %	25 %	325292242
16034	NC_015183	GC	3	6	815259	815264	0 %	0 %	50 %	50 %	325292242
16035	NC_015183	GAT	2	6	815271	815276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292242
16036	NC_015183	GCC	2	6	815302	815307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292242
16037	NC_015183	ATC	2	6	815317	815322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292242
16038	NC_015183	CG	3	6	815389	815394	0 %	0 %	50 %	50 %	325292242
16039	NC_015183	T	6	6	815396	815401	0 %	100 %	0 %	0 %	325292242
16040	NC_015183	CGA	2	6	815445	815450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292242
16041	NC_015183	TGC	2	6	815462	815467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292242
16042	NC_015183	AGG	2	6	815591	815596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292242
16043	NC_015183	CGC	2	6	815651	815656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292242
16044	NC_015183	CCG	2	6	815720	815725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292242
16045	NC_015183	GCG	2	6	815803	815808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292242
16046	NC_015183	GGC	2	6	815814	815819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292242
16047	NC_015183	TCA	2	6	815971	815976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292243
16048	NC_015183	ATC	2	6	815985	815990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292243
16049	NC_015183	GCC	2	6	816027	816032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292243
16050	NC_015183	CGT	2	6	816059	816064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292243
16051	NC_015183	CTG	2	6	816102	816107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292243
16052	NC_015183	GCC	2	6	816108	816113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292243
16053	NC_015183	GCC	2	6	816126	816131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292243
16054	NC_015183	CGA	2	6	816239	816244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292243
16055	NC_015183	TCA	2	6	816292	816297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292243
16056	NC_015183	TCT	2	6	816322	816327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292243
16057	NC_015183	T	6	6	816327	816332	0 %	100 %	0 %	0 %	325292243
16058	NC_015183	GGA	2	6	816359	816364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292243
16059	NC_015183	GCC	2	6	816450	816455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292243
16060	NC_015183	GGC	2	6	816463	816468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292243
16061	NC_015183	CGC	3	9	816515	816523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292243
16062	NC_015183	GGC	2	6	816717	816722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292244
16063	NC_015183	GCT	2	6	816759	816764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292244
16064	NC_015183	CAGCG	2	10	816773	816782	20 %	0 %	40 %	40 %	325292244
16065	NC_015183	TCG	2	6	816836	816841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292244
16066	NC_015183	ATA	2	6	816865	816870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292244
16067	NC_015183	GC	3	6	816895	816900	0 %	0 %	50 %	50 %	325292244
16068	NC_015183	TGGT	2	8	816947	816954	0 %	50 %	50 %	0 %	325292244
16069	NC_015183	CGT	2	6	817050	817055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292244
16070	NC_015183	GC	3	6	817059	817064	0 %	0 %	50 %	50 %	325292244
16071	NC_015183	GCA	3	9	817104	817112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292244
16072	NC_015183	CATG	2	8	817414	817421	25 %	25 %	25 %	25 %	325292244
16073	NC_015183	CGT	2	6	817564	817569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292245
16074	NC_015183	GGA	2	6	817590	817595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292245
16075	NC_015183	CTT	2	6	817621	817626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292245
16076	NC_015183	GC	3	6	817644	817649	0 %	0 %	50 %	50 %	325292245
16077	NC_015183	TGC	2	6	817781	817786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292245
16078	NC_015183	T	6	6	817794	817799	0 %	100 %	0 %	0 %	325292245
16079	NC_015183	GCC	2	6	817803	817808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292245
16080	NC_015183	GCA	2	6	817821	817826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292245
16081	NC_015183	GCC	2	6	817894	817899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292245
16082	NC_015183	GCA	2	6	817903	817908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292245
16083	NC_015183	CGC	2	6	817920	817925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292245
16084	NC_015183	GAG	2	6	817948	817953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292245
16085	NC_015183	CCA	2	6	817997	818002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292245
16086	NC_015183	CGC	2	6	818016	818021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292245
16087	NC_015183	ATT	2	6	818032	818037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292245
16088	NC_015183	TGA	2	6	818057	818062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292245
16089	NC_015183	CGA	2	6	818070	818075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292245
16090	NC_015183	CGCT	2	8	818114	818121	0 %	25 %	25 %	50 %	325292245
16091	NC_015183	T	6	6	818121	818126	0 %	100 %	0 %	0 %	325292245
16092	NC_015183	GTG	2	6	818140	818145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292245
16093	NC_015183	CGC	3	9	818233	818241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292245
16094	NC_015183	CTG	2	6	818248	818253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292245
16095	NC_015183	A	7	7	818273	818279	100 %	0 %	0 %	0 %	325292245
16096	NC_015183	CAA	2	6	818287	818292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292245
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16098	NC_015183	GGC	2	6	818555	818560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292246
16099	NC_015183	GCA	2	6	818641	818646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292246
16100	NC_015183	CTT	2	6	818843	818848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292247
16101	NC_015183	CCA	2	6	818854	818859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292247
16102	NC_015183	CAG	2	6	818882	818887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292247
16103	NC_015183	GGC	2	6	818912	818917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292247
16104	NC_015183	CGG	3	9	818968	818976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292247
16105	NC_015183	GGT	2	6	819040	819045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292247
16106	NC_015183	CA	3	6	819060	819065	50 %	0 %	0 %	50 %	325292247
16107	NC_015183	CG	3	6	819072	819077	0 %	0 %	50 %	50 %	325292247
16108	NC_015183	GCG	2	6	819128	819133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292247
16109	NC_015183	TCC	2	6	819183	819188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292247
16110	NC_015183	CGC	3	9	819241	819249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292247
16111	NC_015183	GAT	2	6	819286	819291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292247
16112	NC_015183	CTGG	2	8	819338	819345	0 %	25 %	50 %	25 %	325292247
16113	NC_015183	GCC	2	6	819346	819351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292247
16114	NC_015183	CCG	2	6	819397	819402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292247
16115	NC_015183	GTC	3	9	819416	819424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292247
16116	NC_015183	TGA	2	6	819439	819444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292247
16117	NC_015183	AGA	2	6	819543	819548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292247
16118	NC_015183	CCATG	2	10	819602	819611	20 %	20 %	20 %	40 %	325292247
16119	NC_015183	ACC	2	6	820031	820036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292248
16120	NC_015183	CCG	2	6	820073	820078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292248
16121	NC_015183	TGGC	2	8	820106	820113	0 %	25 %	50 %	25 %	325292248
16122	NC_015183	GC	4	8	820131	820138	0 %	0 %	50 %	50 %	325292248
16123	NC_015183	CGATCT	2	12	820159	820170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325292248
16124	NC_015183	CCA	2	6	820197	820202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292248
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16221	NC_015183	GATC	2	8	824764	824771	25 %	25 %	25 %	25 %	325292251
16222	NC_015183	ATG	2	6	824786	824791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292251
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16228	NC_015183	GCT	2	6	824971	824976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292251
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16230	NC_015183	GAT	2	6	825019	825024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292251
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16232	NC_015183	CGC	2	6	825073	825078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292251
16233	NC_015183	GC	4	8	825154	825161	0 %	0 %	50 %	50 %	325292251
16234	NC_015183	TGG	2	6	825206	825211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292252
16235	NC_015183	TCT	2	6	825275	825280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292252
16236	NC_015183	TCG	2	6	825305	825310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292252
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16239	NC_015183	CGG	2	6	825476	825481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292252
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