MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC chromosome

Total Repeats: 122707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014910	ACGG	2	8	239	246	25 %	0 %	50 %	25 %	319760739
2	NC_014910	AGC	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
3	NC_014910	AGC	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
4	NC_014910	CTG	2	6	377	382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
5	NC_014910	CTG	2	6	443	448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
6	NC_014910	GCTC	2	8	487	494	0 %	25 %	25 %	50 %	319760739
7	NC_014910	GCCG	2	8	550	557	0 %	0 %	50 %	50 %	319760739
8	NC_014910	GCCG	2	8	565	572	0 %	0 %	50 %	50 %	319760739
9	NC_014910	GAG	2	6	584	589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760739
10	NC_014910	CCGC	2	8	590	597	0 %	0 %	25 %	75 %	319760739
11	NC_014910	GC	3	6	671	676	0 %	0 %	50 %	50 %	319760739
12	NC_014910	GCC	2	6	680	685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760739
13	NC_014910	CGG	2	6	736	741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760739
14	NC_014910	CAA	2	6	781	786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760739
15	NC_014910	GCT	2	6	787	792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
16	NC_014910	CGA	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
17	NC_014910	CTCG	2	8	904	911	0 %	25 %	25 %	50 %	319760739
18	NC_014910	CTG	3	9	914	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
19	NC_014910	CGA	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
20	NC_014910	TTC	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760739
21	NC_014910	CGCA	2	8	956	963	25 %	0 %	25 %	50 %	319760739
22	NC_014910	GGA	2	6	964	969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760739
23	NC_014910	TTC	2	6	971	976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760739
24	NC_014910	GCT	2	6	991	996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
25	NC_014910	AAG	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760739
26	NC_014910	TGA	2	6	1017	1022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760739
27	NC_014910	GCC	2	6	1108	1113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760739
28	NC_014910	CAA	2	6	1144	1149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760739
29	NC_014910	GC	4	8	1151	1158	0 %	0 %	50 %	50 %	319760739
30	NC_014910	GAG	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760739
31	NC_014910	CTT	2	6	1189	1194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760739
32	NC_014910	GC	3	6	1236	1241	0 %	0 %	50 %	50 %	319760739
33	NC_014910	GAAG	2	8	1276	1283	50 %	0 %	50 %	0 %	319760739
34	NC_014910	CG	4	8	1297	1304	0 %	0 %	50 %	50 %	319760739
35	NC_014910	CTG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
36	NC_014910	AGA	2	6	1362	1367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760739
37	NC_014910	ACT	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760739
38	NC_014910	AAG	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760739
39	NC_014910	CG	3	6	1432	1437	0 %	0 %	50 %	50 %	319760739
40	NC_014910	AGA	2	6	1479	1484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760739
41	NC_014910	ACCAC	2	10	1521	1530	40 %	0 %	0 %	60 %	319760739
42	NC_014910	TGC	2	6	1533	1538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
43	NC_014910	CAG	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
44	NC_014910	CAG	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
45	NC_014910	GAT	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760739
46	NC_014910	ACAAG	2	10	1774	1783	60 %	0 %	20 %	20 %	319760740
47	NC_014910	TCG	2	6	1815	1820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
48	NC_014910	CAC	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760740
49	NC_014910	CAC	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760740
50	NC_014910	GC	3	6	1970	1975	0 %	0 %	50 %	50 %	319760740
51	NC_014910	CCG	2	6	2004	2009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760740
52	NC_014910	GGC	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760740
53	NC_014910	GCCG	2	8	2089	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	319760740
54	NC_014910	AGG	2	6	2115	2120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760740
55	NC_014910	CTG	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
56	NC_014910	CTA	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760740
57	NC_014910	TGG	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760740
58	NC_014910	AGC	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760740
59	NC_014910	AGG	2	6	2331	2336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760740
60	NC_014910	CTG	2	6	2375	2380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
61	NC_014910	CCGACG	2	12	2382	2393	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760740
62	NC_014910	CAA	2	6	2416	2421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760740
63	NC_014910	TTCGGC	2	12	2432	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
64	NC_014910	ACC	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760740
65	NC_014910	TCA	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760740
66	NC_014910	CG	3	6	2537	2542	0 %	0 %	50 %	50 %	319760740
67	NC_014910	CAT	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760740
68	NC_014910	AGG	3	9	2655	2663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760740
69	NC_014910	CGG	2	6	2689	2694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760740
70	NC_014910	ACCT	2	8	2723	2730	25 %	25 %	0 %	50 %	319760740
71	NC_014910	GTC	2	6	2798	2803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
72	NC_014910	ACA	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760740
73	NC_014910	CGT	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
74	NC_014910	CGA	2	6	2984	2989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
75	NC_014910	CGG	2	6	3035	3040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
76	NC_014910	CAC	2	6	3138	3143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760741
77	NC_014910	GGT	2	6	3155	3160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760741
78	NC_014910	CGA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
79	NC_014910	CGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
80	NC_014910	TCG	2	6	3205	3210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
81	NC_014910	GAC	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
82	NC_014910	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
83	NC_014910	GGC	2	6	3342	3347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
84	NC_014910	GGC	2	6	3378	3383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
85	NC_014910	GGCGTG	2	12	3390	3401	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319760741
86	NC_014910	CGTG	2	8	3403	3410	0 %	25 %	50 %	25 %	319760741
87	NC_014910	GAA	2	6	3422	3427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760741
88	NC_014910	GTG	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760741
89	NC_014910	GGT	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760741
90	NC_014910	CAA	2	6	3668	3673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760741
91	NC_014910	CGA	2	6	3695	3700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
92	NC_014910	AGG	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
93	NC_014910	CCGGCG	2	12	3727	3738	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
94	NC_014910	TCA	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760741
95	NC_014910	GAA	2	6	3773	3778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760741
96	NC_014910	TGC	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
97	NC_014910	CCACG	2	10	3800	3809	20 %	0 %	20 %	60 %	319760741
98	NC_014910	GC	4	8	3811	3818	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
99	NC_014910	CGG	2	6	3833	3838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
100	NC_014910	ACG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
101	NC_014910	CAA	2	6	3917	3922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760741
102	NC_014910	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
103	NC_014910	CACC	2	8	3944	3951	25 %	0 %	0 %	75 %	319760741
104	NC_014910	GC	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
105	NC_014910	CG	3	6	3976	3981	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
106	NC_014910	AAG	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760741
107	NC_014910	GCG	2	6	4039	4044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
108	NC_014910	TGC	2	6	4065	4070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
109	NC_014910	CAG	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
110	NC_014910	CAG	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
111	NC_014910	GC	4	8	4142	4149	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
112	NC_014910	GGA	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
113	NC_014910	TCG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
114	NC_014910	GGA	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
115	NC_014910	TCG	2	6	4231	4236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
116	NC_014910	CG	7	14	4241	4254	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
117	NC_014910	CG	3	6	4259	4264	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
118	NC_014910	GC	3	6	4269	4274	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
119	NC_014910	TCG	2	6	4372	4377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
120	NC_014910	CCG	2	6	4387	4392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
121	NC_014910	GC	3	6	4473	4478	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
122	NC_014910	ATC	2	6	4506	4511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760741
123	NC_014910	ACGGCA	2	12	4558	4569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
124	NC_014910	GCG	2	6	4573	4578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
125	NC_014910	CGA	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
126	NC_014910	CGC	2	6	4592	4597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
127	NC_014910	ACC	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760741
128	NC_014910	CAT	4	12	4616	4627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760741
129	NC_014910	CTG	3	9	4665	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
130	NC_014910	CTT	2	6	4676	4681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760741
131	NC_014910	TCG	2	6	4702	4707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
132	NC_014910	GCC	2	6	4733	4738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
133	NC_014910	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760741
134	NC_014910	CGC	3	9	4784	4792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
135	NC_014910	CTG	2	6	4806	4811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
136	NC_014910	CGG	2	6	4844	4849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
137	NC_014910	CGCGC	2	10	4853	4862	0 %	0 %	40 %	60 %	319760741
138	NC_014910	CGA	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
139	NC_014910	GC	3	6	4893	4898	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
140	NC_014910	GC	3	6	4961	4966	0 %	0 %	50 %	50 %	319760741
141	NC_014910	GGA	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
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143	NC_014910	GCG	2	6	5062	5067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
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147	NC_014910	AGC	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
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154	NC_014910	AGG	2	6	5281	5286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
155	NC_014910	CAC	2	6	5342	5347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760741
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157	NC_014910	AGC	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
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159	NC_014910	GCC	2	6	5425	5430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
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164	NC_014910	TCG	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760742
165	NC_014910	CTG	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760742
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168	NC_014910	GGCGC	2	10	5887	5896	0 %	0 %	60 %	40 %	319760742
169	NC_014910	GCG	2	6	5953	5958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760742
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211	NC_014910	CAG	2	6	7568	7573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760744
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220	NC_014910	GCG	2	6	7860	7865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760744
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230	NC_014910	CGCA	2	8	8275	8282	25 %	0 %	25 %	50 %	319760745
231	NC_014910	GGC	2	6	8283	8288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760745
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237	NC_014910	ACG	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760745
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243	NC_014910	ACC	2	6	8702	8707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760745
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247	NC_014910	GC	3	6	8853	8858	0 %	0 %	50 %	50 %	319760745
248	NC_014910	GC	4	8	8875	8882	0 %	0 %	50 %	50 %	319760745
249	NC_014910	GCC	2	6	8943	8948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760745
250	NC_014910	GC	3	6	8970	8975	0 %	0 %	50 %	50 %	319760745
251	NC_014910	GCCA	2	8	8980	8987	25 %	0 %	25 %	50 %	319760745
252	NC_014910	GCT	2	6	9032	9037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760746
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254	NC_014910	GCA	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760746
255	NC_014910	CTT	2	6	9135	9140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760746
256	NC_014910	GCG	2	6	9215	9220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760746
257	NC_014910	TGG	2	6	9221	9226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760746
258	NC_014910	TGC	2	6	9323	9328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760746
259	NC_014910	AGT	3	9	9395	9403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760746
260	NC_014910	GCC	2	6	9411	9416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760746
261	NC_014910	GCT	2	6	9441	9446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760746
262	NC_014910	GCT	2	6	9482	9487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760746
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264	NC_014910	GTCC	2	8	9545	9552	0 %	25 %	25 %	50 %	319760746
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