MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
133001	NC_015138	CG	3	6	5307872	5307877	0 %	0 %	50 %	50 %	326319413
133002	NC_015138	GCG	3	9	5307875	5307883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319413
133003	NC_015138	CTG	2	6	5307885	5307890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319413
133004	NC_015138	CGCC	2	8	5307945	5307952	0 %	0 %	25 %	75 %	326319414
133005	NC_015138	GCCA	2	8	5308004	5308011	25 %	0 %	25 %	50 %	326319414
133006	NC_015138	AGGA	2	8	5308175	5308182	50 %	0 %	50 %	0 %	326319414
133007	NC_015138	CGATCG	2	12	5308203	5308214	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326319414
133008	NC_015138	GGT	2	6	5308224	5308229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319414
133009	NC_015138	CGC	3	9	5308290	5308298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319415
133010	NC_015138	CAC	2	6	5308322	5308327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319415
133011	NC_015138	CGC	2	6	5308349	5308354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319415
133012	NC_015138	CGG	2	6	5308405	5308410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319415
133013	NC_015138	AGC	2	6	5308473	5308478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319415
133014	NC_015138	TGG	2	6	5308504	5308509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319415
133015	NC_015138	GCCA	2	8	5308542	5308549	25 %	0 %	25 %	50 %	326319415
133016	NC_015138	CAGC	2	8	5308577	5308584	25 %	0 %	25 %	50 %	326319415
133017	NC_015138	GCATCG	2	12	5308590	5308601	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326319415
133018	NC_015138	GGC	2	6	5308604	5308609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319415
133019	NC_015138	GCT	2	6	5308643	5308648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319415
133020	NC_015138	CTG	2	6	5308688	5308693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319415
133021	NC_015138	GC	3	6	5308700	5308705	0 %	0 %	50 %	50 %	326319415
133022	NC_015138	GCG	2	6	5308794	5308799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319415
133023	NC_015138	ATGC	2	8	5308802	5308809	25 %	25 %	25 %	25 %	326319415
133024	NC_015138	CAGGC	2	10	5308815	5308824	20 %	0 %	40 %	40 %	326319415
133025	NC_015138	CGA	2	6	5308846	5308851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319415
133026	NC_015138	CGGC	2	8	5308856	5308863	0 %	0 %	50 %	50 %	326319415
133027	NC_015138	GCA	3	9	5308876	5308884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319415
133028	NC_015138	GAA	2	6	5308904	5308909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326319415
133029	NC_015138	GCA	3	9	5308921	5308929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319415
133030	NC_015138	CAC	2	6	5309015	5309020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319415
133031	NC_015138	CCAGCG	2	12	5309021	5309032	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326319415
133032	NC_015138	CGG	2	6	5309035	5309040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319415
133033	NC_015138	GAA	2	6	5309051	5309056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326319415
133034	NC_015138	CGA	2	6	5309137	5309142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319415
133035	NC_015138	ACG	2	6	5309160	5309165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319415
133036	NC_015138	GCC	2	6	5309175	5309180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319415
133037	NC_015138	CG	3	6	5309188	5309193	0 %	0 %	50 %	50 %	326319415
133038	NC_015138	GCG	2	6	5309200	5309205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319415
133039	NC_015138	TGC	2	6	5309579	5309584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319416
133040	NC_015138	GC	3	6	5309642	5309647	0 %	0 %	50 %	50 %	326319416
133041	NC_015138	GCGCG	2	10	5309667	5309676	0 %	0 %	60 %	40 %	326319416
133042	NC_015138	CAG	2	6	5309680	5309685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319416
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133044	NC_015138	CGG	2	6	5309777	5309782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319416
133045	NC_015138	GGC	2	6	5309808	5309813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319416
133046	NC_015138	GC	3	6	5309812	5309817	0 %	0 %	50 %	50 %	326319416
133047	NC_015138	CG	4	8	5309826	5309833	0 %	0 %	50 %	50 %	326319416
133048	NC_015138	GCC	2	6	5309917	5309922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319416
133049	NC_015138	CGC	2	6	5309955	5309960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319416
133050	NC_015138	GCC	2	6	5309973	5309978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319416
133051	NC_015138	GCA	2	6	5309991	5309996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319416
133052	NC_015138	GAG	2	6	5310031	5310036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326319416
133053	NC_015138	CTG	2	6	5310037	5310042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319416
133054	NC_015138	CAC	2	6	5310043	5310048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319416
133055	NC_015138	GGT	2	6	5310102	5310107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319416
133056	NC_015138	CTG	2	6	5310139	5310144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319416
133057	NC_015138	GCC	2	6	5310183	5310188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319416
133058	NC_015138	GC	3	6	5310200	5310205	0 %	0 %	50 %	50 %	326319416
133059	NC_015138	GCA	2	6	5310216	5310221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319416
133060	NC_015138	GC	4	8	5310264	5310271	0 %	0 %	50 %	50 %	326319416
133061	NC_015138	GGCCG	2	10	5310300	5310309	0 %	0 %	60 %	40 %	326319416
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133068	NC_015138	CCG	2	6	5310497	5310502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319416
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133070	NC_015138	CTG	2	6	5310535	5310540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319416
133071	NC_015138	CTGGGC	3	18	5310553	5310570	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319416
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133074	NC_015138	ACG	2	6	5310656	5310661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319416
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133080	NC_015138	GCCAG	2	10	5310827	5310836	20 %	0 %	40 %	40 %	326319416
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133082	NC_015138	CCG	2	6	5310851	5310856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319416
133083	NC_015138	ACGC	2	8	5310902	5310909	25 %	0 %	25 %	50 %	326319416
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133089	NC_015138	GCA	2	6	5311221	5311226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319416
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133091	NC_015138	GGCG	2	8	5311248	5311255	0 %	0 %	75 %	25 %	326319416
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133097	NC_015138	CGA	2	6	5311452	5311457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319416
133098	NC_015138	GC	3	6	5311464	5311469	0 %	0 %	50 %	50 %	326319416
133099	NC_015138	CGG	2	6	5311490	5311495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319416
133100	NC_015138	CGA	2	6	5311497	5311502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319416
133101	NC_015138	GGGCC	2	10	5311536	5311545	0 %	0 %	60 %	40 %	326319416
133102	NC_015138	CCG	2	6	5311768	5311773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319417
133103	NC_015138	GCC	2	6	5311778	5311783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319417
133104	NC_015138	TCC	2	6	5311806	5311811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326319417
133105	NC_015138	GCC	2	6	5311845	5311850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319417
133106	NC_015138	CTG	2	6	5311866	5311871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319417
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133108	NC_015138	GCA	2	6	5311888	5311893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319417
133109	NC_015138	GCG	2	6	5311894	5311899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319417
133110	NC_015138	CGG	2	6	5311903	5311908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319417
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133112	NC_015138	CGG	2	6	5311937	5311942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319417
133113	NC_015138	CGA	2	6	5312015	5312020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319417
133114	NC_015138	CCG	2	6	5312029	5312034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319417
133115	NC_015138	CGC	2	6	5312051	5312056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319417
133116	NC_015138	CTGG	2	8	5312057	5312064	0 %	25 %	50 %	25 %	326319417
133117	NC_015138	ACG	2	6	5312091	5312096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319417
133118	NC_015138	CTGG	2	8	5312105	5312112	0 %	25 %	50 %	25 %	326319417
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133200	NC_015138	GGCAGC	2	12	5314885	5314896	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326319418
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133213	NC_015138	CAC	2	6	5315186	5315191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319419
133214	NC_015138	ACG	2	6	5315200	5315205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319419
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133216	NC_015138	CCA	2	6	5315290	5315295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319419
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133219	NC_015138	CAG	2	6	5315444	5315449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319419
133220	NC_015138	CCA	3	9	5315497	5315505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319419
133221	NC_015138	CCT	2	6	5315515	5315520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326319419
133222	NC_015138	ACGG	2	8	5315527	5315534	25 %	0 %	50 %	25 %	326319419
133223	NC_015138	CGC	3	9	5315545	5315553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319419
133224	NC_015138	GCC	2	6	5315587	5315592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319419
133225	NC_015138	GCA	2	6	5315599	5315604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319419
133226	NC_015138	AGC	2	6	5315649	5315654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319419
133227	NC_015138	GCC	3	9	5315703	5315711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319419
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133229	NC_015138	GCC	2	6	5315786	5315791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319419
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133335	NC_015138	CAT	2	6	5319941	5319946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326319423
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133339	NC_015138	CTG	2	6	5319990	5319995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319423
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133342	NC_015138	GAG	2	6	5320119	5320124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326319423
133343	NC_015138	CTG	2	6	5320134	5320139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319423
133344	NC_015138	GCG	2	6	5320177	5320182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319423
133345	NC_015138	CAT	2	6	5320205	5320210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326319423
133346	NC_015138	CG	3	6	5320221	5320226	0 %	0 %	50 %	50 %	326319423
133347	NC_015138	GCTG	2	8	5320261	5320268	0 %	25 %	50 %	25 %	326319423
133348	NC_015138	TCA	2	6	5320273	5320278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326319423
133349	NC_015138	TGA	2	6	5320321	5320326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319423
133350	NC_015138	GGC	2	6	5320332	5320337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319423
133351	NC_015138	CG	3	6	5320412	5320417	0 %	0 %	50 %	50 %	326319423
133352	NC_015138	TGC	2	6	5320435	5320440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319423
133353	NC_015138	GC	3	6	5320446	5320451	0 %	0 %	50 %	50 %	326319423
133354	NC_015138	CAC	2	6	5320604	5320609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319424
133355	NC_015138	GGC	2	6	5320631	5320636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319424
133356	NC_015138	CCAC	2	8	5320656	5320663	25 %	0 %	0 %	75 %	326319424
133357	NC_015138	GCCGG	2	10	5320683	5320692	0 %	0 %	60 %	40 %	326319424
133358	NC_015138	GCA	2	6	5320703	5320708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319424
133359	NC_015138	GGC	2	6	5320712	5320717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319424
133360	NC_015138	CG	3	6	5320727	5320732	0 %	0 %	50 %	50 %	326319424
133361	NC_015138	GCA	2	6	5320747	5320752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319424
133362	NC_015138	CAGC	2	8	5320784	5320791	25 %	0 %	25 %	50 %	326319424
133363	NC_015138	GCG	2	6	5320825	5320830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319424
133364	NC_015138	TGA	2	6	5320843	5320848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319424
133365	NC_015138	GTC	2	6	5320877	5320882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319424
133366	NC_015138	GCA	2	6	5320997	5321002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319424
133367	NC_015138	CCCA	2	8	5321106	5321113	25 %	0 %	0 %	75 %	326319424
133368	NC_015138	GCT	2	6	5321129	5321134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319424
133369	NC_015138	AGC	2	6	5321257	5321262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319424
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133371	NC_015138	GGT	2	6	5321297	5321302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319424
133372	NC_015138	AAG	3	9	5321310	5321318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326319424
133373	NC_015138	GCA	2	6	5321342	5321347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319424
133374	NC_015138	GCT	2	6	5321351	5321356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319424
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133377	NC_015138	A	6	6	5321590	5321595	100 %	0 %	0 %	0 %	326319425
133378	NC_015138	CG	4	8	5321603	5321610	0 %	0 %	50 %	50 %	326319425
133379	NC_015138	GCT	2	6	5321619	5321624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319425
133380	NC_015138	TGC	2	6	5321630	5321635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319425
133381	NC_015138	TGG	2	6	5321645	5321650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319425
133382	NC_015138	CGT	2	6	5321667	5321672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319425
133383	NC_015138	CTT	2	6	5321682	5321687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319425
133384	NC_015138	TCT	2	6	5321702	5321707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326319425
133385	NC_015138	GAG	2	6	5321710	5321715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326319425
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133387	NC_015138	TGA	2	6	5321765	5321770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319425
133388	NC_015138	ACGCTG	2	12	5321854	5321865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326319425
133389	NC_015138	CTG	2	6	5321868	5321873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319425
133390	NC_015138	TGC	2	6	5321876	5321881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319425
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133394	NC_015138	CTG	3	9	5321998	5322006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319425
133395	NC_015138	CG	3	6	5322044	5322049	0 %	0 %	50 %	50 %	326319425
133396	NC_015138	GACG	2	8	5322086	5322093	25 %	0 %	50 %	25 %	326319425
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133399	NC_015138	GCT	2	6	5322181	5322186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319426
133400	NC_015138	GCG	2	6	5322192	5322197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319426
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133403	NC_015138	TGA	2	6	5322315	5322320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319426
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133411	NC_015138	GCT	2	6	5322472	5322477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319426
133412	NC_015138	GAT	2	6	5322484	5322489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319426
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133414	NC_015138	CGC	2	6	5322532	5322537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319426
133415	NC_015138	CAT	2	6	5322544	5322549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326319426
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133417	NC_015138	GTG	2	6	5322581	5322586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319426
133418	NC_015138	GGC	2	6	5322595	5322600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319426
133419	NC_015138	ATG	2	6	5322650	5322655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319426
133420	NC_015138	GCGCTG	2	12	5322656	5322667	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319426
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133430	NC_015138	GCT	2	6	5322856	5322861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319426
133431	NC_015138	TGG	2	6	5322918	5322923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319426
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133433	NC_015138	TCA	2	6	5322984	5322989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326319426
133434	NC_015138	GCT	2	6	5323021	5323026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319426
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133440	NC_015138	AAC	2	6	5323202	5323207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326319426
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133443	NC_015138	GAC	2	6	5323280	5323285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319426
133444	NC_015138	TCA	2	6	5323287	5323292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326319426
133445	NC_015138	CTG	2	6	5323310	5323315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319426
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133447	NC_015138	CTG	2	6	5323427	5323432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319427
133448	NC_015138	ACG	2	6	5323464	5323469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319427
133449	NC_015138	GTG	2	6	5323499	5323504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319427
133450	NC_015138	TCG	3	9	5323524	5323532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319427
133451	NC_015138	GCCA	2	8	5323580	5323587	25 %	0 %	25 %	50 %	326319427
133452	NC_015138	CGA	2	6	5323594	5323599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319427
133453	NC_015138	GGGC	2	8	5323600	5323607	0 %	0 %	75 %	25 %	326319427
133454	NC_015138	ACC	2	6	5323671	5323676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319427
133455	NC_015138	TGC	3	9	5323740	5323748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319427
133456	NC_015138	GGC	2	6	5323799	5323804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319427
133457	NC_015138	CG	3	6	5323830	5323835	0 %	0 %	50 %	50 %	326319427
133458	NC_015138	CTG	2	6	5323862	5323867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319427
133459	NC_015138	CGACC	2	10	5323897	5323906	20 %	0 %	20 %	60 %	326319427
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133461	NC_015138	CCCGG	2	10	5323928	5323937	0 %	0 %	40 %	60 %	326319427
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133463	NC_015138	GCT	2	6	5323972	5323977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319427
133464	NC_015138	CGA	2	6	5323996	5324001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319427
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133479	NC_015138	CCGAGA	2	12	5324509	5324520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319428
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133491	NC_015138	GGAC	2	8	5325017	5325024	25 %	0 %	50 %	25 %	326319428
133492	NC_015138	CAA	3	9	5325050	5325058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326319428
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133494	NC_015138	AGC	3	9	5325157	5325165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319428
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