MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015183	CGC	2	6	51269	51274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291502
1002	NC_015183	GAT	2	6	51285	51290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291502
1003	NC_015183	TGC	2	6	51326	51331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291502
1004	NC_015183	CAA	2	6	51574	51579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291503
1005	NC_015183	GAC	2	6	51696	51701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291503
1006	NC_015183	TCA	2	6	51711	51716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291503
1007	NC_015183	AAATC	2	10	51750	51759	60 %	20 %	0 %	20 %	325291503
1008	NC_015183	TCGA	2	8	51761	51768	25 %	25 %	25 %	25 %	325291503
1009	NC_015183	GAA	2	6	51866	51871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291503
1010	NC_015183	CCGC	2	8	51938	51945	0 %	0 %	25 %	75 %	325291503
1011	NC_015183	GAC	2	6	52012	52017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291503
1012	NC_015183	GC	3	6	52107	52112	0 %	0 %	50 %	50 %	325291504
1013	NC_015183	CGG	2	6	52157	52162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291504
1014	NC_015183	CGG	2	6	52347	52352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291504
1015	NC_015183	CGG	2	6	52356	52361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291504
1016	NC_015183	GAC	2	6	52387	52392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1017	NC_015183	GCG	2	6	52485	52490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291504
1018	NC_015183	CGG	2	6	52527	52532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291504
1019	NC_015183	CGA	2	6	52536	52541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1020	NC_015183	CGT	2	6	52590	52595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1021	NC_015183	CGA	2	6	52599	52604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1022	NC_015183	CAG	2	6	52606	52611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1023	NC_015183	GTC	3	9	52633	52641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1024	NC_015183	TCT	2	6	52670	52675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291504
1025	NC_015183	GTC	2	6	52676	52681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1026	NC_015183	GAT	2	6	52790	52795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291505
1027	NC_015183	CCCG	2	8	52902	52909	0 %	0 %	25 %	75 %	325291505
1028	NC_015183	CAT	2	6	52981	52986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291505
1029	NC_015183	CACGGT	2	12	53024	53035	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1030	NC_015183	TCG	2	6	53121	53126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1031	NC_015183	GTT	2	6	53132	53137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291505
1032	NC_015183	CGA	2	6	53143	53148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1033	NC_015183	GCG	2	6	53176	53181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
1034	NC_015183	CCT	2	6	53188	53193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291505
1035	NC_015183	GAG	2	6	53202	53207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291505
1036	NC_015183	GGC	2	6	53215	53220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
1037	NC_015183	CTC	2	6	53228	53233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291505
1038	NC_015183	ATC	2	6	53234	53239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291505
1039	NC_015183	GGC	2	6	53257	53262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
1040	NC_015183	GCA	2	6	53296	53301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1041	NC_015183	TCA	2	6	53325	53330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291505
1042	NC_015183	CGA	2	6	53359	53364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1043	NC_015183	GCG	2	6	53380	53385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
1044	NC_015183	GCG	2	6	53406	53411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
1045	NC_015183	GA	3	6	53430	53435	50 %	0 %	50 %	0 %	325291505
1046	NC_015183	CAGC	2	8	53467	53474	25 %	0 %	25 %	50 %	325291505
1047	NC_015183	GCA	2	6	53569	53574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1048	NC_015183	GCA	2	6	53587	53592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1049	NC_015183	AGGCGA	2	12	53695	53706	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325291505
1050	NC_015183	TGA	2	6	53707	53712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291505
1051	NC_015183	ACC	2	6	53750	53755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291505
1052	NC_015183	GCA	2	6	53782	53787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1053	NC_015183	CAG	2	6	53798	53803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1054	NC_015183	CAA	2	6	53935	53940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291505
1055	NC_015183	TCG	2	6	53947	53952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1056	NC_015183	GCCA	2	8	53970	53977	25 %	0 %	25 %	50 %	325291505
1057	NC_015183	TTG	2	6	54031	54036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291505
1058	NC_015183	GCCA	2	8	54050	54057	25 %	0 %	25 %	50 %	325291505
1059	NC_015183	TCA	2	6	54085	54090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291506
1060	NC_015183	CG	3	6	54096	54101	0 %	0 %	50 %	50 %	325291506
1061	NC_015183	ATGCCG	2	12	54123	54134	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1062	NC_015183	ATGG	2	8	54147	54154	25 %	25 %	50 %	0 %	325291506
1063	NC_015183	CCGC	2	8	54177	54184	0 %	0 %	25 %	75 %	325291506
1064	NC_015183	GTC	2	6	54227	54232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1065	NC_015183	CAG	3	9	54265	54273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1066	NC_015183	GCCGG	2	10	54475	54484	0 %	0 %	60 %	40 %	325291506
1067	NC_015183	GCA	2	6	54551	54556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1068	NC_015183	CTG	2	6	54619	54624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1069	NC_015183	GAA	2	6	54642	54647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291506
1070	NC_015183	GCC	2	6	54689	54694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291506
1071	NC_015183	CGGG	2	8	54706	54713	0 %	0 %	75 %	25 %	325291506
1072	NC_015183	TCG	2	6	54725	54730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1073	NC_015183	GAT	2	6	54733	54738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291506
1074	NC_015183	CAG	2	6	54793	54798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1075	NC_015183	CTG	2	6	54805	54810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1076	NC_015183	TGCT	2	8	54855	54862	0 %	50 %	25 %	25 %	325291506
1077	NC_015183	ACC	2	6	54908	54913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291506
1078	NC_015183	CGC	2	6	54925	54930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291506
1079	NC_015183	CG	3	6	54987	54992	0 %	0 %	50 %	50 %	325291506
1080	NC_015183	CTC	2	6	54993	54998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291506
1081	NC_015183	TCCGG	2	10	55011	55020	0 %	20 %	40 %	40 %	325291506
1082	NC_015183	GCA	3	9	55029	55037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1083	NC_015183	GTTC	2	8	55059	55066	0 %	50 %	25 %	25 %	325291506
1084	NC_015183	TC	3	6	55138	55143	0 %	50 %	0 %	50 %	325291506
1085	NC_015183	GAAA	2	8	55145	55152	75 %	0 %	25 %	0 %	325291506
1086	NC_015183	CGC	2	6	55225	55230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291506
1087	NC_015183	T	6	6	55232	55237	0 %	100 %	0 %	0 %	325291506
1088	NC_015183	CGT	2	6	55316	55321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1089	NC_015183	GC	3	6	55326	55331	0 %	0 %	50 %	50 %	325291506
1090	NC_015183	CGAT	2	8	55368	55375	25 %	25 %	25 %	25 %	325291506
1091	NC_015183	GCCC	2	8	55573	55580	0 %	0 %	25 %	75 %	325291506
1092	NC_015183	CGG	2	6	55587	55592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291506
1093	NC_015183	GC	3	6	55595	55600	0 %	0 %	50 %	50 %	325291506
1094	NC_015183	CAC	2	6	55678	55683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291506
1095	NC_015183	ACGC	2	8	55684	55691	25 %	0 %	25 %	50 %	325291506
1096	NC_015183	CCGG	2	8	55748	55755	0 %	0 %	50 %	50 %	325291506
1097	NC_015183	CGC	2	6	55768	55773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291506
1098	NC_015183	GAT	2	6	55810	55815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291506
1099	NC_015183	TCG	2	6	55823	55828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1100	NC_015183	CTGC	2	8	55869	55876	0 %	25 %	25 %	50 %	325291506
1101	NC_015183	GGAA	2	8	55880	55887	50 %	0 %	50 %	0 %	325291506
1102	NC_015183	TC	3	6	56096	56101	0 %	50 %	0 %	50 %	325291506
1103	NC_015183	CCT	2	6	56106	56111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291506
1104	NC_015183	TCG	2	6	56168	56173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1105	NC_015183	GTC	2	6	56206	56211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1106	NC_015183	CAC	2	6	56242	56247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291506
1107	NC_015183	GAG	2	6	56264	56269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291506
1108	NC_015183	GAA	2	6	56322	56327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291506
1109	NC_015183	GGC	2	6	56356	56361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291506
1110	NC_015183	GAA	2	6	56379	56384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291506
1111	NC_015183	GTT	2	6	56438	56443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291506
1112	NC_015183	CGG	2	6	56455	56460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291506
1113	NC_015183	GA	3	6	56465	56470	50 %	0 %	50 %	0 %	325291506
1114	NC_015183	GATC	2	8	56541	56548	25 %	25 %	25 %	25 %	325291506
1115	NC_015183	GATT	2	8	59294	59301	25 %	50 %	25 %	0 %	325291507
1116	NC_015183	TCGCT	2	10	59334	59343	0 %	40 %	20 %	40 %	325291507
1117	NC_015183	GC	4	8	59351	59358	0 %	0 %	50 %	50 %	325291507
1118	NC_015183	TG	3	6	59384	59389	0 %	50 %	50 %	0 %	325291507
1119	NC_015183	GAA	2	6	59422	59427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291507
1120	NC_015183	A	8	8	59426	59433	100 %	0 %	0 %	0 %	325291507
1121	NC_015183	CAG	2	6	63629	63634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291508
1122	NC_015183	ATC	2	6	63641	63646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291508
1123	NC_015183	GGCA	2	8	63658	63665	25 %	0 %	50 %	25 %	325291508
1124	NC_015183	GTT	2	6	63752	63757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291508
1125	NC_015183	CGC	2	6	63790	63795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291508
1126	NC_015183	CAGG	2	8	63803	63810	25 %	0 %	50 %	25 %	325291508
1127	NC_015183	AGA	2	6	63847	63852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291508
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1142	NC_015183	ACA	2	6	65104	65109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291508
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1144	NC_015183	CG	3	6	65198	65203	0 %	0 %	50 %	50 %	325291508
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1151	NC_015183	GAT	2	6	65642	65647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291509
1152	NC_015183	GAT	2	6	65663	65668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291509
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1156	NC_015183	GA	3	6	66205	66210	50 %	0 %	50 %	0 %	325291509
1157	NC_015183	CGA	2	6	66310	66315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291509
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1160	NC_015183	ATG	2	6	66471	66476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291509
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1234	NC_015183	GC	4	8	69849	69856	0 %	0 %	50 %	50 %	325291512
1235	NC_015183	ATTCAT	2	12	69919	69930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325291512
1236	NC_015183	TCA	2	6	69953	69958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291512
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1238	NC_015183	TTC	2	6	70072	70077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291513
1239	NC_015183	CATTGC	2	12	70106	70117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325291513
1240	NC_015183	GC	3	6	70176	70181	0 %	0 %	50 %	50 %	325291513
1241	NC_015183	GAA	2	6	70239	70244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291513
1242	NC_015183	GGGC	2	8	70325	70332	0 %	0 %	75 %	25 %	325291513
1243	NC_015183	CTG	2	6	70437	70442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291513
1244	NC_015183	CCCGC	2	10	70630	70639	0 %	0 %	20 %	80 %	325291513
1245	NC_015183	TCG	2	6	71367	71372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291514
1246	NC_015183	TCCG	2	8	71469	71476	0 %	25 %	25 %	50 %	325291514
1247	NC_015183	GAG	2	6	71499	71504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291514
1248	NC_015183	GCG	2	6	71667	71672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291515
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1250	NC_015183	CCG	2	6	71790	71795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291515
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