MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015183	ATG	2	6	569479	569484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292004
11002	NC_015183	CCGG	2	8	569499	569506	0 %	0 %	50 %	50 %	325292004
11003	NC_015183	GCG	2	6	569558	569563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292004
11004	NC_015183	CGC	2	6	569599	569604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292004
11005	NC_015183	CTG	2	6	569605	569610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292004
11006	NC_015183	GTC	2	6	569631	569636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292004
11007	NC_015183	CCA	2	6	569647	569652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292004
11008	NC_015183	ATCC	2	8	569653	569660	25 %	25 %	0 %	50 %	325292004
11009	NC_015183	GCC	2	6	569666	569671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292004
11010	NC_015183	GGT	2	6	569676	569681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292004
11011	NC_015183	TCCC	2	8	569753	569760	0 %	25 %	0 %	75 %	325292004
11012	NC_015183	CAA	2	6	569826	569831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292004
11013	NC_015183	TGC	2	6	569900	569905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292004
11014	NC_015183	AAT	2	6	569922	569927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292004
11015	NC_015183	CTG	2	6	569934	569939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292004
11016	NC_015183	CGGCC	2	10	569955	569964	0 %	0 %	40 %	60 %	325292004
11017	NC_015183	GTC	2	6	569973	569978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292004
11018	NC_015183	CG	3	6	570054	570059	0 %	0 %	50 %	50 %	325292004
11019	NC_015183	CTC	2	6	570080	570085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292004
11020	NC_015183	GCA	2	6	570144	570149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292004
11021	NC_015183	GAG	2	6	570159	570164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292004
11022	NC_015183	ATC	2	6	570207	570212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292004
11023	NC_015183	GGT	2	6	570281	570286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292004
11024	NC_015183	GGC	2	6	570300	570305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292004
11025	NC_015183	TCG	2	6	570309	570314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292004
11026	NC_015183	TCA	2	6	570325	570330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292004
11027	NC_015183	GTT	2	6	570399	570404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292004
11028	NC_015183	GGC	2	6	570423	570428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292004
11029	NC_015183	GCC	2	6	570453	570458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292004
11030	NC_015183	GCT	2	6	570479	570484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292004
11031	NC_015183	GAC	2	6	570563	570568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292004
11032	NC_015183	CGC	2	6	570606	570611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292004
11033	NC_015183	GCCG	2	8	570684	570691	0 %	0 %	50 %	50 %	325292004
11034	NC_015183	CGC	2	6	570692	570697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292004
11035	NC_015183	CGGCG	2	10	570778	570787	0 %	0 %	60 %	40 %	325292004
11036	NC_015183	ATG	2	6	570834	570839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292004
11037	NC_015183	GAT	2	6	570843	570848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292004
11038	NC_015183	GGC	2	6	570856	570861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292004
11039	NC_015183	AAG	2	6	570974	570979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292005
11040	NC_015183	CGC	2	6	571001	571006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292005
11041	NC_015183	GC	3	6	571042	571047	0 %	0 %	50 %	50 %	325292005
11042	NC_015183	CGCGCC	2	12	571064	571075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292005
11043	NC_015183	CAT	2	6	571132	571137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292005
11044	NC_015183	GAT	2	6	571202	571207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292005
11045	NC_015183	CGC	2	6	571216	571221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292005
11046	NC_015183	ATCCC	2	10	571242	571251	20 %	20 %	0 %	60 %	325292005
11047	NC_015183	GGC	2	6	571319	571324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292005
11048	NC_015183	GGC	2	6	571351	571356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292005
11049	NC_015183	ACCA	2	8	571357	571364	50 %	0 %	0 %	50 %	325292005
11050	NC_015183	CCA	2	6	571369	571374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292005
11051	NC_015183	GGC	2	6	571448	571453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292005
11052	NC_015183	GGC	2	6	571478	571483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292005
11053	NC_015183	GAA	3	9	571510	571518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292005
11054	NC_015183	GAT	2	6	571727	571732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292006
11055	NC_015183	TGC	2	6	571819	571824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292006
11056	NC_015183	GGC	2	6	571838	571843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292006
11057	NC_015183	GCA	2	6	571879	571884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292006
11058	NC_015183	GTC	2	6	571919	571924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292006
11059	NC_015183	AGA	2	6	571960	571965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292006
11060	NC_015183	CCG	2	6	571981	571986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292006
11061	NC_015183	GAA	2	6	572030	572035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292006
11062	NC_015183	CGT	2	6	572048	572053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292006
11063	NC_015183	CGA	2	6	572062	572067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292006
11064	NC_015183	GTG	2	6	572133	572138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292006
11065	NC_015183	GCC	2	6	572261	572266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292006
11066	NC_015183	GCC	2	6	572274	572279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292006
11067	NC_015183	GGT	2	6	572326	572331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292006
11068	NC_015183	AAAG	2	8	572350	572357	75 %	0 %	25 %	0 %	325292006
11069	NC_015183	GGCG	2	8	572396	572403	0 %	0 %	75 %	25 %	325292006
11070	NC_015183	GAC	2	6	572420	572425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292006
11071	NC_015183	TGC	2	6	572450	572455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292006
11072	NC_015183	ATA	2	6	572464	572469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292006
11073	NC_015183	TGG	2	6	572500	572505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292006
11074	NC_015183	TCG	2	6	572527	572532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292006
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11076	NC_015183	GGT	2	6	572597	572602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292006
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11078	NC_015183	CGG	2	6	572618	572623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292006
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11081	NC_015183	GGC	2	6	572713	572718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292006
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11083	NC_015183	CGCCC	2	10	572735	572744	0 %	0 %	20 %	80 %	325292006
11084	NC_015183	ACG	2	6	572766	572771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292006
11085	NC_015183	GCA	2	6	572798	572803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292006
11086	NC_015183	CGA	3	9	572812	572820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292006
11087	NC_015183	TTC	2	6	572847	572852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292006
11088	NC_015183	AG	3	6	573016	573021	50 %	0 %	50 %	0 %	325292006
11089	NC_015183	ATG	2	6	573042	573047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292006
11090	NC_015183	CTGC	2	8	573060	573067	0 %	25 %	25 %	50 %	325292006
11091	NC_015183	TCC	2	6	573098	573103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292007
11092	NC_015183	ATG	2	6	573246	573251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292007
11093	NC_015183	TGAGCA	2	12	573262	573273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325292007
11094	NC_015183	GC	3	6	573313	573318	0 %	0 %	50 %	50 %	325292007
11095	NC_015183	GC	3	6	573330	573335	0 %	0 %	50 %	50 %	325292007
11096	NC_015183	GCC	2	6	573392	573397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292007
11097	NC_015183	GC	5	10	573451	573460	0 %	0 %	50 %	50 %	325292007
11098	NC_015183	CGG	2	6	573499	573504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292007
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11100	NC_015183	GGC	2	6	573668	573673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292007
11101	NC_015183	GAC	2	6	573690	573695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292007
11102	NC_015183	GTG	3	9	573702	573710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292007
11103	NC_015183	GC	3	6	573757	573762	0 %	0 %	50 %	50 %	325292007
11104	NC_015183	GGAC	2	8	573814	573821	25 %	0 %	50 %	25 %	325292007
11105	NC_015183	GGC	2	6	573849	573854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292007
11106	NC_015183	AGC	2	6	574003	574008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292007
11107	NC_015183	GAAGT	2	10	574068	574077	40 %	20 %	40 %	0 %	325292007
11108	NC_015183	GGC	3	9	574091	574099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292007
11109	NC_015183	AAG	2	6	574113	574118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292007
11110	NC_015183	CAT	2	6	574543	574548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292008
11111	NC_015183	TGC	2	6	574593	574598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292009
11112	NC_015183	CT	3	6	574682	574687	0 %	50 %	0 %	50 %	325292009
11113	NC_015183	CGG	2	6	574741	574746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292009
11114	NC_015183	GAA	2	6	574790	574795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292009
11115	NC_015183	AAG	2	6	574808	574813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292009
11116	NC_015183	GTC	2	6	574829	574834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292009
11117	NC_015183	TGA	2	6	574884	574889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292009
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11119	NC_015183	CGG	2	6	574927	574932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292009
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11226	NC_015183	GAT	2	6	580119	580124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292014
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11230	NC_015183	GGGGCA	2	12	580247	580258	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	325292015
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11233	NC_015183	CCT	2	6	580299	580304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292015
11234	NC_015183	GCG	2	6	580335	580340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292015
11235	NC_015183	GC	3	6	580404	580409	0 %	0 %	50 %	50 %	325292015
11236	NC_015183	CGAC	2	8	580439	580446	25 %	0 %	25 %	50 %	325292015
11237	NC_015183	GAT	2	6	580467	580472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292015
11238	NC_015183	CGA	2	6	580575	580580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292015
11239	NC_015183	CG	3	6	580609	580614	0 %	0 %	50 %	50 %	325292015
11240	NC_015183	ATC	2	6	580619	580624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292015
11241	NC_015183	TCG	2	6	580634	580639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292015
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11243	NC_015183	GAA	2	6	580780	580785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292015
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11245	NC_015183	TCGGA	2	10	580917	580926	20 %	20 %	40 %	20 %	325292015
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11252	NC_015183	CTG	2	6	581242	581247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292015
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11256	NC_015183	GCA	2	6	581465	581470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292015
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11348	NC_015183	GAAGA	2	10	586299	586308	60 %	0 %	40 %	0 %	325292021
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11351	NC_015183	GC	3	6	586441	586446	0 %	0 %	50 %	50 %	325292021
11352	NC_015183	TGA	3	9	586451	586459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292021
11353	NC_015183	CTG	2	6	586530	586535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292021
11354	NC_015183	GC	3	6	586539	586544	0 %	0 %	50 %	50 %	325292021
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