MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015138	GCAGC	2	10	277176	277185	20 %	0 %	40 %	40 %	326315071
7002	NC_015138	TGA	2	6	277204	277209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315071
7003	NC_015138	CG	3	6	277214	277219	0 %	0 %	50 %	50 %	326315071
7004	NC_015138	GGC	2	6	277244	277249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315071
7005	NC_015138	TCG	3	9	277275	277283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315071
7006	NC_015138	GCGCGG	2	12	277297	277308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315071
7007	NC_015138	CG	3	6	277316	277321	0 %	0 %	50 %	50 %	326315071
7008	NC_015138	GCACC	2	10	277328	277337	20 %	0 %	20 %	60 %	326315071
7009	NC_015138	CGA	2	6	277415	277420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315071
7010	NC_015138	ACCG	2	8	277424	277431	25 %	0 %	25 %	50 %	326315071
7011	NC_015138	CTT	2	6	277456	277461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315071
7012	NC_015138	CCGC	2	8	277464	277471	0 %	0 %	25 %	75 %	326315071
7013	NC_015138	GCA	2	6	279591	279596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7014	NC_015138	GAG	2	6	279621	279626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315072
7015	NC_015138	ATG	2	6	279634	279639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315072
7016	NC_015138	AGC	2	6	279647	279652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7017	NC_015138	GC	3	6	279707	279712	0 %	0 %	50 %	50 %	326315072
7018	NC_015138	GCT	2	6	279809	279814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7019	NC_015138	CTT	2	6	279845	279850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315072
7020	NC_015138	ATCG	2	8	279944	279951	25 %	25 %	25 %	25 %	326315072
7021	NC_015138	GCC	2	6	279955	279960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315072
7022	NC_015138	AATG	2	8	279990	279997	50 %	25 %	25 %	0 %	326315072
7023	NC_015138	GC	3	6	279998	280003	0 %	0 %	50 %	50 %	326315072
7024	NC_015138	TTC	2	6	280024	280029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315072
7025	NC_015138	CAG	2	6	280054	280059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7026	NC_015138	TGGC	2	8	280076	280083	0 %	25 %	50 %	25 %	326315072
7027	NC_015138	TTTTC	2	10	280092	280101	0 %	80 %	0 %	20 %	326315072
7028	NC_015138	AG	3	6	280118	280123	50 %	0 %	50 %	0 %	326315072
7029	NC_015138	CGA	2	6	280130	280135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7030	NC_015138	AT	3	6	280155	280160	50 %	50 %	0 %	0 %	326315072
7031	NC_015138	GA	3	6	280194	280199	50 %	0 %	50 %	0 %	326315072
7032	NC_015138	CTG	2	6	280361	280366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7033	NC_015138	AG	3	6	280376	280381	50 %	0 %	50 %	0 %	326315072
7034	NC_015138	AT	4	8	280398	280405	50 %	50 %	0 %	0 %	326315072
7035	NC_015138	AAG	2	6	280444	280449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315072
7036	NC_015138	CTG	2	6	280521	280526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7037	NC_015138	GCC	2	6	280572	280577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315072
7038	NC_015138	CCCAT	2	10	280639	280648	20 %	20 %	0 %	60 %	326315072
7039	NC_015138	CGT	2	6	280704	280709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7040	NC_015138	AAG	2	6	280776	280781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315072
7041	NC_015138	TGG	2	6	280809	280814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315072
7042	NC_015138	ACT	2	6	280912	280917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315072
7043	NC_015138	CGC	2	6	280935	280940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315072
7044	NC_015138	CTGAAT	2	12	280965	280976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	326315072
7045	NC_015138	TGG	2	6	280993	280998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315072
7046	NC_015138	CAG	2	6	280999	281004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7047	NC_015138	A	6	6	281023	281028	100 %	0 %	0 %	0 %	326315072
7048	NC_015138	GCATG	2	10	281103	281112	20 %	20 %	40 %	20 %	326315072
7049	NC_015138	TTC	3	9	281238	281246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315072
7050	NC_015138	CGA	2	6	281270	281275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7051	NC_015138	TGC	2	6	281276	281281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7052	NC_015138	CA	3	6	281291	281296	50 %	0 %	0 %	50 %	326315072
7053	NC_015138	TGA	2	6	281387	281392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315072
7054	NC_015138	CTT	2	6	281471	281476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315072
7055	NC_015138	ATCT	2	8	281509	281516	25 %	50 %	0 %	25 %	326315072
7056	NC_015138	GCA	2	6	281547	281552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7057	NC_015138	TCG	2	6	281675	281680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315072
7058	NC_015138	TGA	2	6	281951	281956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315072
7059	NC_015138	AGT	2	6	282033	282038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315072
7060	NC_015138	GGC	2	6	282072	282077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315072
7061	NC_015138	TTA	2	6	282082	282087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326315072
7062	NC_015138	GAT	2	6	282186	282191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315072
7063	NC_015138	AGA	2	6	282288	282293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315072
7064	NC_015138	CAA	2	6	282296	282301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315072
7065	NC_015138	GCA	2	6	282654	282659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315073
7066	NC_015138	CCA	2	6	282686	282691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315073
7067	NC_015138	GC	3	6	282692	282697	0 %	0 %	50 %	50 %	326315073
7068	NC_015138	C	6	6	282707	282712	0 %	0 %	0 %	100 %	326315073
7069	NC_015138	GGC	2	6	282736	282741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315073
7070	NC_015138	GGC	2	6	282745	282750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315073
7071	NC_015138	CGG	2	6	282776	282781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315073
7072	NC_015138	G	6	6	282788	282793	0 %	0 %	100 %	0 %	326315073
7073	NC_015138	GGCC	2	8	282842	282849	0 %	0 %	50 %	50 %	326315073
7074	NC_015138	ACC	2	6	282868	282873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315073
7075	NC_015138	CGC	2	6	282893	282898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315073
7076	NC_015138	CAG	2	6	282954	282959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315073
7077	NC_015138	GGC	2	6	282966	282971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315073
7078	NC_015138	CGGGGG	2	12	282998	283009	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	326315073
7079	NC_015138	GGC	2	6	283025	283030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315073
7080	NC_015138	GGC	2	6	283073	283078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315073
7081	NC_015138	GAT	2	6	283101	283106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315073
7082	NC_015138	CAG	2	6	283125	283130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315073
7083	NC_015138	GC	4	8	283190	283197	0 %	0 %	50 %	50 %	326315073
7084	NC_015138	CCA	2	6	283205	283210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315073
7085	NC_015138	GGC	2	6	283259	283264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315073
7086	NC_015138	CCG	2	6	283298	283303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315073
7087	NC_015138	TCGCGC	2	12	283306	283317	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326315073
7088	NC_015138	AGC	2	6	283318	283323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315073
7089	NC_015138	GC	3	6	283326	283331	0 %	0 %	50 %	50 %	326315073
7090	NC_015138	GGCG	2	8	283364	283371	0 %	0 %	75 %	25 %	326315073
7091	NC_015138	GCTG	2	8	283376	283383	0 %	25 %	50 %	25 %	326315073
7092	NC_015138	GTG	2	6	283450	283455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315073
7093	NC_015138	GCGG	2	8	283464	283471	0 %	0 %	75 %	25 %	326315073
7094	NC_015138	GCC	2	6	283482	283487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315073
7095	NC_015138	TCA	2	6	283529	283534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315073
7096	NC_015138	CGC	2	6	283705	283710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315074
7097	NC_015138	TCGTCC	2	12	283717	283728	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	326315074
7098	NC_015138	GCC	2	6	283732	283737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315074
7099	NC_015138	CTG	2	6	283738	283743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315074
7100	NC_015138	GCCT	2	8	283747	283754	0 %	25 %	25 %	50 %	326315074
7101	NC_015138	GCC	3	9	283768	283776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315074
7102	NC_015138	GC	3	6	283778	283783	0 %	0 %	50 %	50 %	326315074
7103	NC_015138	TCA	2	6	283823	283828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315074
7104	NC_015138	GGC	2	6	283876	283881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315074
7105	NC_015138	TCG	2	6	283922	283927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315074
7106	NC_015138	GCT	2	6	283977	283982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315074
7107	NC_015138	CCA	4	12	284039	284050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315074
7108	NC_015138	GTG	2	6	284056	284061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315074
7109	NC_015138	CAG	2	6	284065	284070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315074
7110	NC_015138	TGG	2	6	284072	284077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315074
7111	NC_015138	GCT	2	6	284202	284207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315074
7112	NC_015138	GC	3	6	284220	284225	0 %	0 %	50 %	50 %	326315074
7113	NC_015138	CTG	3	9	284278	284286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315074
7114	NC_015138	GGCCG	2	10	284293	284302	0 %	0 %	60 %	40 %	326315074
7115	NC_015138	GAC	2	6	284317	284322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315074
7116	NC_015138	CCT	2	6	284345	284350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315074
7117	NC_015138	TGC	2	6	284375	284380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315074
7118	NC_015138	GTG	2	6	284386	284391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315074
7119	NC_015138	CAT	2	6	284412	284417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315074
7120	NC_015138	TGG	2	6	284450	284455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315074
7121	NC_015138	GCG	2	6	284483	284488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315074
7122	NC_015138	CAA	2	6	284535	284540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315074
7123	NC_015138	AAG	2	6	284599	284604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315074
7124	NC_015138	GGCC	2	8	284615	284622	0 %	0 %	50 %	50 %	326315075
7125	NC_015138	ACG	2	6	284623	284628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315075
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7127	NC_015138	GCC	2	6	284725	284730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315075
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7132	NC_015138	CGA	2	6	284876	284881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315075
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7139	NC_015138	CGGG	2	8	285097	285104	0 %	0 %	75 %	25 %	326315075
7140	NC_015138	GTGGAC	2	12	285105	285116	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	326315075
7141	NC_015138	TGG	2	6	285130	285135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315075
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7148	NC_015138	TTC	2	6	285336	285341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315075
7149	NC_015138	GCCTG	2	10	285358	285367	0 %	20 %	40 %	40 %	326315075
7150	NC_015138	GCC	2	6	285381	285386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315075
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7154	NC_015138	CTG	2	6	285491	285496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315075
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7157	NC_015138	CAT	2	6	285608	285613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315075
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7160	NC_015138	CTG	2	6	285642	285647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315075
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7200	NC_015138	GGCC	2	8	287563	287570	0 %	0 %	50 %	50 %	326315077
7201	NC_015138	CAG	2	6	287579	287584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315077
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7222	NC_015138	CAG	2	6	288235	288240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315078
7223	NC_015138	GCT	3	9	288282	288290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315078
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7229	NC_015138	CTG	2	6	288457	288462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315078
7230	NC_015138	GC	3	6	288489	288494	0 %	0 %	50 %	50 %	326315078
7231	NC_015138	CGA	3	9	288540	288548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315078
7232	NC_015138	CGT	2	6	288555	288560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315078
7233	NC_015138	GCA	2	6	288588	288593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315078
7234	NC_015138	GAT	2	6	288622	288627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315078
7235	NC_015138	CGA	2	6	288630	288635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315078
7236	NC_015138	GTA	2	6	288688	288693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315078
7237	NC_015138	TCT	2	6	288733	288738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315079
7238	NC_015138	CAGCA	2	10	288768	288777	40 %	0 %	20 %	40 %	326315079
7239	NC_015138	CGG	2	6	288787	288792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315079
7240	NC_015138	CGA	2	6	288793	288798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315079
7241	NC_015138	GAT	2	6	288872	288877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315079
7242	NC_015138	CCG	2	6	288886	288891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315079
7243	NC_015138	GCA	2	6	288955	288960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315079
7244	NC_015138	CTG	2	6	288974	288979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315079
7245	NC_015138	CGA	2	6	289001	289006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315079
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7313	NC_015138	CTG	3	9	291349	291357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315082
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7343	NC_015138	GCT	3	9	292561	292569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315083
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7349	NC_015138	CGC	2	6	292681	292686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315083
7350	NC_015138	TGG	2	6	292707	292712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315083
7351	NC_015138	C	6	6	292944	292949	0 %	0 %	0 %	100 %	326315084
7352	NC_015138	TCC	2	6	292957	292962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315084
7353	NC_015138	CG	3	6	293059	293064	0 %	0 %	50 %	50 %	326315084
7354	NC_015138	GC	3	6	293105	293110	0 %	0 %	50 %	50 %	326315084
7355	NC_015138	CAG	2	6	293111	293116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315084
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7357	NC_015138	CAT	2	6	293236	293241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315084
7358	NC_015138	GCTGC	2	10	293278	293287	0 %	20 %	40 %	40 %	326315084
7359	NC_015138	AGGGCA	2	12	293292	293303	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	326315084
7360	NC_015138	GCC	3	9	293378	293386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315084
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7362	NC_015138	CG	3	6	293428	293433	0 %	0 %	50 %	50 %	326315084
7363	NC_015138	CCCG	2	8	293488	293495	0 %	0 %	25 %	75 %	326315084
7364	NC_015138	CAT	2	6	293500	293505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315084
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7483	NC_015138	GA	3	6	298462	298467	50 %	0 %	50 %	0 %	326315085
7484	NC_015138	GCC	2	6	298471	298476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315085
7485	NC_015138	CAGC	2	8	298496	298503	25 %	0 %	25 %	50 %	326315085
7486	NC_015138	AGGC	2	8	298529	298536	25 %	0 %	50 %	25 %	326315085
7487	NC_015138	GCA	2	6	298564	298569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315085
7488	NC_015138	ACT	2	6	298570	298575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315085
7489	NC_015138	GGC	2	6	298659	298664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315085
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7491	NC_015138	AC	3	6	298976	298981	50 %	0 %	0 %	50 %	326315085
7492	NC_015138	GAC	2	6	299010	299015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315086
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7497	NC_015138	CTG	2	6	299154	299159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315086
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