MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015183	GCC	2	6	665549	665554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292091
13002	NC_015183	CGC	2	6	665572	665577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292091
13003	NC_015183	GGTC	2	8	665589	665596	0 %	25 %	50 %	25 %	325292091
13004	NC_015183	GAA	2	6	665599	665604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292091
13005	NC_015183	CCA	2	6	665712	665717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292091
13006	NC_015183	GCC	3	9	665737	665745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292091
13007	NC_015183	CAT	2	6	665791	665796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292091
13008	NC_015183	ATT	2	6	665834	665839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292091
13009	NC_015183	A	6	6	665976	665981	100 %	0 %	0 %	0 %	325292092
13010	NC_015183	CG	3	6	666089	666094	0 %	0 %	50 %	50 %	325292092
13011	NC_015183	GCT	2	6	666180	666185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292092
13012	NC_015183	GCCGC	2	10	666232	666241	0 %	0 %	40 %	60 %	325292092
13013	NC_015183	GGC	2	6	666246	666251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292092
13014	NC_015183	AGG	2	6	666257	666262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292092
13015	NC_015183	CGG	2	6	666297	666302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292092
13016	NC_015183	GCAT	2	8	666347	666354	25 %	25 %	25 %	25 %	325292092
13017	NC_015183	GCC	2	6	666517	666522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292092
13018	NC_015183	GCA	2	6	666527	666532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292092
13019	NC_015183	GCG	2	6	666619	666624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292092
13020	NC_015183	CGG	2	6	666713	666718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292092
13021	NC_015183	GCC	2	6	666983	666988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292093
13022	NC_015183	AT	3	6	667047	667052	50 %	50 %	0 %	0 %	325292093
13023	NC_015183	GCGA	2	8	667127	667134	25 %	0 %	50 %	25 %	325292093
13024	NC_015183	CAT	2	6	667150	667155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292093
13025	NC_015183	GGCC	2	8	667164	667171	0 %	0 %	50 %	50 %	325292093
13026	NC_015183	ATG	2	6	667188	667193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292093
13027	NC_015183	TGC	2	6	667203	667208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292093
13028	NC_015183	GAA	2	6	667234	667239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292093
13029	NC_015183	GCG	2	6	667281	667286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292093
13030	NC_015183	GAA	2	6	667300	667305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292093
13031	NC_015183	CAC	2	6	667372	667377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292093
13032	NC_015183	CCAG	2	8	667425	667432	25 %	0 %	25 %	50 %	325292093
13033	NC_015183	T	6	6	667443	667448	0 %	100 %	0 %	0 %	325292093
13034	NC_015183	CCG	2	6	667486	667491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292093
13035	NC_015183	GCC	2	6	667553	667558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292093
13036	NC_015183	ATG	2	6	667589	667594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292093
13037	NC_015183	ATCA	2	8	667610	667617	50 %	25 %	0 %	25 %	325292093
13038	NC_015183	CGA	2	6	667632	667637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292093
13039	NC_015183	A	6	6	667637	667642	100 %	0 %	0 %	0 %	325292093
13040	NC_015183	TGC	2	6	667867	667872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292094
13041	NC_015183	CGA	2	6	667873	667878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292094
13042	NC_015183	CG	4	8	667912	667919	0 %	0 %	50 %	50 %	325292094
13043	NC_015183	GCA	2	6	667928	667933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292094
13044	NC_015183	TGCC	2	8	667965	667972	0 %	25 %	25 %	50 %	325292094
13045	NC_015183	GCCG	2	8	668011	668018	0 %	0 %	50 %	50 %	325292094
13046	NC_015183	CGA	2	6	668083	668088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292094
13047	NC_015183	CGGG	2	8	668131	668138	0 %	0 %	75 %	25 %	325292094
13048	NC_015183	CG	3	6	668158	668163	0 %	0 %	50 %	50 %	325292094
13049	NC_015183	GCG	2	6	668168	668173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292094
13050	NC_015183	CCG	2	6	668183	668188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292094
13051	NC_015183	TGCGT	2	10	668227	668236	0 %	40 %	40 %	20 %	325292094
13052	NC_015183	GCG	2	6	668253	668258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292094
13053	NC_015183	TGC	2	6	668259	668264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292094
13054	NC_015183	TCG	2	6	668283	668288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292094
13055	NC_015183	CCG	2	6	668349	668354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292094
13056	NC_015183	CCGG	2	8	668357	668364	0 %	0 %	50 %	50 %	325292094
13057	NC_015183	TGG	2	6	668380	668385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292094
13058	NC_015183	CAC	2	6	668401	668406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292094
13059	NC_015183	A	6	6	668436	668441	100 %	0 %	0 %	0 %	325292094
13060	NC_015183	GGA	2	6	668464	668469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292094
13061	NC_015183	TGC	2	6	668496	668501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292094
13062	NC_015183	GCC	2	6	668570	668575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292094
13063	NC_015183	C	6	6	668574	668579	0 %	0 %	0 %	100 %	325292094
13064	NC_015183	GCC	2	6	668690	668695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292094
13065	NC_015183	TTC	2	6	668726	668731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292094
13066	NC_015183	C	7	7	668758	668764	0 %	0 %	0 %	100 %	325292094
13067	NC_015183	CG	3	6	668797	668802	0 %	0 %	50 %	50 %	325292094
13068	NC_015183	GTGCCG	2	12	668852	668863	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325292094
13069	NC_015183	T	6	6	668950	668955	0 %	100 %	0 %	0 %	325292094
13070	NC_015183	GAC	2	6	668993	668998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292094
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13072	NC_015183	GCC	2	6	669327	669332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292095
13073	NC_015183	CGT	2	6	669359	669364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292095
13074	NC_015183	CA	3	6	669392	669397	50 %	0 %	0 %	50 %	325292095
13075	NC_015183	GC	3	6	669411	669416	0 %	0 %	50 %	50 %	325292095
13076	NC_015183	CG	3	6	669431	669436	0 %	0 %	50 %	50 %	325292095
13077	NC_015183	CCGG	3	12	669451	669462	0 %	0 %	50 %	50 %	325292095
13078	NC_015183	TCG	2	6	669477	669482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292095
13079	NC_015183	ATC	2	6	669510	669515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292095
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13081	NC_015183	CTG	2	6	669645	669650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292095
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13083	NC_015183	CAT	3	9	669686	669694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292095
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13085	NC_015183	GCG	2	6	669753	669758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292095
13086	NC_015183	GCC	2	6	669851	669856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292095
13087	NC_015183	CAG	2	6	669888	669893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292095
13088	NC_015183	CGC	2	6	669925	669930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292095
13089	NC_015183	CG	3	6	669950	669955	0 %	0 %	50 %	50 %	325292095
13090	NC_015183	CGT	2	6	670001	670006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292095
13091	NC_015183	GC	3	6	670042	670047	0 %	0 %	50 %	50 %	325292095
13092	NC_015183	GGT	2	6	670166	670171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292095
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13094	NC_015183	GCC	2	6	670197	670202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292095
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13101	NC_015183	GCC	2	6	670815	670820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292096
13102	NC_015183	CT	3	6	670855	670860	0 %	50 %	0 %	50 %	325292096
13103	NC_015183	GCCGA	2	10	670946	670955	20 %	0 %	40 %	40 %	325292096
13104	NC_015183	CCG	2	6	670974	670979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292096
13105	NC_015183	CTG	2	6	671033	671038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292096
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13107	NC_015183	CGG	2	6	671058	671063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292096
13108	NC_015183	GGCA	2	8	671083	671090	25 %	0 %	50 %	25 %	325292096
13109	NC_015183	CGC	2	6	671101	671106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292096
13110	NC_015183	TCT	2	6	671110	671115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292096
13111	NC_015183	GC	3	6	671126	671131	0 %	0 %	50 %	50 %	325292096
13112	NC_015183	GCC	2	6	671180	671185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292096
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13114	NC_015183	ATCG	2	8	671302	671309	25 %	25 %	25 %	25 %	325292096
13115	NC_015183	CCT	2	6	671340	671345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292096
13116	NC_015183	CTG	2	6	671369	671374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292096
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13118	NC_015183	CAT	2	6	671389	671394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292096
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13120	NC_015183	TCT	2	6	671424	671429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292096
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13233	NC_015183	TGGC	2	8	676853	676860	0 %	25 %	50 %	25 %	325292102
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13237	NC_015183	TCG	2	6	677220	677225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292102
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13239	NC_015183	CAT	2	6	677320	677325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292103
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13242	NC_015183	CTG	2	6	677475	677480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292103
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13342	NC_015183	CCT	2	6	683085	683090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292108
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13347	NC_015183	GCT	2	6	683408	683413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292109
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13350	NC_015183	GCGAG	2	10	683589	683598	20 %	0 %	60 %	20 %	325292109
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13354	NC_015183	TGG	2	6	683736	683741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292109
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13359	NC_015183	CCG	2	6	683940	683945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292109
13360	NC_015183	GAGT	2	8	683950	683957	25 %	25 %	50 %	0 %	325292109
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13461	NC_015183	CGCC	2	8	689469	689476	0 %	0 %	25 %	75 %	325292116
13462	NC_015183	GCG	2	6	689534	689539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292116
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13466	NC_015183	ATG	2	6	689758	689763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292116
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13468	NC_015183	ATCG	2	8	689928	689935	25 %	25 %	25 %	25 %	325292116
13469	NC_015183	AGA	2	6	689984	689989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292116
13470	NC_015183	GCC	2	6	690035	690040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292116
13471	NC_015183	GCA	2	6	690332	690337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292117
13472	NC_015183	GAT	2	6	690355	690360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292117
13473	NC_015183	AGG	2	6	690458	690463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292117
13474	NC_015183	CGC	2	6	690491	690496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292117
13475	NC_015183	CGAC	2	8	690510	690517	25 %	0 %	25 %	50 %	325292117
13476	NC_015183	GC	3	6	690521	690526	0 %	0 %	50 %	50 %	325292117
13477	NC_015183	CACCG	2	10	690609	690618	20 %	0 %	20 %	60 %	325292117
13478	NC_015183	GAA	2	6	690619	690624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292117
13479	NC_015183	CGG	2	6	690627	690632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292117
13480	NC_015183	CGC	2	6	690660	690665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292117
13481	NC_015183	ATCT	2	8	690772	690779	25 %	50 %	0 %	25 %	325292117
13482	NC_015183	AGA	2	6	690908	690913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292117
13483	NC_015183	TCA	2	6	690917	690922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292117
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13487	NC_015183	CG	3	6	690998	691003	0 %	0 %	50 %	50 %	325292117
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13491	NC_015183	GAT	2	6	691128	691133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292117
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