MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015183	TGG	2	6	714770	714775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292144
14002	NC_015183	GC	3	6	714817	714822	0 %	0 %	50 %	50 %	325292144
14003	NC_015183	GCC	2	6	714843	714848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292144
14004	NC_015183	CGA	2	6	714860	714865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292144
14005	NC_015183	CAA	2	6	714908	714913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292144
14006	NC_015183	GCG	2	6	714932	714937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292144
14007	NC_015183	CGGC	2	8	714942	714949	0 %	0 %	50 %	50 %	325292144
14008	NC_015183	CAG	2	6	714981	714986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292144
14009	NC_015183	CCG	2	6	715033	715038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292144
14010	NC_015183	AGC	3	9	715042	715050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292144
14011	NC_015183	CGG	2	6	715125	715130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292144
14012	NC_015183	CCA	2	6	715157	715162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292144
14013	NC_015183	AAG	2	6	715164	715169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292144
14014	NC_015183	ACC	2	6	715171	715176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292144
14015	NC_015183	GGC	2	6	715272	715277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292144
14016	NC_015183	AGC	2	6	715294	715299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292144
14017	NC_015183	TGA	2	6	715316	715321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292144
14018	NC_015183	A	6	6	715330	715335	100 %	0 %	0 %	0 %	325292144
14019	NC_015183	GAG	2	6	715338	715343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292144
14020	NC_015183	TGCT	2	8	715501	715508	0 %	50 %	25 %	25 %	325292145
14021	NC_015183	AGG	3	9	715600	715608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292145
14022	NC_015183	TGGGCG	2	12	715643	715654	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325292145
14023	NC_015183	CGA	2	6	715697	715702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292145
14024	NC_015183	CCG	2	6	715705	715710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292145
14025	NC_015183	TGC	2	6	715729	715734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292145
14026	NC_015183	TCGG	2	8	716160	716167	0 %	25 %	50 %	25 %	325292146
14027	NC_015183	TCA	2	6	716194	716199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292146
14028	NC_015183	GAG	2	6	716208	716213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292146
14029	NC_015183	TCC	2	6	716238	716243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292146
14030	NC_015183	CGC	2	6	716329	716334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292146
14031	NC_015183	CGA	2	6	716338	716343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292146
14032	NC_015183	GAG	2	6	716406	716411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292146
14033	NC_015183	GCG	2	6	716423	716428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292146
14034	NC_015183	AAG	2	6	716444	716449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292146
14035	NC_015183	CGA	2	6	716461	716466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292146
14036	NC_015183	CAT	2	6	716495	716500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292146
14037	NC_015183	GCC	2	6	716639	716644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292146
14038	NC_015183	GGC	2	6	716654	716659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292146
14039	NC_015183	GAA	2	6	716731	716736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292146
14040	NC_015183	GCA	2	6	716740	716745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292146
14041	NC_015183	AACCG	2	10	716755	716764	40 %	0 %	20 %	40 %	325292147
14042	NC_015183	CGA	2	6	716821	716826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292147
14043	NC_015183	GATC	2	8	716893	716900	25 %	25 %	25 %	25 %	325292147
14044	NC_015183	CG	3	6	716916	716921	0 %	0 %	50 %	50 %	325292147
14045	NC_015183	GCA	2	6	716929	716934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292147
14046	NC_015183	GGAA	2	8	716936	716943	50 %	0 %	50 %	0 %	325292147
14047	NC_015183	ATC	2	6	717033	717038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292147
14048	NC_015183	GC	3	6	717081	717086	0 %	0 %	50 %	50 %	325292147
14049	NC_015183	ATG	2	6	717180	717185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292147
14050	NC_015183	GCC	2	6	717478	717483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292148
14051	NC_015183	ATC	2	6	717593	717598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292148
14052	NC_015183	GC	3	6	717654	717659	0 %	0 %	50 %	50 %	325292148
14053	NC_015183	CTT	2	6	717763	717768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292148
14054	NC_015183	GGA	2	6	717772	717777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292148
14055	NC_015183	GAT	2	6	717778	717783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292148
14056	NC_015183	CTC	2	6	717784	717789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292148
14057	NC_015183	CGG	2	6	717860	717865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292148
14058	NC_015183	CCA	2	6	717924	717929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292148
14059	NC_015183	TCG	3	9	717974	717982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292148
14060	NC_015183	CGG	2	6	717998	718003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292148
14061	NC_015183	CCA	2	6	718023	718028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292148
14062	NC_015183	CCA	2	6	718047	718052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292148
14063	NC_015183	GCA	2	6	718131	718136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292148
14064	NC_015183	CGG	2	6	718194	718199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292148
14065	NC_015183	GTG	2	6	718256	718261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292148
14066	NC_015183	GCC	2	6	718285	718290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292148
14067	NC_015183	GC	3	6	718391	718396	0 %	0 %	50 %	50 %	325292148
14068	NC_015183	TCG	2	6	718428	718433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292148
14069	NC_015183	TCG	2	6	718535	718540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292148
14070	NC_015183	GC	3	6	718625	718630	0 %	0 %	50 %	50 %	325292148
14071	NC_015183	GC	3	6	718691	718696	0 %	0 %	50 %	50 %	325292148
14072	NC_015183	GCC	2	6	718726	718731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292148
14073	NC_015183	GGC	2	6	718737	718742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292148
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14076	NC_015183	CGT	2	6	718972	718977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292149
14077	NC_015183	GC	3	6	719067	719072	0 %	0 %	50 %	50 %	325292149
14078	NC_015183	CAG	2	6	719081	719086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292149
14079	NC_015183	TCG	2	6	719088	719093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292149
14080	NC_015183	AGC	2	6	719113	719118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292149
14081	NC_015183	AGC	2	6	719128	719133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292149
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14084	NC_015183	GTC	2	6	719285	719290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292149
14085	NC_015183	GCT	2	6	719395	719400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292149
14086	NC_015183	GCG	2	6	719418	719423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292149
14087	NC_015183	GAT	2	6	719429	719434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292149
14088	NC_015183	CGG	3	9	719443	719451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292149
14089	NC_015183	GC	3	6	719462	719467	0 %	0 %	50 %	50 %	325292149
14090	NC_015183	A	8	8	719537	719544	100 %	0 %	0 %	0 %	325292149
14091	NC_015183	TGG	2	6	719636	719641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292149
14092	NC_015183	CTG	2	6	719649	719654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292149
14093	NC_015183	CAG	2	6	719667	719672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292149
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14097	NC_015183	TCG	2	6	720096	720101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292150
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14099	NC_015183	GTG	2	6	720167	720172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292150
14100	NC_015183	CGT	2	6	720216	720221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292150
14101	NC_015183	TCT	2	6	720226	720231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292150
14102	NC_015183	CTG	2	6	720356	720361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292150
14103	NC_015183	AGG	2	6	720390	720395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292150
14104	NC_015183	TCT	2	6	720415	720420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292150
14105	NC_015183	CGG	2	6	720477	720482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292150
14106	NC_015183	GCC	2	6	720549	720554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292150
14107	NC_015183	GAAG	2	8	720580	720587	50 %	0 %	50 %	0 %	325292150
14108	NC_015183	TTA	2	6	720592	720597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292150
14109	NC_015183	GGT	2	6	720655	720660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292150
14110	NC_015183	CAG	2	6	720668	720673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292150
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14112	NC_015183	GCC	2	6	720770	720775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292150
14113	NC_015183	ACG	2	6	720827	720832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292151
14114	NC_015183	ATC	2	6	720833	720838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292151
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14116	NC_015183	ATG	2	6	720875	720880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292151
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14118	NC_015183	CAT	2	6	720978	720983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292151
14119	NC_015183	CAT	2	6	720990	720995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292151
14120	NC_015183	TGC	2	6	721095	721100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292151
14121	NC_015183	CGG	2	6	721107	721112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292151
14122	NC_015183	TCA	2	6	721151	721156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292151
14123	NC_015183	TCT	2	6	721160	721165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292151
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14125	NC_015183	CGG	2	6	721188	721193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292151
14126	NC_015183	GAT	2	6	721206	721211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292151
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14129	NC_015183	TCG	2	6	721313	721318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292151
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14138	NC_015183	CTG	2	6	721558	721563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292151
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14140	NC_015183	GACC	2	8	721605	721612	25 %	0 %	25 %	50 %	325292151
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14220	NC_015183	CGG	2	6	725460	725465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292155
14221	NC_015183	AGC	2	6	725496	725501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292155
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14223	NC_015183	CTGTTC	2	12	725536	725547	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325292155
14224	NC_015183	GGC	2	6	725566	725571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292155
14225	NC_015183	GC	3	6	725576	725581	0 %	0 %	50 %	50 %	325292155
14226	NC_015183	CAT	2	6	725692	725697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292156
14227	NC_015183	CGG	2	6	725713	725718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292156
14228	NC_015183	GCT	2	6	725757	725762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292156
14229	NC_015183	TCG	2	6	725889	725894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292156
14230	NC_015183	GTC	2	6	725903	725908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292156
14231	NC_015183	GCC	2	6	725941	725946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292156
14232	NC_015183	TGC	3	9	726000	726008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292156
14233	NC_015183	CAT	2	6	726022	726027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292156
14234	NC_015183	CAA	2	6	726046	726051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292156
14235	NC_015183	AGGC	2	8	726061	726068	25 %	0 %	50 %	25 %	325292156
14236	NC_015183	GGC	2	6	726098	726103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292157
14237	NC_015183	GCCGC	2	10	726123	726132	0 %	0 %	40 %	60 %	325292157
14238	NC_015183	AAG	2	6	726199	726204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292157
14239	NC_015183	GGCGC	2	10	726224	726233	0 %	0 %	60 %	40 %	325292157
14240	NC_015183	GCG	2	6	726280	726285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292157
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14245	NC_015183	CTG	2	6	726549	726554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292157
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14249	NC_015183	CGG	2	6	726680	726685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292157
14250	NC_015183	GCG	2	6	726697	726702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292157
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14255	NC_015183	TCG	2	6	726979	726984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292158
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14269	NC_015183	GC	3	6	727582	727587	0 %	0 %	50 %	50 %	325292158
14270	NC_015183	TGG	2	6	727612	727617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292158
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14344	NC_015183	CGGTGG	2	12	731134	731145	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325292162
14345	NC_015183	TGT	2	6	731231	731236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292162
14346	NC_015183	GA	3	6	731297	731302	50 %	0 %	50 %	0 %	325292162
14347	NC_015183	CGC	2	6	731341	731346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292162
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14350	NC_015183	TCCC	2	8	731470	731477	0 %	25 %	0 %	75 %	325292162
14351	NC_015183	GCAT	2	8	731493	731500	25 %	25 %	25 %	25 %	325292162
14352	NC_015183	TCC	2	6	731609	731614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292162
14353	NC_015183	GTCCA	2	10	731653	731662	20 %	20 %	20 %	40 %	325292162
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14355	NC_015183	GTA	2	6	731896	731901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292162
14356	NC_015183	TCT	2	6	731910	731915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292162
14357	NC_015183	T	8	8	731961	731968	0 %	100 %	0 %	0 %	325292162
14358	NC_015183	GTA	2	6	731969	731974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292162
14359	NC_015183	CGG	2	6	732067	732072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292162
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14470	NC_015183	CG	4	8	738347	738354	0 %	0 %	50 %	50 %	325292168
14471	NC_015183	CAG	2	6	738396	738401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292168
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14474	NC_015183	TGA	2	6	738554	738559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292168
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14477	NC_015183	AGAT	2	8	738760	738767	50 %	25 %	25 %	0 %	325292168
14478	NC_015183	CGA	2	6	738797	738802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292168
14479	NC_015183	TGA	2	6	738806	738811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292168
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