MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
131501	NC_015138	CAC	2	6	5247613	5247618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319365
131502	NC_015138	CCA	2	6	5247624	5247629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319365
131503	NC_015138	TTCG	2	8	5247679	5247686	0 %	50 %	25 %	25 %	326319365
131504	NC_015138	CAT	2	6	5247706	5247711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326319365
131505	NC_015138	GTA	2	6	5247742	5247747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319365
131506	NC_015138	GCCC	2	8	5247765	5247772	0 %	0 %	25 %	75 %	326319365
131507	NC_015138	CGCGC	2	10	5247774	5247783	0 %	0 %	40 %	60 %	326319365
131508	NC_015138	GTGC	2	8	5247811	5247818	0 %	25 %	50 %	25 %	326319365
131509	NC_015138	CGG	2	6	5247920	5247925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319365
131510	NC_015138	GGC	2	6	5247940	5247945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319365
131511	NC_015138	GCC	2	6	5247973	5247978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319365
131512	NC_015138	CGG	2	6	5248044	5248049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319365
131513	NC_015138	GCCA	2	8	5248097	5248104	25 %	0 %	25 %	50 %	326319365
131514	NC_015138	AGC	2	6	5248133	5248138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319365
131515	NC_015138	GCC	2	6	5248164	5248169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319365
131516	NC_015138	GC	3	6	5248198	5248203	0 %	0 %	50 %	50 %	326319365
131517	NC_015138	GC	3	6	5248206	5248211	0 %	0 %	50 %	50 %	326319365
131518	NC_015138	CCG	2	6	5248212	5248217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319365
131519	NC_015138	GGT	2	6	5248300	5248305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319366
131520	NC_015138	GCAG	2	8	5248311	5248318	25 %	0 %	50 %	25 %	326319366
131521	NC_015138	TCG	2	6	5248347	5248352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319366
131522	NC_015138	GCC	2	6	5248359	5248364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319366
131523	NC_015138	GCT	2	6	5248384	5248389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319366
131524	NC_015138	CCA	3	9	5248414	5248422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319366
131525	NC_015138	GCCG	2	8	5248441	5248448	0 %	0 %	50 %	50 %	326319366
131526	NC_015138	CGTG	2	8	5248453	5248460	0 %	25 %	50 %	25 %	326319366
131527	NC_015138	CG	3	6	5248502	5248507	0 %	0 %	50 %	50 %	326319366
131528	NC_015138	GC	3	6	5248509	5248514	0 %	0 %	50 %	50 %	326319366
131529	NC_015138	AGC	2	6	5248515	5248520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319366
131530	NC_015138	CGT	2	6	5248541	5248546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319366
131531	NC_015138	CAG	2	6	5248568	5248573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319366
131532	NC_015138	CGTG	2	8	5248590	5248597	0 %	25 %	50 %	25 %	326319366
131533	NC_015138	GC	3	6	5248685	5248690	0 %	0 %	50 %	50 %	326319366
131534	NC_015138	GCC	2	6	5248697	5248702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319366
131535	NC_015138	CGG	2	6	5248714	5248719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319366
131536	NC_015138	TCG	2	6	5248722	5248727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319366
131537	NC_015138	GC	3	6	5248775	5248780	0 %	0 %	50 %	50 %	326319366
131538	NC_015138	GTG	2	6	5248812	5248817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319366
131539	NC_015138	GTG	2	6	5248826	5248831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319366
131540	NC_015138	CGCAG	2	10	5248840	5248849	20 %	0 %	40 %	40 %	326319366
131541	NC_015138	GCC	2	6	5248859	5248864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319366
131542	NC_015138	CG	3	6	5248885	5248890	0 %	0 %	50 %	50 %	326319366
131543	NC_015138	GCC	2	6	5248995	5249000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319366
131544	NC_015138	CGC	2	6	5249008	5249013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319366
131545	NC_015138	TCC	2	6	5249025	5249030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326319366
131546	NC_015138	GGC	2	6	5249035	5249040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319366
131547	NC_015138	CCTGGA	2	12	5249059	5249070	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326319366
131548	NC_015138	GCG	3	9	5249091	5249099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319366
131549	NC_015138	TCA	2	6	5249101	5249106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326319366
131550	NC_015138	AGC	2	6	5249155	5249160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319367
131551	NC_015138	GGC	2	6	5249207	5249212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319367
131552	NC_015138	GCG	2	6	5249224	5249229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319367
131553	NC_015138	CG	4	8	5249238	5249245	0 %	0 %	50 %	50 %	326319367
131554	NC_015138	GGTC	2	8	5249253	5249260	0 %	25 %	50 %	25 %	326319367
131555	NC_015138	CGC	2	6	5249290	5249295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319367
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131559	NC_015138	GGT	2	6	5249500	5249505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319367
131560	NC_015138	CAG	2	6	5249626	5249631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319367
131561	NC_015138	CACGTT	2	12	5249674	5249685	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	326319367
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131564	NC_015138	CGC	2	6	5249871	5249876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319367
131565	NC_015138	CAG	2	6	5249878	5249883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319367
131566	NC_015138	GAT	2	6	5250037	5250042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326319367
131567	NC_015138	GTG	2	6	5250059	5250064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326319367
131568	NC_015138	CAG	2	6	5250082	5250087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319367
131569	NC_015138	CTC	2	6	5250091	5250096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326319367
131570	NC_015138	CTG	2	6	5250100	5250105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319367
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131572	NC_015138	GCC	2	6	5250154	5250159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319367
131573	NC_015138	TCG	2	6	5250164	5250169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319367
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131579	NC_015138	GC	4	8	5250358	5250365	0 %	0 %	50 %	50 %	326319367
131580	NC_015138	GCA	2	6	5250377	5250382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319367
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131582	NC_015138	GTCCAG	2	12	5250463	5250474	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326319367
131583	NC_015138	C	6	6	5250501	5250506	0 %	0 %	0 %	100 %	326319367
131584	NC_015138	GCCGAT	2	12	5250541	5250552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326319367
131585	NC_015138	GCA	2	6	5250561	5250566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319367
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131587	NC_015138	G	6	6	5250673	5250678	0 %	0 %	100 %	0 %	326319367
131588	NC_015138	CGG	2	6	5250732	5250737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319367
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131593	NC_015138	GCC	2	6	5251259	5251264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319367
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131596	NC_015138	TGC	2	6	5251481	5251486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319367
131597	NC_015138	CGG	2	6	5251492	5251497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319367
131598	NC_015138	CATAGG	2	12	5251500	5251511	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	326319367
131599	NC_015138	GGC	2	6	5251528	5251533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319367
131600	NC_015138	GCCG	2	8	5251618	5251625	0 %	0 %	50 %	50 %	326319367
131601	NC_015138	CG	3	6	5251689	5251694	0 %	0 %	50 %	50 %	326319367
131602	NC_015138	CGGCG	2	10	5251701	5251710	0 %	0 %	60 %	40 %	326319367
131603	NC_015138	CGC	2	6	5251716	5251721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319367
131604	NC_015138	GGA	2	6	5251756	5251761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326319367
131605	NC_015138	CGG	2	6	5251905	5251910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319367
131606	NC_015138	GCA	2	6	5251929	5251934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319367
131607	NC_015138	GACG	2	8	5251957	5251964	25 %	0 %	50 %	25 %	326319367
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131609	NC_015138	TCC	2	6	5252132	5252137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326319367
131610	NC_015138	ACG	2	6	5252138	5252143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319367
131611	NC_015138	GGC	2	6	5252196	5252201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319367
131612	NC_015138	GCC	2	6	5252219	5252224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319367
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131614	NC_015138	GCCAG	2	10	5252311	5252320	20 %	0 %	40 %	40 %	326319367
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131841	NC_015138	GATCC	2	10	5260600	5260609	20 %	20 %	20 %	40 %	326319369
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