MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_015138	C	7	7	613907	613913	0 %	0 %	0 %	100 %	326315386
15502	NC_015138	GGCT	2	8	613967	613974	0 %	25 %	50 %	25 %	326315386
15503	NC_015138	GCT	4	12	613972	613983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315386
15504	NC_015138	CTG	2	6	614039	614044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315386
15505	NC_015138	TGC	2	6	614087	614092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315386
15506	NC_015138	CAC	2	6	614233	614238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315386
15507	NC_015138	GGTG	2	8	614377	614384	0 %	25 %	75 %	0 %	326315386
15508	NC_015138	CGC	2	6	614394	614399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315386
15509	NC_015138	CTGG	2	8	614407	614414	0 %	25 %	50 %	25 %	326315386
15510	NC_015138	CTG	2	6	614428	614433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315386
15511	NC_015138	TGG	2	6	614463	614468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315386
15512	NC_015138	CGA	3	9	614473	614481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315386
15513	NC_015138	ACG	2	6	614526	614531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315386
15514	NC_015138	CTGGGC	2	12	614572	614583	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326315386
15515	NC_015138	GCC	2	6	614627	614632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315386
15516	NC_015138	TGC	2	6	614634	614639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315386
15517	NC_015138	TGGCA	2	10	614646	614655	20 %	20 %	40 %	20 %	326315386
15518	NC_015138	GCACC	2	10	614671	614680	20 %	0 %	20 %	60 %	326315386
15519	NC_015138	CTGG	2	8	614716	614723	0 %	25 %	50 %	25 %	326315386
15520	NC_015138	CGCTG	2	10	614760	614769	0 %	20 %	40 %	40 %	326315386
15521	NC_015138	GCT	2	6	614784	614789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315387
15522	NC_015138	TGC	2	6	614807	614812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315387
15523	NC_015138	GCCG	2	8	614817	614824	0 %	0 %	50 %	50 %	326315387
15524	NC_015138	GCA	2	6	614832	614837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315387
15525	NC_015138	GC	3	6	614886	614891	0 %	0 %	50 %	50 %	326315387
15526	NC_015138	GCCC	2	8	614940	614947	0 %	0 %	25 %	75 %	326315387
15527	NC_015138	CCG	2	6	615023	615028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315387
15528	NC_015138	CCCG	2	8	615050	615057	0 %	0 %	25 %	75 %	326315387
15529	NC_015138	GCC	2	6	615082	615087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315387
15530	NC_015138	GAT	2	6	615097	615102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315387
15531	NC_015138	GGGC	2	8	615132	615139	0 %	0 %	75 %	25 %	326315387
15532	NC_015138	CAG	2	6	615196	615201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315387
15533	NC_015138	CG	4	8	615209	615216	0 %	0 %	50 %	50 %	326315387
15534	NC_015138	TGG	2	6	615236	615241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315387
15535	NC_015138	CGA	2	6	615246	615251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315387
15536	NC_015138	GCG	2	6	615258	615263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315387
15537	NC_015138	GC	4	8	615294	615301	0 %	0 %	50 %	50 %	326315387
15538	NC_015138	CGG	2	6	615321	615326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315387
15539	NC_015138	GC	3	6	615334	615339	0 %	0 %	50 %	50 %	326315387
15540	NC_015138	GC	3	6	615384	615389	0 %	0 %	50 %	50 %	326315387
15541	NC_015138	GGC	2	6	615453	615458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315387
15542	NC_015138	GC	3	6	615457	615462	0 %	0 %	50 %	50 %	326315387
15543	NC_015138	GTC	2	6	615485	615490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315387
15544	NC_015138	GGC	2	6	615510	615515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315387
15545	NC_015138	GTT	2	6	615528	615533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315387
15546	NC_015138	CCA	2	6	615546	615551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315387
15547	NC_015138	GAC	2	6	615583	615588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315387
15548	NC_015138	CAG	2	6	615642	615647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315388
15549	NC_015138	CCA	2	6	615662	615667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315388
15550	NC_015138	CGA	2	6	615722	615727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315388
15551	NC_015138	CAG	2	6	615732	615737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315388
15552	NC_015138	GGC	2	6	615744	615749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315388
15553	NC_015138	GC	3	6	615777	615782	0 %	0 %	50 %	50 %	326315388
15554	NC_015138	CCA	2	6	615857	615862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315388
15555	NC_015138	CAGC	2	8	615881	615888	25 %	0 %	25 %	50 %	326315388
15556	NC_015138	CCA	2	6	615908	615913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315388
15557	NC_015138	GGC	3	9	615939	615947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315388
15558	NC_015138	CCA	2	6	615956	615961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315388
15559	NC_015138	AAG	2	6	616002	616007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315388
15560	NC_015138	GC	3	6	616247	616252	0 %	0 %	50 %	50 %	326315389
15561	NC_015138	GTG	2	6	616266	616271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315389
15562	NC_015138	GCACCT	2	12	616296	616307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326315389
15563	NC_015138	CTG	2	6	616312	616317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15564	NC_015138	TTC	2	6	616345	616350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315389
15565	NC_015138	GA	3	6	616434	616439	50 %	0 %	50 %	0 %	326315389
15566	NC_015138	GTC	2	6	616444	616449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15567	NC_015138	TGA	2	6	616455	616460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315389
15568	NC_015138	GCC	2	6	616487	616492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315389
15569	NC_015138	CTG	2	6	616570	616575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15570	NC_015138	GC	3	6	616603	616608	0 %	0 %	50 %	50 %	326315389
15571	NC_015138	ACCA	2	8	616670	616677	50 %	0 %	0 %	50 %	326315389
15572	NC_015138	GCA	2	6	616692	616697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15573	NC_015138	CGCAGC	2	12	616790	616801	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326315389
15574	NC_015138	CAG	2	6	616828	616833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15575	NC_015138	CG	3	6	616923	616928	0 %	0 %	50 %	50 %	326315389
15576	NC_015138	GGT	2	6	616968	616973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315389
15577	NC_015138	CAGC	2	8	617071	617078	25 %	0 %	25 %	50 %	326315389
15578	NC_015138	CAG	2	6	617116	617121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15579	NC_015138	CGC	2	6	617125	617130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315389
15580	NC_015138	GC	3	6	617167	617172	0 %	0 %	50 %	50 %	326315389
15581	NC_015138	CAG	3	9	617179	617187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15582	NC_015138	CAGCGC	2	12	617191	617202	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326315389
15583	NC_015138	CAGGCC	2	12	617236	617247	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326315389
15584	NC_015138	AGC	2	6	617264	617269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15585	NC_015138	CCT	2	6	617286	617291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315389
15586	NC_015138	GCC	2	6	617297	617302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315389
15587	NC_015138	GCAG	2	8	617304	617311	25 %	0 %	50 %	25 %	326315389
15588	NC_015138	CGC	2	6	617320	617325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315389
15589	NC_015138	TGT	2	6	617346	617351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315389
15590	NC_015138	GCCG	2	8	617366	617373	0 %	0 %	50 %	50 %	326315389
15591	NC_015138	GTA	2	6	617377	617382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315389
15592	NC_015138	CAG	2	6	617398	617403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15593	NC_015138	CAG	2	6	617410	617415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15594	NC_015138	GC	3	6	617417	617422	0 %	0 %	50 %	50 %	326315389
15595	NC_015138	CG	3	6	617424	617429	0 %	0 %	50 %	50 %	326315389
15596	NC_015138	GGC	2	6	617436	617441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315389
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15598	NC_015138	GTA	2	6	617566	617571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315389
15599	NC_015138	CCA	2	6	617607	617612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315389
15600	NC_015138	CAG	2	6	617635	617640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15601	NC_015138	GCA	2	6	617646	617651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15602	NC_015138	CAG	2	6	617680	617685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315389
15603	NC_015138	CG	3	6	617887	617892	0 %	0 %	50 %	50 %	326315390
15604	NC_015138	GGCC	2	8	617910	617917	0 %	0 %	50 %	50 %	326315390
15605	NC_015138	GGT	2	6	617944	617949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315390
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15607	NC_015138	GCA	2	6	617976	617981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315390
15608	NC_015138	GCG	2	6	618001	618006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315390
15609	NC_015138	CAGGAA	2	12	618103	618114	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	326315390
15610	NC_015138	CTC	2	6	618166	618171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315390
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15614	NC_015138	GCGG	2	8	618243	618250	0 %	0 %	75 %	25 %	326315390
15615	NC_015138	GC	3	6	618302	618307	0 %	0 %	50 %	50 %	326315390
15616	NC_015138	GGC	2	6	618331	618336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315390
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15619	NC_015138	CCT	2	6	618414	618419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315390
15620	NC_015138	CAC	3	9	618445	618453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315390
15621	NC_015138	GC	3	6	618458	618463	0 %	0 %	50 %	50 %	326315390
15622	NC_015138	GTG	2	6	618502	618507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315390
15623	NC_015138	CG	3	6	618508	618513	0 %	0 %	50 %	50 %	326315390
15624	NC_015138	GGC	2	6	618517	618522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315390
15625	NC_015138	TCC	2	6	618530	618535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315390
15626	NC_015138	ACC	2	6	618545	618550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315390
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15628	NC_015138	ATG	2	6	618593	618598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315390
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15632	NC_015138	CCGCA	2	10	618800	618809	20 %	0 %	20 %	60 %	326315391
15633	NC_015138	GC	3	6	618818	618823	0 %	0 %	50 %	50 %	326315391
15634	NC_015138	AGC	2	6	618842	618847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315391
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15636	NC_015138	GGC	2	6	618941	618946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315391
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15644	NC_015138	GCC	2	6	619080	619085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315391
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15651	NC_015138	GC	3	6	619320	619325	0 %	0 %	50 %	50 %	326315391
15652	NC_015138	CAC	2	6	619346	619351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315391
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15657	NC_015138	G	6	6	619423	619428	0 %	0 %	100 %	0 %	326315391
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15738	NC_015138	GCT	2	6	622576	622581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315394
15739	NC_015138	ACC	2	6	622604	622609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315394
15740	NC_015138	CAT	2	6	622618	622623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315394
15741	NC_015138	CG	3	6	622680	622685	0 %	0 %	50 %	50 %	326315394
15742	NC_015138	CCA	2	6	622849	622854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315394
15743	NC_015138	GC	3	6	622864	622869	0 %	0 %	50 %	50 %	326315394
15744	NC_015138	CAGAAG	2	12	622889	622900	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	326315394
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15747	NC_015138	CCA	2	6	623017	623022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315394
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15751	NC_015138	GCCGT	2	10	623109	623118	0 %	20 %	40 %	40 %	326315394
15752	NC_015138	CCG	2	6	623130	623135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315394
15753	NC_015138	CCTG	2	8	623203	623210	0 %	25 %	25 %	50 %	326315394
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15755	NC_015138	CGG	2	6	623239	623244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315394
15756	NC_015138	GC	3	6	623264	623269	0 %	0 %	50 %	50 %	326315394
15757	NC_015138	GTCG	2	8	623317	623324	0 %	25 %	50 %	25 %	326315394
15758	NC_015138	GTG	2	6	623357	623362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315394
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15763	NC_015138	CTG	2	6	623525	623530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315394
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15856	NC_015138	CGA	2	6	627509	627514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315398
15857	NC_015138	GAA	2	6	627527	627532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315398
15858	NC_015138	CTG	2	6	627579	627584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315398
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15861	NC_015138	CG	4	8	627897	627904	0 %	0 %	50 %	50 %	326315399
15862	NC_015138	CGT	2	6	627912	627917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315399
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15865	NC_015138	CCA	2	6	627962	627967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315399
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15877	NC_015138	CCCG	2	8	628351	628358	0 %	0 %	25 %	75 %	326315399
15878	NC_015138	CG	4	8	628435	628442	0 %	0 %	50 %	50 %	326315399
15879	NC_015138	GTGG	2	8	628467	628474	0 %	25 %	75 %	0 %	326315399
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15887	NC_015138	GCA	2	6	628784	628789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315399
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15953	NC_015138	TCG	2	6	632120	632125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315406
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15962	NC_015138	TGGGCA	2	12	632630	632641	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	326315407
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15964	NC_015138	TCCA	2	8	632731	632738	25 %	25 %	0 %	50 %	326315407
15965	NC_015138	CAT	2	6	632805	632810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315407
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15972	NC_015138	CAA	2	6	633158	633163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315408
15973	NC_015138	TGA	2	6	633197	633202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315409
15974	NC_015138	GGC	2	6	633355	633360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315409
15975	NC_015138	CTG	2	6	633409	633414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315409
15976	NC_015138	GTG	2	6	633499	633504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315409
15977	NC_015138	GGT	2	6	633519	633524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315409
15978	NC_015138	TCA	2	6	633530	633535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315409
15979	NC_015138	GCG	2	6	633539	633544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315409
15980	NC_015138	CGG	2	6	633584	633589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315409
15981	NC_015138	GCC	2	6	633610	633615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315409
15982	NC_015138	GGC	2	6	633616	633621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315409
15983	NC_015138	GCCTG	2	10	633623	633632	0 %	20 %	40 %	40 %	326315409
15984	NC_015138	CTG	3	9	633730	633738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315410
15985	NC_015138	CA	3	6	633764	633769	50 %	0 %	0 %	50 %	326315410
15986	NC_015138	GCA	2	6	633801	633806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315410
15987	NC_015138	ATC	2	6	633922	633927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315410
15988	NC_015138	TGA	2	6	633935	633940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315410
15989	NC_015138	GAA	2	6	633969	633974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315410
15990	NC_015138	CGC	2	6	633991	633996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315410
15991	NC_015138	CCG	2	6	634079	634084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315410
15992	NC_015138	GGCTTC	2	12	634102	634113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315410
15993	NC_015138	GGT	2	6	634125	634130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315410
15994	NC_015138	CGGC	2	8	634139	634146	0 %	0 %	50 %	50 %	326315410
15995	NC_015138	TCT	2	6	634217	634222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315410
15996	NC_015138	CGGC	2	8	634232	634239	0 %	0 %	50 %	50 %	326315410
15997	NC_015138	CGG	2	6	634254	634259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315410
15998	NC_015138	CTG	2	6	634261	634266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315410
15999	NC_015138	GGC	2	6	634299	634304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315410
16000	NC_015138	TGC	2	6	634316	634321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315410

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