MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
134001	NC_015138	TCG	2	6	5345475	5345480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319444
134002	NC_015138	GCG	2	6	5345520	5345525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319444
134003	NC_015138	CCA	2	6	5345550	5345555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319444
134004	NC_015138	CGT	2	6	5345614	5345619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319444
134005	NC_015138	GCC	2	6	5345628	5345633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319444
134006	NC_015138	GACC	2	8	5345710	5345717	25 %	0 %	25 %	50 %	326319444
134007	NC_015138	CAC	2	6	5345737	5345742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319444
134008	NC_015138	GCC	2	6	5345778	5345783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319444
134009	NC_015138	GCG	2	6	5345793	5345798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319444
134010	NC_015138	GGC	3	9	5345810	5345818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319444
134011	NC_015138	GAC	2	6	5345822	5345827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319444
134012	NC_015138	GGC	2	6	5345828	5345833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319444
134013	NC_015138	GGT	2	6	5345837	5345842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319444
134014	NC_015138	CGA	2	6	5345845	5345850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319444
134015	NC_015138	CGG	3	9	5345857	5345865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319444
134016	NC_015138	CG	3	6	5345884	5345889	0 %	0 %	50 %	50 %	326319444
134017	NC_015138	GGC	2	6	5345905	5345910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319444
134018	NC_015138	CGGC	2	8	5345918	5345925	0 %	0 %	50 %	50 %	326319444
134019	NC_015138	CG	4	8	5345967	5345974	0 %	0 %	50 %	50 %	326319444
134020	NC_015138	GTACTT	2	12	5346193	5346204	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	326319445
134021	NC_015138	GTC	2	6	5346293	5346298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134022	NC_015138	T	7	7	5346312	5346318	0 %	100 %	0 %	0 %	326319445
134023	NC_015138	TCG	2	6	5346326	5346331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134024	NC_015138	CGC	2	6	5346343	5346348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319445
134025	NC_015138	CGT	2	6	5346369	5346374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134026	NC_015138	TCG	3	9	5346386	5346394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134027	NC_015138	CGC	2	6	5346411	5346416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319445
134028	NC_015138	CCA	2	6	5346450	5346455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319445
134029	NC_015138	TGA	2	6	5346504	5346509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319445
134030	NC_015138	CAG	2	6	5346517	5346522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134031	NC_015138	CAC	2	6	5346544	5346549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319445
134032	NC_015138	TGG	2	6	5346552	5346557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319445
134033	NC_015138	CAG	2	6	5346583	5346588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134034	NC_015138	CAG	2	6	5346595	5346600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134035	NC_015138	TTC	2	6	5346629	5346634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319445
134036	NC_015138	TCG	2	6	5346650	5346655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134037	NC_015138	CAG	2	6	5346658	5346663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134038	NC_015138	CCA	2	6	5346705	5346710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319445
134039	NC_015138	ACC	2	6	5346722	5346727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319445
134040	NC_015138	GCCGA	2	10	5346728	5346737	20 %	0 %	40 %	40 %	326319445
134041	NC_015138	TCG	2	6	5346767	5346772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134042	NC_015138	TCT	3	9	5346774	5346782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319445
134043	NC_015138	CTT	2	6	5346796	5346801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319445
134044	NC_015138	CTT	2	6	5346837	5346842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319445
134045	NC_015138	GCA	2	6	5346871	5346876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134046	NC_015138	GCA	2	6	5347029	5347034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134047	NC_015138	TCC	2	6	5347058	5347063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326319445
134048	NC_015138	ACC	2	6	5347172	5347177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319445
134049	NC_015138	GCC	2	6	5347180	5347185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319445
134050	NC_015138	CTT	2	6	5347366	5347371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319445
134051	NC_015138	GCC	2	6	5347378	5347383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319445
134052	NC_015138	GCA	2	6	5347398	5347403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134053	NC_015138	TCA	2	6	5347428	5347433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326319445
134054	NC_015138	TCG	2	6	5347496	5347501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134055	NC_015138	TTG	2	6	5347562	5347567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326319445
134056	NC_015138	CTC	2	6	5347570	5347575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326319445
134057	NC_015138	CCG	2	6	5347593	5347598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319445
134058	NC_015138	GCC	2	6	5347604	5347609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319445
134059	NC_015138	ACC	2	6	5347628	5347633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319445
134060	NC_015138	GGC	2	6	5347642	5347647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319445
134061	NC_015138	GCCTG	2	10	5347662	5347671	0 %	20 %	40 %	40 %	326319445
134062	NC_015138	TTC	2	6	5347678	5347683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319445
134063	NC_015138	TCG	2	6	5347712	5347717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134064	NC_015138	GGC	2	6	5347758	5347763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319445
134065	NC_015138	TAG	2	6	5347769	5347774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319445
134066	NC_015138	CTG	2	6	5347804	5347809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134067	NC_015138	GC	3	6	5347844	5347849	0 %	0 %	50 %	50 %	326319445
134068	NC_015138	GCTG	2	8	5347999	5348006	0 %	25 %	50 %	25 %	326319445
134069	NC_015138	TGCG	2	8	5348093	5348100	0 %	25 %	50 %	25 %	326319445
134070	NC_015138	TCG	2	6	5348108	5348113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
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134073	NC_015138	GC	3	6	5348234	5348239	0 %	0 %	50 %	50 %	326319445
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134082	NC_015138	CGCA	2	8	5348500	5348507	25 %	0 %	25 %	50 %	326319445
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134086	NC_015138	GC	3	6	5348610	5348615	0 %	0 %	50 %	50 %	326319445
134087	NC_015138	ACC	2	6	5348747	5348752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319445
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134097	NC_015138	CCA	2	6	5348982	5348987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319445
134098	NC_015138	CTG	2	6	5349019	5349024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134099	NC_015138	CAG	2	6	5349049	5349054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134100	NC_015138	CAG	2	6	5349079	5349084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134101	NC_015138	CG	3	6	5349126	5349131	0 %	0 %	50 %	50 %	326319445
134102	NC_015138	GGCG	2	8	5349156	5349163	0 %	0 %	75 %	25 %	326319445
134103	NC_015138	GCA	3	9	5349186	5349194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
134104	NC_015138	GGTG	2	8	5349255	5349262	0 %	25 %	75 %	0 %	326319445
134105	NC_015138	CGA	2	6	5349273	5349278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319445
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134108	NC_015138	TGC	2	6	5349377	5349382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319446
134109	NC_015138	TCT	2	6	5349389	5349394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319446
134110	NC_015138	CAG	2	6	5349420	5349425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319446
134111	NC_015138	TGG	2	6	5349437	5349442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319446
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134113	NC_015138	TGC	2	6	5349541	5349546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319446
134114	NC_015138	GC	3	6	5349545	5349550	0 %	0 %	50 %	50 %	326319446
134115	NC_015138	GATGC	2	10	5349552	5349561	20 %	20 %	40 %	20 %	326319446
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134118	NC_015138	GTA	2	6	5349696	5349701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319446
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134122	NC_015138	TGA	2	6	5349863	5349868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319446
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134216	NC_015138	TCT	2	6	5354531	5354536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319451
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134219	NC_015138	GGT	2	6	5354664	5354669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319451
134220	NC_015138	TGG	2	6	5354672	5354677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319451
134221	NC_015138	CGCC	2	8	5354678	5354685	0 %	0 %	25 %	75 %	326319451
134222	NC_015138	CGCCA	2	10	5354693	5354702	20 %	0 %	20 %	60 %	326319451
134223	NC_015138	ATC	2	6	5354767	5354772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326319451
134224	NC_015138	CTT	2	6	5354817	5354822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319451
134225	NC_015138	CAGG	2	8	5354841	5354848	25 %	0 %	50 %	25 %	326319451
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134332	NC_015138	GGCCT	2	10	5358026	5358035	0 %	20 %	40 %	40 %	326319454
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134335	NC_015138	GCC	2	6	5358099	5358104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319454
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134337	NC_015138	GC	3	6	5358155	5358160	0 %	0 %	50 %	50 %	326319454
134338	NC_015138	GCCA	2	8	5358167	5358174	25 %	0 %	25 %	50 %	326319454
134339	NC_015138	GTG	3	9	5358203	5358211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319454
134340	NC_015138	GC	3	6	5358243	5358248	0 %	0 %	50 %	50 %	326319454
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134448	NC_015138	GCA	2	6	5362115	5362120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319457
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134450	NC_015138	GC	3	6	5362146	5362151	0 %	0 %	50 %	50 %	326319457
134451	NC_015138	CGG	2	6	5362166	5362171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319457
134452	NC_015138	GC	3	6	5362191	5362196	0 %	0 %	50 %	50 %	326319457
134453	NC_015138	CCA	2	6	5362247	5362252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319457
134454	NC_015138	GCG	2	6	5362412	5362417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319458
134455	NC_015138	GCT	3	9	5362445	5362453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319458
134456	NC_015138	TGG	2	6	5362456	5362461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319458
134457	NC_015138	GGC	2	6	5362473	5362478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319458
134458	NC_015138	ACCGCC	2	12	5362497	5362508	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	326319458
134459	NC_015138	TGC	2	6	5362519	5362524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319458
134460	NC_015138	TGC	2	6	5362534	5362539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319458
134461	NC_015138	TCCTGC	2	12	5362555	5362566	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	326319458
134462	NC_015138	GC	3	6	5362601	5362606	0 %	0 %	50 %	50 %	326319458
134463	NC_015138	CTG	2	6	5362641	5362646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319458
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