MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015138	AGCGC	2	10	673229	673238	20 %	0 %	40 %	40 %	326315448
17002	NC_015138	CGA	2	6	673245	673250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17003	NC_015138	CCG	2	6	673257	673262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
17004	NC_015138	GTG	2	6	673321	673326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315448
17005	NC_015138	GC	3	6	673347	673352	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17006	NC_015138	GC	3	6	673417	673422	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17007	NC_015138	GGA	2	6	673503	673508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315448
17008	NC_015138	GC	3	6	673516	673521	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17009	NC_015138	GGA	2	6	673569	673574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315448
17010	NC_015138	CGG	2	6	673617	673622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
17011	NC_015138	CG	3	6	673668	673673	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17012	NC_015138	CCGTGC	2	12	673676	673687	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326315448
17013	NC_015138	CG	4	8	673719	673726	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17014	NC_015138	GC	3	6	673777	673782	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17015	NC_015138	CGC	3	9	673800	673808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
17016	NC_015138	ACG	3	9	673814	673822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17017	NC_015138	CGCC	2	8	673835	673842	0 %	0 %	25 %	75 %	326315448
17018	NC_015138	CGC	2	6	673865	673870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
17019	NC_015138	GC	4	8	673869	673876	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17020	NC_015138	GC	3	6	673891	673896	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17021	NC_015138	CGCAC	2	10	673913	673922	20 %	0 %	20 %	60 %	326315448
17022	NC_015138	ATC	2	6	673942	673947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315448
17023	NC_015138	GCG	2	6	673951	673956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
17024	NC_015138	CAT	2	6	673995	674000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315448
17025	NC_015138	TGA	2	6	674009	674014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315448
17026	NC_015138	GCG	3	9	674036	674044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
17027	NC_015138	CGC	2	6	674129	674134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
17028	NC_015138	CAG	2	6	674137	674142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17029	NC_015138	CCA	2	6	674147	674152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315448
17030	NC_015138	CTT	2	6	674154	674159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315448
17031	NC_015138	CGG	2	6	674241	674246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
17032	NC_015138	GC	3	6	674268	674273	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17033	NC_015138	GCTG	2	8	674285	674292	0 %	25 %	50 %	25 %	326315448
17034	NC_015138	GGT	2	6	674328	674333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315448
17035	NC_015138	CGAGGC	2	12	674337	674348	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326315448
17036	NC_015138	TCG	2	6	674482	674487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17037	NC_015138	CTG	2	6	674518	674523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17038	NC_015138	GGGCGA	2	12	674556	674567	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	326315448
17039	NC_015138	CTG	2	6	674623	674628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17040	NC_015138	CAC	2	6	674652	674657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315448
17041	NC_015138	TGC	2	6	674678	674683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17042	NC_015138	GAA	2	6	674703	674708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315448
17043	NC_015138	CG	3	6	674815	674820	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17044	NC_015138	CG	3	6	674933	674938	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17045	NC_015138	GTG	2	6	674983	674988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315448
17046	NC_015138	CCG	2	6	675012	675017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
17047	NC_015138	CGG	2	6	675057	675062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
17048	NC_015138	GCA	2	6	675096	675101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17049	NC_015138	CGGC	2	8	675249	675256	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17050	NC_015138	CACC	2	8	675273	675280	25 %	0 %	0 %	75 %	326315448
17051	NC_015138	ATC	2	6	675343	675348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315448
17052	NC_015138	GCC	2	6	675446	675451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
17053	NC_015138	CAG	2	6	675501	675506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17054	NC_015138	CCG	2	6	675514	675519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
17055	NC_015138	GCC	2	6	675551	675556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
17056	NC_015138	TCA	2	6	675590	675595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315448
17057	NC_015138	CGC	2	6	675596	675601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
17058	NC_015138	TGCTCA	2	12	675641	675652	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	326315448
17059	NC_015138	CGG	2	6	675663	675668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
17060	NC_015138	GAC	2	6	675691	675696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17061	NC_015138	GC	4	8	675702	675709	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17062	NC_015138	GC	3	6	675752	675757	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17063	NC_015138	CCGC	2	8	675761	675768	0 %	0 %	25 %	75 %	326315448
17064	NC_015138	GGT	2	6	675771	675776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315448
17065	NC_015138	TGA	2	6	675803	675808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315448
17066	NC_015138	CG	3	6	675863	675868	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17067	NC_015138	CG	3	6	675890	675895	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
17068	NC_015138	CCCA	2	8	675907	675914	25 %	0 %	0 %	75 %	326315448
17069	NC_015138	CGG	2	6	675921	675926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
17070	NC_015138	ACT	2	6	675953	675958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315448
17071	NC_015138	CGA	2	6	675981	675986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
17072	NC_015138	TGC	2	6	675995	676000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315448
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17074	NC_015138	CAA	2	6	676205	676210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315449
17075	NC_015138	CGG	2	6	676271	676276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315449
17076	NC_015138	GCG	2	6	676283	676288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315449
17077	NC_015138	CGCGC	2	10	676304	676313	0 %	0 %	40 %	60 %	326315449
17078	NC_015138	TGA	2	6	676336	676341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315449
17079	NC_015138	CCAACC	2	12	676351	676362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315449
17080	NC_015138	CGA	2	6	676373	676378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315449
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17082	NC_015138	CG	3	6	676448	676453	0 %	0 %	50 %	50 %	326315449
17083	NC_015138	ATG	2	6	676608	676613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315449
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17085	NC_015138	GAG	2	6	676692	676697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315449
17086	NC_015138	AAG	2	6	676767	676772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315449
17087	NC_015138	CTA	2	6	676775	676780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315449
17088	NC_015138	TCT	2	6	676813	676818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315449
17089	NC_015138	GT	3	6	676851	676856	0 %	50 %	50 %	0 %	326315449
17090	NC_015138	TGC	2	6	676894	676899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315449
17091	NC_015138	ACG	2	6	676903	676908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315449
17092	NC_015138	GCGACC	2	12	676942	676953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326315449
17093	NC_015138	CG	3	6	676959	676964	0 %	0 %	50 %	50 %	326315449
17094	NC_015138	TGGA	2	8	677040	677047	25 %	25 %	50 %	0 %	326315449
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17099	NC_015138	GGT	2	6	677282	677287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315449
17100	NC_015138	GC	4	8	677288	677295	0 %	0 %	50 %	50 %	326315449
17101	NC_015138	GC	3	6	677315	677320	0 %	0 %	50 %	50 %	326315449
17102	NC_015138	AGC	2	6	677344	677349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315449
17103	NC_015138	GGA	2	6	677399	677404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315449
17104	NC_015138	CAC	2	6	677456	677461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315449
17105	NC_015138	GCG	2	6	677497	677502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315449
17106	NC_015138	GCT	2	6	677527	677532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315449
17107	NC_015138	GAA	2	6	677570	677575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315449
17108	NC_015138	CCA	2	6	677615	677620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315450
17109	NC_015138	GGC	2	6	677640	677645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315450
17110	NC_015138	GCCG	2	8	677650	677657	0 %	0 %	50 %	50 %	326315450
17111	NC_015138	GC	3	6	677690	677695	0 %	0 %	50 %	50 %	326315450
17112	NC_015138	GC	4	8	677721	677728	0 %	0 %	50 %	50 %	326315450
17113	NC_015138	GCT	2	6	677748	677753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315450
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17115	NC_015138	CCGCG	2	10	677779	677788	0 %	0 %	40 %	60 %	326315450
17116	NC_015138	CGCC	2	8	677796	677803	0 %	0 %	25 %	75 %	326315450
17117	NC_015138	GTT	2	6	677859	677864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315450
17118	NC_015138	GC	3	6	677874	677879	0 %	0 %	50 %	50 %	326315450
17119	NC_015138	CG	3	6	677918	677923	0 %	0 %	50 %	50 %	326315450
17120	NC_015138	CTG	3	9	677974	677982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315450
17121	NC_015138	CGG	2	6	678011	678016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315450
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17124	NC_015138	GCC	2	6	678088	678093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315450
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17187	NC_015138	GC	3	6	679857	679862	0 %	0 %	50 %	50 %	326315452
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17213	NC_015138	TGC	2	6	680512	680517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315453
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17222	NC_015138	CGATC	2	10	680873	680882	20 %	20 %	20 %	40 %	326315454
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17224	NC_015138	AGC	2	6	680920	680925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315454
17225	NC_015138	TGC	2	6	680941	680946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315454
17226	NC_015138	GC	3	6	681054	681059	0 %	0 %	50 %	50 %	326315454
17227	NC_015138	CAT	2	6	681101	681106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315454
17228	NC_015138	GCG	2	6	681111	681116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315454
17229	NC_015138	TCA	2	6	681139	681144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315454
17230	NC_015138	GCG	2	6	681242	681247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315454
17231	NC_015138	CGG	3	9	681248	681256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315454
17232	NC_015138	CCGC	2	8	681281	681288	0 %	0 %	25 %	75 %	326315454
17233	NC_015138	GCG	2	6	681289	681294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315454
17234	NC_015138	CGC	2	6	681390	681395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315454
17235	NC_015138	GC	3	6	681397	681402	0 %	0 %	50 %	50 %	326315454
17236	NC_015138	TGC	2	6	681412	681417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315454
17237	NC_015138	ACC	2	6	681424	681429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315454
17238	NC_015138	TCA	2	6	681445	681450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315454
17239	NC_015138	AAC	2	6	681477	681482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315454
17240	NC_015138	CG	3	6	681560	681565	0 %	0 %	50 %	50 %	326315454
17241	NC_015138	GC	3	6	681602	681607	0 %	0 %	50 %	50 %	326315454
17242	NC_015138	ACA	2	6	681724	681729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315454
17243	NC_015138	CGG	2	6	681775	681780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315454
17244	NC_015138	TGA	2	6	681790	681795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315454
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17248	NC_015138	CTT	2	6	681887	681892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315454
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17252	NC_015138	AGTGG	2	10	682007	682016	20 %	20 %	60 %	0 %	326315454
17253	NC_015138	CGC	2	6	682019	682024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315454
17254	NC_015138	GC	3	6	682027	682032	0 %	0 %	50 %	50 %	326315454
17255	NC_015138	CGA	2	6	682043	682048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315454
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17270	NC_015138	GC	3	6	682442	682447	0 %	0 %	50 %	50 %	326315454
17271	NC_015138	CTG	2	6	682470	682475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315454
17272	NC_015138	GCGT	2	8	682531	682538	0 %	25 %	50 %	25 %	326315454
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17274	NC_015138	GCGCA	2	10	682572	682581	20 %	0 %	40 %	40 %	326315454
17275	NC_015138	TGC	3	9	682582	682590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315454
17276	NC_015138	CTG	2	6	682644	682649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315454
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17341	NC_015138	GACC	2	8	684961	684968	25 %	0 %	25 %	50 %	326315455
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17356	NC_015138	GCCG	2	8	685321	685328	0 %	0 %	50 %	50 %	326315455
17357	NC_015138	GAG	2	6	685343	685348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315455
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17478	NC_015138	GCG	2	6	690271	690276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315459
17479	NC_015138	CTG	2	6	690282	690287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
17480	NC_015138	CTG	2	6	690297	690302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
17481	NC_015138	GCT	2	6	690305	690310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
17482	NC_015138	TGG	2	6	690348	690353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315459
17483	NC_015138	CTG	2	6	690363	690368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
17484	NC_015138	CGTG	2	8	690373	690380	0 %	25 %	50 %	25 %	326315459
17485	NC_015138	GCT	2	6	690383	690388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
17486	NC_015138	GCT	2	6	690455	690460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
17487	NC_015138	GCTGC	2	10	690473	690482	0 %	20 %	40 %	40 %	326315459
17488	NC_015138	GCC	2	6	690489	690494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315459
17489	NC_015138	TTC	2	6	690522	690527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315459
17490	NC_015138	TCT	2	6	690532	690537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315459
17491	NC_015138	CAG	2	6	690546	690551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315459
17492	NC_015138	GTG	2	6	690684	690689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315459
17493	NC_015138	CCA	2	6	690731	690736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315459
17494	NC_015138	TGC	2	6	690751	690756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
17495	NC_015138	CT	3	6	690846	690851	0 %	50 %	0 %	50 %	326315459
17496	NC_015138	CGGCG	2	10	690881	690890	0 %	0 %	60 %	40 %	326315459
17497	NC_015138	G	6	6	690909	690914	0 %	0 %	100 %	0 %	326315459
17498	NC_015138	CTT	2	6	690917	690922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315459
17499	NC_015138	CAC	3	9	691123	691131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315460
17500	NC_015138	GTC	2	6	691168	691173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315460

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